Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7845
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7845, 544 aa
1>>>pF1KB7845 544 - 544 aa - 544 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7406+/-0.00038; mu= 9.9093+/- 0.024
mean_var=261.4867+/-52.252, 0's: 0 Z-trim(122.2): 1989 B-trim: 152 in 1/54
Lambda= 0.079314
statistics sampled from 37581 (39847) to 37581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16
Scan time: 10.860
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005732 (OMIM: 604191) zinc finger protein 263 [ ( 683) 1077 136.8 2.2e-31
XP_011520646 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger ( 683) 1077 136.8 2.2e-31
XP_006720895 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger ( 644) 1063 135.1 6.3e-31
XP_006722621 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1052 133.8 1.4e-30
XP_011524531 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1052 133.8 1.4e-30
XP_011524532 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1052 133.8 1.4e-30
XP_006720896 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger ( 598) 1052 133.8 1.4e-30
NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [ ( 470) 928 119.5 2.3e-26
NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 928 119.5 2.3e-26
XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 879 113.9 1.1e-24
NP_001092753 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
XP_005271889 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 458) 847 110.2 1.4e-23
XP_011538540 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001311279 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001311277 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001311278 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
XP_006718066 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_005665 (OMIM: 601069) zinc finger protein 239 i ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001092752 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001311276 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001311280 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
NP_001092754 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23
XP_006718064 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23
XP_011538537 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23
XP_011538538 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23
XP_016872229 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23
XP_011538536 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23
NP_001311281 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 500) 847 110.3 1.5e-23
XP_011538539 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23
NP_001311282 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 571) 847 110.3 1.6e-23
XP_011538534 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 602) 847 110.4 1.7e-23
XP_016880498 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23
XP_016880499 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23
XP_016880500 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23
NP_001290211 (OMIM: 194524) zinc finger protein 18 ( 548) 845 110.1 1.8e-23
XP_016880497 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23
XP_016880495 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 549) 843 109.9 2.2e-23
XP_011522304 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 549) 843 109.9 2.2e-23
XP_016880496 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 549) 843 109.9 2.2e-23
NP_001290210 (OMIM: 194524) zinc finger protein 18 ( 549) 843 109.9 2.2e-23
NP_653281 (OMIM: 194524) zinc finger protein 18 is ( 549) 843 109.9 2.2e-23
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 838 109.3 3.2e-23
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 838 109.4 3.7e-23
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 838 109.4 3.7e-23
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 838 109.4 3.7e-23
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 838 109.4 3.7e-23
NP_037512 (OMIM: 603994) zinc finger protein 112 i ( 907) 840 109.8 3.7e-23
NP_001076804 (OMIM: 603994) zinc finger protein 11 ( 913) 840 109.8 3.8e-23
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 837 109.3 4e-23
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 837 109.3 4e-23
>>NP_005732 (OMIM: 604191) zinc finger protein 263 [Homo (683 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MLKEHPEMAEAP--QQQLGIPVVKLEKELPWGR----GREDPSPETFRLRFRQFRYQEAA
:: .: :.. :. .::::.. :.. ::::. .::::.::.::::
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10 20 30 40 50
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pF1KB7 GPQEALRELQELCRRWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHGPESGKALA
::.::: .:::::. :::::..:::::::::::::::::::.:. . ..: ::::. .
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pF1KB7 AMVEDLTERALEAKAVPCHRQGEQEETALCRGAWEPGIQLGPVEVKPEWGMPPGEGVQGP
..:::. .: : .:. :. : : . : .. .: . . : : ..:
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: .: :. .: . .: .:.:: : :. : : : .:.:: .: : .
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.:.:. . .::: : :.. .: . .. :. .:. :: .
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pF1KB7 EAKPPQEDLKGALVALTSERFGEASLQGPGLGRVCEQEPGGPAGSAPGLPPPQHGAIPLP
.. .: :. : :.: .:. :. :: .: : :: .: .:
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:. . :. : : :: : : : . .: : .. . .: . : :::.:.
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::::::.::.:: ::.::.. : : :..:..:.
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>--
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pF1KB7 WKPFQCPECGKGFSRSSNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFT-LREYLMKHQRTHLGKRPY
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.. .: :. : :.: .:. :. :: .: : :: .: .:
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:. . :. : : :: : : : . .: : .. . .: . : :::.:.
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::::::.::.:: ::.::.. : : :..:..:.
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pF1KB7 WKPFQCPECGKGFSRSSNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFT-LREYLMKHQRTHLGKRPY
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>>XP_006720895 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger pro (644 aa)
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..:
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