Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7037
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7037, 520 aa
1>>>pF1KB7037 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3708+/-0.000916; mu= 10.8343+/- 0.056
mean_var=205.6308+/-55.781, 0's: 0 Z-trim(112.9): 258 B-trim: 1511 in 2/51
Lambda= 0.089440
statistics sampled from 13123 (13560) to 13123 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 3529 468.2 1e-131
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 1604 219.8 6.5e-57
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 1517 208.4 1.3e-53
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 1517 208.5 1.3e-53
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 1517 208.5 1.4e-53
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 1517 208.5 1.4e-53
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 1252 174.1 2.2e-43
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 797 115.5 1.2e-25
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 797 115.6 1.2e-25
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 797 115.6 1.3e-25
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 654 97.1 4.2e-20
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 652 96.7 4.6e-20
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 636 94.8 2.2e-19
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 620 92.7 9.6e-19
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 563 85.4 1.5e-16
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 558 84.7 2.3e-16
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 553 84.1 3.8e-16
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 539 82.3 1.3e-15
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 532 81.4 2.5e-15
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 510 78.4 1.5e-14
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 510 78.5 1.6e-14
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 506 78.0 2.6e-14
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 502 77.5 3.4e-14
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 501 77.3 3.4e-14
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 502 77.5 3.5e-14
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 499 77.1 4.4e-14
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 497 76.8 5.1e-14
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 490 75.8 9.1e-14
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 485 75.2 1.5e-13
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 477 74.3 3.3e-13
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 456 71.6 2.3e-12
CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 387) 441 69.6 7.6e-12
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 443 70.0 7.8e-12
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 443 70.0 7.9e-12
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 549) 443 70.0 8e-12
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 423 67.3 4.4e-11
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 423 67.4 5e-11
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 420 67.0 6.1e-11
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 418 66.7 6.5e-11
>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 3529 init1: 3529 opt: 3529 Z-score: 2478.1 bits: 468.2 E(32554): 1e-131
Smith-Waterman score: 3529; 100.0% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 WAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLEAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSGSQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSGSQRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFTFKLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFTFKLLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB7 EPESPGTDGGASNGGCEAAADVANGQPGFKSNMPLAPGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPESPGTDGGASNGGCEAAADVANGQPGFKSNMPLAPGQF
490 500 510 520
>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 (572 aa)
initn: 1666 init1: 1016 opt: 1604 Z-score: 1135.2 bits: 219.8 E(32554): 6.5e-57
Smith-Waterman score: 1605; 58.5% identity (78.8% similar) in 424 aa overlap (44-451:95-501)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 PAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAIVGNILVILSVACN
....::. :.::::.:..::.:::::::::
CCDS13 NRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACN
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 RHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDIWAAVDVLCCTASI
:::.: :::::::::.:::::: :::::::..::::.:..:: :::.:::::::::::::
CCDS13 RHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASI
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGPLLGWKEPAPNDDK
::::.::.:::.:::.::.::...:.::: : .::.. :.:.:::::::::.: :..
CCDS13 LSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVPPDER
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 ECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLEAGVMKEMSNSKELTL
::.::: ::.:::. :::.:.:::.:::::::.::. ::..::::: .: ....:..:
CCDS13 FCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKASEVVL
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 RIHSKN--FHEDTLSSTK-AKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVVGMFILCWLPF
::: .. : . . ::::. :::..:.:.::::::::::::.::::.:.:::.::
CCDS13 RIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPF
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 FIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFVRILGCQCRGR
:..::::::: ::: ..::::.:::::::::.::.::::::.::::::.:.: ::::
CCDS13 FFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQCR--
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420
pF1KB7 GRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQS---RKDSLDDSGSCLSGSQ---RTLPSA
:::::: : : : :... :.: .::. :. .::.
CCDS13 ---RRRRRRPL---------WRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDP
430 440 450 460 470
430 440 450 460 470
pF1KB7 SPSP-GYLGRGAP------PPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFTFK
.: : : :: :: :: ::. :
CCDS13 DPEPPGTPEMQAPVASRRKPP---SAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQ
480 490 500 510 520
480 490 500 510 520
pF1KB7 LLTEPESPGTDGGASNGGCEAAADVANGQPGFKSNMPLAPGQF
CCDS13 RAEAACAQRSEVEAVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
530 540 550 560 570
>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa)
initn: 1498 init1: 1037 opt: 1517 Z-score: 1076.0 bits: 208.4 E(32554): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 1523; 60.3% identity (84.3% similar) in 370 aa overlap (25-390:4-362)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQ--LDITRAISVGLVLGAFILF
..: . ::: : : ..:..:: .:..::..:::
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILF
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFC
...:::::::::::.:::.. :.:.:::::.:::::. ::::::: .::::::..::.::
CCDS60 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFC
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISI
.::::::::::::::..:: ::::::::: : :.:::.::.:....::: ::.:: ::::
CCDS60 NIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISI
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLE
:::.::..:::.:. : ..::: :.:::.:::::.:::.:::::::::.:::: ...:.
CCDS60 GPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHE--DTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTL
.:. . :.:...::::: :: . ..:.:.: : ..:.:.::::::::::::
CCDS60 SGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTH-----FSVRLLKFSREKKAAKTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFK
::::: :.:::::::...:.::.: .:: ..:::.::::::.:::.:::::::::.:::
CCDS60 GIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 RAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSG
.:: .: :: :.. .. :: :: .:
CCDS60 KAFQNVLRIQCLC---RKQSSKHALG---YTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRI
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 SQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFTF
CCDS60 SKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARGHTPMT
390 400 410 420
>>CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (455 aa)
initn: 1498 init1: 1037 opt: 1517 Z-score: 1075.7 bits: 208.5 E(32554): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 1523; 60.3% identity (84.3% similar) in 370 aa overlap (25-390:4-362)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQ--LDITRAISVGLVLGAFILF
..: . ::: : : ..:..:: .:..::..:::
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILF
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFC
...:::::::::::.:::.. :.:.:::::.:::::. ::::::: .::::::..::.::
CCDS60 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFC
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISI
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CCDS60 NIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISI
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLE
:::.::..:::.:. : ..::: :.:::.:::::.:::.:::::::::.:::: ...:.
CCDS60 GPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHE--DTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTL
.:. . :.:...::::: :: . ..:.:.: : ..:.:.::::::::::::
CCDS60 SGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTH-----FSVRLLKFSREKKAAKTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFK
::::: :.:::::::...:.::.: .:: ..:::.::::::.:::.:::::::::.:::
CCDS60 GIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 RAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSG
.:: .: :: :.. .. :: :: .:
CCDS60 KAFQNVLRIQCLC---RKQSSKHALG---YTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRI
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 SQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFTF
CCDS60 SKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARRGMDCRYFTKNCREHIKHVNFMMPP
390 400 410 420 430 440
>>CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (466 aa)
initn: 1498 init1: 1037 opt: 1517 Z-score: 1075.6 bits: 208.5 E(32554): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 1523; 60.3% identity (84.3% similar) in 370 aa overlap (25-390:4-362)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQ--LDITRAISVGLVLGAFILF
..: . ::: : : ..:..:: .:..::..:::
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILF
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFC
...:::::::::::.:::.. :.:.:::::.:::::. ::::::: .::::::..::.::
CCDS60 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFC
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISI
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pF1KB7 DIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISI
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pF1KB7 GPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLE
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pF1KB7 AGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHE--DTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTL
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CCDS34 SGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTH-----FSVRLLKFSREKKAAKTL
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pF1KB7 RAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSG
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CCDS34 KAFQNVLRIQCLC---RKQSSKHALG---YTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRI
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pF1KB7 SQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFTF
CCDS34 SKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARTKSRSVTRLECSGMILAHCNLRLPG
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pF1KB7 AIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFC
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CCDS83 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFC
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pF1KB7 DIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISI
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CCDS83 NIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISI
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLE
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CCDS83 GPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHE--DTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTL
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CCDS83 SGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTH-----FSVRLLKFSREKKAAKTL
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 GIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFK
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CCDS83 GIVVGCFVLCWLPFFLVMPIDEETEAQEGKNDSPSFKQPVHHAAVLGLEVMEKENLEGVS
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pF1KB7 FCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVI
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pF1KB7 SIGPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT-K
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NLEAGVMK-EMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
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pF1KB7 TLGIVVGMFILCWLPFFI---ALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCS
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pF1KB7 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFIL
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pF1KB7 FAIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLG-YWVLGRI
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CCDS74 LTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHF
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pF1KB7 FCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVI
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CCDS74 FCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASI
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pF1KB7 SIGPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT-K
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CCDS74 TLPPLFGWAQNV-NDDKVCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAK
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NLEAGVMK-EMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
. : . : .. :. .. .. :. . .. :. :..:.. :.::.:::
CCDS74 HKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHE-RKNISI----FKREQKAAT
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pF1KB7 TLGIVVGMFILCWLPFFI---ALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCS
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CCDS74 TLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFF
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360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSG
..... .. .: :: :. .:.
CCDS74 NRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGHDS
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFIL
:...:. . . .. . .: .: . :
CCDS74 DGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITL
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FAIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLG-YWVLGRI
..:.:: ::..:: ..:: :.::.::.::.::: .. .:.:: .. ...: :..:..
CCDS74 LTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHF
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVI
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CCDS74 FCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASI
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 SIGPLLGWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT-K
.. ::.:: . . :::: : .... :...:. .::::..:.: :: ..: .:.... :
CCDS74 TLPPLFGWAQNV-NDDKVCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAK
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NLEAGVMK-EMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
. : . : .. :. .. .. :. . .. :. :..:.. :.::.:::
CCDS74 HKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHE-RKNISI----FKREQKAAT
280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TLGIVVGMFILCWLPFFI---ALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCS
::::.:: : .::::::. : :. : : : .. .:::: :: .::.::
CCDS74 TLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFF
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSG
..... .. .: :: :. .:.
CCDS74 NRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRP
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520 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]