Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6158
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6158, 646 aa
1>>>pF1KB6158 646 - 646 aa - 646 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8488+/-0.00102; mu= 4.5840+/- 0.061
mean_var=249.0985+/-53.634, 0's: 0 Z-trim(113.5): 700 B-trim: 198 in 1/49
Lambda= 0.081262
statistics sampled from 13292 (14113) to 13292 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.434), width: 16
Scan time: 4.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS515.1 PLK3 gene_id:1263|Hs108|chr1 ( 646) 4369 525.7 7.8e-149
CCDS75250.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 671) 1503 189.7 1.1e-47
CCDS3974.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 685) 1499 189.2 1.6e-47
CCDS10616.1 PLK1 gene_id:5347|Hs108|chr16 ( 603) 1146 147.8 4.1e-35
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 756 102.3 3.4e-21
CCDS54804.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 929) 674 92.6 2.6e-18
CCDS54803.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 938) 619 86.2 2.3e-16
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 588 82.4 2.2e-15
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 581 81.6 4.1e-15
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 537 76.1 7.3e-14
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 537 76.1 7.6e-14
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 550 78.2 7.6e-14
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 550 78.2 7.8e-14
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 537 76.1 7.9e-14
CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 303) 529 75.2 1.5e-13
CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 344) 529 75.2 1.6e-13
CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 ( 403) 529 75.3 1.8e-13
CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 345) 526 74.9 2.1e-13
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 529 75.6 3e-13
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 528 75.4 3e-13
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 529 75.6 3e-13
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 529 75.6 3e-13
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 528 75.4 3e-13
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 528 75.4 3e-13
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 528 75.4 3.1e-13
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 528 75.4 3.2e-13
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 525 75.1 4e-13
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 524 74.9 4.2e-13
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 524 74.9 4.2e-13
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 524 74.9 4.3e-13
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 524 75.0 4.3e-13
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 523 74.8 4.4e-13
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 523 74.8 4.7e-13
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 514 73.7 8.4e-13
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 514 73.7 8.8e-13
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 504 72.4 1.5e-12
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 504 72.5 1.8e-12
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 454) 499 71.8 2.3e-12
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 556) 499 71.9 2.7e-12
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 493 71.1 3.6e-12
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 497 71.7 3.6e-12
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 496 71.7 4.1e-12
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 496 71.7 4.1e-12
CCDS45896.1 STK11 gene_id:6794|Hs108|chr19 ( 433) 490 70.7 4.6e-12
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 495 71.6 4.7e-12
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 495 71.6 4.7e-12
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 493 71.3 4.8e-12
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 490 70.9 6.6e-12
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 492 71.4 8.1e-12
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 492 71.4 8.2e-12
>>CCDS515.1 PLK3 gene_id:1263|Hs108|chr1 (646 aa)
initn: 4369 init1: 4369 opt: 4369 Z-score: 2785.5 bits: 525.7 E(32554): 7.8e-149
Smith-Waterman score: 4369; 100.0% identity (100.0% similar) in 646 aa overlap (1-646:1-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEPAAGFLSPRPFQRAAAAPAPPAGPGPPPSALRGPELEMLAGLPTSDPGRLITDPRSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MEPAAGFLSPRPFQRAAAAPAPPAGPGPPPSALRGPELEMLAGLPTSDPGRLITDPRSGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKPHQREKILNEIELHRDLQHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 TYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKPHQREKILNEIELHRDLQHR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYYLRQILSGLKYLHQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 HIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYYLRQILSGLKYLHQRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPEQRKKTICGTPNYVAPEVLLRQGHGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPEQRKKTICGTPNYVAPEVLLRQGHGPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIKQVHYTLPASLSLPARQLLAAILRASPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIKQVHYTLPASLSLPARQLLAAILRASPR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKKSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 DRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKKSKN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 HAQERDEVSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPVSLVETAPEDSSPRGTLASSGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 HAQERDEVSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPVSLVETAPEDSSPRGTLASSGDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FEEGLTVATVVESALCALRNCIAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FEEGLTVATVVESALCALRNCIAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 SSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVHYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGILRYFASYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVHYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGILRYFASYME
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 QHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB6 LLVTFVARNRSACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLRYALRLLRDRSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LLVTFVARNRSACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLRYALRLLRDRSPA
610 620 630 640
>>CCDS75250.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 (671 aa)
initn: 2085 init1: 1464 opt: 1503 Z-score: 969.4 bits: 189.7 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 2130; 49.6% identity (75.5% similar) in 665 aa overlap (2-643:10-669)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MEPAAGF-LSPRPFQRAAAAPAPPAGPGPPPSALRGPELEMLAGLPTSDPGR
.:::. . . . .. .: . : :: . :. . : .: . .:
CCDS75 MELLRTITYQPAASTKMCEQALGKGCGADSKKKRPPQPPEESQPPQSQ--AQVPPA-ISR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LITDPRSGRTYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKPHQREKILNEI
.:.:: .:. : .:..:::::::.::: :: ....::.:.::.:::::::::::: .::
CCDS75 IIVDPTTGKRYCRGKVLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVAKPHQREKIDKEI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ELHRDLQHRHIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYYLRQILS
:::: :.:.:.:.: :.::: .::::.:: :::.:.::: :::..: :::::::::::.:
CCDS75 ELHRILHHKHVVQFYHYFEDKENIYILLEYCSRRSMAHILKARKVLTEPEVRYYLRQIVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GLKYLHQRGILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPEQRKKTICGTPNYVAPEV
::::::.. :::::::::::::.: :::::::::::::::: :.:..::::::::..:::
CCDS75 GLKYLHEQEILHRDLKLGNFFINEAMELKVGDFGLAARLEPLEHRRRTICGTPNYLSPEV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LLRQGHGPEADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIKQVHYTLPASLSLPARQLL
: .:::: :.:.:.:::::::.: : :::::..::::::::....::.:.:: ::..:.
CCDS75 LNKQGHGCESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRCIREARYTMPSSLLAPAKHLI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AAILRASPRDRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSL
:..: .:.::::.:.:.::::: .:.::::: : : ::::. .::...: :.. .:
CCDS75 ASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKNFFKKAAAAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 FGRKKK------SKNHAQERDE-VSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPVSLVET-
:: :: ..:.....:: . : : .::. .: .. .. : ......
CCDS75 FGGKKDKARYIDTHNRVSKEDEDIYKLRHDLKKTSITQQPSKHRTDEELQPPTTTVARSG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB6 --APEDSSP---------RGTLASSGDGFE--EGLTVATVVESALCALRNCIAFMPPAEQ
: :... ::::.: ... : : :...:.... .::.:. :: :.
CCDS75 TPAVENKQQIGDAIRMIVRGTLGSCSSSSECLEDSTMGSVADTVARVLRGCLENMPEADC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 NPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVHYNPTS
: . . ::.::::::::.:::::::.. :.::::.:.::.: ..:::::
CCDS75 IPKEQLSTS-FQWVTKWVDYSNKYGFGYQLSDHTVGVLFNNGAHMSLLPDKKTVHYYAEL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 TKHFSFSVGAVPRALQPQLGILRYFASYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTD
. : . .:. . :. .:.::. :::..:: ::::::: ... : ::::.:.:
CCDS75 GQCSVFPATDAPEQFISQVTVLKYFSHYMEENLMDGGDLPSVTDIRRPRL-YLLQWLKSD
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KB6 QALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLIL-SGWEPLLVTFVARNRSACTYLASHLRQLGCSPDL
.::.:::.::: ::::: ::::.:. : : :.:.. ..: . :. . : . ::: .:
CCDS75 KALMMLFNDGTFQVNFYHDHTKIIICSQNEEYLLTYINEDRISTTFRLTTLLMSGCSSEL
600 610 620 630 640 650
630 640
pF1KB6 RQRLRYALRLLRDRSPA
..:..::: .: .:
CCDS75 KNRMEYALNMLLQRCN
660 670
>>CCDS3974.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 (685 aa)
initn: 2121 init1: 1464 opt: 1499 Z-score: 966.8 bits: 189.2 E(32554): 1.6e-47
Smith-Waterman score: 2126; 50.6% identity (74.9% similar) in 650 aa overlap (20-643:36-683)
10 20 30 40
pF1KB6 MEPAAGFLSPRPFQRAAAAPAPPAGPGPPPSALRGPELEMLAGLPTSDP
: :: :: : . : :
CCDS39 TITYQPAASTKMCEQALGKGCGADSKKKRPPQPPEESQPPQSQAQVPPAAPHHHHHHSHS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 G----RLITDPRSGRTYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKPHQRE
: :.:.:: .:. : .:..:::::::.::: :: ....::.:.::.::::::::::
CCDS39 GPEISRIIVDPTTGKRYCRGKVLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVAKPHQRE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KILNEIELHRDLQHRHIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYY
:: .:::::: :.:.:.:.: :.::: .::::.:: :::.:.::: :::..: :::::::
CCDS39 KIDKEIELHRILHHKHVVQFYHYFEDKENIYILLEYCSRRSMAHILKARKVLTEPEVRYY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 LRQILSGLKYLHQRGILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPEQRKKTICGTPN
::::.:::::::.. :::::::::::::.: :::::::::::::::: :.:..:::::::
CCDS39 LRQIVSGLKYLHEQEILHRDLKLGNFFINEAMELKVGDFGLAARLEPLEHRRRTICGTPN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 YVAPEVLLRQGHGPEADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIKQVHYTLPASLSL
:..:::: .:::: :.:.:.:::::::.: : :::::..::::::::....::.:.::
CCDS39 YLSPEVLNKQGHGCESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRCIREARYTMPSSLLA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 PARQLLAAILRASPRDRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFA
::..:.:..: .:.::::.:.:.::::: .:.::::: : : ::::. .::...:
CCDS39 PAKHLIASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKNFFK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB6 KVTKSLFGRKKK------SKNHAQERDE-VSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPV
:.. .::: :: ..:.....:: . : : .::. .: .. .. : .
CCDS39 KAAAALFGGKKDKARYIDTHNRVSKEDEDIYKLRHDLKKTSITQQPSKHRTDEELQPPTT
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440
pF1KB6 SLVET---APEDSSP---------RGTLASSGDGFE--EGLTVATVVESALCALRNCIAF
..... : :... ::::.: ... : : :...:.... .::.:.
CCDS39 TVARSGTPAVENKQQIGDAIRMIVRGTLGSCSSSSECLEDSTMGSVADTVARVLRGCLEN
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 MPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTV
:: :. : . . ::.::::::::.:::::::.. :.::::.:.::.: ..:::
CCDS39 MPEADCIPKEQLSTS-FQWVTKWVDYSNKYGFGYQLSDHTVGVLFNNGAHMSLLPDKKTV
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 HYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGILRYFASYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLL
:: . : . .:. . :. .:.::. :::..:: ::::::: ... : ::
CCDS39 HYYAELGQCSVFPATDAPEQFISQVTVLKYFSHYMEENLMDGGDLPSVTDIRRPRL-YLL
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 QWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLIL-SGWEPLLVTFVARNRSACTYLASHLRQL
::.:.:.::.:::.::: ::::: ::::.:. : : :.:.. ..: . :. . : .
CCDS39 QWLKSDKALMMLFNDGTFQVNFYHDHTKIIICSQNEEYLLTYINEDRISTTFRLTTLLMS
610 620 630 640 650 660
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CCDS54 MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGLEVAIKML-
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CCDS54 SGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRRLLIGQPLPNKMTVFPKNKSSTDFSSSGDGNSFY
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CCDS31 QADTEAKMKGLAKPTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRPKGIL
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CCDS31 TSHSLSCRRKGILKHSS--KYSAGTMDPALVSP-EMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPS
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CCDS31 SVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYR
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CCDS13 MPAAAGDGLLGEPAAPGGGGGAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQ
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CCDS13 HHKRVGNYLIGSRKLGEGSFAKVREGLHVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQ
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CCDS13 VEHLHRAGVVHRDLKIENLLLDEDNNIKLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPE
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CCDS13 LLARKKYGPKIDVWSIGVNMYAMLTGTLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGA
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CCDS13 ISFLRSLLEPDPVKRPNIQQALANRWLNENYTGKVPCNVTYPNRISLEDLSPSVVLHMTE
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CCDS13 KLGYKNSDVINTVLSNRACHILAIYFLLNKKLERYLSGKSDIQDSLCYKTRLYQIEKYRA
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CCDS46 MRRLTVDDFEIGRPLGKGKFGNVYLARLKESHFIVALKVLF
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CCDS46 KSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARRVYLILEYAPRGELYKELQKS
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CCDS46 EKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLGFRGEVKIADFGWS--VHTPS
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