Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6166
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6166, 603 aa
1>>>pF1KB6166 603 - 603 aa - 603 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8970+/-0.00123; mu= 16.3980+/- 0.074
mean_var=83.9593+/-16.997, 0's: 0 Z-trim(102.8): 125 B-trim: 230 in 1/48
Lambda= 0.139972
statistics sampled from 7011 (7136) to 7011 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9051.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 603) 3977 813.7 0
CCDS44953.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 483) 3075 631.5 7.7e-181
CCDS41821.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 467) 3067 629.8 2.3e-180
CCDS74905.1 NR2C2 gene_id:7182|Hs108|chr3 ( 596) 1488 311.0 2.7e-84
CCDS2621.1 NR2C2 gene_id:7182|Hs108|chr3 ( 615) 1470 307.4 3.5e-83
CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 463) 470 105.4 1.7e-22
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 340) 465 104.3 2.6e-22
CCDS45359.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 261) 442 99.6 5.3e-21
CCDS45358.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 281) 442 99.6 5.7e-21
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6 ( 533) 439 99.2 1.5e-20
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6 ( 537) 439 99.2 1.5e-20
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs108|chr9 ( 462) 436 98.5 2e-20
CCDS13331.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 417) 431 97.5 3.6e-20
CCDS46605.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 464) 431 97.5 4e-20
CCDS13330.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 474) 431 97.5 4.1e-20
CCDS6220.2 HNF4G gene_id:3174|Hs108|chr8 ( 445) 424 96.1 1e-19
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19 ( 404) 422 95.7 1.3e-19
CCDS68131.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 395) 421 95.5 1.4e-19
CCDS4068.1 NR2F1 gene_id:7025|Hs108|chr5 ( 423) 421 95.5 1.5e-19
CCDS46604.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 442) 421 95.5 1.6e-19
CCDS74728.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 449) 421 95.5 1.6e-19
CCDS42876.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 452) 421 95.5 1.6e-19
CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 414) 411 93.5 6e-19
CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 457) 411 93.5 6.5e-19
CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 462) 411 93.5 6.5e-19
CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 454) 410 93.3 7.4e-19
CCDS83303.1 HNF4G gene_id:3174|Hs108|chr8 ( 408) 409 93.1 7.8e-19
CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 443) 409 93.1 8.3e-19
CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 382) 408 92.8 8.5e-19
CCDS2642.1 RARB gene_id:5915|Hs108|chr3 ( 448) 404 92.1 1.7e-18
CCDS45271.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15 ( 468) 399 91.1 3.5e-18
CCDS10177.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15 ( 523) 399 91.1 3.9e-18
CCDS10178.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15 ( 548) 399 91.1 4e-18
CCDS10179.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15 ( 556) 399 91.1 4.1e-18
CCDS30856.1 RORC gene_id:6097|Hs108|chr1 ( 497) 393 89.9 8.6e-18
CCDS1004.1 RORC gene_id:6097|Hs108|chr1 ( 518) 393 89.9 8.9e-18
CCDS73751.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 ( 367) 367 84.5 2.6e-16
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs108|chr2 ( 598) 369 85.1 2.9e-16
CCDS6646.1 RORB gene_id:6096|Hs108|chr9 ( 459) 367 84.6 3.1e-16
CCDS2610.2 PPARG gene_id:5468|Hs108|chr3 ( 477) 357 82.6 1.3e-15
CCDS2609.1 PPARG gene_id:5468|Hs108|chr3 ( 505) 357 82.6 1.3e-15
CCDS5063.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 ( 385) 355 82.1 1.4e-15
CCDS9078.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 472) 353 81.8 2.2e-15
CCDS55875.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 482) 353 81.8 2.3e-15
CCDS42316.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 410) 349 80.9 3.5e-15
CCDS58546.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 451) 349 81.0 3.8e-15
CCDS11360.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 490) 349 81.0 4e-15
CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 ( 422) 348 80.7 4.1e-15
CCDS2641.1 THRB gene_id:7068|Hs108|chr3 ( 461) 348 80.8 4.4e-15
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 598) 349 81.0 4.7e-15
>>CCDS9051.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 (603 aa)
initn: 3977 init1: 3977 opt: 3977 Z-score: 4343.1 bits: 813.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3977; 100.0% identity (100.0% similar) in 603 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FMNIHPSGVKTESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FMNIHPSGVKTESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSNDDTSLCEFQEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LSNDDTSLCEFQEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSIN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 YTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDKMSTERRKLLMEHIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDKMSTERRKLLMEHIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 KLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIG
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 HSI
:::
CCDS90 HSI
>>CCDS44953.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 (483 aa)
initn: 3075 init1: 3075 opt: 3075 Z-score: 3360.1 bits: 631.5 E(32554): 7.7e-181
Smith-Waterman score: 3075; 100.0% identity (100.0% similar) in 465 aa overlap (1-465:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FMNIHPSGVKTESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FMNIHPSGVKTESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSNDDTSLCEFQEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSNDDTSLCEFQEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSIN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 YTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDKMSTERRKLLMEHIF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDAKVIAALIHFTRRAI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 KLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTY
CCDS44 TDL
>>CCDS41821.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 (467 aa)
initn: 3067 init1: 3067 opt: 3067 Z-score: 3351.6 bits: 629.8 E(32554): 2.3e-180
Smith-Waterman score: 3067; 100.0% identity (100.0% similar) in 464 aa overlap (1-464:1-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FMNIHPSGVKTESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FMNIHPSGVKTESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSNDDTSLCEFQEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSNDDTSLCEFQEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSIN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 YTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDKMSTERRKLLMEHIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQAEG
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 KLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTY
>>CCDS74905.1 NR2C2 gene_id:7182|Hs108|chr3 (596 aa)
initn: 2447 init1: 1238 opt: 1488 Z-score: 1626.7 bits: 311.0 E(32554): 2.7e-84
Smith-Waterman score: 2357; 62.7% identity (82.4% similar) in 601 aa overlap (11-603:17-596)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTALDHNTQGKQ-FILTNHDGST
. : .:::.::::::::::::.: . . :: ::::. ::.
CCDS74 MTSPSPRIQIISTDSAVASPQRIQIVTDQQTGQKIQIVTAVDASGSPKQQFILTSPDGAG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PSKVILARQDSTPGK-VFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDL
.::::: ... .: ...:: : ... ..: . :...: :: : : .: .
CCDS74 TGKVILASPETSSAKQLIFTTSDNLVPGRIQIVTDSASVERLLGKTDV---QRP-QVVEY
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 CVVCGDKASGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQR
::::::::::::::::.:::::::::::.::::.::::...:::::::::::::.:::..
CCDS74 CVVCGDKASGRHYGAVSCEGCKGFFKRSVRKNLTYSCRSNQDCIINKHHRNRCQFCRLKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 CIAFGMKQDSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRS
:. .:::..::: ::::..:.::: :::::::::::::::::::: ::::::.:....:.
CCDS74 CLEMGMKMESVQSERKPFDVQREKPSNCAASTEKIYIRKDLRSPLIATPTFVADKDGARQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TGLLDSGMFMNIHPSGVKTESAVLMTSD-KAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQN
::::: ::..::. .. ...::...: :::. :: :.::::::::::::.
CCDS74 TGLLDPGMLVNIQQPLIREDGTVLLATDSKAETSQGALGTLANVVTSLANLS--------
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB6 SNEMSMIESLSNDDTSLCEFQ-EMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGME---
:::.: ::: :.: : :. ....::::::::::: .:.. : . :..
CCDS74 -------ESLNNGDTS--EIQPEDQSASEITRAFDTLAKALNTTDSSSSPSLADGIDTSG
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 -GSVHLITGDSSINYTEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMH
::.:.:. :.: : :::::::.::.:.:::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS74 GGSIHVISRDQSTPIIEVEGPLLSDTHVTFKLTMPSPMPEYLNVHYICESASRLLFLSMH
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 WALSIPSFQALGQENSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDK
:: :::.::::::. . :::.: :::::::::::: :::...::::..:: :.::.:.::
CCDS74 WARSIPAFQALGQDCNTSLVRACWNELFTLGLAQCAQVMSLSTILAAIVNHLQNSIQEDK
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 MSTERRKLLMEHIFKLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQE
.: .: : .::::.:::::::::.:: ::::::::::::::::::::.: . :::::::
CCDS74 LSGDRIKQVMEHIWKLQEFCNSMAKLDIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPGLTSTSQIEKFQE
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 KAYVEFQDYITKTYPDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRIDSVIPHI
:: .:.:::. ::: .:::::.:.:.::::::::...::::::: :::::. :::.::.:
CCDS74 KAQMELQDYVQKTYSEDTYRLARILVRLPALRLMSSNITEELFFTGLIGNVSIDSIIPYI
520 530 540 550 560 570
590 600
pF1KB6 LKMEPADYNSQIIGHSI
:::: :.::.:: : :.
CCDS74 LKMETAEYNGQITGASL
580 590
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10 20 30 40
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.:::.::::::::::::.: . . :: :::
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50 60 70 80 90 100
pF1KB6 TNHDGSTPSKVILARQDSTPGK-VFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQG
:. ::. .::::: ... .: ...:: : ... ..: . :...: :: :
CCDS26 TSPDGAGTGKVILASPETSSAKQLIFTTSDNLVPGRIQIVTDSASVERLLGKTDV---QR
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110 120 130 140 150 160
pF1KB6 PNKVFDLCVVCGDKASGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRC
: .: . ::::::::::::::::.:::::::::::.::::.::::...::::::::::::
CCDS26 P-QVVEYCVVCGDKASGRHYGAVSCEGCKGFFKRSVRKNLTYSCRSNQDCIINKHHRNRC
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170 180 190 200 210 220
pF1KB6 QYCRLQRCIAFGMKQDSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVT
:.:::..:. .:::..::: ::::..:.::: :::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS26 QFCRLKKCLEMGMKMESVQSERKPFDVQREKPSNCAASTEKIYIRKDLRSPLIATPTFVA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DSESTRSTGLLDSGMFMNIHPSGVKTESAVLMTSD-KAESCQGDLSTLANVVTSLANLGK
:....:.::::: ::..::. .. ...::...: :::. :: :.::::::::::::.
CCDS26 DKDGARQTGLLDPGMLVNIQQPLIREDGTVLLATDSKAETSQGALGTLANVVTSLANLS-
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TKDLSQNSNEMSMIESLSNDDTSLCEFQ-EMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSV
:::.: ::: :.: : :. ....::::::::::: .:.. : .
CCDS26 --------------ESLNNGDTS--EIQPEDQSASEITRAFDTLAKALNTTDSSSSPSLA
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350 360 370 380 390
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:.. ::.:.:. :.: : :::::::.::.:.:::::::::::::::: :::::
CCDS26 DGIDTSGGGSIHVISRDQSTPIIEVEGPLLSDTHVTFKLTMPSPMPEYLNVHYICESASR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 LLFLSMHWALSIPSFQALGQENSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLH
::::::::: :::.::::::. . :::.: :::::::::::: :::...::::..:: :.
CCDS26 LLFLSMHWARSIPAFQALGQDCNTSLVRACWNELFTLGLAQCAQVMSLSTILAAIVNHLQ
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460 470 480 490 500 510
pF1KB6 NSLQQDKMSTERRKLLMEHIFKLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENME
::.:.::.: .: : .::::.:::::::::.:: ::::::::::::::::::::.: .
CCDS26 NSIQEDKLSGDRIKQVMEHIWKLQEFCNSMAKLDIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPGLTSTS
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520 530 540 550 560 570
pF1KB6 QIEKFQEKAYVEFQDYITKTYPDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRI
::::::::: .:.:::. ::: .:::::.:.:.::::::::...::::::: :::::. :
CCDS26 QIEKFQEKAQMELQDYVQKTYSEDTYRLARILVRLPALRLMSSNITEELFFTGLIGNVSI
540 550 560 570 580 590
580 590 600
pF1KB6 DSVIPHILKMEPADYNSQIIGHSI
::.::.::::: :.::.:: : :.
CCDS26 DSIIPYILKMETAEYNGQITGASL
600 610
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10 20 30 40 50 60
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:. :. . . . . :: .. : ::
CCDS12 STGKPMDSHPSYTDTPVSAPRTLSAVGTPLNALGSPYRVITSAMGPPSGALAA----PPG
40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTD----NSPDQGPNK-VFDLCVVCGDKASG
. :..: .. .: . .. . . . : : : :. .:.. : .:..:::..::
CCDS12 -INLVAPPSSQLNVVNSVSSSEDIKPLPGLPGIGNMNYPSTSPGSLVKHICAICGDRSSG
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130 140 150 160 170 180
pF1KB6 RHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQDS
.:::. .::::::::::.:::.:.:.:: .:::.:.:..:::::::: :.:...:::...
CCDS12 KHYGVYSCEGCKGFFKRTIRKDLIYTCRDNKDCLIDKRQRNRCQYCRYQKCLVMGMKREA
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:: ::. . :. ..::.: : . ... :.. :.. :
CCDS12 VQEERQRSRERAESEAECATSGHEDMPVERILEAELAVEP--------------------
210 220 230 240
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:::: :: :.: .:
CCDS12 --------KTES------------YGD--------------------------MNMENST
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.. :..:.
CCDS12 NDPVTNICH---------------------------------------------------
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.:.. :: ..:: :: :. : :.
CCDS12 ----------------------------------AADKQLFTLVEWAKRIPHFSDLTLED
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.. :..: ::::. .... .. . .::: .. ..: .. ... ..: : . :
CCDS12 QVILLRAGWNELLIASFSHRSVSVQDGILLATGLHVHRSSAHSAGVGSIFDRVLTELVSK
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pF1KB6 LQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTYP
... . .: : . :.:::::.:: .: : ..: ..::.:. .. : . ::
CCDS12 MKD-------MQMDKSELGCLRAIVLFNPDAKGLSNPSEVETLREKVYATLEAYTKQKYP
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.. :...::::::::: .. :.::: :::. ::. . ..:.
CCDS12 EQPGRFAKLLLRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLIGDTPIDTFLMEMLETPLQIT
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pF1KB6 SI
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.::::::::::.:::.:.:.:: .:::.:.:..:::::::: :.:...:::...:: ::.
CCDS72 SCEGCKGFFKRTIRKDLIYTCRDNKDCLIDKRQRNRCQYCRYQKCLVMGMKREAVQEERQ
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. :. ..::.: : . ... :.. :.. :
CCDS72 RSRERAESEAECATSGHEDMPVERILEAELAVEP--------------------------
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:::: :: :.: .: .. :.
CCDS72 --KTES------------YGD--------------------------MNMENSTNDPVTN
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.:.
CCDS72 ICH---------------------------------------------------------
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.:.. :: ..:: :: :. : :... :..
CCDS72 ----------------------------AADKQLFTLVEWAKRIPHFSDLTLEDQVILLR
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: ::::. .... .. . .::: .. ..: .. ... ..: : . :...
CCDS72 AGWNELLIASFSHRSVSVQDGILLATGLHVHRSSAHSAGVGSIFDRVLTELVSKMKD---
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. .: : . :.:::::.:: .: : ..: ..::.:. .. : . ::.. :.
CCDS72 ----MQMDKSELGCLRAIVLFNPDAKGLSNPSEVETLREKVYATLEAYTKQKYPEQPGRF
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pF1KB6 SRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIGHSI
..::::::::: .. :.::: :::. ::. . ..:.
CCDS72 AKLLLRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLIGDTPIDTFLMEMLETPLQIT
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....:.. :.:::.:. ::: . ..:: .::. :: : ::..: .:.
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:: .:: ... : .:. ::. :::::::. : .: .. ..:..:::. ...:.
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. ::.. :...::::::.:: ..... :.::: :.:. :...: .:
CCDS45 SQYPNQPTRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDMLLSGSSFNWPY
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600
pF1KB6 IIGHSI
CCDS45 MAIQ
260
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.... : : :.:.:: ...:: .:: : :
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....:.. :.:::.:. ::: . ..:: .::. :: : ::..: .:.
CCDS45 QITDQVALLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAA--AGLHAS----PMSADRVVAFMD
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pF1KB6 HIFKLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYIT
:: .:: ... : .:. ::. :::::::. : .: .. ..:..:::. ...:.
CCDS45 HIRIFQEQVEKLKALHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDVAHVESLQEKSQCALEEYVR
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pF1KB6 KTYPDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRIDSVIPHILKMEPADYNSQ
. ::.. :...::::::.:: ..... :.::: :.:. :...: .:
CCDS45 SQYPNQPTRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDMLLSGSSFNWPY
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600
pF1KB6 IIGHSI
CCDS45 MAIQ
280
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pF1KB6 TTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSPDQGPNKVFDLCVVCGDKASGRHYGAVTCE
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CCDS47 STVSLPGGGSGPPEDVKPPVLGVRGLHCPPPPGGPGAGKRLCAICGDRSSGKHYGVYSCE
170 180 190 200 210 220
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 GCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCIINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQDSVQCERKPIE
::::::::.:::.:.:::: .::: ..:..:::::::: :.:.: :::...:: ::.
CCDS47 GCKGFFKRTIRKDLTYSCRDNKDCTVDKRQRNRCQYCRYQKCLATGMKREAVQEERQ---
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 VSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLTATPTFVTDSESTRSTGLLDSGMFMNIHPSGVKT
: :. :: :.:.. .:.
CCDS47 --RGKD-------------KD------------GDGEGA----------------GGAPE
290
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 ESAVLMTSDKAESCQGDLSTLANVVTSLANLGKTKDLSQNSNEMSMIESLSNDDTSLCEF
: : :. ..:.
CCDS47 E----MPVDR-----------------------------------ILEA-----------
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320 330 340 350 360 370
pF1KB6 QEMQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSVAGMEGSVHLITGDSSINYTEKEGPLLSD
: .. :.: :.:: :: :.
CCDS47 -----------------------ELAVEQKSDQGVEGPGG--TGGSG-------------
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:: : : ..:.. :: ..:: :: :..: .... :..: ::
CCDS47 ---------SSPNDPVTN---ICQAADKQLFTLVEWAKRIPHFSSLPLDDQVILLRAGWN
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pF1KB6 ELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHNSLQQDKMSTERRKLLMEHIFKLQEFCNSMVK
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CCDS47 ELLIASFSHRSIDVRDGILLATGLHVHRNSAHSAGVGAIFDRVLTELVSKMRD-------
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pF1KB6 LCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPSLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTYPDDTYRLSRLL
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CCDS47 MRMDKTELGCLRAIILFNPDAKGLSNPSEVEVLREKVYASLETYCKQKYPEQQGRFAKLL
440 450 460 470 480 490
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pF1KB6 LRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNIRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIGHSI
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CCDS47 LRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLIGDTPIDTFLMEMLEAPHQLA
500 510 520 530
603 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:45:51 2016 done: Sun Nov 6 14:45:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]