Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6263
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6263, 688 aa
1>>>pF1KB6263 688 - 688 aa - 688 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8760+/-0.00113; mu= 9.1818+/- 0.067
mean_var=250.2781+/-52.563, 0's: 0 Z-trim(111.4): 923 B-trim: 537 in 1/50
Lambda= 0.081070
statistics sampled from 11288 (12322) to 11288 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 4.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS84.1 ZBTB48 gene_id:3104|Hs108|chr1 ( 688) 4802 575.6 8e-164
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CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 897 119.0 2.8e-26
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 897 119.0 2.8e-26
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 897 119.0 2.8e-26
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 881 117.1 9.5e-26
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CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 877 116.5 1.2e-25
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 872 115.8 1.5e-25
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 867 115.2 2.2e-25
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 865 115.0 2.8e-25
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 859 114.1 3.6e-25
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 865 115.3 3.8e-25
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 862 114.9 4.7e-25
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 862 115.0 5.1e-25
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 857 114.2 6.1e-25
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 855 113.9 6.7e-25
CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 ( 498) 853 113.6 7.1e-25
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 855 114.0 7.1e-25
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 856 114.2 7.3e-25
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 857 114.4 7.8e-25
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 852 113.6 9.1e-25
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 852 113.6 9.4e-25
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 852 113.8 1.2e-24
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 850 113.5 1.3e-24
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 850 113.6 1.3e-24
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 846 112.9 1.4e-24
CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 846 112.9 1.5e-24
CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 846 112.9 1.5e-24
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 846 112.9 1.5e-24
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 843 112.6 2e-24
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 843 112.7 2.2e-24
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 843 112.7 2.2e-24
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 843 112.7 2.2e-24
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 843 112.7 2.2e-24
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 841 112.4 2.5e-24
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 840 112.2 2.5e-24
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 839 112.1 2.7e-24
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 840 112.3 2.7e-24
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 837 111.9 3.1e-24
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 836 111.8 3.6e-24
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 836 111.8 3.7e-24
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 833 111.3 3.8e-24
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 830 110.9 4.3e-24
CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 591) 832 111.2 4.4e-24
CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 635) 832 111.3 4.6e-24
CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 653) 832 111.3 4.6e-24
CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 654) 832 111.3 4.7e-24
CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 657) 832 111.3 4.7e-24
CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 667) 832 111.3 4.7e-24
>>CCDS84.1 ZBTB48 gene_id:3104|Hs108|chr1 (688 aa)
initn: 4802 init1: 4802 opt: 4802 Z-score: 3054.6 bits: 575.6 E(32554): 8e-164
Smith-Waterman score: 4802; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDGSFVQHSVRVLQELNKQREKGQYCDATLDVGGLVFKAHWSVLACCSHFFQSLYGDGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MDGSFVQHSVRVLQELNKQREKGQYCDATLDVGGLVFKAHWSVLACCSHFFQSLYGDGSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GSVVLPAGFAEIFGLLLDFFYTGHLALTSGNRDQVLLAARELRVPEAVELCQSFKPKTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GSVVLPAGFAEIFGLLLDFFYTGHLALTSGNRDQVLLAARELRVPEAVELCQSFKPKTSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GQAAGGQSGLGPPASQNVNSHVKEPAGLEEEEVSRTLGLVPRDQEPRGSHSPQRPQLHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GQAAGGQSGLGPPASQNVNSHVKEPAGLEEEEVSRTLGLVPRDQEPRGSHSPQRPQLHSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 AQSEGPSSLCGKLKQALKPCPLEDKKPEDCKVPPRPLEAEGAQLQGGSNEWEVVVQVEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AQSEGPSSLCGKLKQALKPCPLEDKKPEDCKVPPRPLEAEGAQLQGGSNEWEVVVQVEDD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GDGDYMSEPEAVLTRRKSNVIRKPCAAEPALSAGSLAAEPAENRKGTAVPVECPTCHKKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GDGDYMSEPEAVLTRRKSNVIRKPCAAEPALSAGSLAAEPAENRKGTAVPVECPTCHKKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSKYYLKVHNRKHTGEKPFECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LSKYYLKVHNRKHTGEKPFECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRMELRVHMVSHTGEMPYKCSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RRMELRVHMVSHTGEMPYKCSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ELQLHEAFKHRGEKLFVCEECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ELQLHEAFKHRGEKLFVCEECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB6 NMHLRTHTGEKPFQCHLCGKTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NMHLRTHTGEKPFQCHLCGKTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHV
490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 ASRHQEGRPHFCQICGKTFKAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ASRHQEGRPHFCQICGKTFKAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIH
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pF1KB6 DRVENYNPRQRKLRNLIIEDEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DRVENYNPRQRKLRNLIIEDEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRL
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB6 CAEESFTGPGVLEPSLIITAAVPEDCDT
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CAEESFTGPGVLEPSLIITAAVPEDCDT
670 680
>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 (699 aa)
initn: 1992 init1: 298 opt: 911 Z-score: 595.0 bits: 120.6 E(32554): 8e-27
Smith-Waterman score: 911; 38.9% identity (66.0% similar) in 321 aa overlap (280-600:384-696)
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EAVLTRRKSNVIRKPCAAEPALSAGSLAAEPAENRKGTAVPVECPTCHKKFLSKYYLKVH
: ... : : ::: : : : : :. :
CCDS35 SVHQKVHIRAKPYEYNECGKSCSMNSHLIWPQKSHTGEK-PYECPECGKAFSEKSRLRKH
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310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NRKHTGEKPFECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFRRRMELRVHM
.: ::::::..: : : . : .: :. . .:. : : : ..: . : ::.
CCDS35 QRTHTGEKPYKCDGCDKAFSAKSGLRIHQRTH---TGEKPFECHECGKSFNYKSILIVHQ
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370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VSHTGEMPYKCSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRTELQLHEAFK
.:::: :..:. :...: . . :..: . : . .:. : :.: : .. :. :.
CCDS35 RTHTGEKPFECNECGKSFSHMSGLRNHR-RTHTGERPYKCDECGKAFKLKSGLRKHHR-T
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430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HRGEKLFVCEECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTG
: ::: . :..::. .... :. : . : .:.:. :. :..::.::.:: .: :::::
CCDS35 HTGEKPYKCNQCGKAFGQKSQLRGHHRI-HTGEKPYKCNHCGEAFSQKSNLRVHHRTHTG
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pF1KB6 EKPFQCHLCGKTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHVASRHQEGRP
:::.::. :::::: ...: :.::::::.:. :. : . :.::. : .: : .:
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pF1KB6 HFCQICGKTFKAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIHDRVENYNPR
. :. ::..:. .:::: : : : . ..: .:: :.... ::.:.. :
CCDS35 YNCNQCGEAFSQKSNLRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSSLREHQKAHPGD
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610 620 630 640 650 660
pF1KB6 QRKLRNLIIEDEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRLCAEESFTGP
>>CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 (816 aa)
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Smith-Waterman score: 897; 38.6% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (290-600:375-678)
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 VIRKPCAAEPALSAGSLAAEPAENRKGTAVPVECPTCHKKFLSKYYLKVHNRKHTGEKPF
: : : : :. : .. .:.: ::::::.
CCDS35 GKHFECTECGKAFTRKSTLSMHQKIHTGEKPYVCTECGKAFIRKSHFITHERIHTGEKPY
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pF1KB6 ECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFRRRMELRVHMVSHTGEMPYK
:: ::: ...: .: :. .. .:. : :: : ..: .. .: .:. :::: ::
CCDS35 ECSDCGKSFIKKSQLHVHQR---IHTGENPFICSECGKVFTHKTNLIIHQKIHTGERPYI
410 420 430 440 450 460
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pF1KB6 CSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRTELQLHEAFKHRGEKLFVCE
:. :.. : ....: .:. :.: . ::. : :.: : ...:..:. : ::. . :
CCDS35 CTVCGKAFTDRSNLIKHQ-KIHTGEKPYKCSDCGKSFTWKSRLRIHQKC-HTGERHYECS
470 480 490 500 510
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 ECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTGEKPFQCHLCG
:::. ... :.:: . ::.:.:.:: :..:: .:... : : ::::::..: .::
CCDS35 ECGKAFIQKSTLSMHQRI-HRGEKPYVCTECGKAFFHKSHFITHERIHTGEKPYECSICG
520 530 540 550 560 570
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 KTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHVASRHQEGRPHFCQICGKTF
:.: ...: :.. ::::.:. : : . ::... :. : . : .:. :. :::.:
CCDS35 KSFTKKSQLHVHQQIHTGEKPYRCAECGKAFTDRSNLFTH-QKIHTGEKPYKCSDCGKAF
580 590 600 610 620 630
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 KAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIHDRVENYNPRQRKLRNLIIE
:..: . : : :..::.::: :.:.. : :..::
CCDS35 TRKSGLHIHQQSHTGERHYECSECGKAFARKSTLIMHQRIHTGEKPYICNECGKSFIQKS
640 650 660 670 680 690
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 DEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRLCAEESFTGPGVLEPSLIIT
CCDS35 HLNRHRRIHTGEKPYECSDCGKSFIKKSQLHEHHRIHTGEKPYICAECGKAFTIRSNLIK
700 710 720 730 740 750
>>CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 (852 aa)
initn: 2355 init1: 304 opt: 897 Z-score: 585.2 bits: 119.0 E(32554): 2.8e-26
Smith-Waterman score: 897; 38.6% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (290-600:411-714)
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 VIRKPCAAEPALSAGSLAAEPAENRKGTAVPVECPTCHKKFLSKYYLKVHNRKHTGEKPF
: : : : :. : .. .:.: ::::::.
CCDS35 GKHFECTECGKAFTRKSTLSMHQKIHTGEKPYVCTECGKAFIRKSHFITHERIHTGEKPY
390 400 410 420 430 440
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 ECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFRRRMELRVHMVSHTGEMPYK
:: ::: ...: .: :. .. .:. : :: : ..: .. .: .:. :::: ::
CCDS35 ECSDCGKSFIKKSQLHVHQR---IHTGENPFICSECGKVFTHKTNLIIHQKIHTGERPYI
450 460 470 480 490
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pF1KB6 CSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRTELQLHEAFKHRGEKLFVCE
:. :.. : ....: .:. :.: . ::. : :.: : ...:..:. : ::. . :
CCDS35 CTVCGKAFTDRSNLIKHQ-KIHTGEKPYKCSDCGKSFTWKSRLRIHQKC-HTGERHYECS
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440 450 460 470 480 490
pF1KB6 ECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTGEKPFQCHLCG
:::. ... :.:: . ::.:.:.:: :..:: .:... : : ::::::..: .::
CCDS35 ECGKAFIQKSTLSMHQRI-HRGEKPYVCTECGKAFFHKSHFITHERIHTGEKPYECSICG
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500 510 520 530 540 550
pF1KB6 KTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHVASRHQEGRPHFCQICGKTF
:.: ...: :.. ::::.:. : : . ::... :. : . : .:. :. :::.:
CCDS35 KSFTKKSQLHVHQQIHTGEKPYRCAECGKAFTDRSNLFTH-QKIHTGEKPYKCSDCGKAF
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 KAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIHDRVENYNPRQRKLRNLIIE
:..: . : : :..::.::: :.:.. : :..::
CCDS35 TRKSGLHIHQQSHTGERHYECSECGKAFARKSTLIMHQRIHTGEKPYICNECGKSFIQKS
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620 630 640 650 660 670
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CCDS35 HLNRHRRIHTGEKPYECSDCGKSFIKKSQLHEHHRIHTGEKPYICAECGKAFTIRSNLIK
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: : : : :. : .. .:.: ::::::.
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CCDS59 ECSDCGKSFIKKSQLHVHQR---IHTGENPFICSECGKVFTHKTNLIIHQKIHTGERPYI
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:. :.. : ....: .:. :.: . ::. : :.: : ...:..:. : ::. . :
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CCDS59 ECGKAFIQKSTLSMHQRI-HRGEKPYVCTECGKAFFHKSHFITHERIHTGEKPYECSICG
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:.: ...: :.. ::::.:. : : . ::... :. : . : .:. :. :::.:
CCDS59 KSFTKKSQLHVHQQIHTGEKPYRCAECGKAFTDRSNLFTH-QKIHTGEKPYKCSDCGKAF
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560 570 580 590 600 610
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:..: . : : :..::.::: :.:.. : :..::
CCDS59 TRKSGLHIHQQSHTGERHYECSECGKAFARKSTLIMHQRIHTGEKPYICNECGKSFIQKS
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CCDS59 HLNRHRRIHTGEKPYECSDCGKSFIKKSQLHEHHRIHTGEKPYICAECGKAFTIRSNLIK
740 750 760 770 780 790
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320 330 340 350 360 370
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: : : .:.: .:..:.. .. .:. . :: :...::.: : :. .:::: :.
CCDS31 GCSDCRKAFFEKSELIRHQT---IHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHG
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380 390 400 410 420 430
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: .:.. : ::. : ::.. : . :: : :.: : ...: :. : ::: . :
CCDS31 CIQCGKAFSQKSHLISHQMT-HTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQR-THTGEKPYECS
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CCDS31 ECGKAFSEKLSLTNHQRI-HTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECG
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500 510 520 530 540 550
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CCDS31 KAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTH--QRIHTGEKPYECSLCRKA
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560 570 580 590 600 610
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: .: :.: : : . .::.:: : ... : :..::
CCDS31 FFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRK
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620 630 640 650 660 670
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CCDS31 SHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLI
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CCDS35 ERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTY
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CCDS35 ECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHE---CNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHK
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pF1KB6 ECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTGEKPFQCHLCG
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CCDS35 ECEKAFSQKSYLMLHQRG-HTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECG
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CCDS35 KAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIH-QRTHTGEKPYACTECGKAF
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. . :: : : : . ..::::: ::....: :.. :
CCDS35 REKSTFTVHQRTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
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620 630 640 650 660 670
pF1KB6 DEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRLCAEESFTGPGVLEPSLIIT
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: :: : : : .: : ::.. ::::: .
CCDS35 ERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTY
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CCDS35 ECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHE---CNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHK
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CCDS35 CTECGKSFNEKSTLIVHQ-RTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQR-THSGEKPFECN
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CCDS35 ECEKAFSQKSYLMLHQRG-HTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECG
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CCDS35 KAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIH-QRTHTGEKPYACTECGKAF
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. . :: : : : . ..::::: ::....: :.. :
CCDS35 REKSTFTVHQRTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
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pF1KB6 DEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRLCAEESFTGPGVLEPSLIIT
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CCDS68 MLEEGVLPSPGPALPQEENTGEEGMAAGLLTA-GPRGSTFFSSVTVAFA----
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CCDS68 QERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNS---QLEQREGAWMLEG---E
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pF1KB6 DCKVPPRPLEAEGAQLQGGSNEWEVVVQV--EDD------GDGDY-MSEPEAVLTRRK--
: . : : : .. .:: ... .. .: ::.:. :. : .. :
CCDS68 DLR-SPSP----GWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVL
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: : : :.: . . . . .: : : : : : : : :. :...:::
CCDS68 SPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTG
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pF1KB6 EKPFECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFRRRMELRVHMVSHTGE
:::.:: .::: . .. .:..:. .. .:. . :: : ..: . .: :. .::::
CCDS68 EKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQR---IHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGE
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 MPYKCSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRTELQLHEAFKHRGEKL
::.:: : . : . . : .:. ..: . ::. : :.: : ..: :. : :::
CCDS68 KPYRCSECEKAFSDCSALVQHQ-RIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQR-THTGEKP
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pF1KB6 FVCEECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPHVCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTGEKPFQC
. : :::. : .. .: . : .:.:. : :..::.:.:::. : ::::::::..:
CCDS68 YKCSECGKAFSYCAAFIQHQRI-HTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKC
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 HLCGKTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHVASRHQEGRPHFCQIC
:::.: ...: :..:::::.:..:. : . :.:.. :.:: : .:. :. :
CCDS68 SECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHII-HTGEKPYECNEC
400 410 420 430 440 450
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pF1KB6 GKTFKAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIHDRVENYNPRQRKLRN
::.:. .: : : : ::. .::.::: : .. . ::...:
CCDS68 GKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
460 470 480 490
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pF1KB6 LIIEDEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGGLASQLPGQRLCAEESFTGPGVLEPS
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pF1KB6 GQAAGGQSGLGPPASQNVNSHVKEPAGLEEEEVSRTLGLVPRDQEPRGSHSPQRPQ--LH
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CCDS69 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLG
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pF1KB6 SPAQSEGPSSLCGKLKQALKPCPLEDKKPEDCKVPPRPLEAEGAQLQGGSNEWEVVVQV-
:... : .: .:.: :: :: . : . : .. .:: ... ..
CCDS69 LPVSQPGMNS---QLEQREGAWMLEG---EDLRSP-----SPGWKIISGSPPEQALSEAS
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pF1KB6 -EDD------GDGDY-MSEPEAVLTRRK--SNVIRKPCAAEP-ALSAGSLAAEPAENRKG
.: ::.:. :. : .. : : : : :.: . . . . .: :
CCDS69 FQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKP
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pF1KB6 -TAVPVECPTCHKKFLSKYYLKVHNRKHTGEKPFECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNR
: : : : : : :. :...::::::.:: .::: . .. .:..:. ..
CCDS69 HRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQR---IHT
170 180 190 200 210 220
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pF1KB6 SEQVFTCSVCQETFRRRMELRVHMVSHTGEMPYKCSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPK
.:. . :: : ..: . .: :. .:::: ::.:: : . : . . : .:. ..: . :
CCDS69 GEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQ-RIHTGEK
230 240 250 260 270
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pF1KB6 PHACPTCAKCFLSRTELQLHEAFKHRGEKLFVCEECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPH
:. : :.: : ..: :. : ::: . : :::. : .. .: . : .:.:.
CCDS69 PYECSDCGKAFRHSANLTNHQR-THTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRI-HTGEKPY
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pF1KB6 VCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTGEKPFQCHLCGKTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEF
: :..::.:.:::. : ::::::::..: :::.: ...: :..:::::.:..:.
CCDS69 RCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNE
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 CEQRFTEKGPLLRHVASRHQEGRPHFCQICGKTFKAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGY
: . :.:.. :.:: : .:. :. :::.:. .: : : : ::. .::.:::
CCDS69 CGKFFSESSALIRHHII-HTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGK
400 410 420 430 440 450
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pF1KB6 KFTRQAHLRRHMEIHDRVENYNPRQRKLRNLIIEDEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVES
: .. . ::...:
CCDS69 AFRCSSAFVRHQRLHAGE
460 470
688 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 01:32:03 2016 done: Mon Nov 7 01:32:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]