Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6196
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6196, 706 aa
1>>>pF1KB6196 706 - 706 aa - 706 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0406+/-0.000391; mu= -1.9690+/- 0.025
mean_var=449.4223+/-93.370, 0's: 0 Z-trim(124.8): 65 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.060499
statistics sampled from 47104 (47199) to 47104 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.553), width: 16
Scan time: 15.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_542937 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isofo ( 706) 4597 415.7 3.1e-115
XP_011533242 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 614) 2507 233.2 2.3e-60
XP_011533241 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 758) 2507 233.3 2.7e-60
XP_011533243 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 379) 2466 229.4 2e-59
NP_542938 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isofo ( 558) 2462 229.2 3.3e-59
XP_011533244 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 365) 2358 220.0 1.3e-56
XP_016875885 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 417) 2139 200.9 8.3e-51
NP_004383 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isofo ( 504) 2136 200.7 1.1e-50
XP_016884744 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 586) 1439 140.0 2.6e-32
NP_001132986 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 is ( 571) 1430 139.2 4.4e-32
XP_016884745 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 571) 1430 139.2 4.4e-32
XP_016884743 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 596) 1409 137.4 1.6e-31
NP_001132987 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 is ( 432) 943 96.5 2.3e-19
NP_444511 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 isofo ( 599) 943 96.7 2.8e-19
XP_011529150 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 584) 934 95.9 4.8e-19
XP_011529149 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 594) 771 81.7 9.3e-15
XP_011529148 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 609) 771 81.7 9.4e-15
>>NP_542937 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isoform a (706 aa)
initn: 4597 init1: 4597 opt: 4597 Z-score: 2189.8 bits: 415.7 E(85289): 3.1e-115
Smith-Waterman score: 4597; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 QSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 HQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB6 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
670 680 690 700
>>XP_011533242 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund homol (614 aa)
initn: 2466 init1: 2466 opt: 2507 Z-score: 1204.7 bits: 233.2 E(85289): 2.3e-60
Smith-Waterman score: 3335; 88.8% identity (89.4% similar) in 596 aa overlap (1-544:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVG--------------------------------------------
::::::::::::::::
XP_011 QHGADSENGDMNSSVGSSDGSWDKETLPSSPSQGPQASITHPRMPGARSLPLSHPLNHLQ
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420
pF1KB6 --------LELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QSHLLPNGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVE
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMN
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 QMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::: . :. : .:: . ::
XP_011 QMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKVHIILT----RIQLDFTKNTGLNMH
550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLREREL
XP_011 KRLQCGMCADSSVSSRHY
600 610
>>XP_011533241 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund homol (758 aa)
initn: 2466 init1: 2466 opt: 2507 Z-score: 1203.6 bits: 233.3 E(85289): 2.7e-60
Smith-Waterman score: 4358; 93.0% identity (93.0% similar) in 738 aa overlap (1-686:1-738)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVG--------------------------------------------
::::::::::::::::
XP_011 QHGADSENGDMNSSVGSSDGSWDKETLPSSPSQGPQASITHPRMPGARSLPLSHPLNHLQ
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420
pF1KB6 --------LELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QSHLLPNGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVE
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMN
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 QMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQP
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLREREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLREREL
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 RETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDSLR
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700
pF1KB6 VLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
::::::::::::::::::
XP_011 VLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
730 740 750
>>XP_011533243 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund homol (379 aa)
initn: 2466 init1: 2466 opt: 2466 Z-score: 1187.9 bits: 229.4 E(85289): 2e-59
Smith-Waterman score: 2466; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
::::::::::::::::
XP_011 QHGADSENGDMNSSVGWLI
370
>>NP_542938 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isoform b (558 aa)
initn: 3593 init1: 2458 opt: 2462 Z-score: 1183.9 bits: 229.2 E(85289): 3.3e-59
Smith-Waterman score: 3301; 79.0% identity (79.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-558)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
:::::::::::::::
NP_542 QHGADSENGDMNSSV---------------------------------------------
370
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPV
NP_542 ------------------------------------------------------------
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKL
:::::::::::::::::
NP_542 -------------------------------------------DETPLSTPTARDSLDKL
380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700
pF1KB6 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
520 530 540 550
>>XP_011533244 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund homol (365 aa)
initn: 2358 init1: 2358 opt: 2358 Z-score: 1137.1 bits: 220.0 E(85289): 1.3e-56
Smith-Waterman score: 2358; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (342-706:1-365)
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 LMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDM
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 NSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSV
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 IKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQML
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 MGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPP
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 GFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRET
220 230 240 250 260 270
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 LEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDSLRVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDSLRVLN
280 290 300 310 320 330
680 690 700
pF1KB6 DSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
340 350 360
>>XP_016875885 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund homol (417 aa)
initn: 2139 init1: 2139 opt: 2139 Z-score: 1033.1 bits: 200.9 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2244; 87.5% identity (87.5% similar) in 417 aa overlap (342-706:1-417)
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 LMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDM
10 20 30
pF1KB6 NSSVG----------------------------------------------------LEL
::::: :::
XP_016 NSSVGSSDGSWDKETLPSSPSQGPQASITHPRMPGARSLPLSHPLNHLQQSHLLPNGLEL
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 PFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDS
100 110 120 130 140 150
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 PSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVL
160 170 180 190 200 210
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 PGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLF
220 230 240 250 260 270
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 PDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAME
280 290 300 310 320 330
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 QKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDSLRVLNDSLTPEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDSLRVLNDSLTPEIE
340 350 360 370 380 390
680 690 700
pF1KB6 ADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
:::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
400 410
>>NP_004383 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isoform c (504 aa)
initn: 2507 init1: 2136 opt: 2136 Z-score: 1030.7 bits: 200.7 E(85289): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 2868; 71.4% identity (71.4% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
:::::::::::::::::::::
NP_004 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPT---------------------------------------
310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
NP_004 ------------------------------------------------------------
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPV
NP_004 ------------------------------------------------------------
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKL
:::::::::::::::::
NP_004 -------------------------------------------DETPLSTPTARDSLDKL
330
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
340 350 360 370 380 390
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
400 410 420 430 440 450
670 680 690 700
pF1KB6 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
460 470 480 490 500
>>XP_016884744 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund homol (586 aa)
initn: 1899 init1: 651 opt: 1439 Z-score: 701.1 bits: 140.0 E(85289): 2.6e-32
Smith-Waterman score: 1857; 52.2% identity (70.0% similar) in 630 aa overlap (148-699:4-575)
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GGGGISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPS
:.: :..::... : . ..:.::::
XP_016 MAVSASPVISATSSGAGVPGGLFRAEPLYSTPR
10 20 30
180 190 200 210
pF1KB6 -PVENTPQ-----------------------NNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQ
: . ::. .:::.:::..: ::::: ..: :::::::
XP_016 EPPRLTPNMINSFVVNNHSNSAGGGGRGNTNTNECRMVDMHGMKVASFLMDGQELICLPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 AFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITPVVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFE
.::::::::::::::::::::::.:.::::.:::::::::::::::::::::::.:::::
XP_016 VFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLDISPVVCTVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLITRKDFE
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 TLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPENSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAA
::..:::::::::::::::. .: . ::.... :.::::.:::.: :::.:::
XP_016 TLFTDCTNASSRPGRPPKRSLGVLQ-ENARLLTHAVPGLLSPGLITPTGITAA-------
160 170 180 190 200
340 350 360 370
pF1KB6 TNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDMNSSVG-----------------
:.:::::..:.:: ::.. .....:.:..:: :.::..:
XP_016 ---AMAEAMKLQKMKLMAMNTLQGNGSQNGTESEPDDLNSNTGGSESSWDKDKMQSPFAA
210 220 230 240 250 260
380 390 400
pF1KB6 ------------------------------------LELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTM
:.::::::::::.:::::::::.:
XP_016 PGPQHGIAHAALAGQPGIGGAPTLNPLQQNHLLTNRLDLPFMMMPHPLLPVSLPPASVAM
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 AMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHR
::.:::::.::::::::::..:: ::. :::::::.:.::::::::::..::::. :::
XP_016 AMNQMNHLNTIANMAAAAQIHSPLSRAGTSVIKERIPESPSPAPSLEENHRPGSQTSSHT
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 SSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMH
::::::::.. : :. .::
XP_016 SSSVSSSPSQ-----------------------------------------MDHHLERM-
390 400
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 IEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVA
.:.:.. : .. :::..:: :: :: :::.::.: :.:::.::::::::::::::
XP_016 ---EEVPVQIPIMKSPLDKIQLTP-GQALPAGFPGPFIFADSLSSVETLLTNIQGLLKVA
410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 IDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKL
.:::: ::::.: :: ::.... ::::.::.::.:::.: ..:. .:::::::::.::::
XP_016 LDNARIQEKQIQQEKKELRLELYREREIRENLERQLAVELQSRTTMQKRLKKEKKTKRKL
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690
pF1KB6 QEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDS-LRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLY
:::::::.:::::.::.::::...:: ::.:.:. :.:: . .: :. ..: : :
XP_016 QEALEFESKRREQVEQALKQATTSDSGLRMLKDTGIPDIEIENNGTPHDSA-AMQGGNYY
520 530 540 550 560 570
700
pF1KB6 LKTTVMY
XP_016 CLEMAQQLYSA
580
>>NP_001132986 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 isofor (571 aa)
initn: 1899 init1: 651 opt: 1430 Z-score: 697.0 bits: 139.2 E(85289): 4.4e-32
Smith-Waterman score: 1848; 52.6% identity (70.3% similar) in 620 aa overlap (148-689:4-566)
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GGGGISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPS
:.: :..::... : . ..:.::::
NP_001 MAVSASPVISATSSGAGVPGGLFRAEPLYSTPR
10 20 30
180 190 200 210
pF1KB6 -PVENTPQ-----------------------NNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQ
: . ::. .:::.:::..: ::::: ..: :::::::
NP_001 EPPRLTPNMINSFVVNNHSNSAGGGGRGNTNTNECRMVDMHGMKVASFLMDGQELICLPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 AFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITPVVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFE
.::::::::::::::::::::::.:.::::.:::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 VFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLDISPVVCTVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLITRKDFE
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 TLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPENSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAA
::..:::::::::::::::. .: . ::.... :.::::.:::.: :::.::::
NP_001 TLFTDCTNASSRPGRPPKRSLGVLQ-ENARLLTHAVPGLLSPGLITPTGITAAA------
160 170 180 190 200
340 350 360 370
pF1KB6 TNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDMNSSVG-----------------
.:::::..:.:: ::.. .....:.:..:: :.::..:
NP_001 ----MAEAMKLQKMKLMAMNTLQGNGSQNGTESEPDDLNSNTGGSESSWDKDKMQSPFAA
210 220 230 240 250 260
380 390 400
pF1KB6 ------------------------------------LELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTM
:.::::::::::.:::::::::.:
NP_001 PGPQHGIAHAALAGQPGIGGAPTLNPLQQNHLLTNRLDLPFMMMPHPLLPVSLPPASVAM
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 AMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHR
::.:::::.::::::::::..:: ::. :::::::.:.::::::::::..::::. :::
NP_001 AMNQMNHLNTIANMAAAAQIHSPLSRAGTSVIKERIPESPSPAPSLEENHRPGSQTSSHT
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 SSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMH
::::::::.. : :. .::
NP_001 SSSVSSSPSQ-----------------------------------------MDHHLERM-
390 400
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 IEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVA
.:.:.. : .. :::..:: :: :: :::.::.: :.:::.::::::::::::::
NP_001 ---EEVPVQIPIMKSPLDKIQLTP-GQALPAGFPGPFIFADSLSSVETLLTNIQGLLKVA
410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 IDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKL
.:::: ::::.: :: ::.... ::::.::.::.:::.: ..:. .:::::::::.::::
NP_001 LDNARIQEKQIQQEKKELRLELYREREIRENLERQLAVELQSRTTMQKRLKKEKKTKRKL
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690
pF1KB6 QEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDS-LRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLY
:::::::.:::::.::.::::...:: ::.:.:. :.:: . .: :.
NP_001 QEALEFESKRREQVEQALKQATTSDSGLRMLKDTGIPDIEIENNGTPHDSAAMQA
520 530 540 550 560 570
700
pF1KB6 LKTTVMY
706 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 15:35:28 2016 done: Mon Nov 7 15:35:30 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]