FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6158, 646 aa 1>>>pF1KB6158 646 - 646 aa - 646 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3931+/-0.000463; mu= -3.3364+/- 0.028 mean_var=465.4262+/-106.695, 0's: 0 Z-trim(121.1): 1959 B-trim: 801 in 1/57 Lambda= 0.059450 statistics sampled from 34600 (37333) to 34600 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16 Scan time: 11.660 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004064 (OMIM: 602913) serine/threonine-protein ( 646) 4369 389.9 1.5e-107 NP_001239155 (OMIM: 607023) serine/threonine-prote ( 671) 1503 144.1 1.5e-33 NP_006613 (OMIM: 607023) serine/threonine-protein ( 685) 1499 143.8 1.9e-33 NP_005021 (OMIM: 602098) serine/threonine-protein ( 603) 1146 113.5 2.3e-24 XP_005262758 (OMIM: 605031,616171) PREDICTED: seri ( 936) 756 80.3 3.6e-14 XP_016863152 (OMIM: 605031,616171) PREDICTED: seri ( 937) 756 80.3 3.6e-14 NP_055079 (OMIM: 605031,616171) serine/threonine-p ( 970) 756 80.3 3.6e-14 XP_016863151 (OMIM: 605031,616171) PREDICTED: seri ( 971) 756 80.3 3.6e-14 NP_001177730 (OMIM: 605031,616171) serine/threonin ( 929) 674 73.2 4.6e-12 NP_001177728 (OMIM: 605031,616171) serine/threonin ( 938) 619 68.5 1.2e-10 NP_055655 (OMIM: 608130) NUAK family SNF1-like kin ( 661) 588 65.7 6.3e-10 XP_011527839 (OMIM: 606532) PREDICTED: hormonally ( 698) 581 65.1 9.8e-10 NP_055401 (OMIM: 606532) hormonally up-regulated n ( 714) 581 65.1 1e-09 XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre ( 660) 550 62.4 6e-09 NP_003151 (OMIM: 243060,603495) aurora kinase C is ( 275) 537 60.8 7.5e-09 NP_001015879 (OMIM: 243060,603495) aurora kinase C ( 290) 537 60.8 7.8e-09 NP_001015878 (OMIM: 243060,603495) aurora kinase C ( 309) 537 60.9 8.1e-09 XP_016872913 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1213) 550 62.7 8.7e-09 NP_001268678 (OMIM: 614776) serine/threonine-prote (1261) 550 62.8 8.9e-09 XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1261) 550 62.8 8.9e-09 XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1309) 550 62.8 9.1e-09 XP_005271539 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1321) 550 62.8 9.2e-09 NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein (1321) 550 62.8 9.2e-09 XP_005271538 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 550 62.8 9.4e-09 XP_011541023 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 550 62.8 9.4e-09 XP_016880796 (OMIM: 604970) PREDICTED: aurora kina ( 303) 529 60.2 1.3e-08 NP_001243763 (OMIM: 604970) aurora kinase B isofor ( 303) 529 60.2 1.3e-08 XP_011522374 (OMIM: 604970) PREDICTED: aurora kina ( 303) 529 60.2 1.3e-08 NP_001300880 (OMIM: 604970) aurora kinase B isofor ( 303) 529 60.2 1.3e-08 NP_001300879 (OMIM: 604970) aurora kinase B isofor ( 344) 529 60.2 1.4e-08 NP_004208 (OMIM: 604970) aurora kinase B isoform 1 ( 344) 529 60.2 1.4e-08 XP_016883524 (OMIM: 603072) PREDICTED: aurora kina ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_003591 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo sap ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_001310233 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_940837 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo sap ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_001310232 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_940835 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo sap ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_940839 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo sap ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_940836 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo sap ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_940838 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo sap ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_001310234 (OMIM: 603072) aurora kinase A [Homo ( 403) 529 60.3 1.5e-08 NP_001300881 (OMIM: 604970) aurora kinase B isofor ( 304) 526 59.9 1.5e-08 XP_016883523 (OMIM: 603072) PREDICTED: aurora kina ( 437) 529 60.4 1.6e-08 NP_001271455 (OMIM: 604970) aurora kinase B isofor ( 345) 526 60.0 1.7e-08 XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 532 60.9 1.9e-08 XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 532 60.9 1.9e-08 XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 532 60.9 1.9e-08 XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 532 60.9 1.9e-08 XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 532 60.9 1.9e-08 XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 532 60.9 1.9e-08 >>NP_004064 (OMIM: 602913) serine/threonine-protein kina (646 aa) initn: 4369 init1: 4369 opt: 4369 Z-score: 2052.0 bits: 389.9 E(85289): 1.5e-107 Smith-Waterman score: 4369; 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NP_001 LNKQGHGCESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRCIREARYTMPSSLLAPAKHLI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 AAILRASPRDRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSL :..: .:.::::.:.:.::::: .:.::::: : : ::::. .::...: :.. .: NP_001 ASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKNFFKKAAAAL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 FGRKKK------SKNHAQERDE-VSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPVSLVET- :: :: ..:.....:: . : : .::. .: .. .. : ...... NP_001 FGGKKDKARYIDTHNRVSKEDEDIYKLRHDLKKTSITQQPSKHRTDEELQPPTTTVARSG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KB6 --APEDSSP---------RGTLASSGDGFE--EGLTVATVVESALCALRNCIAFMPPAEQ : :... ::::.: ... : : :...:.... .::.:. :: :. NP_001 TPAVENKQQIGDAIRMIVRGTLGSCSSSSECLEDSTMGSVADTVARVLRGCLENMPEADC 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KB6 NPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVHYNPTS : . . ::.::::::::.:::::::.. :.::::.:.::.: ..::::: NP_001 IPKEQLSTS-FQWVTKWVDYSNKYGFGYQLSDHTVGVLFNNGAHMSLLPDKKTVHYYAEL 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB6 TKHFSFSVGAVPRALQPQLGILRYFASYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTD . : . .:. . :. .:.::. :::..:: ::::::: ... : ::::.:.: NP_001 GQCSVFPATDAPEQFISQVTVLKYFSHYMEENLMDGGDLPSVTDIRRPRL-YLLQWLKSD 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 pF1KB6 QALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLIL-SGWEPLLVTFVARNRSACTYLASHLRQLGCSPDL .::.:::.::: ::::: ::::.:. : : :.:.. ..: . :. . : . ::: .: NP_001 KALMMLFNDGTFQVNFYHDHTKIIICSQNEEYLLTYINEDRISTTFRLTTLLMSGCSSEL 600 610 620 630 640 650 630 640 pF1KB6 RQRLRYALRLLRDRSPA ..:..::: .: .: NP_001 KNRMEYALNMLLQRCN 660 670 >>NP_006613 (OMIM: 607023) serine/threonine-protein kina (685 aa) initn: 2121 init1: 1464 opt: 1499 Z-score: 721.4 bits: 143.8 E(85289): 1.9e-33 Smith-Waterman score: 2126; 50.6% identity (74.9% similar) in 650 aa overlap (20-643:36-683) 10 20 30 40 pF1KB6 MEPAAGFLSPRPFQRAAAAPAPPAGPGPPPSALRGPELEMLAGLPTSDP : :: :: : . : : NP_006 TITYQPAASTKMCEQALGKGCGADSKKKRPPQPPEESQPPQSQAQVPPAAPHHHHHHSHS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB6 G----RLITDPRSGRTYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKPHQRE : :.:.:: .:. : .:..:::::::.::: :: ....::.:.::.:::::::::: NP_006 GPEISRIIVDPTTGKRYCRGKVLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVAKPHQRE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 KILNEIELHRDLQHRHIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYY :: .:::::: :.:.:.:.: :.::: .::::.:: :::.:.::: :::..: ::::::: NP_006 KIDKEIELHRILHHKHVVQFYHYFEDKENIYILLEYCSRRSMAHILKARKVLTEPEVRYY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 LRQILSGLKYLHQRGILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPEQRKKTICGTPN ::::.:::::::.. :::::::::::::.: :::::::::::::::: :.:..::::::: NP_006 LRQIVSGLKYLHEQEILHRDLKLGNFFINEAMELKVGDFGLAARLEPLEHRRRTICGTPN 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 YVAPEVLLRQGHGPEADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIKQVHYTLPASLSL :..:::: .:::: :.:.:.:::::::.: : :::::..::::::::....::.:.:: NP_006 YLSPEVLNKQGHGCESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRCIREARYTMPSSLLA 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 PARQLLAAILRASPRDRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFA ::..:.:..: .:.::::.:.:.::::: .:.::::: : : ::::. .::...: NP_006 PAKHLIASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKNFFK 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 pF1KB6 KVTKSLFGRKKK------SKNHAQERDE-VSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPV :.. .::: :: ..:.....:: . : : .::. .: .. .. : . 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XP_016 SGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRRLLIGQPLPNKMTVFPKNKSSTDFSSSGDGNSFY 290 300 310 320 330 340 >>NP_055079 (OMIM: 605031,616171) serine/threonine-prote (970 aa) initn: 801 init1: 561 opt: 756 Z-score: 375.3 bits: 80.3 E(85289): 3.6e-14 Smith-Waterman score: 756; 37.4% identity (71.7% similar) in 297 aa overlap (65-356:15-311) 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 GPELEMLAGLPTSDPGRLITDPRSGRTYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIP : :::::.:: :.: . .:: :.:.: NP_055 MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGLEVAIKMID 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 QSRVAKPHQREKILNEIELHRDLQHRHIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKAR .. . : . ... ::...: .:.: :... ..:::.. .:. ::.: . . : : NP_055 KKAMYKAGMVQRVQNEVKIHCQLKHPSILELYNYFEDSNYVYLVLEMCHNGEMNRYLKNR 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 -HTLLEPEVRYYLRQILSGLKYLHQRGILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPP . . : :.:....::..:. :::..::::::: :.:...:.::..:..:::::..:. : NP_055 VKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHGILHRDLTLSNLLLTRNMNIKIADFGLATQLKMP 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 EQRKKTICGTPNYVAPEVLLRQGHGPEADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIK .... :.::::::..::. :..:: :.:::::::..:::: : :::.: .:.: . 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