Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6286
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6286, 784 aa
1>>>pF1KB6286 784 - 784 aa - 784 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3055+/-0.0011; mu= 13.4147+/- 0.066
mean_var=243.9502+/-50.256, 0's: 0 Z-trim(111.4): 881 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.082115
statistics sampled from 11378 (12363) to 11378 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32370.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 ( 784) 5160 625.4 1.1e-178
CCDS73810.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 ( 654) 4238 516.1 7.5e-146
CCDS73809.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 ( 607) 2447 303.8 5.3e-82
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 733 101.0 8.5e-21
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 733 101.0 8.5e-21
CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 648 90.9 9e-18
CCDS77335.1 ZNF473 gene_id:25888|Hs108|chr19 ( 859) 631 88.9 3.8e-17
CCDS33077.1 ZNF473 gene_id:25888|Hs108|chr19 ( 871) 631 88.9 3.8e-17
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 616 87.0 1.1e-16
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 616 87.0 1.1e-16
CCDS12266.2 ZNF441 gene_id:126068|Hs108|chr19 ( 693) 610 86.3 1.9e-16
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 609 86.1 1.9e-16
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 609 86.2 2.2e-16
CCDS54312.1 ZNF611 gene_id:81856|Hs108|chr19 ( 636) 603 85.4 3.1e-16
CCDS12855.1 ZNF611 gene_id:81856|Hs108|chr19 ( 705) 603 85.5 3.3e-16
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19 ( 610) 589 83.7 9.7e-16
CCDS30773.1 GFI1 gene_id:2672|Hs108|chr1 ( 422) 577 82.1 2.1e-15
CCDS43677.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 567) 579 82.5 2.1e-15
CCDS33116.3 ZNF628 gene_id:89887|Hs108|chr19 (1059) 583 83.3 2.2e-15
CCDS47745.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 624) 579 82.6 2.2e-15
CCDS31089.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 289) 567 80.7 3.8e-15
CCDS73057.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 351) 567 80.8 4.2e-15
CCDS45460.1 ZNF771 gene_id:51333|Hs108|chr16 ( 317) 563 80.3 5.5e-15
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 564 80.7 6.9e-15
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 564 80.7 7e-15
CCDS59177.1 ZFP92 gene_id:139735|Hs108|chrX ( 416) 562 80.3 7.1e-15
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 564 80.7 7.2e-15
CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 563 80.6 7.4e-15
CCDS77368.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 441) 561 80.2 7.9e-15
CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 442) 561 80.2 7.9e-15
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 561 80.3 8.6e-15
CCDS1638.1 ZNF672 gene_id:79894|Hs108|chr1 ( 452) 560 80.1 8.7e-15
CCDS12981.1 ZNF324 gene_id:25799|Hs108|chr19 ( 553) 561 80.4 9.1e-15
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 561 80.4 9.1e-15
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 561 80.4 9.2e-15
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 563 80.8 9.2e-15
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 561 80.4 9.3e-15
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 562 80.6 9.5e-15
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 561 80.4 9.7e-15
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 562 80.6 9.8e-15
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 561 80.4 9.8e-15
CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 559 80.1 1.1e-14
CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 559 80.2 1.1e-14
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 557 79.8 1.1e-14
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 557 79.8 1.2e-14
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 557 79.8 1.2e-14
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 557 79.8 1.2e-14
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 557 79.8 1.2e-14
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 557 79.8 1.2e-14
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 561 80.6 1.2e-14
>>CCDS32370.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 (784 aa)
initn: 5160 init1: 5160 opt: 5160 Z-score: 3321.5 bits: 625.4 E(32554): 1.1e-178
Smith-Waterman score: 5160; 99.9% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEGAMAVRVTAAHTAEAQAEAGREAGEGAVAAVAAALAPSGFLGLPAPFSEEDEDDVHRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEGAMAVRVTAAHTAEAQAEAGREAGEGAVAAVAAALAPSGFLGLPAPFSEEDEDDVHRC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GRCQAEFTALEDFVQHKIQKACQRAPPEALPATPATTALLGQEVVPAAPGPEEPITVAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GRCQAEFTALEDFVQHKIQKACQRAPPEALPATPATTALLGQEVVPAAPGPEEPITVAHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VVEAASLAADISHASDLVGGGHIKEVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPHQQGLGLAGEGEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS32 VVEAASLAADISHASDLVGGGHIKEVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPRQQGLGLAGEGEQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QVKLLVNKDGRYVCALCHKTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QVKLLVNKDGRYVCALCHKTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AGLGTATSSVTGEPIETSPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AGLGTATSSVTGEPIETSPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 CSSEGSRENLLHQAMQNSGIVLERAAGEEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEVQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSSEGSRENLLHQAMQNSGIVLERAAGEEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEVQPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ETQVASEASAVPRTHPCPQCSETFPTAATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETQVASEASAVPRTHPCPQCSETFPTAATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVRGHRRVHSDERPYPCPKCGKRYKTKNAQQVHFRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVRGHRRVHSDERPYPCPKCGKRYKTKNAQQVHFRT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 HLEEKPHVCQFCSRGFREKGSLVRHVRHHTGEKPFKCYKCGRGFAEHGTLNRHLRTKGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLEEKPHVCQFCSRGFREKGSLVRHVRHHTGEKPFKCYKCGRGFAEHGTLNRHLRTKGGC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LLEVEELLVSEDSPAAATTVLTEDPHTVLVEFSSVVADTQEYIIEATADDAETSEATEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLEVEELLVSEDSPAAATTVLTEDPHTVLVEFSSVVADTQEYIIEATADDAETSEATEII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 EGTQTEVDSHIMKVVQQIVHQASAGHQIIVQNVTMDEETALGPEAAAADTITIATPESLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGTQTEVDSHIMKVVQQIVHQASAGHQIIVQNVTMDEETALGPEAAAADTITIATPESLT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 EQVAMTLASAISEGTVLAARAGTSGTEQATVTMVSSEDIEILEHAGELVIASPEGQLEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQVAMTLASAISEGTVLAARAGTSGTEQATVTMVSSEDIEILEHAGELVIASPEGQLEVQ
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 TVIV
::::
CCDS32 TVIV
>>CCDS73810.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 (654 aa)
initn: 4238 init1: 4238 opt: 4238 Z-score: 2732.0 bits: 516.1 E(32554): 7.5e-146
Smith-Waterman score: 4238; 99.8% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEGAMAVRVTAAHTAEAQAEAGREAGEGAVAAVAAALAPSGFLGLPAPFSEEDEDDVHRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MEGAMAVRVTAAHTAEAQAEAGREAGEGAVAAVAAALAPSGFLGLPAPFSEEDEDDVHRC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GRCQAEFTALEDFVQHKIQKACQRAPPEALPATPATTALLGQEVVPAAPGPEEPITVAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GRCQAEFTALEDFVQHKIQKACQRAPPEALPATPATTALLGQEVVPAAPGPEEPITVAHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VVEAASLAADISHASDLVGGGHIKEVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPHQQGLGLAGEGEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS73 VVEAASLAADISHASDLVGGGHIKEVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPRQQGLGLAGEGEQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QVKLLVNKDGRYVCALCHKTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QVKLLVNKDGRYVCALCHKTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AGLGTATSSVTGEPIETSPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AGLGTATSSVTGEPIETSPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 CSSEGSRENLLHQAMQNSGIVLERAAGEEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEVQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CSSEGSRENLLHQAMQNSGIVLERAAGEEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEVQPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ETQVASEASAVPRTHPCPQCSETFPTAATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ETQVASEASAVPRTHPCPQCSETFPTAATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVRGHRRVHSDERPYPCPKCGKRYKTKNAQQVHFRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVRGHRRVHSDERPYPCPKCGKRYKTKNAQQVHFRT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 HLEEKPHVCQFCSRGFREKGSLVRHVRHHTGEKPFKCYKCGRGFAEHGTLNRHLRTKGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HLEEKPHVCQFCSRGFREKGSLVRHVRHHTGEKPFKCYKCGRGFAEHGTLNRHLRTKGGC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LLEVEELLVSEDSPAAATTVLTEDPHTVLVEFSSVVADTQEYIIEATADDAETSEATEII
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLEVEELLVSEDSPAAATTVLTEDPHTVPLRTMRRPVRPRRSSRAPRQRWTATS
610 620 630 640 650
>>CCDS73809.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 (607 aa)
initn: 2553 init1: 2447 opt: 2447 Z-score: 1585.7 bits: 303.8 E(32554): 5.3e-82
Smith-Waterman score: 3546; 77.3% identity (77.4% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-607)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEGAMAVRVTAAHTAEAQAEAGREAGEGAVAAVAAALAPSGFLGLPAPFSEEDEDDVHRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MEGAMAVRVTAAHTAEAQAEAGREAGEGAVAAVAAALAPSGFLGLPAPFSEEDEDDVHRC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GRCQAEFTALEDFVQHKIQKACQRAPPEALPATPATTALLGQEVVPAAPGPEEPITVAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GRCQAEFTALEDFVQHKIQKACQRAPPEALPATPATTALLGQEVVPAAPGPEEPITVAHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VVEAASLAADISHASDLVGGGHIKEVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPHQQGLGLAGEGEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS73 VVEAASLAADISHASDLVGGGHIKEVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPRQQGLGLAGEGEQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QVKLLVNKDGRYVCALCHKTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QVKLLVNKDGRYVCALCHKTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AGLGTATSSVTGEPIETSPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AGLGTATSSVTGEPIETSPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 CSSEGSRENLLHQAMQNSGIVLERAAGEEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEVQPL
:::::::::::::
CCDS73 CSSEGSRENLLHQ-----------------------------------------------
370
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ETQVASEASAVPRTHPCPQCSETFPTAATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKK
CCDS73 ------------------------------------------------------------
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVRGHRRVHSDERPYPCPKCGKRYKTKNAQQVHFRT
CCDS73 ------------------------------------------------------------
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 HLEEKPHVCQFCSRGFREKGSLVRHVRHHTGEKPFKCYKCGRGFAEHGTLNRHLRTKGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ----------FCSRGFREKGSLVRHVRHHTGEKPFKCYKCGRGFAEHGTLNRHLRTKGGC
380 390 400 410 420
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LLEVEELLVSEDSPAAATTVLTEDPHTVLVEFSSVVADTQEYIIEATADDAETSEATEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLEVEELLVSEDSPAAATTVLTEDPHTVLVEFSSVVADTQEYIIEATADDAETSEATEII
430 440 450 460 470 480
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CCDS73 EQVAMTLASAISEGTVLAARAGTSGTEQATVTMVSSEDIEILEHAGELVIASPEGQLEVQ
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CCDS73 TVIV
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CCDS33 RIHSGEKPYVCDYCGKAFGLSAELVRHQRIHTGEKPYVCQECGKAFTQSSCLSIHRRVHT
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CCDS33 GEKPYRCGECGKAFAQKANLTQHQRIHTGEKPYSCNVCGKAFVLSAHLNQHLRVHTQETL
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CCDS54 EPDQCEKFRKAFSHLTDLRKHQKINAREKPYECEECGKVFSYPANLAQHGKVHV-EKPYE
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CCDS54 CKECGEAFRTSRQLTVHHRFHYGEKPYECKECGKAFSVYGRLSRH-QSIH--TGEKPFEC
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CCDS54 NK----CGKSFRL-----KAGLKVHQSIHTGE----KP--HECKEC-GKAFR----QFSH
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