Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6255
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6255, 762 aa
1>>>pF1KB6255 762 - 762 aa - 762 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9250+/-0.00106; mu= 16.8513+/- 0.063
mean_var=69.9209+/-14.166, 0's: 0 Z-trim(103.3): 19 B-trim: 24 in 2/46
Lambda= 0.153381
statistics sampled from 7359 (7367) to 7359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS861.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 ( 762) 5031 1123.0 0
CCDS81359.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 ( 637) 4216 942.6 0
CCDS47622.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 747) 1782 404.0 4.4e-112
CCDS47621.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 751) 1782 404.0 4.5e-112
CCDS47624.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 352) 822 191.5 2e-48
CCDS47623.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 356) 804 187.5 3.2e-47
>>CCDS861.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 (762 aa)
initn: 5031 init1: 5031 opt: 5031 Z-score: 6011.0 bits: 1123.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5031; 100.0% identity (100.0% similar) in 762 aa overlap (1-762:1-762)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIKGLKNKPKKMGHIKPDLIDVDLIRGST
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CCDS86 MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIKGLKNKPKKMGHIKPDLIDVDLIRGST
10 20 30 40 50 60
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CCDS86 FAKAKPEIPWTSLTRKGLVRVVFFPLFSNWWIQVTSLRIFVWLLLLYFMQVIAIVLYLMM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PIVNISEVLGPLCLMLLMGTVHCQIVSTQITRPSGNNGNRRRRKLRKTVNGDGSRENGNN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SSDKVRGIETLESVPIIGGFWETIFGNRIKRVKLISNKGTETDNDPSCVHPIIKRRQCRP
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CCDS86 SSDKVRGIETLESVPIIGGFWETIFGNRIKRVKLISNKGTETDNDPSCVHPIIKRRQCRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS86 EIRMWQTREKAKFSDGEKCRREAFRRLGNGVSDDLSSEEDGEARTQMILLRRSVEGASSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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CCDS86 NGCEVKNRKSILSRHLNSQVKKTTTRWCHIVRDSDSLAESEFESAAFSQGSRSGVSGGSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SLNMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHGPECRSSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDPKEDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNECKKMDMSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNECKKMDMSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 NVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSISAEEILTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSISAEEILTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 TWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARKARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARKARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 KRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVLQGHKTFLNDAYNWEFLIWETALLLFLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVLQGHKTFLNDAYNWEFLIWETALLLFLLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 LASLGSETNKKYSNVSILLTEQINLYLKMEKKPNKKEQLTLVNNVLKLSTKLLKELDTPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LASLGSETNKKYSNVSILLTEQINLYLKMEKKPNKKEQLTLVNNVLKLSTKLLKELDTPF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB6 RLYGLTMNPLIYNITRVVILSAVSGVISDLLGFNIRLWKIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RLYGLTMNPLIYNITRVVILSAVSGVISDLLGFNIRLWKIKS
730 740 750 760
>>CCDS81359.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 (637 aa)
initn: 4212 init1: 4212 opt: 4216 Z-score: 5037.6 bits: 942.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4216; 99.5% identity (99.7% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIKGLKNKPKKMGHIKPDLIDVDLIRGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIKGLKNKPKKMGHIKPDLIDVDLIRGST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FAKAKPEIPWTSLTRKGLVRVVFFPLFSNWWIQVTSLRIFVWLLLLYFMQVIAIVLYLMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FAKAKPEIPWTSLTRKGLVRVVFFPLFSNWWIQVTSLRIFVWLLLLYFMQVIAIVLYLMM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PIVNISEVLGPLCLMLLMGTVHCQIVSTQITRPSGNNGNRRRRKLRKTVNGDGSRENGNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PIVNISEVLGPLCLMLLMGTVHCQIVSTQITRPSGNNGNRRRRKLRKTVNGDGSRENGNN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SSDKVRGIETLESVPIIGGFWETIFGNRIKRVKLISNKGTETDNDPSCVHPIIKRRQCRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSDKVRGIETLESVPIIGGFWETIFGNRIKRVKLISNKGTETDNDPSCVHPIIKRRQCRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EIRMWQTREKAKFSDGEKCRREAFRRLGNGVSDDLSSEEDGEARTQMILLRRSVEGASSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EIRMWQTREKAKFSDGEKCRREAFRRLGNGVSDDLSSEEDGEARTQMILLRRSVEGASSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NGCEVKNRKSILSRHLNSQVKKTTTRWCHIVRDSDSLAESEFESAAFSQGSRSGVSGGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NGCEVKNRKSILSRHLNSQVKKTTTRWCHIVRDSDSLAESEFESAAFSQGSRSGVSGGSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SLNMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHGPECRSSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDPKEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLNMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHGPECRSSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDPKEDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNECKKMDMSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNECKKMDMSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 NVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSISAEEILTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSISAEEILTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 TWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARKARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARKARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 KRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVLQGHKTFLNDAYNWEFLIWETALLLFLLR
::::::::::::::::::::::::::::::: .:
CCDS81 KRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVKVSHLL
610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 LASLGSETNKKYSNVSILLTEQINLYLKMEKKPNKKEQLTLVNNVLKLSTKLLKELDTPF
>>CCDS47622.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 (747 aa)
initn: 2608 init1: 1613 opt: 1782 Z-score: 2125.7 bits: 404.0 E(32554): 4.4e-112
Smith-Waterman score: 2605; 55.4% identity (76.6% similar) in 789 aa overlap (1-762:1-747)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIKGLKNKPKKMGHIKPDLIDVDLIRGST
:::. ::: :::::::::::::::::.:: .::::.::::: .:.:::::::::.:::.
CCDS47 MASKVTDAIVWYQKKIGAYDQQIWEKSVEQREIKGLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLVRGSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FAKAKPEIPWTSLTRKGLVRVVFFPLFSNWWIQVTSLRIFVWLLLLYFMQVIAIVLYLMM
::::::: :::::::::.:::::::.: ::.:::: :: :::.::..:: ::::.
CCDS47 FAKAKPESPWTSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVLFCST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB6 --P-IVNISEVLGPLCLMLLMGTVHCQIVSTQITRPSGNNGNRRRRKLRKTVN------G
: . ..::.::. ::::.::::::::::. .: ..:..:::::::... :
CCDS47 SSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTVHCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEVHREG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 DGSRENGNNSSDKVR--GIETLESV-PIIGGFWET-IFGNRIKRVKLISNKGTETDNDPS
::: . :.. :. : : .:: .. .:.. .: . :..: .:.:::::
CCDS47 DGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFFLSGSKKAKNSIDKSTETDNGYV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB6 CV--HPIIK---------RRQC---RPEIRMWQTREKAKFSDGEKCRREAFRRLGNGVSD
. . .: . :: ::: :.: . . .: . ... : . : :::
CCDS47 SLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNT---GTLRNGPS--KDTQRTITN-VSD
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 DLSSEEDGEARTQMILLRRSVEGASSDNGCEVKNRKSILSRHLNSQVKKTTTRWCHIVRD
..:::: :. . ::: :. .: .: ..:::: : . :: : .
CCDS47 EVSSEEGPETGYS---LRRHVDRTS--EGV-LRNRKS----H---HYKK------HYPNE
300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SDSLAESEFESAAFSQGSRSGVSGGSRSLNMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHGPECR
. . .::.: .:: . ::.::::.: .:::::.::.:::: ::.
CCDS47 D---------------APKSGTSCSSRC-SSSRQDSESARPESETEDVLWEDLLHCAECH
340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 SSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDPKEDVFQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNECKKMD
:: ::... .. . .. .:.. ..: :.:.:: ::..: :. ...:::.::::.::: :
CCDS47 SSCTSETD-VENHQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDCKKAD
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 MSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLGNVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSISAEEI
::::::::.::.:::.. :.:::..::.:.. :.. ::. :: . .:.:: . :: :.
CCDS47 MSVLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASEL
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 LTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCLTWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARK
.. :. . .. . ::.: :. :.:.:::..::::::::::.::::::.:.::::.
CCDS47 YVIAFGSNEDVIVLSMVIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQRLLFAKLFGHLTSARR
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 ARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYLKRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVLQ
::: :.::::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::.::::.:..::::::.:.
CCDS47 ARKSEVPHFRLKKVQNIKMWLSLRSYLKRRGPQRSVDVIVSSAFLLTISVVFICCAQLLH
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 GHKTFLNDAYNWEFLIWETALLLFLLRLASLGSETNKKYSNVSILLTEQINLYLKMEKKP
:. ::. ::::..:: .: :::::...:::::.:::::.::::::::::::::::::
CCDS47 VHEIFLDCHYNWELVIWCISLTLFLLRFVTLGSETSKKYSNTSILLTEQINLYLKMEKKP
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KB6 NKKEQLTLVNNVLKLSTKLLKELDTPFRLYGLTMNPLIYNITRVVILSAVSGVISDLLGF
::::.::::::::::.::::::::.::::::::::::.::::.:::::::::::::::::
CCDS47 NKKEELTLVNNVLKLATKLLKELDSPFRLYGLTMNPLLYNITQVVILSAVSGVISDLLGF
680 690 700 710 720 730
760
pF1KB6 NIRLWKIKS
:..::::::
CCDS47 NLKLWKIKS
740
>>CCDS47621.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 (751 aa)
initn: 2423 init1: 1613 opt: 1782 Z-score: 2125.6 bits: 404.0 E(32554): 4.5e-112
Smith-Waterman score: 2587; 55.1% identity (76.2% similar) in 793 aa overlap (1-762:1-751)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIK----GLKNKPKKMGHIKPDLIDVDLI
:::. ::: :::::::::::::::::.:: .:: ::.::::: .:.:::::::::.
CCDS47 MASKVTDAIVWYQKKIGAYDQQIWEKSVEQREIKFIKLGLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RGSTFAKAKPEIPWTSLTRKGLVRVVFFPLFSNWWIQVTSLRIFVWLLLLYFMQVIAIVL
:::.::::::: :::::::::.:::::::.: ::.:::: :: :::.::..:: ::::
CCDS47 RGSAFAKAKPESPWTSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 YLMM--P-IVNISEVLGPLCLMLLMGTVHCQIVSTQITRPSGNNGNRRRRKLRKTVN---
. : . ..::.::. ::::.::::::::::. .: ..:..:::::::...
CCDS47 FCSTSSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTVHCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 ---GDGSRENGNNSSDKVR--GIETLESV-PIIGGFWET-IFGNRIKRVKLISNKGTETD
:::: . :.. :. : : .:: .. .:.. .: . :..: .:.::::
CCDS47 HREGDGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFFLSGSKKAKNSIDKSTETD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB6 NDPSCV--HPIIK---------RRQC---RPEIRMWQTREKAKFSDGEKCRREAFRRLGN
: . . .: . :: ::: :.: . . .: . ... : . :
CCDS47 NGYVSLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNT---GTLRNGPS--KDTQRTITN
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 GVSDDLSSEEDGEARTQMILLRRSVEGASSDNGCEVKNRKSILSRHLNSQVKKTTTRWCH
:::..:::: :. . ::: :. .: .: ..:::: : . :: :
CCDS47 -VSDEVSSEEGPETGYS---LRRHVDRTS--EGV-LRNRKS----H---HYKK------H
300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 IVRDSDSLAESEFESAAFSQGSRSGVSGGSRSLNMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHG
.. . .::.: .:: . ::.::::.: .:::::.::.::::
CCDS47 YPNED---------------APKSGTSCSSRC-SSSRQDSESARPESETEDVLWEDLLHC
340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 PECRSSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDPKEDVFQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNEC
::.:: ::... .. . .. .:.. ..: :.:.:: ::..: :. ...:::.::::.:
CCDS47 AECHSSCTSETD-VENHQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDC
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 KKMDMSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLGNVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSIS
:: :::::::::.::.:::.. :.:::..::.:.. :.. ::. :: . .:.:: . :
CCDS47 KKADMSVLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHS
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 AEEILTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCLTWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHIT
: :. .. :. . .. . ::.: :. :.:.:::..::::::::::.::::::.:.:
CCDS47 ASELYVIAFGSNEDVIVLSMVIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQRLLFAKLFGHLT
500 510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 SARKARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYLKRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCA
:::.::: :.::::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::.::::.:..:::::
CCDS47 SARRARKSEVPHFRLKKVQNIKMWLSLRSYLKRRGPQRSVDVIVSSAFLLTISVVFICCA
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 QVLQGHKTFLNDAYNWEFLIWETALLLFLLRLASLGSETNKKYSNVSILLTEQINLYLKM
:.:. :. ::. ::::..:: .: :::::...:::::.:::::.::::::::::::::
CCDS47 QLLHVHEIFLDCHYNWELVIWCISLTLFLLRFVTLGSETSKKYSNTSILLTEQINLYLKM
620 630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
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CCDS47 LLGFNLKLWKIKS
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..:::: :. . ::: :. .: .: ..:::: ..: ..:
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350
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CCDS47 FCSTSSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTVHCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEV
130 140 150 160 170 180
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CCDS47 HREGDGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFFLSGSKKAKNSIDKSTETD
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CCDS47 NGYVSLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNT---GTLRNGPS--KDTQRTITN
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CCDS47 IRIYFICY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]