Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7309
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7309, 911 aa
1>>>pF1KB7309 911 - 911 aa - 911 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8449+/-0.000424; mu= 3.6511+/- 0.026
mean_var=174.0907+/-35.767, 0's: 0 Z-trim(117.7): 211 B-trim: 1284 in 2/50
Lambda= 0.097205
statistics sampled from 29745 (30017) to 29745 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 13.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 6079 865.5 0
XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 4417 632.4 2.2e-180
XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 4417 632.4 2.2e-180
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 3148 454.5 1e-126
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 3148 454.5 1e-126
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 3148 454.5 1e-126
NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated c ( 500) 1304 195.8 4.5e-49
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494) 1223 184.4 1.2e-45
XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 1113 169.0 4.9e-41
XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 1113 169.0 4.9e-41
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466) 1113 169.0 4.9e-41
XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 1113 169.0 4.9e-41
XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509) 1113 169.0 5.3e-41
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425) 1040 158.7 5.5e-38
NP_036413 (OMIM: 605410) potassium voltage-gated c ( 630) 943 145.2 9.5e-34
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 912 140.8 1.6e-32
XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 912 140.8 1.6e-32
XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 912 140.8 1.6e-32
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 912 140.8 1.6e-32
NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647) 902 139.5 5.2e-32
XP_011542212 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 647) 902 139.5 5.2e-32
NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477) 864 134.1 1.6e-30
XP_016884998 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558) 841 130.9 1.7e-29
XP_016884997 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558) 841 130.9 1.7e-29
XP_006723848 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527108 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527107 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527105 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527104 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527103 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527102 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011527106 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 820 127.9 1.2e-28
NP_002228 (OMIM: 603788) potassium voltage-gated c ( 513) 820 127.9 1.2e-28
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 808 126.2 3.9e-28
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 808 126.2 3.9e-28
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 808 126.2 3.9e-28
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 808 126.2 3.9e-28
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 808 126.2 3.9e-28
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 808 126.2 3.9e-28
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499) 808 126.2 3.9e-28
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575) 777 121.9 9e-27
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636) 770 120.9 1.9e-26
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 636) 770 120.9 1.9e-26
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495) 762 119.8 3.4e-26
NP_114092 (OMIM: 176268) potassium voltage-gated c ( 456) 753 118.5 7.6e-26
NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated c ( 519) 742 117.0 2.5e-25
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510) 741 116.8 2.7e-25
XP_016856733 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 741 116.9 3.3e-25
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655) 741 116.9 3.3e-25
XP_006710692 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 741 116.9 3.3e-25
>>NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated chann (911 aa)
initn: 6079 init1: 6079 opt: 6079 Z-score: 4617.0 bits: 865.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6079; 100.0% identity (100.0% similar) in 911 aa overlap (1-911:1-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SKGLSPRFPKQKLFPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SKGLSPRFPKQKLFPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 GRDPLREEGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GRDPLREEGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGD
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB7 TGYCPTRETSM
:::::::::::
NP_004 TGYCPTRETSM
910
>>XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium volta (666 aa)
initn: 4417 init1: 4417 opt: 4417 Z-score: 3359.4 bits: 632.4 E(85289): 2.2e-180
Smith-Waterman score: 4417; 100.0% identity (100.0% similar) in 666 aa overlap (246-911:1-666)
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 PELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAIL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAIL
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLK
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 DAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEV
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 SQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIE
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 MEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPT
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 DLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDN
400 410 420 430 440 450
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 ATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFKENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFKENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTI
460 470 480 490 500 510
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 LLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGPSKGLSPRFPKQKLFPFSSRERRSFTEIDTGDDEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGPSKGLSPRFPKQKLFPFSSRERRSFTEIDTGDDEDF
520 530 540 550 560 570
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 LELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSDGRDPLREEGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSDGRDPLREEGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVK
580 590 600 610 620 630
880 890 900 910
pF1KB7 KDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGDTGYCPTRETSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGDTGYCPTRETSM
640 650 660
>>XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium volta (666 aa)
initn: 4417 init1: 4417 opt: 4417 Z-score: 3359.4 bits: 632.4 E(85289): 2.2e-180
Smith-Waterman score: 4417; 100.0% identity (100.0% similar) in 666 aa overlap (246-911:1-666)
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 PELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAIL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAIL
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNEL
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGK
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLK
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 DAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEV
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 SQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIE
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 MEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPT
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 DLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
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pF1KB7 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
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XP_011 SSIDSFISCATDFPEATRF-------SHSPL---TSLPSKTGGSTA---PEVGWRGALG-
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pF1KB7 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
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XP_011 -ASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF----FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFM
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pF1KB7 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
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XP_011 EG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTAS
680 690 700 710 720 730
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pF1KB7 SKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADK
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XP_011 AK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDDEGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPK
740 750 760 770 780
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pF1KB7 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI
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XP_011 FSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDV
790 800 810 820 830 840
900 910
pF1KB7 HSNPGDTGYCPTRETSM
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XP_011 RVLPGGGAHGSTRDQSI
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pF1KB7 TH----------ESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
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NP_055 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
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pF1KB7 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL-----RREAETMREREGEEFDNTCCP
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NP_055 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESE-QDFSQGPCP
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pF1KB7 DKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQL
:.:::..::::.::.::.:....::.:.:.: : ..: . ::. : :: :
NP_055 TVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--QL-----L
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
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NP_055 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
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NP_055 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
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NP_055 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB7 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNLKDAFARS-MELID
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NP_055 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 VAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNN
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NP_055 L---KGRERASTRSSGGDDFWF
490 500
>>NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated chann (494 aa)
initn: 1196 init1: 873 opt: 1223 Z-score: 940.7 bits: 184.4 E(85289): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1223; 40.6% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (22-481:10-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
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NP_002 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 LGKLRDC--NTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
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NP_002 LAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
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pF1KB7 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKK
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NP_002 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKC
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pF1KB7 LWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEA
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NP_002 VWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVET
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 VCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRR
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NP_002 ACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQ
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pF1KB7 VVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEK
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NP_002 AVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQ
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pF1KB7 DEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN
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NP_002 SHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIIN
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 NFSEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESAN
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NP_002 NFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGG----EGKTGGSRS-DLDNLPPEPAGKEAP
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pF1KB7 TKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSA
. .:
NP_002 SCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
470 480 490
>>XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
initn: 941 init1: 398 opt: 1113 Z-score: 857.7 bits: 169.0 E(85289): 4.9e-41
Smith-Waterman score: 1113; 40.6% identity (74.2% similar) in 419 aa overlap (32-441:14-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 AEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRL
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10 20 30 40
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pF1KB7 GKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQ
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XP_011 ERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRD
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pF1KB7 ELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDK----RK
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XP_011 ELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRR
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 KLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHV
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XP_011 RLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVL
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pF1KB7 EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQ
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XP_011 ETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLE
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pF1KB7 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
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XP_011 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH
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pF1KB7 FAEKDEDATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPI
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XP_011 LAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPV
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pF1KB7 PIIVNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKA
: ..::. :.: : .:..: . . ::.
XP_011 TSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALW
410 420 430 440 450 460
>>XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
initn: 941 init1: 398 opt: 1113 Z-score: 857.7 bits: 169.0 E(85289): 4.9e-41
Smith-Waterman score: 1113; 40.6% identity (74.2% similar) in 419 aa overlap (32-441:14-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 AEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRL
: .:.: ::::: .. : .: : : .::
XP_011 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARL
10 20 30 40
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pF1KB7 GKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQ
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XP_011 ERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRD
50 60 70 80 90 100
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pF1KB7 ELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDK----RK
:: :::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :.
XP_011 ELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRR
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 KLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHV
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XP_011 RLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVL
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQ
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XP_011 ETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLE
230 240 250 260 270 280
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XP_011 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH
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pF1KB7 FAEKDEDATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPI
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350 360 370 380 390 400
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]