FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6192, 706 aa
1>>>pF1KB6192 706 - 706 aa - 706 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2933+/-0.00222; mu= 17.0762+/- 0.134
mean_var=323.4800+/-58.390, 0's: 0 Z-trim(105.0): 944 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.071310
statistics sampled from 7144 (8181) to 7144 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 5053 535.6 9.6e-152
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 2502 273.1 9.6e-73
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 2483 271.2 3.7e-72
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 2297 252.0 2e-66
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2213 243.4 8.5e-64
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 2192 241.1 3.5e-63
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CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2089 231.1 7.8e-60
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2068 228.5 2.7e-59
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 2009 222.4 1.8e-57
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1993 220.7 5.3e-57
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1993 220.7 5.4e-57
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1993 220.8 5.6e-57
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1981 219.3 1.2e-56
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1981 219.5 1.3e-56
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1972 218.5 2.3e-56
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1972 218.6 2.4e-56
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1972 218.6 2.4e-56
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1972 218.6 2.5e-56
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1969 218.6 3.7e-56
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1969 218.7 3.8e-56
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1968 218.5 4e-56
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1961 217.5 5.6e-56
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1958 217.3 7.1e-56
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1958 217.3 7.2e-56
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1948 216.0 1.3e-55
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1948 216.1 1.3e-55
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1948 216.1 1.3e-55
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1948 216.1 1.3e-55
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1942 215.6 2.1e-55
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1940 215.5 2.6e-55
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1940 215.5 2.6e-55
CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 575) 1925 213.6 6.5e-55
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1918 212.8 1e-54
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1914 212.6 1.5e-54
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1914 212.6 1.5e-54
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1913 212.5 1.6e-54
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1911 212.5 2e-54
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1911 212.5 2.1e-54
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1911 212.5 2.1e-54
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1911 212.5 2.1e-54
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1911 212.5 2.1e-54
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1907 212.0 2.7e-54
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1908 212.3 2.7e-54
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1904 211.8 3.5e-54
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1900 211.2 4.2e-54
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1894 210.7 6.9e-54
>>CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 (706 aa)
initn: 5053 init1: 5053 opt: 5053 Z-score: 2837.8 bits: 535.6 E(32554): 9.6e-152
Smith-Waterman score: 5053; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALPSPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPCGSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDAAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MALPSPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPCGSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDAAQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HLYHSVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVEVLQVRIPNADPSTKKANSCDMCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HLYHSVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVEVLQVRIPNADPSTKKANSCDMCG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PFLKDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDRDALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFLKDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDRDALM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KSSKVHLSENPFTCREGGKVILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTTQKLFECSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSSKVHLSENPFTCREGGKVILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTTQKLFECSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 CGKAFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSILGNKKFHTGEIPHVCKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKAFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSILGNKKFHTGEIPHVCKECGKAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SHSSKLRKHQKFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDECGKAFSNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SHSSKLRKHQKFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDECGKAFSNRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 HLIRHEKVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKSFSRSSALIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HLIRHEKVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKSFSRSSALIQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HWRVHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRHQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HWRVHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRHQKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HTGERPFECCDCGKAFSNSSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLIQHWRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGERPFECCDCGKAFSNSSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLIQHWRIHTGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 KPYECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQKVHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPYECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQKVHTGEKPYK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 CSECGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQERPYECIQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CSECGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQERPYECIQC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB6 GKAFSERSTLVRHQKVHTRERTYECSQCGKLFSHLCNLAQHKKIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKAFSERSTLVRHQKVHTRERTYECSQCGKLFSHLCNLAQHKKIHT
670 680 690 700
>>CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (697 aa)
initn: 3469 init1: 1851 opt: 2502 Z-score: 1419.5 bits: 273.1 E(32554): 9.6e-73
Smith-Waterman score: 2502; 50.6% identity (75.9% similar) in 692 aa overlap (24-706:9-691)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MALPSPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPC---GSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDA
.: : :: .... :.:::::: :::::: ::.
CCDS82 MQEGLHRMTWDCIAIGSHENSVQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 AQRHLYHSVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVE-VLQVRIPNADPSTKKANSC
.:: :::.::::: :..::: : : : : : :...:.. : :: :.: : :::.::
CCDS82 VQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSC
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DMCGPFLKDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDR
.::: .: ::::::.::::. ..: . : : : .. ..: . ::... : ::.: ..
CCDS82 EMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DALMKSSKVHLSENPFTCREGGKVILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTT----
..: : :.::. ..:: .: : :: .:. .:.: :. :: : .
CCDS82 ALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSK----PE-CESPFQW
170 180 190 200 210
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pF1KB6 -QKLFECSNCGKAFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSILGNKKFHTGEIPH
. . :..: : . .. .. : :.: . : .: . :. .... :::. :.
CCDS82 GDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPY
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 VCKECGKAFSHSSKLRKHQKFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDE
: ::::.:::...: .::. :: . ::: :::.:.:: ..:.:::.:.::::::: :
CCDS82 ECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGE
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pF1KB6 CGKAFSNRSHLIRHEKVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKS
:::.::. . ::.:..:::::::.:: .::. :.:..:...::. ::. ::::: .:::
CCDS82 CGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKC
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FSRSSALIQHWRVHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQS
::....: .: :::: ::::::.:::..:. ...: .::. ::::::.::.:::..::..
CCDS82 FSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRK
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 SHLLRHQKVHTGERPFECCDCGKAFSNSSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLI
..:..::. ::::::.:: .: : : ..: ::.::.::::.:::::.:: :::. ::..
CCDS82 GNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFR
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 QHWRIHTGEKPYECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQK
: :.::::::.:::::::.: .: .:..: :::: ::::::.:::: : :.: :..:::
CCDS82 VHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 VHTGEKPYKCSECGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQ
.::.:.::.: ::::::: ::. : ::::::::::: :::..:. : .:::.::.
CCDS82 THTAERPYECRECGKFFS---SLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTR
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700
pF1KB6 ERPYECIQCGKAFSERSTLVRHQKVHTRERTYECSQCGKLFSHLCNLAQHKKIHT
.:::: .:::.:.: .:..:..::: :: ::::.::: : . .: .:...::
CCDS82 GKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPY
640 650 660 670 680 690
CCDS82 K
>>CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (676 aa)
initn: 3463 init1: 1845 opt: 2483 Z-score: 1409.0 bits: 271.2 E(32554): 3.7e-72
Smith-Waterman score: 2483; 51.0% identity (76.4% similar) in 679 aa overlap (34-706:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 PSPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPCGSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDAAQRHLY
... :.:::::: :::::: ::. .:: ::
CCDS42 MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HSVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVE-VLQVRIPNADPSTKKANSCDMCGPF
:.::::: :..::: : : : : : :...:.. : :: :.: : :::.::.::: .
CCDS42 HDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LKDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDRDALMKS
: ::::::.::::. ..: . : : : .. ..: . ::... : ::.: .. ..:
CCDS42 LGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKR
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB6 SKVHLSENPFTCREGGKVILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTT-----QKLFE
: :.::. ..:: .: : :: .:. .:.: :. :: : . . .
CCDS42 CKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSK----PE-CESPFQWGDTHYS
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 CSNCGKAFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSILGNKKFHTGEIPHVCKECG
:..: : . .. .. : :.: . : .: . :. .... :::. :. : :::
CCDS42 CGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECG
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KAFSHSSKLRKHQKFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDECGKAFS
:.:::...: .::. :: . ::: :::.:.:: ..:.:::.:.::::::: ::::.::
CCDS42 KSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 NRSHLIRHEKVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKSFSRSSA
. . ::.:..:::::::.:: .::. :.:..:...::. ::. ::::: .::: ::....
CCDS42 QNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 LIQHWRVHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRH
: .: :::: ::::::.:::..:. ...: .::. ::::::.::.:::..::....:..:
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::.: ::::::: ::. : ::::::::::: :::..:. : .:::.::. .::::
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CCDS12 VRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPY
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620
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CCDS12 SQSSGFLRHRKAHGRTRTHECSECGKSFSRKTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVS
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CCDS12 HWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRV
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CCDS12 HTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRRAHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGE
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CCDS12 RPYECSVCGKSFIRKTHLIRHQTVHTNERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYE
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CCDS12 CRECGKSFTRKNHLIQHKTVHTGERPYECSECGKSFSQSSGLLRHRRVHVQ
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CCDS12 MAEAALVITPQGHVTFEDIAVYFSQEEWGLLDEAQR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]