Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6196
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6196, 706 aa
1>>>pF1KB6196 706 - 706 aa - 706 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3820+/-0.00106; mu= -4.1207+/- 0.065
mean_var=416.4300+/-85.855, 0's: 0 Z-trim(116.6): 45 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.062850
statistics sampled from 17200 (17243) to 17200 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.53), width: 16
Scan time: 5.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41899.1 DACH1 gene_id:1602|Hs108|chr13 ( 706) 4597 431.1 2.7e-120
CCDS48140.1 DACH2 gene_id:117154|Hs108|chrX ( 571) 1430 143.9 6.5e-34
CCDS55457.1 DACH2 gene_id:117154|Hs108|chrX ( 432) 943 99.6 1e-20
CCDS14455.1 DACH2 gene_id:117154|Hs108|chrX ( 599) 943 99.7 1.3e-20
>>CCDS41899.1 DACH1 gene_id:1602|Hs108|chr13 (706 aa)
initn: 4597 init1: 4597 opt: 4597 Z-score: 2273.1 bits: 431.1 E(32554): 2.7e-120
Smith-Waterman score: 4597; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAVPAALIPPTQLVPPQPPISTSASSSGTTTSTSSATSSPAPSIGPPASSGPTLFRPEPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASAAAAAATVTSTGGGGGGGGSGGGGGSSGNGGGGGGGGGGSNCNPNLAAASNGSGGGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB6 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AASTDSLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
670 680 690 700
>>CCDS48140.1 DACH2 gene_id:117154|Hs108|chrX (571 aa)
initn: 1899 init1: 651 opt: 1430 Z-score: 722.3 bits: 143.9 E(32554): 6.5e-34
Smith-Waterman score: 1848; 52.6% identity (70.3% similar) in 620 aa overlap (148-689:4-566)
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GGGGISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPS
:.: :..::... : . ..:.::::
CCDS48 MAVSASPVISATSSGAGVPGGLFRAEPLYSTPR
10 20 30
180 190 200 210
pF1KB6 -PVENTPQ-----------------------NNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQ
: . ::. .:::.:::..: ::::: ..: :::::::
CCDS48 EPPRLTPNMINSFVVNNHSNSAGGGGRGNTNTNECRMVDMHGMKVASFLMDGQELICLPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 AFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITPVVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFE
.::::::::::::::::::::::.:.::::.:::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS48 VFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLDISPVVCTVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLITRKDFE
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 TLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPENSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAA
::..:::::::::::::::. .: . ::.... :.::::.:::.: :::.::::
CCDS48 TLFTDCTNASSRPGRPPKRSLGVLQ-ENARLLTHAVPGLLSPGLITPTGITAAA------
160 170 180 190 200
340 350 360 370
pF1KB6 TNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDMNSSVG-----------------
.:::::..:.:: ::.. .....:.:..:: :.::..:
CCDS48 ----MAEAMKLQKMKLMAMNTLQGNGSQNGTESEPDDLNSNTGGSESSWDKDKMQSPFAA
210 220 230 240 250 260
380 390 400
pF1KB6 ------------------------------------LELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTM
:.::::::::::.:::::::::.:
CCDS48 PGPQHGIAHAALAGQPGIGGAPTLNPLQQNHLLTNRLDLPFMMMPHPLLPVSLPPASVAM
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 AMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHR
::.:::::.::::::::::..:: ::. :::::::.:.::::::::::..::::. :::
CCDS48 AMNQMNHLNTIANMAAAAQIHSPLSRAGTSVIKERIPESPSPAPSLEENHRPGSQTSSHT
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 SSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDMGHESKRMH
::::::::.. : :. .::
CCDS48 SSSVSSSPSQ-----------------------------------------MDHHLERM-
390 400
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 IEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVA
.:.:.. : .. :::..:: :: :: :::.::.: :.:::.::::::::::::::
CCDS48 ---EEVPVQIPIMKSPLDKIQLTP-GQALPAGFPGPFIFADSLSSVETLLTNIQGLLKVA
410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 IDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKL
.:::: ::::.: :: ::.... ::::.::.::.:::.: ..:. .:::::::::.::::
CCDS48 LDNARIQEKQIQQEKKELRLELYREREIRENLERQLAVELQSRTTMQKRLKKEKKTKRKL
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690
pF1KB6 QEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDS-LRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLY
:::::::.:::::.::.::::...:: ::.:.:. :.:: . .: :.
CCDS48 QEALEFESKRREQVEQALKQATTSDSGLRMLKDTGIPDIEIENNGTPHDSAAMQA
520 530 540 550 560 570
700
pF1KB6 LKTTVMY
>>CCDS55457.1 DACH2 gene_id:117154|Hs108|chrX (432 aa)
initn: 1292 init1: 577 opt: 943 Z-score: 485.2 bits: 99.6 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 1277; 49.5% identity (67.9% similar) in 471 aa overlap (283-699:9-421)
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 GLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPENSHIMPHSVPGL
::::::::::. .: . ::.... :.::::
CCDS55 MTRKQAVNSSRPGRPPKRSLGVLQ-ENARLLTHAVPGL
10 20 30
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 MSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDMN
.:::.: :::.:::: .:::::..:.:: ::.. .....:.:..:: :.:
CCDS55 LSPGLITPTGITAAA----------MAEAMKLQKMKLMAMNTLQGNGSQNGTESEPDDLN
40 50 60 70 80
pF1KB6 SSVG-----------------------------------------------------LEL
:..: :.:
CCDS55 SNTGGSESSWDKDKMQSPFAAPGPQHGIAHAALAGQPGIGGAPTLNPLQQNHLLTNRLDL
90 100 110 120 130 140
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 PFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDS
:::::::::.:::::::::.:::.:::::.::::::::::..:: ::. :::::::.:.:
CCDS55 PFMMMPHPLLPVSLPPASVAMAMNQMNHLNTIANMAAAAQIHSPLSRAGTSVIKERIPES
150 160 170 180 190 200
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 PSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVL
:::::::::..::::. ::: ::::::::..
CCDS55 PSPAPSLEENHRPGSQTSSHTSSSVSSSPSQ-----------------------------
210 220 230
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 PGPKEGDLAGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLF
: :. .:: .:.:.. : .. :::..:: :: :: :::.::.:
CCDS55 ------------MDHHLERM----EEVPVQIPIMKSPLDKIQLTP-GQALPAGFPGPFIF
240 250 260 270 280
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 PDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAME
:.:::.::::::::::::::.:::: ::::.: :: ::.... ::::.::.::.:::.:
CCDS55 ADSLSSVETLLTNIQGLLKVALDNARIQEKQIQQEKKELRLELYREREIRENLERQLAVE
290 300 310 320 330 340
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 QKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDS-LRVLNDSLTPEI
..:. .:::::::::.:::::::::::.:::::.::.::::...:: ::.:.:. :.:
CCDS55 LQSRTTMQKRLKKEKKTKRKLQEALEFESKRREQVEQALKQATTSDSGLRMLKDTGIPDI
350 360 370 380 390 400
680 690 700
pF1KB6 EADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY
: . .: :. ..: : :
CCDS55 EIENNGTPHDSA-AMQGGNYYCLEMAQQLYSA
410 420 430
>>CCDS14455.1 DACH2 gene_id:117154|Hs108|chrX (599 aa)
initn: 1787 init1: 577 opt: 943 Z-score: 483.4 bits: 99.7 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 1821; 51.2% identity (68.6% similar) in 643 aa overlap (148-699:4-588)
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GGGGISAGGGVASSTPINASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPS
:.: :..::... : . ..:.::::
CCDS14 MAVSASPVISATSSGAGVPGGLFRAEPLYSTPR
10 20 30
180 190 200 210
pF1KB6 -PVENTPQ-----------------------NNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQ
: . ::. .:::.:::..: ::::: ..: :::::::
CCDS14 EPPRLTPNMINSFVVNNHSNSAGGGGRGNTNTNECRMVDMHGMKVASFLMDGQELICLPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 AFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITPVVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFE
.::::::::::::::::::::::.:.::::.:::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS14 VFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLDISPVVCTVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLITRKDFE
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320
pF1KB6 TLYNDCTNA-------------SSRPGRPPKRTQSVTSPENSHIMPHSVPGLMSPGIIPP
::..::::: ::::::::::. .: . ::.... :.::::.:::.: :
CCDS14 TLFTDCTNARRKRQMTRKQAVNSSRPGRPPKRSLGVLQ-ENARLLTHAVPGLLSPGLITP
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370
pF1KB6 TGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDMNSSVG----
::.::: :.:::::..:.:: ::.. .....:.:..:: :.::..:
CCDS14 TGITAA----------AMAEAMKLQKMKLMAMNTLQGNGSQNGTESEPDDLNSNTGGSES
220 230 240 250 260
380
pF1KB6 -------------------------------------------------LELPFMMMPHP
:.:::::::::
CCDS14 SWDKDKMQSPFAAPGPQHGIAHAALAGQPGIGGAPTLNPLQQNHLLTNRLDLPFMMMPHP
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 LIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLE
:.:::::::::.:::.:::::.::::::::::..:: ::. :::::::.:.:::::::::
CCDS14 LLPVSLPPASVAMAMNQMNHLNTIANMAAAAQIHSPLSRAGTSVIKERIPESPSPAPSLE
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 EGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDL
:..::::. ::: ::::::::..
CCDS14 ENHRPGSQTSSHTSSSVSSSPSQ-------------------------------------
390 400
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 AGHDMGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIE
: :. .:: .:.:.. : .. :::..:: :: :: :::.::.: :.:::.:
CCDS14 ----MDHHLERM----EEVPVQIPIMKSPLDKIQLTP-GQALPAGFPGPFIFADSLSSVE
410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 TLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQ
:::::::::::::.:::: ::::.: :: ::.... ::::.::.::.:::.: ..:. .:
CCDS14 TLLTNIQGLLKVALDNARIQEKQIQQEKKELRLELYREREIRENLERQLAVELQSRTTMQ
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 KRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDS-LRVLNDSLTPEIEADRSGGR
::::::::.:::::::::::.:::::.::.::::...:: ::.:.:. :.:: . .:
CCDS14 KRLKKEKKTKRKLQEALEFESKRREQVEQALKQATTSDSGLRMLKDTGIPDIEIENNGTP
520 530 540 550 560 570
690 700
pF1KB6 TDAERTIQDGRLYLKTTVMY
:. ..: : :
CCDS14 HDSA-AMQGGNYYCLEMAQQLYSA
580 590
706 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 15:35:27 2016 done: Mon Nov 7 15:35:28 2016
Total Scan time: 5.050 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]