Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7152
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7152, 351 aa
1>>>pF1KB7152 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6095+/-0.00114; mu= 14.7196+/- 0.068
mean_var=128.6526+/-38.096, 0's: 0 Z-trim(104.1): 263 B-trim: 1014 in 2/47
Lambda= 0.113075
statistics sampled from 7345 (7719) to 7345 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 2313 389.4 2.4e-108
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 1712 291.3 8e-79
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 1610 274.7 8.1e-74
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 ( 356) 741 132.9 3.9e-31
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 719 129.4 4.8e-30
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 719 129.4 4.8e-30
CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 ( 333) 643 116.9 2.4e-26
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 642 116.8 3e-26
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 568 104.7 1.2e-22
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 530 98.5 9e-21
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 530 98.6 9.4e-21
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 530 98.6 9.5e-21
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 508 95.1 1.3e-19
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 502 94.0 2.1e-19
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 500 93.6 2.7e-19
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 500 93.6 2.7e-19
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 474 89.4 5.2e-18
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 458 86.8 3.3e-17
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 452 85.9 6.7e-17
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CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 451 85.7 7.2e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 451 85.7 7.3e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 451 85.7 7.3e-17
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 451 85.7 7.4e-17
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 451 85.7 7.5e-17
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 451 85.7 7.5e-17
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 451 85.8 7.8e-17
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 451 85.8 8.3e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 434 82.9 4.8e-16
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 423 81.1 1.7e-15
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 417 80.1 3.2e-15
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 413 79.3 4.5e-15
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 413 79.4 4.6e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 412 79.3 5.7e-15
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 407 78.5 9.7e-15
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 406 78.3 1.1e-14
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 404 78.0 1.5e-14
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 402 77.6 1.7e-14
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 401 77.5 2e-14
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 400 77.3 2.2e-14
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 389 75.5 7.6e-14
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 386 75.0 1.1e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 384 74.8 1.4e-13
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 380 74.1 2.1e-13
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 379 73.9 2.5e-13
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 372 72.7 4.9e-13
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 373 73.1 5.4e-13
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 370 72.4 6.6e-13
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 367 71.8 7.9e-13
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 367 71.9 9.1e-13
>>CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 2313 init1: 2313 opt: 2313 Z-score: 2058.5 bits: 389.4 E(32554): 2.4e-108
Smith-Waterman score: 2313; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSCLNPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSCLNPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 LYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
310 320 330 340 350
>>CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 (353 aa)
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Smith-Waterman score: 1712; 72.2% identity (89.0% similar) in 353 aa overlap (1-351:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
:::::: :::: ::: : ::.::: :. :.: :::::.::::::::::::::::::::.
CCDS12 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
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CCDS12 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
::::::::::.:::::::.::: .:..: ::...::::: :.: ::.. :::::: :::
CCDS12 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
: :: : :::.: ::: . :..:.::::.::::...:::.::::::.. ::::::::
CCDS12 AFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSCLNPM
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CCDS12 RVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLNPI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 LYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSE--DSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
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CCDS12 LYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETELQAM
310 320 330 340 350
>>CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 (350 aa)
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Smith-Waterman score: 1610; 68.9% identity (86.6% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
:::: : : : . :::: : :. .:..::::::::::::::::::::::.:::
CCDS12 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
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CCDS12 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
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CCDS12 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACTFNF
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
. : . :.::..::..:::.::::::.:::: ::::::. :::::.::::.:.:::::::
CCDS12 SPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSCLNPM
:::. :.:.::.:: :.:.:::..:: ..:.: : :: : : :. ::.:::::::::::
CCDS12 RVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELL-QGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLNPM
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 LYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
::::.::::::::::.::.::::::.:::. :.:::.::. : ::.::::
CCDS12 LYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 (356 aa)
initn: 726 init1: 222 opt: 741 Z-score: 672.5 bits: 132.9 E(32554): 3.9e-31
Smith-Waterman score: 741; 40.5% identity (70.7% similar) in 304 aa overlap (25-328:42-342)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFR
:: : .:.:....:.::::::::.:.. ::
CCDS12 SDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVFR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MTRTVTTICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVF
:.:::.:.:...:::::: .. .:: . . . ....: .: . ::: : .. :.:
CCDS12 MARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLP-IAMYYIVSRQWLLGEWACKLYITFVFLSYFASNC
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LIGFIALDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDT
:. ::..:::: ::.:::: :::::. : . : :.:: .: . : :: :: :
CCDS12 LLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRTTRKW-NGCT
140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YCTFNFASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMI
.: . : : . : . .. .. : .:..:: :..:.. : :: ::. ..: .
CCDS12 HCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLREGWV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KSSRPLRVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFN
...:: :.: ..:..::: : ::..: :: .: . :: . . .... . .:. :
CCDS12 HANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVV-LLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQASFALGCVN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SCLNPMLYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
: :::.::::::.::.:....:: ..: ::..:.
CCDS12 SSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
310 320 330 340 350
>>CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (371 aa)
initn: 603 init1: 431 opt: 719 Z-score: 652.9 bits: 129.4 E(32554): 4.8e-30
Smith-Waterman score: 719; 37.2% identity (68.8% similar) in 317 aa overlap (24-333:36-344)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGF
: ::. .:: ... ::.::::::: .: :
CCDS41 YNTSISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RMTRTVTTICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSV
.: .::. . .::::.::: :.. ::. :. :: .: :: .::. .... :.: ::
CCDS41 KMKKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FLIGFIALDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGD
::. .:. :::: :: :::.::::.: ::. . . :.::. :. : ..: :... .:
CCDS41 FLLTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANL-HGK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 TYCTFNFA-------SWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAA
: ::. :: : . :. . . . ::. :: .:. :.. :: :.
CCDS41 ISCFNNFSLSTPGSSSWP-THSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACYLTIVC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 KIHKKGMIKSSRPLRVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNP
:.... . :...:........ .::.:: :.. . :: :.. . :. .... .
CCDS41 KLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLE---LHHTAMPGS--VFSLGLPL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 TSSLAFFNSCLNPMLYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAET
...::. :::.::.::::.::::.. . .: . : :::::.. ..
CCDS41 ATALAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKV-ALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSM
300 310 320 330 340 350
350
pF1KB7 ELQAM
CCDS41 NERTSMNERETGML
360 370
>>CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (373 aa)
initn: 603 init1: 431 opt: 719 Z-score: 652.9 bits: 129.4 E(32554): 4.8e-30
Smith-Waterman score: 719; 37.2% identity (68.8% similar) in 317 aa overlap (24-333:38-346)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGF
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: ::. :: : . :. . . . ::. :: .:. :.. :: :.
CCDS44 ISCFNNFSLSTPGSSSWP-THSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACYLTIVC
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350
pF1KB7 ELQAM
CCDS44 NERTSMNERETGML
360 370
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CCDS79 LTCPDMLRKLRRSLRTVLESVLVDDSELGGAGSSRRRRTSSTARSASPLALCSRPEEPRG
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350
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]