Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6508
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6508, 384 aa
1>>>pF1KB6508 384 - 384 aa - 384 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3179+/-0.0012; mu= 16.6609+/- 0.072
mean_var=128.6743+/-47.376, 0's: 0 Z-trim(102.7): 326 B-trim: 961 in 2/45
Lambda= 0.113065
statistics sampled from 6489 (7065) to 6489 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 2558 429.6 2.3e-120
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 1407 241.8 7.7e-64
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 1292 223.1 3.5e-58
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 627 114.7 1.7e-25
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 627 114.8 1.9e-25
CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 ( 427) 606 111.2 1.7e-24
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 602 110.6 2.8e-24
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 521 97.3 2.4e-20
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 521 97.3 2.4e-20
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 504 94.5 1.7e-19
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 488 92.0 1.1e-18
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 476 90.0 3.9e-18
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 474 89.7 5.3e-18
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 470 89.0 7.7e-18
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 469 88.8 8.6e-18
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 444 84.8 1.6e-16
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 436 83.3 3.2e-16
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 436 83.5 3.8e-16
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 433 83.0 5.4e-16
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 433 83.0 5.4e-16
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 433 83.1 6.1e-16
CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7 ( 613) 431 82.9 8.5e-16
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 427 82.0 1e-15
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 413 79.7 5.1e-15
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 406 78.6 1.1e-14
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 400 77.6 2.2e-14
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 396 76.9 3.4e-14
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 385 75.1 1.1e-13
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 382 74.8 1.9e-13
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 377 73.9 3.1e-13
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 374 73.3 4e-13
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 365 71.8 1.1e-12
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 354 70.0 3.7e-12
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 353 69.9 4.2e-12
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 353 69.9 4.3e-12
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 352 69.7 4.7e-12
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 352 69.8 4.9e-12
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 352 69.8 4.9e-12
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 351 69.6 5.8e-12
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 347 69.0 9.1e-12
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 345 68.5 9.9e-12
CCDS1420.1 GPR37L1 gene_id:9283|Hs108|chr1 ( 481) 345 68.7 1.2e-11
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 330 66.2 6.4e-11
>>CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX (384 aa)
initn: 2558 init1: 2558 opt: 2558 Z-score: 2274.4 bits: 429.6 E(32554): 2.3e-120
Smith-Waterman score: 2558; 100.0% identity (100.0% similar) in 384 aa overlap (1-384:1-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALNDCFLLNLEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MALNDCFLLNLEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LIKIFCTVKSMRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGCKLIPFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LIKIFCTVKSMRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGCKLIPFIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LTSVGVSVFTLTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAVFSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LTSVGVSVFTLTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAVFSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LHPFHEESTNQTFISCAPYPHSNELHPKIHSMASFLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNLIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LHPFHEESTNQTFISCAPYPHSNELHPKIHSMASFLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNLIQS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AYNLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDTSMLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AYNLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDTSMLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 FVTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTGRSTTCMTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FVTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTGRSTTCMTS
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB6 LKSTNPSVATFSLINGNICHERYV
::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKSTNPSVATFSLINGNICHERYV
370 380
>>CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 1371 init1: 686 opt: 1407 Z-score: 1259.6 bits: 241.8 E(32554): 7.7e-64
Smith-Waterman score: 1407; 59.3% identity (83.9% similar) in 354 aa overlap (28-377:30-382)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MALNDCFLLNLEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILY-VIPAVYGVIILIGLIG
::..: . .. :::..: .:: .::.:
CCDS51 MPSKSLSNLSVTTGANESGSVPEGWERDFLPASDGTTTELVIRCVIPSLYLLIITVGLLG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 NITLIKIFCTVKSMRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGCKLIP
:: :.::: : ..::.:::.:::.:: ::::::.::.:::::::. :.:.::..::::::
CCDS51 NIMLVKIFITNSAMRSVPNIFISNLAAGDLLLLLTCVPVDASRYFFDEWMFGKVGCKLIP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FIQLTSVGVSVFTLTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAV
:::::::::::::::::::::.::: :::.:.: ::.. :.:: ::..:.:::.::::
CCDS51 VIQLTSVGVSVFTLTALSADRYRAIVNPMDMQTSGALLRTCVKAMGIWVVSVLLAVPEAV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 FSDLHPFHEESTNQTFISCAPYPHSNELHPKIHSMASFLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNL
::.. . . :..: .: :::...::::::::. :::...:::.:::.::: :::.:
CCDS51 FSEVARISSLD-NSSFTACIPYPQTDELHPKIHSVLIFLVYFLIPLAIISIYYYHIAKTL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 IQSAYNLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDTS
:.::.::: : : :.:::.:.:::::: :::::: : :::.:::..:.:::..:.:.: :
CCDS51 IKSAHNLPGEYNEHTKKQMETRKRLAKIVLVFVGCFIFCWFPNHILYMYRSFNYNEIDPS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MLHFVTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIR--SHSTGRST
. :..... ::.:.: :::::::::::::.:::..::.:: : . . : :. . :.
CCDS51 LGHMIVTLVARVLSFGNSCVNPFALYLLSESFRRHFNSQLCCGRKSYQERGTSYLLSSSA
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB6 TCMTSLKSTNPSVATFS-LINGNICHERYV
. ::::::. ...: : :.::.
CCDS51 VRMTSLKSNAKNMVTNSVLLNGHSMKQEMAL
360 370 380 390
>>CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX (399 aa)
initn: 1263 init1: 1047 opt: 1292 Z-score: 1158.1 bits: 223.1 E(32554): 3.5e-58
Smith-Waterman score: 1292; 58.6% identity (84.4% similar) in 326 aa overlap (22-341:24-349)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MALNDCFLLNLEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWS---HPGI--LYVIPAVYGVIILI
:: .. .: :: ::: : .: .:.::: .
CCDS14 MAQRQPHSPNQTLISITNDTESSSSVVSNDNTNKGWSGDNSPGIEALCAIYITYAVIISV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GLIGNITLIKIFCTVKSMRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGC
:..:: :::.: .:::..:::.::.:::.::::::.::.::::..:::. ::::::::
CCDS14 GILGNAILIKVFFKTKSMQTVPNIFITSLAFGDLLLLLTCVPVDATHYLAEGWLFGRIGC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 KLIPFIQLTSVGVSVFTLTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAI
:.. ::.:::::::::::: ::::::::.:.:.. : :.:..: :.::. .::.::..:.
CCDS14 KVLSFIRLTSVGVSVFTLTILSADRYKAVVKPLERQPSNAILKTCVKAGCVWIVSMIFAL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PEAVFSDLHPFHEESTNQTFISCAPYPHSNELHPKIHSMASFLVFYVIPLSIISVYYYFI
:::.::... :.. . :.:: ::. :: :..: .:::. :::::.:::::::::: .:
CCDS14 PEAIFSNVYTFRDPNKNMTFESCTSYPVSKKLLQEIHSLLCFLVFYIIPLSIISVYYSLI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 AKNLIQSAYNLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSY-HYS
:..: .:. :.:.: . :..::::::::.:.::::.:.:::.::::::..:::.:. .
CCDS14 ARTLYKSTLNIPTEEQSHARKQIESRKRIARTVLVLVALFALCWLPNHLLYLYHSFTSQT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EVDTSMLHFVTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTG
:: : .::. .: .:.:::.:::::::::: :::::.:.:..::.::.
CCDS14 YVDPSAMHFIFTIFSRVLAFSNSCVNPFALYWLSKSFQKHFKAQLFCCKAERPEPPVADT
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KB6 RSTTCMTSLKSTNPSVATFSLINGNICHERYV
CCDS14 SLTTLAVMGTVPGTGSIQMSEISVTSFTGCSVKQAEDRF
370 380 390
>>CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (442 aa)
initn: 555 init1: 384 opt: 627 Z-score: 571.4 bits: 114.7 E(32554): 1.7e-25
Smith-Waterman score: 627; 32.1% identity (65.9% similar) in 340 aa overlap (41-371:102-433)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 LEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNITLIKIFCTVKS
:. .: .....:.::: ::..:. :
CCDS94 PKGDRTAGSPPRTISPPPCQGPIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKC
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 MRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGCKLIPFIQLTSVGVSVFT
::: ::..:.:::::::: .. :... . ::. : :: :::.:::: .:::..:..
CCDS94 MRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLS
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 LTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAVFSDLHPFHEESTN
: ::: :::.:.. :.. . .. ..::..:..::.:::. :. . ...
CCDS94 LCALSIDRYRAVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDIITMDYKGSY
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240
pF1KB6 QTFISCAPYPHSNELHPKIHSMAS----FLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNLIQSAYNLPV
. : .: .. .... :. : .. .::.: . .: ... ..... .. .
CCDS94 LRI--CLLHPVQKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEMLRKKSGMQI
260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDTS---MLHF--
: :.:. :...::::. .: .::.:::: :. . . :.. : . .: :
CCDS94 ALNDHLKQ----RREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLL
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTGRSTTCMTSL
: . . .: :::.::.::::.:: :.. :.. ::: . ...: .. .:. ..
CCDS94 VLDYIGINMASLNSCINPIALYLVSKRFKNCFKS-CLCCWCQSFEEKQSLEEKQSCL-KF
370 380 390 400 410 420
370 380
pF1KB6 KSTNPSVATFSLINGNICHERYV
:... . .:
CCDS94 KANDHGYDNFRSSNKYSSS
430 440
>>CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (532 aa)
initn: 555 init1: 384 opt: 627 Z-score: 570.5 bits: 114.8 E(32554): 1.9e-25
Smith-Waterman score: 627; 32.1% identity (65.9% similar) in 340 aa overlap (41-371:192-523)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 LEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNITLIKIFCTVKS
:. .: .....:.::: ::..:. :
CCDS55 PKGDRTAGSPPRTISPPPCQGPIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKC
170 180 190 200 210 220
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 MRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGCKLIPFIQLTSVGVSVFT
::: ::..:.:::::::: .. :... . ::. : :: :::.:::: .:::..:..
CCDS55 MRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLS
230 240 250 260 270 280
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 LTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAVFSDLHPFHEESTN
: ::: :::.:.. :.. . .. ..::..:..::.:::. :. . ...
CCDS55 LCALSIDRYRAVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDIITMDYKGSY
290 300 310 320 330 340
200 210 220 230 240
pF1KB6 QTFISCAPYPHSNELHPKIHSMAS----FLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNLIQSAYNLPV
. : .: .. .... :. : .. .::.: . .: ... ..... .. .
CCDS55 LRI--CLLHPVQKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEMLRKKSGMQI
350 360 370 380 390
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDTS---MLHF--
: :.:. :...::::. .: .::.:::: :. . . :.. : . .: :
CCDS55 ALNDHLKQ----RREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLL
400 410 420 430 440 450
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTGRSTTCMTSL
: . . .: :::.::.::::.:: :.. :.. ::: . ...: .. .:. ..
CCDS55 VLDYIGINMASLNSCINPIALYLVSKRFKNCFKS-CLCCWCQSFEEKQSLEEKQSCL-KF
460 470 480 490 500 510
370 380
pF1KB6 KSTNPSVATFSLINGNICHERYV
:... . .:
CCDS55 KANDHGYDNFRSSNKYSSS
520 530
>>CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 (427 aa)
initn: 422 init1: 237 opt: 606 Z-score: 553.1 bits: 111.2 E(32554): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 606; 33.3% identity (66.3% similar) in 312 aa overlap (41-340:81-387)
20 30 40 50 60 70
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:. .. .:...:..:: ::..:. :
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80 90 100 110 120
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::: :: .:.:::::::. .. :... . :: :: : : . :::.::.: .:::
CCDS37 MRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVG
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
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..:..: :::.:::.:.. .:. . .. . :::.:..::::::. . ::
CCDS37 ITVLNLCALSVDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVMVPF-
180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 EESTNQTFISCAPYPHSN--ELHPKIHSMASFLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNLIQSAYN
: .. .: :. :.. ... : .. .:: ...: ... ... . :
CCDS37 -EYRGEQHKTCMLNATSKFMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEML-NRRN
230 240 250 260 270 280
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.. : .......:...::::. .: .::.::.: :. . .. :.:.: . .:
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310 320 330 340 350
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:. . . :: :::.::.:::..::.:.. :.. : ::
CCDS37 FLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSI
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360 370 380
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CCDS37 QWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
410 420
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20 30 40 50 60 70
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:. .: .....:.::: ::..:. :
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80 90 100 110 120 130
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::: ::..:.:::::::: .. :... . ::. : :: :::.:::: .:::..:..
CCDS45 MRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLS
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140 150 160 170 180 190
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: ::: :::.:.. :.. . .. ..::..:..::.:::. :. . ...
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200 210 220 230 240
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. : .: .. .... :. : .. .::.: . .: ... ..... .. .
CCDS45 LRI--CLLHPVQKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEMLRKKSGMQI
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250 260 270 280 290 300
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: :.:. :...::::. .: .::.:::: :. . . :.. : . .: :
CCDS45 ALNDHLKQ----RREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLL
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310 320 330 340 350 360
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: . . .: :::.::.::::.:: :.. :
CCDS45 VLDYIGINMASLNSCINPIALYLVSKRFKNCFKAGPHVGNKLVMLFSVNIECDGTVNQNP
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370 380
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CCDS45 TMWPERKSNNN
430
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10 20 30 40
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:.:: :.:. :.: ..: :::::::....::: ..:.:. . : : . : :
CCDS76 GWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLA--I
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: .: .::.: :: : .: : . : . :.: . .... . .:: :..::
CCDS76 WALSAVLALPAAV----HTYHVELKPHDVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLL
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CCDS76 VILLSYVRVSVKL----RNRVVPGCVTQSQADWDRARRRRTFCLLVVIVVVFAVCWLPLH
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:. : :. .: . .: .: . ::....: ::: : :::... .::
CCDS76 VFNLLRDLDPHAIDPYAFGLVQLLC-HWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELR-KLLVAW
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:
CCDS76 PRKIAPHGQNMTVSVVI
360 370
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... . : ... . :.: .. ...: : .:.:..:. . :.:::...
CCDS79 TGDLENTTKVQCYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIA
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. .:: ...:.:: . ..:.: ::.::.: :.. :. : . :
CCDS79 GHFRKERIEG-------LRKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSLLHWPCD
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CCDS79 EKSASYSSGHSQGPGPNMGK--GGEQMHEKSIPYSQETLVVD
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>>CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 (384 aa)
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CCDS34 MNSTLFSQVE-NHSVHSNFSEKNAQLLAFENDDCHLPLAMIFTLALAYGAVIILGVSG
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CCDS34 NLALIIIILKQKEMRNVTNILIVNLSFSDLLVAIMCLPFTFVYTLMDHWVFGEAMCKLNP
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CCDS34 TIAMSTMHTDVSKTSLKQASP-VA-FKKINNNDDNEKI
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384 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:51:33 2016 done: Sun Nov 6 12:51:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]