Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7686
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7686, 410 aa
1>>>pF1KB7686 410 - 410 aa - 410 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9719+/-0.000719; mu= 10.2082+/- 0.044
mean_var=103.1391+/-20.226, 0's: 0 Z-trim(113.1): 126 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.126288
statistics sampled from 13670 (13796) to 13670 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73750.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 ( 410) 2773 515.2 4.6e-146
CCDS73751.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 ( 367) 2495 464.5 7.3e-131
CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 ( 422) 1076 206.0 5.6e-53
CCDS5063.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 ( 385) 1059 202.9 4.4e-52
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19 ( 404) 633 125.3 1.1e-28
CCDS45359.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 261) 593 117.9 1.1e-26
CCDS4068.1 NR2F1 gene_id:7025|Hs108|chr5 ( 423) 596 118.5 1.2e-26
CCDS45358.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 281) 593 117.9 1.2e-26
CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 414) 593 118.0 1.7e-26
CCDS2610.2 PPARG gene_id:5468|Hs108|chr3 ( 477) 498 100.7 3.1e-21
CCDS2609.1 PPARG gene_id:5468|Hs108|chr3 ( 505) 498 100.7 3.3e-21
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs108|chr9 ( 462) 471 95.8 9.2e-20
CCDS54994.1 PPARD gene_id:5467|Hs108|chr6 ( 402) 468 95.2 1.2e-19
CCDS4803.1 PPARD gene_id:5467|Hs108|chr6 ( 441) 468 95.2 1.3e-19
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6 ( 537) 456 93.1 7e-19
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6 ( 533) 451 92.1 1.3e-18
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 340) 444 90.8 2.1e-18
CCDS33669.1 PPARA gene_id:5465|Hs108|chr22 ( 468) 445 91.0 2.5e-18
CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 463) 444 90.8 2.8e-18
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 984) 448 91.7 3.3e-18
CCDS83303.1 HNF4G gene_id:3174|Hs108|chr8 ( 408) 373 77.9 1.9e-14
CCDS6220.2 HNF4G gene_id:3174|Hs108|chr8 ( 445) 373 77.9 2.1e-14
CCDS68131.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 395) 371 77.5 2.4e-14
CCDS46604.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 442) 371 77.5 2.7e-14
CCDS42876.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 452) 371 77.5 2.7e-14
CCDS41821.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 467) 367 76.8 4.7e-14
CCDS44953.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 483) 367 76.8 4.8e-14
CCDS42316.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 410) 364 76.2 6.1e-14
CCDS58546.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 451) 364 76.3 6.6e-14
CCDS13331.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 417) 363 76.1 7e-14
CCDS11360.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 490) 364 76.3 7.1e-14
CCDS74728.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 449) 363 76.1 7.5e-14
CCDS46605.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 464) 363 76.1 7.7e-14
CCDS13330.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 474) 363 76.1 7.9e-14
CCDS4804.1 PPARD gene_id:5467|Hs108|chr6 ( 361) 350 73.7 3.2e-13
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs108|chr14 ( 508) 349 73.6 4.9e-13
CCDS44584.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 387) 347 73.1 5e-13
CCDS44585.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 402) 347 73.1 5.1e-13
CCDS7929.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 447) 347 73.2 5.6e-13
CCDS73285.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 453) 347 73.2 5.7e-13
CCDS11361.1 NR1D1 gene_id:9572|Hs108|chr17 ( 614) 349 73.6 5.8e-13
CCDS2641.1 THRB gene_id:7068|Hs108|chr3 ( 461) 340 71.9 1.4e-12
CCDS1004.1 RORC gene_id:6097|Hs108|chr1 ( 518) 340 71.9 1.6e-12
CCDS33718.1 NR1D2 gene_id:9975|Hs108|chr3 ( 579) 340 71.9 1.7e-12
CCDS54627.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 397) 337 71.3 1.8e-12
CCDS60383.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs108|chr1 ( 469) 338 71.5 1.8e-12
CCDS1400.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs108|chr1 ( 495) 338 71.5 1.9e-12
CCDS42593.1 NR1H2 gene_id:7376|Hs108|chr19 ( 460) 337 71.3 2e-12
CCDS1401.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs108|chr1 ( 541) 338 71.6 2.1e-12
CCDS30856.1 RORC gene_id:6097|Hs108|chr1 ( 497) 336 71.2 2.5e-12
>>CCDS73750.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 (410 aa)
initn: 2773 init1: 2773 opt: 2773 Z-score: 2735.8 bits: 515.2 E(32554): 4.6e-146
Smith-Waterman score: 2773; 100.0% identity (100.0% similar) in 410 aa overlap (1-410:1-410)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METRPTALMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRWGLGEDPTGVSPSLQCRVCGDSSSGKHYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 METRPTALMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRWGLGEDPTGVSPSLQCRVCGDSSSGKHYG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGAGMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQAGMNQDAVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGAGMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQAGMNQDAVQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGHHFMASLITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGHHFMASLITA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGLDSIHETSARLLFMAVKWAKNLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGLDSIHETSARLLFMAVKWAKNLPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQGRLTLASMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQGRLTLASMET
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQSQVMLSQHSKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQSQVMLSQHSKAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 HPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMFKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMFKN
370 380 390 400 410
>>CCDS73751.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 (367 aa)
initn: 2495 init1: 2495 opt: 2495 Z-score: 2462.8 bits: 464.5 E(32554): 7.3e-131
Smith-Waterman score: 2495; 100.0% identity (100.0% similar) in 367 aa overlap (1-367:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METRPTALMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRWGLGEDPTGVSPSLQCRVCGDSSSGKHYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 METRPTALMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRWGLGEDPTGVSPSLQCRVCGDSSSGKHYG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGAGMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQAGMNQDAVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGAGMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQAGMNQDAVQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGHHFMASLITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGHHFMASLITA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGLDSIHETSARLLFMAVKWAKNLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGLDSIHETSARLLFMAVKWAKNLPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQGRLTLASMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQGRLTLASMET
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQSQVMLSQHSKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQSQVMLSQHSKAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 HPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMFKN
:::::::
CCDS73 HPSQPVR
>>CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 (422 aa)
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Smith-Waterman score: 1076; 43.3% identity (68.7% similar) in 409 aa overlap (16-410:21-419)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METRPTALMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRW-GLGEDPTGVSPSLQCRVCGDSS
: :. : . : : .: :.: : .. :.:::: :
CCDS69 MFRAGAEGAEKEPSPRPECRADPGPGLGFPLGSGLPWPSLLESPGGRILDIPCKVCGDRS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 SGKHYGIYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGA-GMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQAGM
::::::.:::.:::::::::.:: : :. : : :::::.:::::.::::::::...:
CCDS69 SGKHYGVYACDGCSGFFKRSIRRNRTYVCKSGNQGGCPVDKTHRNQCRACRLKKCLEVNM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NQDAVQNERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGHHF
:.::::.:: :: :. .. . . :. .: :.. : .:. ..:. : :
CCDS69 NKDAVQHERGPR-TSTIRKQVALYFRGHKEENGAAAHFPSAALP-APAFFTAVTQLEPHG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 MASLITAETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGL-----DSIHETSARLL
. .. : :: ..... :..: ...: : .:. :..::::
CCDS69 LELAAVSTT-----PERQTL-VSLAQPTPKYPHE--VNGTPMYLYEVATESVCESAARLL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FMAVKWAKNLPVFSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGG
::..::::..:.::.: ..::..:::.:: :::.:: ::..:.:. ::: .. .
CCDS69 FMSIKWAKSVPAFSTLSLQDQLMLLEDAWRELFVLGIAQWAIPVDANTLLAVSGMNGDNT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 AQGRLTLASMETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFK--P-----ETRGLKDPEH
. .:. : ..:::...::: : .: :::::.: .: :: : : :....
CCDS69 DSQKLNKIISEIQALQEVVARFRQLRLDATEFACLKCIVTFKAVPTHSGSELRSFRNAAA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 VEALQDQSQVMLSQHSKAHHPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPME
. ::::..:. :... ....:.:: ::::::::::.:: :. :: .::.:::::.:.
CCDS69 IAALQDEAQLTLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPALRSISPSTIEEVFFKKTIGNVPIT
360 370 380 390 400 410
410
pF1KB7 KLLCDMFKN
.:: ::.:.
CCDS69 RLLSDMYKSSDI
420
>>CCDS5063.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 (385 aa)
initn: 1058 init1: 377 opt: 1059 Z-score: 1048.5 bits: 202.9 E(32554): 4.4e-52
Smith-Waterman score: 1059; 43.7% identity (69.9% similar) in 389 aa overlap (38-410:4-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRWGLGEDPTGVSP---SLQCRVCGDSSSGKHYGIYAC
:.: . .. :.:::: :::::::.:::
CCDS50 MSKPAGSTSRILDIPCKVCGDRSSGKHYGVYAC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGA-GMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQAGMNQDAVQNERQ
.:::::::::.:: : :. : : :::::.:::::.::::::::...::.::::.::
CCDS50 DGCSGFFKRSIRRNRTYVCKSGNQGGCPVDKTHRNQCRACRLKKCLEVNMNKDAVQHERG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGHHFMASLITAETC
:: :. .. . . :. .: :.. : .:. ..:. : : . .. :
CCDS50 PR-TSTIRKQVALYFRGHKEENGAAAHFPSAALP-APAFFTAVTQLEPHGLELAAVSTT-
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB7 AKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGL-----DSIHETSARLLFMAVKWAKNL
:: ..... :..: ...: : .:. :..::::::..::::..
CCDS50 ----PERQTL-VSLAQPTPKYPHE--VNGTPMYLYEVATESVCESAARLLFMSIKWAKSV
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PVFSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQGRLTLASM
:.::.: ..::..:::.:: :::.:: ::..:.:. ::: .. . . .:.
CCDS50 PAFSTLSLQDQLMLLEDAWRELFVLGIAQWAIPVDANTLLAVSGMNGDNTDSQKLNKIIS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 ETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFK--P-----ETRGLKDPEHVEALQDQSQV
: ..:::...::: : .: :::::.: .: :: : : :.... . ::::..:.
CCDS50 EIQALQEVVARFRQLRLDATEFACLKCIVTFKAVPTHSGSELRSFRNAAAIAALQDEAQL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 MLSQHSKAHHPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMFKN
:... ....:.:: ::::::::::.:: :. :: .::.:::::.:. .:: ::.:.
CCDS50 TLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPALRSISPSTIEEVFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSS
330 340 350 360 370 380
CCDS50 DI
>>CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19 (404 aa)
initn: 955 init1: 573 opt: 633 Z-score: 628.7 bits: 125.3 E(32554): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 956; 41.1% identity (65.5% similar) in 397 aa overlap (14-408:21-390)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METRPTALMSSTVAAAAPAAGAASRKESPGRWGLGEDPTGVSPSLQ--CRVCG
:.. : :. . :: . .: :.:: : :::
CCDS12 MAMVTGGWGGPGGDTNGVDKAGGYPRAAEDDSASPPGAASDAEPGDEERPGLQVDCVVCG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DSSSGKHYGIYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGAGMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQA
:.:::::::...:.::..:::::.:: : : :. . : .:. :::::: ::::::...
CCDS12 DKSSGKHYGVFTCEGCKSFFKRSIRRNLSYTCRSNRD-CQIDQHHRNQCQYCRLKKCFRV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GMNQDAVQNERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGH
:: ..::: : :.: .. ... : : : .: : .: : :.:
CCDS12 GMRKEAVQRGRIPHSLP----GAVAASSGSPPGSALAAVASGGDLFPGQ-PVS-------
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HFMASLITAETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGLDSIHETSARLLFMA
...:.:. :: : : . .: .. .... :.:.. : .::::: .
CCDS12 ELIAQLLRAE------PYPAAAG--------RFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAARLLFST
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VKWAKNLPVFSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQG
:.::.. : : :: ::: ::. .:::::.:.: : .::: . :::: :: :
CCDS12 VEWARHAPFFPELPVADQVALLRLSWSELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAAPMAAE
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RLTLASMETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQSQV
: . ..:..:: .... : :: .:..:.::..:: :.. ::.:: :::.::...::
CCDS12 RAVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQV
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 MLSQHSKAHHPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMFKN
:... .:..:::: :::.::: ::.:: . : : ::: . .:.::.: :. ::.
CCDS12 ALTEYVRAQYPSQPQRFGRLLLRLPALRAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLSG
340 350 360 370 380 390
CCDS12 STFNWPYGSGQ
400
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:: : .. ....:.::.::::::: ::::: ... :: ::: . .:.::.: :. ::.
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410
pF1KB7 KN
CCDS45 LSGSSFNWPYMAIQ
250 260
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CCDS40 ELAARLLFSAVEWARNIPFFPDLQITDQVSLLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAA
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pF1KB7 EASAAGGAQGRLTLASMETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEH
:. . :.. . :..:: . ...:: :: .:..:.::.::: .. ::.: :
CCDS40 GLHASPMSADRVVAFMDHIRIFQEQVEKLKALHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDAAH
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pF1KB7 VEALQDQSQVMLSQHSKAHHPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPME
.:.::..:: : .. ....:.:: ::::::: ::::: ... :: ::: . .:.::.:
CCDS40 IESLQEKSQCALEEYVRSQYPNQPSRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIE
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410
pF1KB7 KLLCDMFKN
:. ::.
CCDS40 TLIRDMLLSGSSFNWPYMSIQCS
410 420
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180 190 200 210 220
pF1KB7 MASLITAETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSS--SPC---GLDSIHETSARLL
.:.: ..:. .: :...: : .::.:
CCDS45 HGQFALTNGDPLNCHSYLSGYISLLLRAEPYPTSRFGSQCMQPNNIMGIENICELAARML
30 40 50 60 70 80
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pF1KB7 FMAVKWAKNLPVFSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGG
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CCDS45 FSAVEWARNIPFFPDLQITDQVALLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAAGLHASPM
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pF1KB7 AQGRLTLASMETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQ
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CCDS45 SADRVVAFMDHIRIFQEQVEKLKALHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDVAHVESLQEK
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pF1KB7 SQVMLSQHSKAHHPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMF
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CCDS45 SQCALEEYVRSQYPNQPTRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDML
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410
pF1KB7 KN
CCDS45 LSGSSFNWPYMAIQ
270 280
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CCDS10 IECVVCGDKSSGKHYGQFTCEGCKSFFKRSVRRNLSYTCRANRN-CPIDQHHRNQCQYCR
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CCDS10 NGDPLNCHSYLSGYISLLLRAEPYP---------TS---RFGSQCMQPNNIMGIENICEL
170 180 190 200 210
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pF1KB7 SARLLFMAVKWAKNLPVFSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEA
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CCDS10 AARMLFSAVEWARNIPFFPDLQITDQVALLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAAGL
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pF1KB7 SAAGGAQGRLTLASMETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVE
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410
pF1KB7 LCDMFKN
. ::.
CCDS10 IRDMLLSGSSFNWPYMAIQ
400 410
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CCDS26 KSLRKPFGDFMEPKF--EFAVKFNALELDDSDLAIFIAVIILSGDRPGLLNVKPIEDIQD
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..:.
CCDS26 IYKDLY
410 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 05:28:42 2016 done: Sun Nov 6 05:28:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]