FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7143, 337 aa
1>>>pF1KB7143 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3931+/-0.0011; mu= 15.0281+/- 0.066
mean_var=95.3909+/-26.534, 0's: 0 Z-trim(102.7): 310 B-trim: 844 in 2/47
Lambda= 0.131317
statistics sampled from 6627 (7053) to 6627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 2234 434.3 6.9e-122
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CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 641 132.5 5e-31
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 634 131.2 1.3e-30
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 598 124.3 1.4e-28
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 598 124.4 1.5e-28
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CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 517 109.0 5.6e-24
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 514 108.4 8.9e-24
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 505 106.8 3e-23
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 492 104.3 1.6e-22
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CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 491 104.1 1.9e-22
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CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 490 103.9 2.1e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 491 104.2 2.1e-22
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CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 491 104.2 2.3e-22
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 486 103.1 3.5e-22
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 477 101.4 1.1e-21
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CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 477 101.4 1.2e-21
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 477 101.5 1.2e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 477 101.5 1.2e-21
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 475 101.1 1.5e-21
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CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 473 100.6 1.9e-21
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CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 471 100.3 2.6e-21
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CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 468 99.7 3.8e-21
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 468 99.8 4.2e-21
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 467 99.6 4.5e-21
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 463 98.8 7.2e-21
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 463 98.8 7.5e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 461 98.4 9.2e-21
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 460 98.2 1.1e-20
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 459 98.0 1.3e-20
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 457 97.6 1.6e-20
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 2234 init1: 2234 opt: 2234 Z-score: 2301.7 bits: 434.3 E(32554): 6.9e-122
Smith-Waterman score: 2234; 99.7% identity (99.7% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNNTKCFEPPQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNNTKCFEPPQDN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKKNLSSHKKAIGMIMVVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKKNLSSHKKAIGMIMVVTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLTMQKSVVITLSLAASNCCFDPLLYFFSGG
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLRMQKSVVITLSLAASNCCFDPLLYFFSGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB7 NFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
310 320 330
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
initn: 691 init1: 377 opt: 736 Z-score: 767.8 bits: 150.5 E(32554): 1.9e-36
Smith-Waterman score: 736; 37.1% identity (72.4% similar) in 315 aa overlap (1-311:17-322)
10 20 30 40
pF1KB7 MDETGNLTVS-SATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGF
:. .:... . : .: ::..:. . . .: .: : .:::.
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNC--TIENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VLYVLIKTYHKKSAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYAL
.::... :.:... .:.:.:::..::: . :::.:. ::.. . :.:::. ::. .:.:
CCDS94 SIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSL
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 YVNLYCSIFFMTAMSFFRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKP
:::.: ::.:.:..: : .:.: : . ..... ..: ..: :::. :..:: .:. .
CCDS94 YVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWIL-IMASSIMLLDSG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 QKDEKNNTKCFEPPQDNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKK
.... . :.:.: . .: . ...:..: :: ..:: . .:: .:: .::: . .
CCDS94 SEQNGSVTSCLELNLYKIAK--LQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVPE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 N--LSSHKKAIGMIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLTMQKSVVITL
. ::.::. :... :.. :.::: ::.:: .. : . ..:..::::
CCDS94 SGLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTW--KVGLCKD--RLHKALVITL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB7 SLAASNCCFDPLLYFFSGGNFRKRL-STFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
.:::.: ::.::::.:.: ::. :: :..::
CCDS94 ALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALRKGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETRV
300 310 320 330 340
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
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Smith-Waterman score: 641; 32.7% identity (70.3% similar) in 303 aa overlap (7-306:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
..:.:. : . :.:. .:. ..::. :.:...: ..:..: . . .. .
CCDS94 MVSVNSSHCFYN-DSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNETTT
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::::::..::: : :::.:. :.. .. : :::.::..:.. .:.:.: ::.:.: .:
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pF1KB7 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNNTK--CFEPPQ
: .:::.: .. .: :...:..::.:.:. :: :.: .... ... ::.. :::
CCDS94 RFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNASEACFENFP
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKK-SMKKNLSSHKKAIGMIMV
. :... . .:::.::... ..: .:.. :: : ..... .. :.. ::.:
CCDS94 EATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKTKVLKMIFV
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pF1KB7 VTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLTMQKSVVITLSLAASNCCFDPLLYFF
: :.::.:. .. . :. : ... ::: .:.:::::::..:.:
CCDS94 HLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPIVYYF
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300 310 320 330
pF1KB7 SGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
.. .... .
CCDS94 TSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
300 310 320 330 340
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 527 init1: 424 opt: 634 Z-score: 663.0 bits: 131.2 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 634; 32.0% identity (66.8% similar) in 331 aa overlap (10-334:38-357)
10 20 30
pF1KB7 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFF
:: : : :. ..: .. ..::.
CCDS31 AVPNGTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GNGFVLYVLIKTYHKK--SAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCR
::. ...... .: : :...:::.:::.::.: : ::: . :: .: :.::: .:.
CCDS31 GNSVAIWMFV--FHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFFRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSP
:. . ..:::: ::.:.: .: : ..:.:..... . .:.: . : .:..:... ::
CCDS31 LQRFIFHVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FLMAKPQKDEKNNT-KCFEPPQDNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTL
.:. . .::.: :.. .:. ... .. . . . : .:.:.:. :: .:. .:
CCDS31 ILFYSGTGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSY-FIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRAL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LKKSMKKNLSSHKKAIGMIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKP--CDSVLTMQ
. :.. : ..:.: ....: ..: ::..:.:...:..:. . : : .
CCDS31 IYKDLD-NSPLRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVY
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KSVVITLSLAASNCCFDPLLYFFSGGNFRKRLS-TFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEE
. .: .::. : : ::.:::..: .::.::: . :: : :..:.: :.:.
CCDS31 ATYQVTRGLASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASR-------RSEANLQSKSED
310 320 330 340 350
pF1KB7 ICKV
.
CCDS31 MTLNILPEFKQNGDTSL
360 370
>>CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX (333 aa)
initn: 482 init1: 209 opt: 598 Z-score: 626.7 bits: 124.3 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 598; 32.7% identity (63.5% similar) in 318 aa overlap (20-329:16-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQV
::: .:.. :..: : :..:: ..:.:. ... . .
CCDS14 MPANYTCTRPDGDNTDFRYFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYMKETKRAVI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFF
.:::::.:::: : .::::. ::... : :: :: . : :::.: ::.:.. .:
CCDS14 FMINLAIADLLQVLSLPLRIFYYLNHD-WPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIYFLVCISVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNN-TKCF-EPPQ
: ...: . .. :: .. .. :... :. : . . . : ..: :::: . :
CCDS14 RFWFLMYPFR-FHDCKQKYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRTKCFVDLPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKK-SMKKNLSSHKKAIGMIMV
: . . .:. .. ..::. :..:.. : .:.: : : ..:. ..::. ::..
CCDS14 RNVNLAQSVVMMTIGELIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSLQDKYPMAQDLGEKQKALKMILT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLTMQKSVVITLSLAASNCCFDPLLYFF
...::. : :::.. . . :: : : . .. ..: ::. : :.::..:.:
CCDS14 CAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNEIKSCLARRVILIFHSVALCLASLNSCLDPVIYYF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB7 SGGNFRKRLSTFRKHS---LSSVTYVPRKKASL--PEKGEEICKV
: ..::.::: :. : . ..: . :: ::
CCDS14 STNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
300 310 320 330
>>CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 (361 aa)
initn: 518 init1: 360 opt: 598 Z-score: 626.3 bits: 124.4 E(32554): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 598; 29.3% identity (67.8% similar) in 311 aa overlap (30-334:38-346)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQ
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CCDS94 DRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERITCMEYPNF
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CCDS94 EETKSLPWIL-LGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNKKALNTI
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CCDS94 ILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFNCCMDPF
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CCDS94 IYFFACKGYKRKVMRMLKRQVS-VSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNGK
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40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 TLLKKSMKKNLSSHKKAIGMIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLTMQ
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CCDS21 SL-RQGLRVEKRLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILA
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CCDS21 LANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAK
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pF1KB7 CKV
CCDS21 SEL
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CCDS14 SVSLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRH-WPFGDTLCKISGT
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CCDS14 AFLTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLF
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CCDS14 STTNVNNATTTCFEGFSKRVWKTY---LSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRK
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CCDS14 PATLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYN--SVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKI
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CCDS14 MYPITLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQE
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pF1KB7 EICKV
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CCDS14 EVSDQTTNNGGELMLESTF
360 370
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CCDS31 NEIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLG
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CCDS31 VTRCFEHYEKGSVP--VLIIHIFIVFSFFLV-FLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEV
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CCDS31 KRRALWMVCTVLAVFIICFVPHHV---VQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLS
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CCDS31 TNCVLDPVIYCFLTKKFRKHL-TEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
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CCDS82 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVPGLCLNAVALYIFLC
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CCDS82 RLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCS
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CCDS82 ILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARGGR
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CCDS82 RAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSF-RSLDLSCHTLNAINMAYKVTRPLAS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]