Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7845
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7845, 544 aa
1>>>pF1KB7845 544 - 544 aa - 544 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5237+/-0.000958; mu= 11.1530+/- 0.057
mean_var=221.1657+/-43.147, 0's: 0 Z-trim(115.0): 927 B-trim: 210 in 1/53
Lambda= 0.086241
statistics sampled from 14559 (15571) to 14559 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 3.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5671.2 ZSCAN25 gene_id:221785|Hs108|chr7 ( 544) 3904 498.5 8.2e-141
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CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 928 128.2 2.2e-29
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CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 840 117.6 6.6e-26
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 837 117.1 7.7e-26
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 831 116.1 9.1e-26
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 834 116.7 9.8e-26
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 829 115.9 1.1e-25
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CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 826 115.5 1.4e-25
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 823 115.2 2.2e-25
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CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 823 115.3 2.3e-25
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 823 115.3 2.3e-25
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 823 115.3 2.3e-25
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 821 114.9 2.4e-25
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CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 821 115.1 2.8e-25
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 821 115.1 3e-25
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 818 114.5 3e-25
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 818 114.6 3.2e-25
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CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 812 113.8 5.5e-25
CCDS58659.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 549) 811 113.7 5.8e-25
CCDS33004.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 550) 811 113.7 5.8e-25
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 812 113.9 5.9e-25
>>CCDS5671.2 ZSCAN25 gene_id:221785|Hs108|chr7 (544 aa)
initn: 3904 init1: 3904 opt: 3904 Z-score: 2641.5 bits: 498.5 E(32554): 8.2e-141
Smith-Waterman score: 3904; 100.0% identity (100.0% similar) in 544 aa overlap (1-544:1-544)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLKEHPEMAEAPQQQLGIPVVKLEKELPWGRGREDPSPETFRLRFRQFRYQEAAGPQEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MLKEHPEMAEAPQQQLGIPVVKLEKELPWGRGREDPSPETFRLRFRQFRYQEAAGPQEAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RELQELCRRWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHGPESGKALAAMVEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RELQELCRRWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHGPESGKALAAMVEDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TERALEAKAVPCHRQGEQEETALCRGAWEPGIQLGPVEVKPEWGMPPGEGVQGPDPGTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TERALEAKAVPCHRQGEQEETALCRGAWEPGIQLGPVEVKPEWGMPPGEGVQGPDPGTEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLSQDPGDETRAFQEQALPVLQAGPGLPAVNPRDQEMAAGFFTAGSQGLGPFKDMALAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLSQDPGDETRAFQEQALPVLQAGPGLPAVNPRDQEMAAGFFTAGSQGLGPFKDMALAFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EEEWRHVTPAQIDCFGEYVEPQDCRVSPGGGSKEKEAKPPQEDLKGALVALTSERFGEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EEEWRHVTPAQIDCFGEYVEPQDCRVSPGGGSKEKEAKPPQEDLKGALVALTSERFGEAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LQGPGLGRVCEQEPGGPAGSAPGLPPPQHGAIPLPDEVKTHSSFWKPFQCPECGKGFSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LQGPGLGRVCEQEPGGPAGSAPGLPPPQHGAIPLPDEVKTHSSFWKPFQCPECGKGFSRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFTLREYLMKHQRTHLGKRPYVCSECWKTFSQRHHLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFTLREYLMKHQRTHLGKRPYVCSECWKTFSQRHHLEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 HQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSRRQHLQVHRRTHTGEKPYTCECGKSFSRNANLAVHRRAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSRRQHLQVHRRTHTGEKPYTCECGKSFSRNANLAVHRRAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 TGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQRIHTGEKPYHCPACGRSFNQRSILNRHQKTQHRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQRIHTGEKPYHCPACGRSFNQRSILNRHQKTQHRQE
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pF1KB7 PLVQ
::::
CCDS56 PLVQ
>>CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16 (683 aa)
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Smith-Waterman score: 1125; 37.9% identity (60.1% similar) in 567 aa overlap (8-539:1-543)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLKEHPEMAEAP--QQQLGIPVVKLEKELPWGR----GREDPSPETFRLRFRQFRYQEAA
:: .: :.. :. .::::.. :.. ::::. .::::.::.::::
CCDS10 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHLRFRRFRFQEAA
10 20 30 40 50
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pF1KB7 GPQEALRELQELCRRWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHGPESGKALA
::.::: .:::::. :::::..:::::::::::::::::::.:. . ..: ::::. .
CCDS10 GPREALSRLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSRVQELHPESGEEAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AMVEDLTERALEAKAVPCHRQGEQEETALCRGAWEPGIQLGPVEVKPEWGMPPGEGVQGP
..:::. .: : .:. :. : : . : .. .: . . : : ..:
CCDS10 TLVEDM-QRELGRLRQQVTNHGRGTEVLL-----EEPLPLETARESPSFKLEPMETERSP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DPGTEEQLSQDPGDETRAFQEQAL--PVLQAGPGLPAVNPRDQEMAAGFFTAGSQGLGPF
: .: :. .: . .: .:.:: : :. : : : .:.:: .: : .
CCDS10 GPRLQELLGPSPQRDPQAVKERALSAPWLSLFP--PEGNMEDKEM------TGPQLPESL
170 180 190 200 210
240 250 260 270
pF1KB7 KDMALAFPEEEWRHVTPAQ--------------IDCFGEYVEPQDC---RVSPGGGSKEK
.:.:. . .::: : :.. .: . .. :. .:. :: .
CCDS10 EDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDP
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 EAKPPQEDLKGALVALTSERFGEASLQGPGLGRVCEQEPGGPAGSAPGLPPPQHGAIPLP
.. .: :. : :.: .:. :. :: .: : :: .: .:
CCDS10 SVQSCKEGLSPRGPAPGEEKF--ENLE--GVPSVC-SENIHPQ---VLLPDQARGEVPWS
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380
pF1KB7 DEV-KTHSSF---WKPFQCPECG-----KGFSRSSNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFTL
:. . :. : : :: : : : . .: : .. . .: . : :::.:.
CCDS10 PELGRPHDRSQGDWAP--PPEGGMEQALAGASSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSN
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pF1KB7 REYLMKHQRTHLGKRPYVCSECWKTFSQRHHLEVHQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSRRQHL
:..::: : ..: . .: . :. .. .:.: ::. .:: .: : ::. ::
CCDS10 NSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHL
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pF1KB7 QVHRRTHTGEKPYTCE-CGKSFSRNANLAVHRRAHTGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQ
:.::::::::: :. ::: :: :.:: :.:.::::::: : ::. :... :.:::
CCDS10 TRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQ
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pF1KB7 RIHTGEKPYHCPACGRSFNQRSILNRHQKTQHRQEPLVQ
::::::.::.:: ::.::.. : : :..:..:.
CCDS10 RIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHK
510 520 530 540 550 560
CCDS10 AEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEK
570 580 590 600 610 620
>--
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Smith-Waterman score: 487; 50.7% identity (69.6% similar) in 138 aa overlap (375-510:546-683)
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pF1KB7 WKPFQCPECGKGFSRSSNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFT-LREYLMKHQRTHLGKRPY
: :::.. . .: .: . :. .
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pF1KB7 VCSECWKTFSQRHHLEVHQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSRRQHLQVHRRTHTGEKPYTC-E
: : :.: : :: :::.::::::::: : ..::.:..: :.: ::::::::: :
CCDS10 ECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHE
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pF1KB7 CGKSFSRNANLAVHRRAHTGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQRIHTGEKPYHCPACGRS
:: :::...: : :.::::.:: :. ::. ::.. ::. ::: :::
CCDS10 CGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
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530 540
pF1KB7 FNQRSILNRHQKTQHRQEPLVQ
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
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Smith-Waterman score: 928; 43.3% identity (67.8% similar) in 335 aa overlap (217-541:1-333)
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GDETRAFQEQALPVLQAGPGLPAVNPRDQEMAAGFFTAGSQGLGPFKDMALAFPEEEWRH
::: .. ::::. :.:::. . .::::
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRP
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VTPAQIDCFGEYVEPQDCRVSPGGGS--KEKEAKPPQEDLKGALVALTSERFGEASLQGP
. :: : . . .. . : .:.:..: :: . . . :::: .: . ..:
CCDS23 LDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENP
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350
pF1KB7 ----GL--GRVCEQEPGGPAGSAPGLPPPQHGAIPLPDEVKTHSSFWKPFQCPECGKGFS
:. : :.. : . . : . . : . ..:... . : .:::.::
CCDS23 ESEEGFESGDRSERQ-WGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGI-RYHICSHCGKAFS
100 110 120 130 140
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 RSSNLVRHQRTHE-EKSYGCVECGKGFTLREYLMKHQRTHLGKRPYVCSECWKTFSQRHH
. :.: :::.:: .. : : ::::::. .:..::::: :.::: :.:: :.:.. :
CCDS23 QISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSH
150 160 170 180 190 200
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LEVHQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSRRQHLQVHRRTHTGEKPYTCE-CGKSFSRNANLAVH
: :: ::::::.::..: ::: : .:: :.:::.::::: :: :::::::...:: :
CCDS23 LIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQH
210 220 230 240 250 260
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 RRAHTGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQRIHTGEKPYHCPACGRSFNQRSILNRHQKTQ
.:.::::::: :. ::. ::. :..: :.::::.::.: ::..:.: : : ::....
CCDS23 QRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAH
270 280 290 300 310 320
540
pF1KB7 HRQEPLVQ
..:
CCDS23 TGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEK
330 340 350 360 370 380
>--
initn: 1173 init1: 387 opt: 563 Z-score: 395.7 bits: 82.8 E(32554): 1e-15
Smith-Waterman score: 594; 54.4% identity (80.9% similar) in 136 aa overlap (375-509:334-469)
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 WKPFQCPECGKGFSRSSNLVRHQRTHEEKSYGCVECGKGFTLREYLMKHQRTHLGKRPYV
: : :::..:. .:..::::: :..::
CCDS23 RPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYE
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
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CCDS23 GKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
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530 540
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540
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490
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CCDS32 ---------PQEQWRQLDSTQKEQYWDLMLETYGKMVSGAGISHPKSDLTNSIEFGEELA
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: . . .:.. . . : .: .:: . .: : : : . .
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: . . : . . :: .... ... . :. ::. : . :. :.
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CCDS64 IHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTG
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CCDS64 SQRSKLIKHQLIHTRE
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