FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6220, 734 aa
1>>>pF1KB6220 734 - 734 aa - 734 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2658+/-0.000911; mu= 10.7042+/- 0.055
mean_var=261.7746+/-51.739, 0's: 0 Z-trim(116.0): 934 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.079270
statistics sampled from 15588 (16607) to 15588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.51), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1187 149.4 3.2e-35
CCDS33133.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 489) 1156 145.4 2e-34
CCDS82406.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 377) 1149 144.5 3e-34
CCDS42638.1 ZNF134 gene_id:7693|Hs108|chr19 ( 427) 1150 144.6 3e-34
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1152 145.0 3.2e-34
CCDS46210.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 448) 1149 144.5 3.3e-34
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CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1152 145.1 3.4e-34
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CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1147 144.3 4e-34
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1147 144.3 4e-34
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 1147 144.4 4.1e-34
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CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1141 143.8 8.1e-34
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CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1138 143.3 8.4e-34
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CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 442) 1124 141.7 2.4e-33
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 1125 141.9 2.6e-33
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CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1120 141.3 3.8e-33
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CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1119 141.2 4e-33
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1120 141.4 4.1e-33
CCDS82408.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 432) 1115 140.6 4.8e-33
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 1115 140.7 5.1e-33
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 1115 140.7 5.2e-33
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19 ( 610) 1115 140.8 6e-33
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CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1100 139.0 1.7e-32
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 1102 139.4 1.8e-32
CCDS47738.1 ZNF786 gene_id:136051|Hs108|chr7 ( 782) 1102 139.4 2e-32
>>CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 (734 aa)
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Smith-Waterman score: 5258; 100.0% identity (100.0% similar) in 734 aa overlap (1-734:1-734)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRPAVLGSPDRAPPEDEGPVMVKLEDSEEEGEAALWDPGPEAARLRFRCFRYEEATGPQE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 ALAQLRELCRQWLRPEVRSKEQMLELLVLEQFLGALPPEIQARVQGQRPGSPEEAAALVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALAQLRELCRQWLRPEVRSKEQMLELLVLEQFLGALPPEIQARVQGQRPGSPEEAAALVD
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLRREPGGPRRWVTVQVQGQEVLSEKMEPSSFQPLPETEPPTPEPGPKTPPRTMQESPLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQVKEESEVTEDSDFLESGPLAATQESVPTLLPEEAQRCGTVLDQIFPHSKTGPEGPSWR
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EHPRALWHEEAGGIFSPGFALQLGSISAGPGSVSPHLHVPWDLGMAGLSGQIQSPSREGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FAHALLLPSDLRSEQDPTDEDPCRGVGPALITTRWRSPRGRSRGRPSTGGGVVRGGRCDV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKVFSQRSNLLRHQKIHTGERPFVCSECGRSFSRSSHLLRHQLTHTEERPFVCGDCGQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FVRSARLEEHRRVHTGEQPFRCAECGQSFRQRSNLLQHQRIHGDPPGPGAKPPAPPGAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FVRSARLEEHRRVHTGEQPFRCAECGQSFRQRSNLLQHQRIHGDPPGPGAKPPAPPGAPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PPGPFPCSECRESFARRAVLLEHQAVHTGDKSFGCVECGERFGRRSVLLQHRRVHSGERP
490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 FACAECGQSFRQRSNLTQHRRIHTGERPFACAECGKAFRQRPTLTQHLRVHTGEKPFACP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FACAECGQSFRQRSNLTQHRRIHTGERPFACAECGKAFRQRPTLTQHLRVHTGEKPFACP
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610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ECGQRFSQRLKLTRHQRTHTGEKPYHCGECGLGFTQVSRLTEHQRIHTGERPFACPECGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECGQRFSQRLKLTRHQRTHTGEKPYHCGECGLGFTQVSRLTEHQRIHTGERPFACPECGQ
610 620 630 640 650 660
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pF1KB6 SFRQHANLTQHRRIHTGERPYACPECGKAFRQRPTLTQHLRTHRREKPFACQDCGRRFHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SFRQHANLTQHRRIHTGERPYACPECGKAFRQRPTLTQHLRTHRREKPFACQDCGRRFHQ
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB6 STKLIQHQRVHSAE
::::::::::::::
CCDS12 STKLIQHQRVHSAE
730
>>CCDS59427.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 (290 aa)
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Smith-Waterman score: 1800; 93.4% identity (94.4% similar) in 286 aa overlap (1-286:1-275)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MRPAVLGSPDRAPPEDEGPVMVKLEDSEEEGEAALWDPGPEAARLRFRCFRYEEATGPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MRPAVLGSPDRAPPEDEGPVMVKLEDSEEEGEAALWDPGPEAARLRFRCFRYEEATGPQE
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pF1KB6 ALAQLRELCRQWLRPEVRSKEQMLELLVLEQFLGALPPEIQARVQGQRPGSPEEAAALVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ALAQLRELCRQWLRPEVRSKEQMLELLVLEQFLGALPPEIQARVQGQRPGSPEEAAALVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GLRREPGGPRRWVTVQVQGQEVLSEKMEPSSFQPLPETEPPTPEPGPKTPPRTMQESPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLRREPGGPRRWVTVQVQGQEVLSEKMEPSSFQPLPETEPPTPEPGPKTPPRTMQESPLG
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LQVKEESEVTEDSDFLESGPLAATQESVPTLLPEEAQRCGTVLDQIFPHSKTGPEGPSWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LQVKEESEVTEDSDFLESGPLAATQESVPTLLPEEAQRCGTVLDQIFPHSKTGPEGPSWR
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:::::::::::::::::: :: :. .: : . : :: :
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pF1KB6 FAHALLLPSDLRSEQDPTDEDPCRGVGPALITTRWRSPRGRSRGRPSTGGGVVRGGRCDV
CCDS59 C
290
>>CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19 (412 aa)
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pF1KB6 WRSPRGRSRGRPSTGGGVVRGGRCDVCGKVFSQRSNLLRHQKIHTGERPFVCSECGRSFS
....:.::.:..:::::.:. :.:: ..::
CCDS33 MIGMLESLQHESDLLQHDQIHTGEKPYECNECRKTFS
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pF1KB6 RSSHLLRHQLTHTEERPFVCGDCGQGFVRSARLEEHRRVHTGEQPFRCAECGQSFRQRSN
...:..:. :: :. : .::. : . : : : :::.. ..: .::..: :. :
CCDS33 LKQNLVEHKKMHTGEKSHECTECGKVCSRVSSLTLHLRSHTGKKAYKCNKCGKAFSQKEN
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pF1KB6 LLQHQRIH-GDPPGPGAK-----PPAPPGAPEPPG--PFPCSECRESFARRAVLLEHQAV
.:.::. : :. : : : . : :. :.:: ..: .: : ::. .
CCDS33 FLSHQKHHTGEKPYECEKVSIQMPTIIRHQKNHTGTKPYACKECGKAFNGKAYLTEHEKI
100 110 120 130 140 150
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 HTGDKSFGCVECGERFGRRSVLLQHRRVHSGERPFACAECGQSFRQRSNLTQHRRIHTGE
:::.: : : .::. :.... :..:. .:.:..:: :.:::..: :. :: :.::::::
CCDS33 HTGEKPFECNQCGRAFSQKQYLIKHQNIHTGKKPFKCSECGKAFSQKENLIIHQRIHTGE
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570 580 590 600 610 620
pF1KB6 RPFACAECGKAFRQRPTLTQHLRVHTGEKPFACPECGQRFSQRLKLTRHQRTHTGEKPYH
.:. : ::::: :. .: .: : ::::::..: :::. :: . .::.:.. : :::::.
CCDS33 KPYECKGCGKAFIQKSSLIRHQRSHTGEKPYTCKECGKAFSGKSNLTEHEKIHIGEKPYK
220 230 240 250 260 270
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 CGECGLGFTQVSRLTEHQRIHTGERPFACPECGQSFRQHANLTQHRRIHTGERPYACPEC
:.::: : : . : .:. :::::.:. : .::..: . ..: : :::::..:: : :
CCDS33 CNECGTIFRQKQYLIKHHNIHTGEKPYECNKCGKAFSRITSLIVHVRIHTGDKPYECKVC
280 290 300 310 320 330
690 700 710 720 730
pF1KB6 GKAFRQRPTLTQHLRTHRREKPFACQDCGRRFHQSTKLIQHQRVHSAE
:::: : .:: :.:.: :::..:..::. : : . : :.:.:..:
CCDS33 GKAFCQSSSLTVHMRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHMRIHTGEKPYQCSECGKAF
340 350 360 370 380 390
CCDS33 SQKSHHIRHQRIHTH
400 410
>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa)
initn: 5889 init1: 1018 opt: 1250 Z-score: 787.4 bits: 156.3 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 1762; 39.2% identity (62.0% similar) in 758 aa overlap (15-734:20-744)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MRPAVLGSPDRAPPEDEGPVMVKLEDSEE---EGEAALWDPGP--EAARLRFRCF
..:: . :: : ... .: . . : : ::.:: .
CCDS27 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RYEEATGPQEALAQLRELCRQWLRPEVRSKEQMLELLVLEQFLGALPPEIQARVQGQRPG
:.: .::::::..:::::: :: :::..:::.::::::::::. :: :... :: ..:
CCDS27 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 SPEEAAALVDGLRREPGGPRRWVTVQVQGQEVLSEKMEPSSFQPLPETEPPTPEPGPKTP
: :::.:.:. ..:. .: .. :.. .: ::. : : ... :. : .: : ..:
CCDS27 SGEEAVAVVEDFQRHLSGSEE-VSAPAQKQEMHFE--ETTALGTTKESPPTSPLSGGSAP
130 140 150 160 170
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pF1KB6 PRTMQESPLGLQVKEESEVTEDSDFLESGPLAATQESVPTLLPEEA----QRCGTVLDQI
. : : . : :: .: :::: :. . : .::: ..
CCDS27 GAHL-EPPYD----------PGTHHLPSGDFAQCTSPVPTL-PQVGNSGDQAGATVLRMV
180 190 200 210 220
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pF1KB6 FPHSKTGPEGPS-------WRE---HPRAL-WH---EEAGGIFS-PGFALQLGSISAGPG
:.. .. : : :. ::: :. :. .. : : .. :: :
CCDS27 RPQDTVAYEDLSVDYTQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGS-ELTPK
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB6 SVSPHLHVPWDLGMAGLSGQIQSPSREGG-----FAHALLLPSDL---RSEQD---PTDE
. . . .:: : . . .. : : . :: : :.: :::
CCDS27 QEFFKGSESSNRTSGGLFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDE
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
pF1KB6 DPCRGVGPALITTRWRSPRGRSRGRPSTGGGVVRGG---RCDVCGKVFSQRSNLLRHQKI
: ... . . . . : ::..: ::: :::.:.. :.:. ::.:
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CCDS27 HTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGE
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CCDS27 EKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSS
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CCDS27 GLAWSVS
750
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pF1KB6 FHQSTKLIQHQRVHSAE
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CCDS64 FSRSSYLIEHQRIHTRAQWFYEYGNALEGSTFVSRKKVNTIKKLHQCEDCEKIFRWRSHL
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CCDS48 LHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYK---CTECGKVFIQKAN
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CCDS48 LVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKH
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:...
CCDS48 HTGDKNL
580
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