Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7053, 543 aa
1>>>pF1KB7053 543 - 543 aa - 543 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.8149+/-0.000455; mu= -25.0789+/- 0.029
mean_var=563.4352+/-121.440, 0's: 0 Z-trim(124.1): 1482 B-trim: 2494 in 1/60
Lambda= 0.054032
statistics sampled from 43384 (45201) to 43384 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.795), E-opt: 0.2 (0.53), width: 16
Scan time: 13.220
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001955 (OMIM: 128990) early growth response pro ( 543) 3664 300.2 1.1e-80
NP_001186810 (OMIM: 602419) early growth response ( 333) 968 89.9 1.3e-17
NP_001186809 (OMIM: 602419) early growth response ( 349) 968 89.9 1.4e-17
XP_005273483 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 349) 968 89.9 1.4e-17
NP_004421 (OMIM: 602419) early growth response pro ( 387) 968 90.0 1.5e-17
XP_011542731 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 406) 968 90.0 1.5e-17
XP_005273482 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 442) 968 90.0 1.7e-17
NP_001129651 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 426) 823 78.7 4.1e-14
NP_001307966 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 426) 823 78.7 4.1e-14
NP_001129649 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 476) 823 78.7 4.4e-14
NP_001129650 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 476) 823 78.7 4.4e-14
NP_000390 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 S ( 476) 823 78.7 4.4e-14
XP_011537729 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) P ( 489) 823 78.7 4.5e-14
NP_001956 (OMIM: 128992) early growth response pro ( 589) 598 61.2 1e-08
NP_001185480 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19 ( 302) 435 48.3 3.9e-05
NP_000369 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 497) 435 48.5 5.8e-05
NP_077742 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 514) 435 48.5 6e-05
NP_001185481 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19 ( 288) 419 47.1 9e-05
NP_077744 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 517) 419 47.2 0.00014
XP_011525944 (OMIM: 111150,600599,613566,613673) P ( 324) 368 43.1 0.0015
NP_006554 (OMIM: 111150,600599,613566,613673) Krue ( 362) 368 43.2 0.0017
XP_005250017 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037
XP_005250018 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037
NP_997219 (OMIM: 614040) zinc finger protein 467 i ( 595) 361 42.8 0.0037
XP_005250016 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037
XP_011514160 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 595) 361 42.8 0.0037
XP_006715927 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 636) 361 42.8 0.0039
NP_001303927 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 487) 355 42.2 0.0043
NP_001303926 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 487) 355 42.2 0.0043
XP_016867288 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 770) 361 42.8 0.0045
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 355 42.3 0.0046
XP_011514159 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 809) 361 42.9 0.0047
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 355 42.3 0.0049
XP_011514158 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 846) 361 42.9 0.0049
XP_011514157 (OMIM: 614040) PREDICTED: zinc finger ( 846) 361 42.9 0.0049
NP_114124 (OMIM: 606139) Krueppel-like factor 16 [ ( 252) 343 41.1 0.0049
NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB do ( 584) 353 42.1 0.0056
XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 584) 353 42.1 0.0056
NP_056982 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domai ( 584) 353 42.1 0.0056
XP_016874442 (OMIM: 609951) PREDICTED: zinc finger ( 500) 350 41.9 0.0058
XP_016874441 (OMIM: 609951) PREDICTED: zinc finger ( 500) 350 41.9 0.0058
XP_016874440 (OMIM: 609951) PREDICTED: zinc finger ( 500) 350 41.9 0.0058
NP_660334 (OMIM: 616238) zinc finger and BTB domai ( 765) 356 42.5 0.0059
NP_001317554 (OMIM: 616238) zinc finger and BTB do ( 765) 356 42.5 0.0059
XP_005259627 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 634) 353 42.2 0.006
NP_008894 (OMIM: 194529) zinc finger protein 22 [H ( 224) 336 40.5 0.0065
XP_005251444 (OMIM: 610192,610199) PREDICTED: zinc ( 708) 353 42.2 0.0065
XP_011516069 (OMIM: 610192,610199) PREDICTED: zinc ( 708) 353 42.2 0.0065
XP_005251445 (OMIM: 610192,610199) PREDICTED: zinc ( 708) 353 42.2 0.0065
XP_016882236 (OMIM: 165260) PREDICTED: zinc finger ( 327) 341 41.0 0.0067
>>NP_001955 (OMIM: 128990) early growth response protein (543 aa)
initn: 3664 init1: 3664 opt: 3664 Z-score: 1569.8 bits: 300.2 E(85289): 1.1e-80
Smith-Waterman score: 3664; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLGAAGAPEGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLGAAGAPEGSGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SASASQSPPLSCAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASASQSPPLSCAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PAAKGGFQVPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAAKGGFQVPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SQDLKALNTSYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQDLKALNTSYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 IHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QKDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 TYPSPVHSGFPSPSVATTYSSVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYPSPVHSGFPSPSVATTYSSVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTI
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 EIC
:::
NP_001 EIC
>>NP_001186810 (OMIM: 602419) early growth response prot (333 aa)
initn: 1004 init1: 716 opt: 968 Z-score: 437.1 bits: 89.9 E(85289): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 1007; 51.3% identity (70.1% similar) in 355 aa overlap (107-449:2-331)
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 SNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLP---PITY
::.:.::: : :: .. : .::
NP_001 MDIGLTNEKPNPELSYSGSFQPAPGNKTVTY
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 TGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVS-GLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPLS
:.:... : : . ..::.: :.... ::::. : : .:.:: : ::
NP_001 LGKFAFDSPSN-----WCQDNIISLMSAGILGV--PPASG--ALSTQTSTASMVQ-PP--
40 50 60 70
200 210 220 230 240
pF1KB7 CAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNT-DIFPEPQSQAFP-GSAGTALQYPPPAYPAAKGGFQ-
..: .: : : : : :.. :: : : :. : : : : : .:: ...
NP_001 ----QGDVEAMYPALP--PYSNCGDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPALDS
80 90 100 110 120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 --VPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLES-RTQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQDLK
:::::: . .. .:.: . :..:::::.. :.. : .::: ::::: . :
NP_001 NLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QIHP
140 150 160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIHTG
.... : : .:: : ::::::::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.:::::
NP_001 GFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIHTG
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDK
.::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::.:
NP_001 HKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQKEK
250 260 270 280 290 300
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPS
::.:. : ::.:. .::.:.
NP_001 KAEKGG-APSASSAPPVSLAPVVTTCA
310 320 330
>>NP_001186809 (OMIM: 602419) early growth response prot (349 aa)
initn: 1004 init1: 716 opt: 968 Z-score: 436.8 bits: 89.9 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 1010; 50.4% identity (69.7% similar) in 357 aa overlap (103-449:14-347)
80 90 100 110 120
pF1KB7 GGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLP---
:. ::.:.::: : :: .. :
NP_001 MEPCAAWSPRGGRENVMDIGLTNEKPNPELSYSGSFQPAPGNK
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PITYTGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSP
.:: :.:... : : . ..::.:. . . :::: .: : .:.:: : :
NP_001 TVTYLGKFAFDSPSN-----WCQDNIISLMSAGI-LGVPPAS--GALSTQTSTASMVQ-P
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PLSCAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFP-GSAGTALQYPPPAYPAAKGGF
: ..: .: : : . . :.. :: : : :. : : : : : .:: ..
NP_001 P------QGDVEAMYPALPPY-SNCGDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPAL
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 Q---VPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLES-RTQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQD
. :::::: . .. .:.: . :..:::::.. :.. : .::: ::::: . :
NP_001 DSNLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QI
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LKALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIH
.... : : .:: : ::::::::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.:::
NP_001 HPGFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIH
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQK
::.::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::
NP_001 TGHKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQK
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTY
.:::.:. : ::.:. .::.:.
NP_001 EKKAEKGG-APSASSAPPVSLAPVVTTCA
330 340
>>XP_005273483 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growth re (349 aa)
initn: 1004 init1: 716 opt: 968 Z-score: 436.8 bits: 89.9 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 1010; 50.4% identity (69.7% similar) in 357 aa overlap (103-449:14-347)
80 90 100 110 120
pF1KB7 GGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLP---
:. ::.:.::: : :: .. :
XP_005 MEPCAAWSPRGGRENVMDIGLTNEKPNPELSYSGSFQPAPGNK
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PITYTGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSP
.:: :.:... : : . ..::.:. . . :::: .: : .:.:: : :
XP_005 TVTYLGKFAFDSPSN-----WCQDNIISLMSAGI-LGVPPAS--GALSTQTSTASMVQ-P
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PLSCAVPSNDSSPIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFP-GSAGTALQYPPPAYPAAKGGF
: ..: .: : : . . :.. :: : : :. : : : : : .:: ..
XP_005 P------QGDVEAMYPALPPY-SNCGDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPAL
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 Q---VPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLES-RTQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQD
. :::::: . .. .:.: . :..:::::.. :.. : .::: ::::: . :
XP_005 DSNLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QI
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LKALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIH
.... : : .:: : ::::::::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.:::
XP_005 HPGFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIH
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQK
::.::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::
XP_005 TGHKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQK
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTY
.:::.:. : ::.:. .::.:.
XP_005 EKKAEKGG-APSASSAPPVSLAPVVTTCA
330 340
>>NP_004421 (OMIM: 602419) early growth response protein (387 aa)
initn: 1043 init1: 716 opt: 968 Z-score: 436.1 bits: 90.0 E(85289): 1.5e-17
Smith-Waterman score: 1025; 48.9% identity (69.7% similar) in 380 aa overlap (81-449:31-385)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISL
:. . :. ..:. . :.....:. ::.:
NP_004 MTGKLAEKLPVTMSSLLNQLPDNLYPEEIPSALNLFSGSSDSVVH-YNQMATENVMDIGL
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160
pF1KB7 NNEKVLVETSYPSQTTRLP---PITYTGRFSLEPAPNSGNTLW-PEPLFSLVSGLVSMTN
.::: : :: .. : .:: :.:... : : . ..::.:. . .
NP_004 TNEKPNPELSYSGSFQPAPGNKTVTYLGKFAFDSPSN-----WCQDNIISLMSAGI-LGV
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170 180 190 200 210 220
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:::: .: : .:.:: : :: ..: .: : : : : :.. :: :
NP_004 PPAS--GALSTQTSTASMVQ-PP------QGDVEAMYPALP--PYSNCGDLYSEPVSFHD
120 130 140 150 160
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: :. : : : : : .:: ... :::::: . .. .:.: . :..:::::.. :
NP_004 PQGNPGLA--YSPQDYQSAKPALDSNLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIPEHKPFQGMDPIR
170 180 190 200 210
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pF1KB7 TQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQDLKALNTSYQSQL-IKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYA
.. : .::: ::::: . : .... : : .:: : ::::::::::: ::::.:
NP_004 VNPPPITPLETIKAFKDK---QIHPGFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNRPSKTPLHERPHA
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 CPVESCDRRFSRSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACD
::.:.::::::::::::::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::.
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.::::::::::::::.::::.::.:::.:. : ::.:. .::.:.
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pF1KB7 SPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSSVPPAFPAQVSSFPSSAVT
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: : :. : .. ..... : .
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. :. ::.:.::: : :: .. : .:: :.:... : : . .
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.::.:. . . ::::. : : .:.:: : :: ..: .: : : : :
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:.. :: : : :. : : : : : .:: ... :::::: . .. .:.: . :
XP_011 GDLYSEPVSFHDPQGNPGLA--YSPQDYQSAKPALDSNLFPMIPDYNLYHHPNDMG-SIP
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..:::::.. :.. : .::: ::::: . : .... : : .:: : ::::::
XP_011 EHKPFQGMDPIRVNPPPITPLETIKAFKDK---QIHPGFGSLPQPPLTLKPIRPRKYPNR
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::::: ::::.:::.:.::::::::::::::.:::::.::::::::::.:::::::::::
XP_011 PSKTPLHERPHACPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIHTGHKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHI
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:::::::::::..::::::::::::::.::::.::.:::.:. : ::.:. .::.
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:.
XP_011 TTCA
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:. . . ::::. : : .:.:: : :: ..: .: : : . . :..
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:: : : :. : : : : : .:: ... :::::: . .. .:.: . :..:::
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::.. :.. : .::: ::::: .. . .: : : .:: : :::::::::::
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::::.:::.:.::::::::::::::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::
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::::::..::::::::::::::.::::.::.:::.:. : ::.:. .::.:.
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pF1KB7 PVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSSVPPAFPAQVSS
>>NP_001129651 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (426 aa)
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pF1KB7 SNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQ-----TTRLPPI
.:....:: .. :::. . : .
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pF1KB7 TYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVS-GLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPL
:: :.::..: : . .:: ....:: :... .. :::.... : ...: . . ::
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. :.. .. : . .:: : : : . :.. .:.. .: :....: :::: .:
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pF1KB7 PAAKGGFQ---VPMIPDY--LFPQQ-QGDL-GLGTPDQKPFQ-GLESRTQQPSLTPLSTI
:. : . . :::::: .::.: : :: : . ::.::: :.. : :::::::
NP_001 PSPKPATDPGLFPMIPDYPGFFPSQCQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPPLTPLSTI
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pF1KB7 KAFA------------TQSGSQDLK-----------ALNTSYQSQLI--KPS-RMRKYPN
. :. ...::. . : ..:. . . .: : :::::
NP_001 RNFTLGGPSAGVTGPGASGGSEGPRLPGSSSAAAAAAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPN
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pF1KB7 RPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTH
:::::: ::::: ::.:.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 RPSKTPVHERPYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTH
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pF1KB7 IRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADK---SVVA-SSATSSLSSY
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::..:.. :: : :.:. : .
NP_001 IRTHTGEKPFACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQ
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pF1KB7 PSPVATSYPSPVTTSYP-SPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSS
:. . : : . : .: .. .:
NP_001 PGGTLCSSNSSSLGGGPLAPCSSRTRTP
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>>NP_001307966 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (426 aa)
initn: 939 init1: 708 opt: 823 Z-score: 374.4 bits: 78.7 E(85289): 4.1e-14
Smith-Waterman score: 998; 44.7% identity (66.5% similar) in 418 aa overlap (107-469:11-426)
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pF1KB7 SNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQ-----TTRLPPI
.:....:: .. :::. . : .
NP_001 MNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTF
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 TYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVS-GLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPL
:: :.::..: : . .:: ....:: :... .. :::.... : ...: . . ::
NP_001 TYMGKFSIDPQ-YPGASCYPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPLATGPL
50 60 70 80 90
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pF1KB7 S-CAVPSN--DSSPIYSAAPTFPTPNT----DIFPEPQS--QAFPGSAGTALQYPPP-AY
. :.. .. : . .:: : : : . :.. .:.. .: :....: :::: .:
NP_001 GVCTMSQTQPDLDHLYSPPPP-PPPYSGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSLAYPPPPSY
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 PAAKGGFQ---VPMIPDY--LFPQQ-QGDL-GLGTPDQKPFQ-GLESRTQQPSLTPLSTI
:. : . . :::::: .::.: : :: : . ::.::: :.. : :::::::
NP_001 PSPKPATDPGLFPMIPDYPGFFPSQCQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPPLTPLSTI
160 170 180 190 200 210
300 310 320
pF1KB7 KAFA------------TQSGSQDLK-----------ALNTSYQSQLI--KPS-RMRKYPN
. :. ...::. . : ..:. . . .: : :::::
NP_001 RNFTLGGPSAGVTGPGASGGSEGPRLPGSSSAAAAAAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPN
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 RPSKTPPHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTH
:::::: ::::: ::.:.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 RPSKTPVHERPYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTH
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 IRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADK---SVVA-SSATSSLSSY
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::..:.. :: : :.:. : .
NP_001 IRTHTGEKPFACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQ
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 PSPVATSYPSPVTTSYP-SPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSS
:. . : : . : .: .. .:
NP_001 PGGTLCSSNSSSLGGGPLAPCSSRTRTP
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>>NP_001129649 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (476 aa)
initn: 939 init1: 708 opt: 823 Z-score: 373.8 bits: 78.7 E(85289): 4.4e-14
Smith-Waterman score: 1019; 43.1% identity (66.7% similar) in 448 aa overlap (80-469:32-476)
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pF1KB7 GAAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHLTA---ESFP
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NP_001 MTAKAVDKIPVTLSGFVHQLSDNIYPVEDLAATSVTIFPNAELG-GPFDQMNGVAGDGMI
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pF1KB7 DISLNNEKVLVETSYPSQ-----TTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVS-G
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NP_001 NIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSIDPQ-YPGASCYPEGIINIVSAG
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NP_001 ILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPLATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYSPPPP-PPPYSGCA
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NP_001 HGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPPLTPLSTIRNFTLGGPSAGVTGPGASGGSEGPRLPGSS
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NP_001 SAAAAAAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPVHERPYPCPAEGCDRRFSRSDELT
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NP_001 RHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDYCGRKFARSDERKRHTK
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pF1KB7 IHLRQKDKKADK---SVVA-SSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYP-SPATTSYPSPVP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]