Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7761
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7761, 448 aa
1>>>pF1KB7761 448 - 448 aa - 448 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6654+/-0.000955; mu= 2.6791+/- 0.058
mean_var=179.0659+/-36.401, 0's: 0 Z-trim(112.3): 33 B-trim: 115 in 1/50
Lambda= 0.095845
statistics sampled from 13044 (13072) to 13044 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 3.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 3093 439.8 2.7e-123
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 1582 230.8 2.1e-60
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 1247 184.5 1.6e-46
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 671 104.9 1.7e-22
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 653 102.4 1.2e-21
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 648 101.7 1.9e-21
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 632 99.5 7.7e-21
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 632 99.5 8.4e-21
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 597 94.7 3.1e-19
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 567 90.6 5.6e-18
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 558 89.7 4.2e-17
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 558 89.7 4.4e-17
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 537 86.4 7.8e-17
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 487 79.5 9.2e-15
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 489 79.8 9.5e-15
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 480 78.5 2e-14
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 470 77.0 3.6e-14
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 463 76.1 8.8e-14
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 465 76.5 9.7e-14
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 463 76.2 1e-13
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 456 75.1 1.4e-13
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 456 75.1 1.4e-13
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 456 75.2 1.7e-13
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 453 74.7 2.1e-13
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 438 72.7 1.3e-12
>>CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 (448 aa)
initn: 3093 init1: 3093 opt: 3093 Z-score: 2327.0 bits: 439.8 E(32554): 2.7e-123
Smith-Waterman score: 3093; 100.0% identity (100.0% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAMSELGTRKPSDGTVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEVTNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAMSELGTRKPSDGTVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEVTNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MIVTKNGRRMFPVLKISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVSSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MIVTKNGRRMFPVLKISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVSSHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CVYIHPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVGSAHRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CVYIHPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVGSAHRM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VTNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLRDVPEAISESQHVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLRDVPEAISESQHVTY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SHLGGWIFSNPDGVCTAGNSNYQYAAPLPLPAPHTHHGCEHYSGLRGHRQAPYPSAYMHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SHLGGWIFSNPDGVCTAGNSNYQYAAPLPLPAPHTHHGCEHYSGLRGHRQAPYPSAYMHR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NHSPSVNLIESSSNNLQVFSGPDSWTSLSSTPHASILSVPHTNGPINPGPSPYPCLWTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NHSPSVNLIESSSNNLQVFSGPDSWTSLSSTPHASILSVPHTNGPINPGPSPYPCLWTIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NGAGGPSGPGPEVHASTPGAFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVEVLGEPSLTSIAVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NGAGGPSGPGPEVHASTPGAFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVEVLGEPSLTSIAVST
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB7 WTAVASHPFAGWGGPGAGGHHSPSSLDG
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WTAVASHPFAGWGGPGAGGHHSPSSLDG
430 440
>>CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 (435 aa)
initn: 1401 init1: 1216 opt: 1582 Z-score: 1198.0 bits: 230.8 E(32554): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1582; 56.3% identity (78.4% similar) in 435 aa overlap (3-432:1-427)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAMSELGTR---KPSDGTVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEV
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CCDS52 MSSPGTESAGKSLQYRVDHLLSAVENELQAGSEKGDPTERELRVGLEESELWLRFKEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TNEMIVTKNGRRMFPVLKISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVS
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CCDS52 TNEMIVTKNGRRMFPVLKVNVSGLDPNAMYSFLLDFVAADNHRWKYVNGEWVPGGKPEPQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SHSCVYIHPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVGSA
. ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::..::::::.
CCDS52 APSCVYIHPDSPNFGAHWMKAPVSFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPRIHIVRVGGP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HRMVTNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLRDVPEAISESQH
.::.:. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ... : ..::.
CCDS52 QRMITSHCFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERSDHKEMMEEPGDSQQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VTYSHLGGWIFSNPDGVCTAGNSNYQYAAPLPLPAPHTHHGCEHYSGLRGHRQAPYPSAY
::. : :.. . . .: .: . :... : ::. :. :..: ::.::..:::: :
CCDS52 PGYSQWG-WLLPGTSTLCPPANPHPQFGGALSLPSTHS---CDRYPTLRSHRSSPYPSPY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MHRNHSPSVNLIESSSNNLQVFSGPDSWTSLSSTPHASILSVPHTNGPINPGPSPYPCLW
:::.::. . ..: :..... :.:.::. : :.: : :. .: . . : :: ::
CCDS52 AHRNNSPTYS--DNSPACLSMLQSHDNWSSLGMPAHPSMLPVSHNASPPTSS-SQYPSLW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TISNGAGGPSGPGPEVHASTPGAFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVEVL-GEPSLTSI
..:::: :.. . : . . :. :.:: .: . ..::.:.: . : . :.:
CCDS52 SVSNGAVTPGSQAAAVSNGLGAQFFRGSPAHYTPLT-HPVSAPSSSGSPLYEGAAAATDI
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KB7 AVSTWTAVASHPF-AGWGGPGAGGHHSPSSLDG
. : . :.:. . :.:
CCDS52 VDSQYDAAAQGRLIASWTPVSPPSM
420 430
>>CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 (377 aa)
initn: 1293 init1: 1205 opt: 1247 Z-score: 948.6 bits: 184.5 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1286; 52.4% identity (68.7% similar) in 435 aa overlap (3-432:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAMSELGTR---KPSDGTVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEV
:: ::. : . :.:::..::.::::: :::::::..:.. ::.. :: ::::.
CCDS59 MSSPGTESAGKSLQYRVDHLLSAVENELQAGSEKGDPTERELRVGLEESELWLRFKEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TNEMIVTKNGRRMFPVLKISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVS
::::::::::::::::::..:.:::::::::.::::: .:.::::::::::::.:::: .
CCDS59 TNEMIVTKNGRRMFPVLKVNVSGLDPNAMYSFLLDFVAADNHRWKYVNGEWVPGGKPEPQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SHSCVYIHPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVGSA
. ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::..::::::.
CCDS59 APSCVYIHPDSPNFGAHWMKAPVSFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPRIHIVRVGGP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HRMVTNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLRDVPEAISESQH
.::.:. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ... : ..::.
CCDS59 QRMITSHCFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERSDHKEMMEEPGDSQQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VTYSHLGGWIFSNPDGVCTAGNSNYQYAAPLPLPAPHTHHGCEHYSGLRGHRQAPYPSAY
::. : : :: :: : : :..:
CCDS59 PGYSQ------SYSD------NS----------PA------C--LSMLQSH---------
240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MHRNHSPSVNLIESSSNNLQVFSGPDSWTSLSSTPHASILSVPHTNGPINPGPSPYPCLW
:.:.::. : :.: : :. .: . . : :: ::
CCDS59 -------------------------DNWSSLGMPAHPSMLPVSHNASPPTSS-SQYPSLW
260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TISNGAGGPSGPGPEVHASTPGAFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVEVL-GEPSLTSI
..:::: :.. . : . . :. :.:: .: . ..::.:.: . : . :.:
CCDS59 SVSNGAVTPGSQAAAVSNGLGAQFFRGSPAHYTPLT-HPVSAPSSSGSPLYEGAAAATDI
300 310 320 330 340 350
420 430 440
pF1KB7 AVSTWTAVASHPF-AGWGGPGAGGHHSPSSLDG
. : . :.:. . :.:
CCDS59 VDSQYDAAAQGRLIASWTPVSPPSM
360 370
>>CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 (436 aa)
initn: 574 init1: 417 opt: 671 Z-score: 517.2 bits: 104.9 E(32554): 1.7e-22
Smith-Waterman score: 672; 38.3% identity (60.6% similar) in 358 aa overlap (45-382:95-428)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 TVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEVTNEMIVTKNGRRMFPVL
::. ::..:. : .:::.:: ::::::.
CCDS10 PLPLLPPAMGTEPAPSAPEALHSLPGVSLSLENRELWKEFSSVGTEMIITKAGRRMFPAC
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 KISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVSSHSCVYIHPDSPNFGAH
..:::::::.: : .::: .:.:. :... . .: :.:: : . :::::::: :::
CCDS10 RVSVTGLDPEARYLFLLDVIPVDGARYRWQGRRWEPSGKAEPRLPDRVYIHPDSPATGAH
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180
pF1KB7 WMKAPISFSKVKLTNK-LNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVG---SAHRM-VTNCSFPET
::. :.:: .:::::. :. :...:.:.:::.:..:.::.. : : ... ::::
CCDS10 WMRQPVSFHRVKLTNSTLDPHGHLILHSMHKYQPRIHLVRAAQLCSQHWGGMASFRFPET
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLRDVPEAISESQH-----VTYSHLG
::.:::::: .:: ::: :::::.: . :: :. .... . .: .. .
CCDS10 TFISVTAYQNPQITQLKIAANPFAKGFRENG-RNCKRERDARVKRKLRGPEPAATEAYGS
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GWIFSNPDGVCTAG-NSNYQYAAPLPLPAPHTHHGCEHYSGLRGHRQAPY---PSAYMHR
: ..: : : . ... . . : ::: : :: ::: .
CCDS10 G---DTPGGPCDSTLGGDIRESDPEQAPAP----------GEATAAPAPLCGGPSAEAYL
310 320 330 340 350
310 320 330 340 350
pF1KB7 NHSPSVNLIESSSNNLQVFSGPDSWTSLSSTPH-ASILSVPHTNG----PINPGPSPY-P
: :.. : . : :.. : :.:. :..: .:: .: : : :. :
CCDS10 LH-PAAFHGAPSHLPTRSPSFPEAPDSGRSAPYSAAFLELPHGSGGSGYPAAPPAVPFAP
360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CLWTISNGAGGPSGPGPEVHASTPGAFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVEVLGEPSLT
. ::: : : ..::..:
CCDS10 HFLQ-----GGPF-PLPY---TAPGGYLDVGSKPMY
410 420 430
>>CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (545 aa)
initn: 666 init1: 415 opt: 653 Z-score: 502.3 bits: 102.4 E(32554): 1.2e-21
Smith-Waterman score: 662; 35.4% identity (59.3% similar) in 413 aa overlap (35-429:61-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 ELGTRKPSDGTVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEVTNEMIVT
. : ..... :.. ::..:.:. .:::.:
CCDS11 EPALAAPGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAAEQTIENIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIIT
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KNGRRMFPVLKISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVSSHSCVYI
: :::::: :..:::..:.. : ::.:.::.:.::.:. ...:. ::: : . . .:.
CCDS11 KAGRRMFPSYKVKVTGMNPKTKYILLIDIVPADDHRYKFCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYV
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170
pF1KB7 HPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNK-LNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRV------GSA
::::: :::::. .::.:.::::. :. :.:.:::.:::.:..:::.. ::
CCDS11 HPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVKADENNAFGSK
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HRMVTNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLRDVPEAISESQH
. . ::::.::.::.:::..:: :::. :::::.: . . . :: : . :.
CCDS11 NTAFCTHVFPETSFISVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSD-LR-VARLQSKEYP
220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VTYSHLGGWIFSNPDGVCTAGNSNYQYAAPLPLPAPHTHHGCEHYSGLRG-HRQAPYPSA
: . . . .:. :.: : ::.. .::. : : : :.
CCDS11 VISKSIMRQRLISPQ----------LSATPDVGPLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQD
270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 YMHRNHSPSVNLIESSSNNLQVFSGPDSWTSLSSTPHASILSVPHTNGPIN----PGP--
. . :. ..:: . .. :. :. . : : .: . : . : :
CCDS11 -LPLSTFPT---QRDSSLFYHCLKRRDGTRHLDLPCKRSYLEAPSSVGEDHYFRSPPPYD
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400
pF1KB7 ----SPYPCLWTISNGAGGPSGPGPEVHASTPGAFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVE
:: : . : :: :::. :.. :. : :: :: . ::..
CCDS11 QQMLSPSYCSEVTPREACMYSGSGPEI-AGVSGVDDL-------PPPPLSCNMWTSVS--
380 390 400 410 420
410 420 430 440
pF1KB7 VLGEPSLTSIAVSTWTAVASHPFAGWGGPGAGGHHSPSSLDG
: :: .:.: .: .::
CCDS11 ----P-YTSYSVQTMETVPYQPFPTHFTATTMMPRLPTLSAQSSQPPGNAHFSVYNQLSQ
430 440 450 460 470
>>CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (546 aa)
initn: 666 init1: 415 opt: 648 Z-score: 498.5 bits: 101.7 E(32554): 1.9e-21
Smith-Waterman score: 657; 34.4% identity (60.0% similar) in 410 aa overlap (35-429:61-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 ELGTRKPSDGTVSHLLNVVESELQAGREKGDPTEKQLQIILEDAPLWQRFKEVTNEMIVT
. : ..... :.. ::..:.:. .:::.:
CCDS82 EPALAAPGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAAEQTIENIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIIT
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KNGRRMFPVLKISVTGLDPNAMYSLLLDFVPTDSHRWKYVNGEWVPAGKPEVSSHSCVYI
: :::::: :..:::..:.. : ::.:.::.:.::.:. ...:. ::: : . . .:.
CCDS82 KAGRRMFPSYKVKVTGMNPKTKYILLIDIVPADDHRYKFCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYV
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170
pF1KB7 HPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNK-LNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRV------GSA
::::: :::::. .::.:.::::. :. :.:.:::.:::.:..:::.. ::
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240 250 260 270 280 290
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: . . . .:. :.: : ::.. .::. : : : :
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:.. .:. : . .. ... . .. : . . : . .. .. : .
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360 370 380 390 400
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: :: .:.: .: .::
CCDS82 -P-YTSYSVQTMETVPYQPFPTHFTATTMMPRLPTLSAQSSQPPGNAHFSVYNQLSQSQV
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CCDS11 GGDGPFG-LRSLEKERAEARRKDEGRKEAAEGKEQGLAPLVVQTDSASPLGAGHLPGLAF
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pF1KB7 G
:
CCDS11 GLDAGGLGPAASAASTAAPFPFHLSQHMLASQGIPMPTFGGLFPYPYTYMAAAAAAASAL
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 18:48:24 2016 done: Sun Nov 6 18:48:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]