Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6526
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6526, 359 aa
1>>>pF1KB6526 359 - 359 aa - 359 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3686+/-0.000332; mu= 16.3720+/- 0.021
mean_var=70.1624+/-13.955, 0's: 0 Z-trim(115.6): 27 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.153117
statistics sampled from 26212 (26239) to 26212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 8.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004303 (OMIM: 301770) arrestin-C [Homo sapiens] ( 388) 2341 526.1 5.2e-149
XP_016885007 (OMIM: 301770) PREDICTED: arrestin-C ( 403) 2130 479.5 5.7e-135
XP_011543336 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 449) 1545 350.3 5e-96
XP_016873239 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 473) 1545 350.3 5.2e-96
NP_004032 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform A ( 418) 1539 348.9 1.2e-95
XP_016873241 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 442) 1539 348.9 1.2e-95
XP_016873242 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 437) 1534 347.8 2.6e-95
XP_011543337 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 441) 1485 337.0 4.8e-92
XP_016873240 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 465) 1485 337.0 5e-92
NP_064647 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform B ( 410) 1479 335.7 1.1e-91
XP_016873243 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 434) 1479 335.7 1.2e-91
NP_004304 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 1 ( 409) 1396 317.3 3.7e-86
NP_001244259 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 421) 1396 317.3 3.8e-86
XP_011522160 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrest ( 440) 1394 316.9 5.4e-86
XP_016860130 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 373) 1258 286.8 5.2e-77
NP_000532 (OMIM: 181031,258100,613758) S-arrestin ( 405) 1257 286.6 6.5e-77
XP_016860131 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 369) 1255 286.2 8.2e-77
NP_945355 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 2 ( 394) 1159 265.0 2.1e-70
NP_001244260 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 406) 1159 265.0 2.1e-70
NP_001244258 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 330) 1044 239.5 8e-63
XP_016860132 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 273) 900 207.7 2.6e-53
NP_001244257 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 430) 902 208.2 2.8e-53
XP_011509895 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 305) 847 196.0 9.5e-50
XP_011509896 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 281) 836 193.5 4.8e-49
XP_011509898 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 271) 799 185.3 1.3e-46
NP_001316993 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 217) 550 130.3 4e-30
XP_016880134 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrest ( 229) 550 130.3 4.2e-30
>>NP_004303 (OMIM: 301770) arrestin-C [Homo sapiens] (388 aa)
initn: 2341 init1: 2341 opt: 2341 Z-score: 2796.2 bits: 526.1 E(85289): 5.2e-149
Smith-Waterman score: 2341; 99.7% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
NP_004 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYLKCRKLFVMLTCAFRYG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 AQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 TIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAASS
310 320 330 340 350 360
NP_004 EDIVIEEFTRKGEEESQKAVEAEGDEGS
370 380
>>XP_016885007 (OMIM: 301770) PREDICTED: arrestin-C isof (403 aa)
initn: 2327 init1: 2130 opt: 2130 Z-score: 2544.1 bits: 479.5 E(85289): 5.7e-135
Smith-Waterman score: 2301; 95.7% identity (96.0% similar) in 373 aa overlap (1-358:1-373)
10 20 30 40
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPI---------------DGVVLVDPEYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:
XP_016 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIGEFFLTKVLSVLLSTDGVVLVDPEYLK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 CRKLFVMLTCAFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CRKLFVMLTCAFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GDNAYPFTLQMVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDNAYPFTLQMVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 RKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 KKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 LDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELP
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB6 LVLIHPKPSHEAAR
:::::::::::::
XP_016 LVLIHPKPSHEAASSEDIVIEEFTRKGEEESQKAVEAEGDEGS
370 380 390 400
>>XP_011543336 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (449 aa)
initn: 1567 init1: 1127 opt: 1545 Z-score: 1845.0 bits: 350.3 E(85289): 5e-96
Smith-Waterman score: 1545; 62.4% identity (86.5% similar) in 356 aa overlap (1-356:36-390)
10 20 30
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTV
.:.::::.: ::::..::::::::::.: :
XP_011 QRERLRLHARRIQTLAFHPPQHPGAGCVALLSRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 EPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSP
.:.::::::::::.: :...: :::::::::.::.:.::::::::.: ..: : .
XP_011 DPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APED
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAEN
. ::: :::::..:::..:::::... ::::::::::::::.:: ::.:.:::.:::::
XP_011 KKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAEN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEP
:: . ::. ::::.::::.:: . :: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::
XP_011 LEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFA
::::: ..: :::..::::::: : .:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ..
XP_011 ISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGG
.::.:: . .:::::::::::::::::::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::
XP_011 LTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB6 ILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR
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XP_011 LLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFAR
370 380 390 400 410 420
>>XP_016873239 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (473 aa)
initn: 1546 init1: 1127 opt: 1545 Z-score: 1844.7 bits: 350.3 E(85289): 5.2e-96
Smith-Waterman score: 1545; 62.4% identity (86.5% similar) in 356 aa overlap (1-356:36-390)
10 20 30
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTV
.:.::::.: ::::..::::::::::.: :
XP_016 QRERLRLHARRIQTLAFHPPQHPGAGCVALLSRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 EPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSP
.:.::::::::::.: :...: :::::::::.::.:.::::::::.: ..: : .
XP_016 DPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APED
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAEN
. ::: :::::..:::..:::::... ::::::::::::::.:: ::.:.:::.:::::
XP_016 KKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAEN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEP
:: . ::. ::::.::::.:: . :: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::
XP_016 LEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFA
::::: ..: :::..::::::: : .:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ..
XP_016 ISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGG
.::.:: . .:::::::::::::::::::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::
XP_016 LTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB6 ILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR
.::::..:::.::::..:.::::..:
XP_016 LLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPENETPVDTNLIELDTNQRPSSHRTVAR
370 380 390 400 410 420
>>NP_004032 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform A [Ho (418 aa)
initn: 1540 init1: 1127 opt: 1539 Z-score: 1838.3 bits: 348.9 E(85289): 1.2e-95
Smith-Waterman score: 1539; 62.3% identity (86.5% similar) in 355 aa overlap (2-356:6-359)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCA
..::::.: ::::..::::::::::.: :.:.::::::::::.: :...: ::::
NP_004 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQM
:::::.::.:.::::::::.: ..: : . . ::: :::::..:::..:::::...
NP_004 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAG
::::::::::::::.:: ::.:.:::.::::: :: . ::. ::::.::::.:: . :
NP_004 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQIT
: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::::::: ..: :::..::::::: : .
NP_004 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTN
:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ...::.:: . .::::::::::::::::
NP_004 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHE
:::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::.::::..:::.::::..:.::::..:
NP_004 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AAR
NP_004 PPHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
360 370 380 390 400 410
>>XP_016873241 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (442 aa)
initn: 1540 init1: 1127 opt: 1539 Z-score: 1837.9 bits: 348.9 E(85289): 1.2e-95
Smith-Waterman score: 1539; 62.3% identity (86.5% similar) in 355 aa overlap (2-356:6-359)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCA
..::::.: ::::..::::::::::.: :.:.::::::::::.: :...: ::::
XP_016 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQM
:::::.::.:.::::::::.: ..: : . . ::: :::::..:::..:::::...
XP_016 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAG
::::::::::::::.:: ::.:.:::.::::: :: . ::. ::::.::::.:: . :
XP_016 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQIT
: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::::::: ..: :::..::::::: : .
XP_016 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTN
:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ...::.:: . .::::::::::::::::
XP_016 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
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300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHE
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XP_016 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AAR
XP_016 PPHREVPENETPVDTNLIELDTNQRPSSHRTVARGGGPGPTARTASSDDDIVFEDFARQR
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initn: 1535 init1: 1127 opt: 1534 Z-score: 1832.0 bits: 347.8 E(85289): 2.6e-95
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYG
::::.: ::::..::::::::::.: :.:.::::::::::.: :...: ::::::::
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XP_016 REDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKK-PLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNL
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pF1KB6 PCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPS
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XP_016 PCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPT
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:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::::::: ..: :::..::::::: : .:. :
XP_016 AETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICL
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.. .: : ..: .::: .:.: . ...::.:: . .::::::::::::::::::::
XP_016 FNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASS
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pF1KB6 TIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR
:..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::.::::..:::.::::..:.::::..:
XP_016 TLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEPPHR
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XP_016 EVPENETPVDTNLIELDTNQRPSSHRTVARGGGPGPTARTASSDDDIVFEDFARQRLKGM
360 370 380 390 400 410
>>XP_011543337 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (441 aa)
initn: 1498 init1: 1004 opt: 1485 Z-score: 1773.5 bits: 337.0 E(85289): 4.8e-92
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10 20 30
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTV
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XP_011 QRERLRLHARRIQTLAFHPPQHPGAGCVALLSRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLV
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40 50 60 70 80 90
pF1KB6 EPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSP
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pF1KB6 QGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAEN
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XP_011 KKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAEN
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pF1KB6 PEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEP
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XP_011 LEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFA
::::: ..: :::..::::::: : .:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ..
XP_011 ISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGG
.::.:: . .:::::::::::::::::::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::
XP_011 LTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG
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340 350
pF1KB6 ILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR
::.::::..:.::::..:
XP_011 --------DVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPENETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFAR
370 380 390 400 410
>>XP_016873240 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (465 aa)
initn: 1498 init1: 1004 opt: 1485 Z-score: 1773.1 bits: 337.0 E(85289): 5e-92
Smith-Waterman score: 1485; 61.0% identity (84.3% similar) in 356 aa overlap (1-356:36-382)
10 20 30
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTV
.:.::::.: ::::..::::::::::.: :
XP_016 QRERLRLHARRIQTLAFHPPQHPGAGCVALLSRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLV
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40 50 60 70 80 90
pF1KB6 EPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSP
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XP_016 DPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APED
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pF1KB6 QGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAEN
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XP_016 KKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAEN
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160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEP
:: . ::. ::::.::::.:: . :: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::
XP_016 LEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEP
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220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFA
::::: ..: :::..::::::: : .:. :.. .: : ..: .::: .:.: . ..
XP_016 ISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYT
250 260 270 280 290 300
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pF1KB6 VTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGG
.::.:: . .:::::::::::::::::::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: ::
XP_016 LTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB6 ILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR
::.::::..:.::::..:
XP_016 --------DVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPENETPVDTNLIELDTNQRPSSHRTVAR
370 380 390 400 410
>>NP_064647 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform B [Ho (410 aa)
initn: 1492 init1: 1004 opt: 1479 Z-score: 1766.8 bits: 335.7 E(85289): 1.1e-91
Smith-Waterman score: 1479; 60.8% identity (84.2% similar) in 355 aa overlap (2-356:6-351)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCA
..::::.: ::::..::::::::::.: :.:.::::::::::.: :...: ::::
NP_064 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA
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pF1KB6 FRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQM
:::::.::.:.::::::::.: ..: : . . ::: :::::..:::..:::::...
NP_064 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
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pF1KB6 VTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAG
::::::::::::::.:: ::.:.:::.::::: :: . ::. ::::.::::.:: . :
NP_064 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 PGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQIT
: :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::::::: ..: :::..::::::: : .
NP_064 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
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pF1KB6 DVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTN
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NP_064 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHE
:::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: :: ::.::::..:.::::..:
NP_064 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG--------DVAVELPFTLMHPKPKEE
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pF1KB6 AAR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]