Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6554
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6554, 391 aa
1>>>pF1KB6554 391 - 391 aa - 391 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5560+/-0.00113; mu= -3.8655+/- 0.066
mean_var=249.9695+/-56.149, 0's: 0 Z-trim(109.0): 480 B-trim: 158 in 1/50
Lambda= 0.081121
statistics sampled from 10040 (10616) to 10040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13003.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 ( 391) 2661 324.9 8e-89
CCDS59224.1 CSNK2A3 gene_id:283106|Hs108|chr11 ( 391) 2619 320.0 2.4e-87
CCDS10794.1 CSNK2A2 gene_id:1459|Hs108|chr16 ( 350) 1980 245.1 7.2e-65
CCDS13004.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 ( 255) 1760 219.3 3.2e-57
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 495 71.4 1.5e-12
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 492 71.0 2e-12
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 465 67.8 1.6e-11
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 464 67.7 1.6e-11
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 465 67.9 1.8e-11
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 465 67.9 1.9e-11
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 465 67.9 2e-11
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 464 67.8 2.1e-11
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 464 67.8 2.2e-11
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 464 67.8 2.3e-11
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 458 67.0 3e-11
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 458 67.1 3.9e-11
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 458 67.1 4e-11
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 454 66.6 4.2e-11
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 458 67.2 4.4e-11
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 452 66.3 5e-11
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 451 66.3 7.2e-11
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 451 66.3 7.2e-11
>>CCDS13003.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 (391 aa)
initn: 2661 init1: 2661 opt: 2661 Z-score: 1708.2 bits: 324.9 E(32554): 8e-89
Smith-Waterman score: 2661; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANMMSGISSVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANMMSGISSVPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 PSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
370 380 390
>>CCDS59224.1 CSNK2A3 gene_id:283106|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 2619 init1: 2619 opt: 2619 Z-score: 1681.6 bits: 320.0 E(32554): 2.4e-87
Smith-Waterman score: 2619; 98.5% identity (99.2% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.::::
CCDS59 FYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWRLGCMLASMIFRKEPFFHGRDNYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDF
::::::: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QLVRIAKFLGTEDLYGYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANMMSGISSVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS59 LDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANVMSGISSVPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 PSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS59 PSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAATGAQQ
370 380 390
>>CCDS10794.1 CSNK2A2 gene_id:1459|Hs108|chr16 (350 aa)
initn: 1969 init1: 1969 opt: 1980 Z-score: 1278.1 bits: 245.1 E(32554): 7.2e-65
Smith-Waterman score: 1980; 85.3% identity (94.9% similar) in 334 aa overlap (1-333:1-334)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSGPVP-SRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
: ::. ::::::..::. : :::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNT
::::.:::::::::::::::::.::::::::: ::: : : ::::::.:::::::..:::
CCDS10 TNNERVVVKILKPVKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFEYINNT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLA
::::::: :::.::::::::.::::::::: ::::::::::::::::...::::::::::
CCDS10 DFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQKKLRLIDWGLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNY
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::
CCDS10 EFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRREPFFHGQDNY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALD
:::::::::::::.:: :. ::.:.:::.::::::.::::::: :.::::.:::::::::
CCDS10 DQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIHSENRHLVSPEALD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 FLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANMMSGISSVP
.::::::::::.::::.::::::::: :::.:..
CCDS10 LLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLTAAR
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 TPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
>>CCDS13004.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 (255 aa)
initn: 1760 init1: 1760 opt: 1760 Z-score: 1140.9 bits: 219.3 E(32554): 3.2e-57
Smith-Waterman score: 1760; 100.0% identity (100.0% similar) in 255 aa overlap (137-391:1-255)
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 RTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDH
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 EHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMI
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 FRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVH
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 SENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPV
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390
pF1KB6 SSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
220 230 240 250
>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa)
initn: 206 init1: 131 opt: 495 Z-score: 338.6 bits: 71.4 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 495; 30.1% identity (62.0% similar) in 316 aa overlap (20-324:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPRE-YWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
:: .. : . . : . : .: .: : :. : : .
CCDS14 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TNNEKVVVKIL-KP----VKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVS---RTPAL
.::.:: : .: .. .. ::...:..:. :.: : :. .: . .
CCDS14 RLRQKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKH-ENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 VFEHVNNTDFKQLY--QTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHR
. . ..:.... :.:.: ..: .:..:..: : :: ::.:::.:: :: .. :
CCDS14 LVTTLMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVN-EDC
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRK
.::..:.:::. . .:.. ::.:....::...... :. ..:.::.::..: .. .
CCDS14 ELRILDFGLAR--QADEEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELL-QG
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 EPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSEN
. .: : : ::: :: .:.:: . . . : . : . . : .: . .. :
CCDS14 KALFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPS-PEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGAN
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 QHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSA
: :.:.: ..: : ..:..: ::. : ::
CCDS14 -----PLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KB6 NMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
CCDS14 LEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
340 350 360
>>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 (367 aa)
initn: 364 init1: 127 opt: 492 Z-score: 336.7 bits: 71.0 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 492; 30.3% identity (61.7% similar) in 337 aa overlap (1-327:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINIT
::.: :.:. : . : . : : ..: :. .. .: : :. : :..
CCDS14 MSSPPPARSGFYRQEVT---KTAW--EVRAV-------YRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 NNEKVVVKIL-KPVKK----KKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEH
.. ::..: : .: .. :. ::...:...: :.: : :. . :
CCDS14 TGAKVAIKKLYRPFQSELFAKRAYRELRLLKHMRH-ENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VN---NTDFKQL--YQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRK
: .::. .: .. : . :.: .:..::.: : :. ::.:::.:: :. .. : .
CCDS14 VMPFMGTDLGKLMKHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVN-EDCE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKE
:...:.:::. . .:.. :..:....::...... : ..:.::.::..: :: :
CCDS14 LKILDFGLAR--QADSEMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQ
.:.: :. ::: .: :: :: ..... . . . : . .: . .. .
CCDS14 -LFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPA-EFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTN---
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 HLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSAN
.:: :...:.:.: : ..:.:: ::. :::: ..
CCDS14 --ASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KB6 MMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
CCDS14 DEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
340 350 360
>>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa)
initn: 373 init1: 145 opt: 465 Z-score: 320.5 bits: 67.8 E(32554): 1.6e-11
Smith-Waterman score: 466; 29.5% identity (62.8% similar) in 312 aa overlap (37-333:2-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 SRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVV
. :. . : :.:.:. ::. : :... :.
CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VKIL-----KPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDF
:: . :: :: :::..:..:. ::...: .. . .: ::::. ..: .
CCDS33 VKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH-PNLVNLIEVFRR--KRKMHLVFEYCDHTLL
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KB6 KQLYQT---LTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGL
..: .. ..: :. ... :.::..:: . .:::.::.:..: .. ... :.:.
CCDS33 NELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIHNCIHRDIKPENILITKQG-IIKICDFGF
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