Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7153
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7153, 353 aa
1>>>pF1KB7153 353 - 353 aa - 353 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7875+/-0.000999; mu= 13.9294+/- 0.059
mean_var=196.9248+/-79.816, 0's: 0 Z-trim(105.9): 124 B-trim: 1193 in 2/47
Lambda= 0.091395
statistics sampled from 8442 (8694) to 8442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 2306 317.4 1.1e-86
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 1006 146.0 4.7e-35
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 814 120.7 2e-27
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 691 104.5 1.5e-22
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 674 102.3 7.3e-22
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 546 85.4 8.4e-17
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 535 83.9 2.3e-16
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 532 83.5 3e-16
CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 413 67.8 1.6e-11
CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 413 67.9 1.6e-11
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 394 65.3 8.6e-11
>>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 2306 init1: 2306 opt: 2306 Z-score: 1669.4 bits: 317.4 E(32554): 1.1e-86
Smith-Waterman score: 2306; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAPQTLALLKTVTIVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAPQTLALLKTVTIVLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 RPLQCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEGNTVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RPLQCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEGNTVV
310 320 330 340 350
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 967 init1: 693 opt: 1006 Z-score: 742.8 bits: 146.0 E(32554): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 1006; 47.9% identity (77.7% similar) in 336 aa overlap (14-341:18-349)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYT-KETLETQETT-SRQVASAFIVILCCAIVVENLLV
..:::.:. : . . .:.. . .........: ::.:::.:
CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGKLAGRLKEASEGSTLTTVLFLVICSFIVLENLMV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFI
:::. .:.:::. ::.:.:::: :::::.:. .: :.::. :. :.:. :: :::: :.
CCDS66 LIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFLREGSMFV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLG
.:.::. ::::::::::... :.. : ..: :..:::: :::...::.:::::::::
CCDS66 ALGASTCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALPILGWNCLH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMA----APQTLA
.: :::.::::.:.:. ..::. ::..:: ::.::: .:.:: .: . ...:
CCDS66 NLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAILVTIVILYARIYFLVKSSSRKVANHNNSERSMA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTW
::.::.::..:::.:: : : ..:.: :: :..::::.::..:.....::: .::::::
CCDS66 LLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDVACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNSAMNPVIYTL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB7 RSRDLRREVLRPLQCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLL-PLRS-SSSLERGMHMPTSPTFLE
:...:: .: : : . :.:: ..: . : : :: ::: . . : :
CCDS66 ASKEMRRAFFR-LVC---NCLVRGRGARASPIQPALDPSRSKSSSSNNSSHSPKVKEDLP
310 320 330 340 350
350
pF1KB7 GNTVV
CCDS66 HTAPSSCIMDKNAALQNGIFCN
360 370
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 1101 init1: 747 opt: 814 Z-score: 605.9 bits: 120.7 E(32554): 2e-27
Smith-Waterman score: 1091; 48.4% identity (78.6% similar) in 345 aa overlap (3-333:14-358)
10 20 30 40
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYT-KETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIV
: :.:.: . . .::::: : .. ... .: ...:. ....:: :.
CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VENLLVLIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAR
.::..::... ...::: :: :.:::: ::::::::..:: ::::..: .:::.::: :
CCDS77 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 EGSAFITLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPIL
::: :..:::::::::::::::.... :.::...... :..:::.: :.:::.::::::.
CCDS77 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB7 GWNCLGHLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRS----------
::::.. : .:::::::: :::.: .:.:...::.:: :: ::: .::.
CCDS77 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -SHADMAAPQTLALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVS
:.:. .. ..::::::: :::.:::.:: : : .:::: .: :..: ::..:.::....
CCDS77 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 TLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWR-PGVGVQGR-RRGGTPGHHLLPLRSSSSLE
.::: ::.::: ....:: .: ..: . :. :. .: : .. .:..:
CCDS77 VLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSSH
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB7 RGMHMPTSPTFLEGNTVV
CCDS77 PQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
370 380
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 653 init1: 277 opt: 691 Z-score: 518.2 bits: 104.5 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 691; 41.8% identity (70.4% similar) in 280 aa overlap (41-314:54-333)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 PNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVARNSKFHSAMYL
: : .:.:::::: :.. . . . .:
CCDS12 LIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYY
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 FLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASVFSLLAIAIER
: :.. ::::.:.:..::.::::. :.::.:.::: ::: : .:.::.:::: : ::
CCDS12 CLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGER
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180
pF1KB7 HVAIAK-VKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACSTVLPLYAKH
..... : :. :. :. .:: ::.. .:: ::.:::::: .. ::..::::.:.
CCDS12 FATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKR
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAP----QTLALLKTVTIVLGVFIVC
:.: ..::. .: .:..:: :. .:..: : .. ::::: ..: .:.::
CCDS12 YILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVC
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 WLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQ
: : :..:: : .. . . : ...:...::: .::.::..:::.. : :: :
CCDS12 WGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLC
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KB7 CWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEGNTVV
: .:..:
CCDS12 CGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRS
330 340 350 360 370 380
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 950 init1: 643 opt: 674 Z-score: 506.0 bits: 102.3 E(32554): 7.3e-22
Smith-Waterman score: 943; 48.0% identity (70.8% similar) in 329 aa overlap (4-311:1-329)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQE----HYNYT-KETLETQETTSRQVASAFIVILCCA-IVVENLLV
. : : : :.: ::::: : . . :.: . . :: ::.::: :
CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLAVCAFIVLENLAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFI
:....:. .::. :.:.::.:. ::::::.:..:: :::: .::.:.:. ::::::..:.
CCDS12 LLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFAREGGVFV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLG
.:.:::.::::::.:: ...:. .. : : . .:.: .::.:: :: :::::::
CCDS12 ALTASVLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLPALGWNCLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 HLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAA---------
.:.::::::::::: ::: : : :: :: :::.:::: ::.. . :
CCDS12 RLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPARPGTAGTTS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB7 ------PQTLALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVSTL
:..::::.:...:: .:..:: : : .:::: :::...::.: .: :....
CCDS12 TRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDVACPARTCPVLLQADPFLGLAMA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 NSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMH
::::::.::: .::::. .:: . : : . :
CCDS12 NSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCGRDPSGSQQSASAAEASGGLRRCLPPGLD
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KB7 MPTSPTFLEGNTVV
CCDS12 GSFSGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
360 370 380 390
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 615 init1: 425 opt: 546 Z-score: 415.1 bits: 85.4 E(32554): 8.4e-17
Smith-Waterman score: 687; 34.5% identity (67.4% similar) in 322 aa overlap (18-326:34-352)
10 20 30 40
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAI
:: . . : :. .: ... .. . .: :
CCDS67 ISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVCIFI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VVENLLVLIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFA
.. ::::..:. : .:: .: ...::::.:..::.:. . .: : ::: :.
CCDS67 MLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVSTWLL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 REGSAFITLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPI
:.: .:.::: .:::::::::... ...:. .. :....: . : ...:.:..:
CCDS67 RQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGAIPS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 LGWNCLGHLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAI-VALYVRIYCVVRSSHADMA--
.::::. .: ::.. :::. : : .::... ... :.::..:. ::. :.
CCDS67 VGWNCICDIENCSNMAPLYSDSY-LVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMSRH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB7 --APQT-----LALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVS
.:. ..:::::.::::.::.:: :.. .:::: :: .: .: ..:. ..
CCDS67 SSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCP--QCDVLAYEKFFLLLA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 TLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWR---PGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSL
.:: .::.::..:.... . : : : : ..: :... .: .
CCDS67 EFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSND
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB7 ERGMHMPTSPTFLEGNTVV
CCDS67 HSVV
>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa)
initn: 601 init1: 436 opt: 535 Z-score: 407.4 bits: 83.9 E(32554): 2.3e-16
Smith-Waterman score: 639; 32.7% identity (67.9% similar) in 315 aa overlap (9-306:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILC-----CAIVV-ENLLV
.: . ..:... . .: .:.. ... ....:: : .. : ::
CCDS70 MNECHYDKHMDFFYNRSNT-DTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFI
. :: .: ::: .: .:.::::.:..::.:.: . .: :. :: .:: :.:
CCDS70 IAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLG
.:.::. .::.::.:::..: ....... . :. ::: : :.. .:..: ::::::
CCDS70 SLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 HLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAPQT------
.. :::.. :.:.. :.. .. . .: .:..:.::: :. . ... .:.:
CCDS70 NISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRK-TNVLSPHTSGSISR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 ----LALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLL
. :.::: :::.:.::: :.. .:::: : ..: . . ..:. .. :::..
CCDS70 RRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNC--RQCGVQHVKRWFLLLALLNSVV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 NPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTS
::.::.....:. . . . :.
CCDS70 NPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVC
290 300 310 320 330 340
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 629 init1: 437 opt: 532 Z-score: 405.3 bits: 83.5 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 648; 37.3% identity (63.3% similar) in 327 aa overlap (18-327:17-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVAR
:: . . : .. . :. :. . . ... ::::. :.:
CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASV
: .::. .: .::::::.::.::::.. . .: : ::. :: :.: .:.:::
CCDS12 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACS
.:::::.::: .. :.:.. :...:: . :. .: :: :: .:.:: :. ::
CCDS12 ATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 TVLPLYAKHYVLCVVTIFSI-ILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAA-----PQ----TLA
. :: .. : : : .. :. ..: .::.:.::. :: :: :. ::.
CCDS12 RMAPLLSRSY-LAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 LLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYT
:.:::.:.::.:.::: :. .:::: .: .:: .: .::. .. :::.: ..:.
CCDS12 LVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGC--ESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 WRSRDLRREVLRPLQCW------RPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTS
:. ..:: : : : : .: . .::. . .::
CCDS12 CRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL
300 310 320 330 340 350
350
pF1KB7 PTFLEGNTVV
>>CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (362 aa)
initn: 365 init1: 176 opt: 413 Z-score: 320.4 bits: 67.8 E(32554): 1.6e-11
Smith-Waterman score: 445; 34.1% identity (62.2% similar) in 296 aa overlap (41-315:77-357)
20 30 40 50 60
pF1KB7 PNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVV---ENLLVLIAVARNSKFHSA
:.:: . .: :: ::. .: . ...
CCDS50 GGGANGSLELSSQLSAGPPGLLLPAVNPWDVLLCVSGTVIAGENALVVALIASTPALRTP
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTL---LSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASVFSLL
:....:.::..::::: ... . . : : :. : : : ...::: :::
CCDS50 MFVLVGSLATADLLAGCGLILHFVFQYLVPSETVSLLTV------GFLVASFAASVSSLL
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRML-LLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACSTVL
::...:.... .. : : .. . ::..:.: .:: :: ::.::::::.. :::.:
CCDS50 AITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATWTVSLGLGLLPVLGWNCLAERAACSVVR
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230
pF1KB7 PLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHAD--------MAAPQTLALLK--
:: .: .: ...: ... .. ::::: : : :: .: :. : :
CCDS50 PLARSHVALLSAAFF-MVFGIMLHLYVRI-CQVVWRHAHQIALQQHCLAPPHLAATRKGV
230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 -TVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPV--HSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTW
:...:::.: . ::: :.: : : : : .: .. . .: ::..::.::..
CCDS50 GTLAVVLGTFGASWLP-FAIY-----CVVGSHEDPAVY-TYATLLPATYNSMINPIIYAF
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KB7 RSRDLRREVLRPL-QCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEG
:.....: . : :.. : ..:
CCDS50 RNQEIQRALWLLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV
340 350 360
>>CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (377 aa)
initn: 365 init1: 176 opt: 413 Z-score: 320.2 bits: 67.9 E(32554): 1.6e-11
Smith-Waterman score: 445; 34.1% identity (62.2% similar) in 296 aa overlap (41-315:92-372)
20 30 40 50 60
pF1KB7 PNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVV---ENLLVLIAVARNSKFHSA
:.:: . .: :: ::. .: . ...
CCDS69 GGGANGSLELSSQLSAGPPGLLLPAVNPWDVLLCVSGTVIAGENALVVALIASTPALRTP
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTL---LSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASVFSLL
:....:.::..::::: ... . . : : :. : : : ...::: :::
CCDS69 MFVLVGSLATADLLAGCGLILHFVFQYLVPSETVSLLTV------GFLVASFAASVSSLL
130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRML-LLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACSTVL
::...:.... .. : : .. . ::..:.: .:: :: ::.::::::.. :::.:
CCDS69 AITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATWTVSLGLGLLPVLGWNCLAERAACSVVR
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230
pF1KB7 PLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHAD--------MAAPQTLALLK--
:: .: .: ...: ... .. ::::: : : :: .: :. : :
CCDS69 PLARSHVALLSAAFF-MVFGIMLHLYVRI-CQVVWRHAHQIALQQHCLAPPHLAATRKGV
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 -TVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPV--HSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTW
:...:::.: . ::: :.: : : : : .: .. . .: ::..::.::..
CCDS69 GTLAVVLGTFGASWLP-FAIY-----CVVGSHEDPAVY-TYATLLPATYNSMINPIIYAF
300 310 320 330 340
300 310 320 330 340
pF1KB7 RSRDLRREVLRPL-QCWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEG
:.....: . : :.. : ..:
CCDS69 RNQEIQRALWLLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV
350 360 370
353 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 13:26:14 2016 done: Sun Nov 6 13:26:14 2016
Total Scan time: 2.410 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]