Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7141
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7141, 337 aa
1>>>pF1KB7141 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4958+/-0.00143; mu= 14.8538+/- 0.084
mean_var=185.8890+/-68.973, 0's: 0 Z-trim(100.1): 288 B-trim: 787 in 2/43
Lambda= 0.094069
statistics sampled from 5504 (5991) to 5504 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 2251 319.2 3e-87
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 798 122.1 7.2e-28
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 648 101.7 9.7e-22
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 516 83.8 2.4e-16
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 502 81.9 9e-16
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CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 485 79.5 4.3e-15
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 478 78.7 8.6e-15
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 473 78.0 1.4e-14
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 454 75.5 8.8e-14
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 450 74.9 1.2e-13
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 447 74.4 1.6e-13
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 441 73.6 2.8e-13
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 440 73.5 3e-13
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 440 73.5 3.2e-13
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 439 73.3 3.2e-13
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 435 72.7 4.6e-13
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 429 72.0 8.6e-13
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 426 71.6 1.1e-12
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 422 71.1 1.7e-12
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 419 70.7 2.2e-12
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 415 70.0 3e-12
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 411 69.5 4.6e-12
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 410 69.4 5.1e-12
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 410 69.4 5.1e-12
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 407 68.9 6.5e-12
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 405 68.7 8.3e-12
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 403 68.4 9.8e-12
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 403 68.5 1e-11
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 403 68.5 1e-11
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 397 67.6 1.7e-11
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 395 67.4 2.1e-11
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 395 67.4 2.1e-11
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 394 67.2 2.3e-11
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 387 66.2 4.2e-11
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 383 65.7 6.4e-11
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 383 65.7 6.5e-11
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 383 65.8 6.6e-11
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 379 65.2 9.7e-11
>>CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 (337 aa)
initn: 2251 init1: 2251 opt: 2251 Z-score: 1679.8 bits: 319.2 E(32554): 3e-87
Smith-Waterman score: 2251; 100.0% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIGSLCVSFLQAKKESELGIYLFSLSLSD
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CCDS98 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIGSLCVSFLQAKKESELGIYLFSLSLSD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLMYMNFYSSTAFLTCIAVDRYLAVVYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 LLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLMYMNFYSSTAFLTCIAVDRYLAVVYPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDETVVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLEKWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 KFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDETVVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLEKWQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 INLNLFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQAVRHNKATENKEKKRIIKLLVSITVTFVLCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 INLNLFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQAVRHNKATENKEKKRIIKLLVSITVTFVLCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSGKRTYTMYRITVALTSLNCVADPILYCFVTETGRYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 PFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSGKRTYTMYRITVALTSLNCVADPILYCFVTETGRYD
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB7 MWNILKFCTGRCNTSQRQRKRILSVSTKDTMELEVLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MWNILKFCTGRCNTSQRQRKRILSVSTKDTMELEVLE
310 320 330
>>CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 (362 aa)
initn: 719 init1: 453 opt: 798 Z-score: 613.9 bits: 122.1 E(32554): 7.2e-28
Smith-Waterman score: 799; 41.4% identity (70.5% similar) in 302 aa overlap (12-307:15-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIGSLCVSFLQAKKESELGIYLFSLS
.:: . : .::::: :..:.: .: ... :.....:::.::..::
CCDS12 MGNHTWEGCHVDSRVDHLFPPSLYIFVIGVGLPTNCLALWAAYRQVQQRNELGVYLMNLS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LSDLLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLMYMNFYSSTAFLTCIAVDRYLAVV
..:::: :::::.:: ..::: .:. :: .:..: :.: : ::: ::.:::::::.
CCDS12 IADLLYICTLPLWVDYFLHHDNWIHGPGSCKLFGFIFYTNIYISIAFLCCISVDRYLAVA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YPLKFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDETVVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLE
.::.: :: . :. :: .: : :.. :..:: .. : :.:..:.:.:
CCDS12 HPLRFARLRRVKTAVAVSSVVWATELGANSAPLFHDELF-----RDRYNHTFCFEKFPME
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KWQINLNLFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQAVRHNKATENKEKKRIIKLLVSITVTFVL
: .::.:. .:. .: . .:. : . .::: . .:: .:: .: .: .:. . ..
CCDS12 GWVAWMNLYRVFVGFLFPWALMLLSYRGILRAVRGSVSTERQEKAKIKRLALSLIAIVLV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CFTPFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSG--KRTYTMYRITVALTSLNCVADPILYCFVTE
::.:.::.:: : :. . . : .:... :. ..:.:::::::::::::.:.:
CCDS12 CFAPYHVLLLSRS----AIYLGRPWDCGFEERVFSAYHSSLAFTSLNCVADPILYCLVNE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB7 TGRYD----MWNILKFCTGRCNTSQRQRKRILSVSTKDTMELEVLE
.: : . :.:.:
CCDS12 GARSDVAKALHNLLRFLASDKPQEMANASLTLETPLTSKRNSTAKAMTGSWAATPPSQGD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 (365 aa)
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Smith-Waterman score: 783; 36.7% identity (70.9% similar) in 313 aa overlap (10-320:17-318)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIGSLCVSFLQAKKESELGIYL
: . . : :.::. :..:..::: :: ..:: : ..:::.::
CCDS98 MGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQIKARNELGVYL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FSLSLSDLLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLMYMNFYSSTAFLTCIAVDRY
.:...::.: .::.:..:. ..:::. . :. ..:.: :.: :..:: ::.::::
CCDS98 CNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVGFLCCISVDRY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAVVYPLKFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDETVVEYCDAEKSNFTLCYDK
:::..:..: .:: . :. ::. :: : . . .: ..: :.: .... .:...
CCDS98 LAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEE-VIE----DENQHRVCFEH
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YPLEKWQINLNLFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQAVRHNKATENKEKKRIIKLLVSITV
::.. :: .: .: .:. .:. .: . . .:::....:....: .: .:..: .:
CCDS98 YPIQAWQRAINYYRFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLVLSTVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TFVLCFTPFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSGKRTYTMYRITVALTSLNCVADPILYCFV
:. :: :.::.::.: . : . .: .: ... :.... :::.::::::.:::::
CCDS98 IFLACFLPYHVLLLVRSVWEASCDF------AKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPVLYCFV
240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KB7 TETGRYDMWNILKFCTG--RCNTSQRQRKRILSVSTKDTMELEVLE
.:: . :. . : . :. . : :.
CCDS98 SETTHRDLARLRGACLAFLTCSRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLTKLHPAFQ
290 300 310 320 330 340
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
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Smith-Waterman score: 516; 29.1% identity (63.0% similar) in 327 aa overlap (5-326:42-360)
10 20 30
pF1KB7 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIG
: . .. : .: :::.:.:... .:
CCDS31 GTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SLCVSFLQAKKESELGIYLFSLSLSDLLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLM
.. . .. : : ...:.:.:.:.:.::.:::: : : .:: .: :. :.:: . :..
CCDS31 AIWMFVFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIF
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pF1KB7 YMNFYSSTAFLTCIAVDRYLAVVYPLKFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDE
..:.:.: :::::.. :: .:::::: . .. :. .:. .:.. .. . .:. .
CCDS31 HVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSG
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TVVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLEKWQINLNLFRTCTGYA---IPLVTILICNRKVYQAVR
: :. :.. ::: : . . .. :: : .::: :: : . .:.
CCDS31 TGVR-----KNKTITCYDTTSDEYLR-SYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALI
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 HNKATENKEKKRIIKLLVSITVTFVLCFTPFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSG--KRTY
.. .. ... : :.. . ..:.. . ::::: . :. ..:. . . :.:
CCDS31 YKDLDNSPLRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMN--LRARLDFQTPAMCAFNDRVY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TMYRITVALTSLNCVADPILYCFVTETGRYDMWNILKFCTGRCNTSQRQRKRILSVSTKD
. :..: .:.::: .::::: .. .: : . . . : ... ..... ....
CCDS31 ATYQVTRGLASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILP
310 320 330 340 350 360
330
pF1KB7 TMELEVLE
CCDS31 EFKQNGDTSL
370
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 446 init1: 208 opt: 502 Z-score: 396.7 bits: 81.9 E(32554): 9e-16
Smith-Waterman score: 502; 32.9% identity (65.5% similar) in 304 aa overlap (2-296:28-317)
10 20 30
pF1KB7 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIG
:.::: .. .. . : :: :.:... .:
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDD-SFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSV
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SLCVSFLQAKKESELGIYLFSLSLSDLLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCK--GSAF
:: : .. : .:: .:.. .:..::::.. :::. : :..:. .: :. .::: :.::
CCDS14 SLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNR-HWPFGDTLCKISGTAF
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LMYMNFYSSTAFLTCIAVDRYLAVVYPLKFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWE
: :.:.: :::::.:::.::.:::.. .:::: . .: ..::: .... .
CCDS14 LT--NIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWIL--VLSGGISAS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB7 DETVVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLEKWQINLN---LFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQA
.... .: : :.. . . :. :. .: .:. :::. . :. : ..
CCDS14 LFSTTNVNNAT----TTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 VRHNKATENK---EKKRIIKLLVSITVTFVLCFTPFH-VMLLIRCILEHAVNFEDHSNSG
.:. :: .. .::...:... ..::.::.:.. :..: . .:.. .
CCDS14 LRK-PATLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAIT---NCFLE
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 KRTYTMYRITVALTSLNCVADPILYCFVTETGRYDMWNILKFCTGRCNTSQRQRKRILSV
. . :: ::. :..::: ::..: :. :.
CCDS14 RFAKIMYPITLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSL
290 300 310 320 330 340
330
pF1KB7 STKDTMELEVLE
CCDS14 PAIQEEVSDQTTNNGGELMLESTF
350 360 370
>>CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 (342 aa)
initn: 445 init1: 363 opt: 497 Z-score: 393.3 bits: 81.2 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 503; 30.4% identity (61.4% similar) in 339 aa overlap (8-331:2-325)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNSTCIEEQHDLDHY-------LFPIVYIFVIIVSIPANIGSLCV--SFLQAKKESELGI
: :: .:. :::::: ....... :: : : . :: .:. :
CCDS31 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YLFSLSLSDLLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLMYMNFYSSTAFLTCIAVD
.. .:...:.:. .:::::: : :. :: . ::. .. :...: : :.::: :. .
CCDS31 FMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RYLAVVYPLKFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDETVVEYCDAEKSNFTLCY
:. ::. :.: ::. .. .:: ::. . . .: : : . .: ..: : :.
CCDS31 RFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 DKYPLEKWQIN---LNLFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQAVRHNKATENKE---KKRII
..: :: .. ...: . . . . :. ::.:: . ... . . .... :.: .
CCDS31 EHY--EKGSVPVLIIHIFIVFSFFLVFLI-ILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEVKRRAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 KLLVSITVTFVLCFTPFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSGKRTYTMYRITVALTSLNCVA
.. .. ..:..::.: ::. : . : ..:.: :. . ...:. : : :::
CCDS31 WMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAE--LGFQD-SKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVL
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CCDS31 LKN
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CCDS94 IHSKSSNGK
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CCDS40 SCCIDPLIYYYASSECQRY-VYSIL-CCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIY
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CCDS40 KKLLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]