Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6156
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6156, 637 aa
1>>>pF1KB6156 637 - 637 aa - 637 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3380+/-0.000677; mu= -6.4755+/- 0.042
mean_var=581.2375+/-118.685, 0's: 0 Z-trim(118.1): 214 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.053198
statistics sampled from 30442 (30657) to 30442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 12.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 4177 336.4 1.9e-91
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 2571 213.1 2.4e-54
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 2258 189.1 4.1e-47
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 2252 188.6 5.6e-47
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 2188 183.7 1.6e-45
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 2157 181.3 8.4e-45
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 2092 176.3 2.6e-43
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 2091 176.2 2.7e-43
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 2085 175.8 3.8e-43
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 1913 162.5 3.4e-39
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1901 161.6 6.5e-39
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 1886 160.5 1.5e-38
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1811 154.7 7.7e-37
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1789 153.0 2.5e-36
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1750 150.0 2e-35
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1712 147.1 1.5e-34
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1712 147.1 1.5e-34
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1696 145.8 3.1e-34
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1609 139.3 3.9e-32
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1609 139.3 3.9e-32
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1599 138.3 5.3e-32
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1598 138.3 5.8e-32
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 1566 135.8 3.3e-31
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 1566 135.8 3.3e-31
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 1566 135.9 3.5e-31
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1559 135.4 5.1e-31
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 1506 131.2 8e-30
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1413 124.1 1.1e-27
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1397 122.8 2.5e-27
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1384 121.8 5.1e-27
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1378 121.2 6e-27
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1373 121.1 9.9e-27
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1359 120.0 2.1e-26
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1344 118.8 4.6e-26
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1327 117.5 1.1e-25
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1320 117.0 1.6e-25
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1320 117.0 1.6e-25
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1320 117.1 1.8e-25
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1231 110.0 1.7e-23
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 1159 104.6 8.3e-22
XP_011536591 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 322) 1109 100.5 9.5e-21
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1111 101.0 1.2e-20
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1111 101.1 1.3e-20
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1076 98.4 8.2e-20
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1005 92.8 2.9e-18
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 994 91.9 5.1e-18
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 952 88.4 3.8e-17
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 940 87.5 6.9e-17
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508) 938 87.7 1.1e-16
XP_011536312 (OMIM: 611159) PREDICTED: keratin, ty ( 488) 854 81.2 9.5e-15
>>NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,600962,60 (644 aa)
initn: 4078 init1: 3848 opt: 4177 Z-score: 1762.8 bits: 336.4 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 4177; 98.9% identity (98.9% similar) in 644 aa overlap (1-637:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGAGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGGFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKSRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 REQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 REQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNLRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTKVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQYED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQYED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQIS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 TYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGGSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGGSYG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB6 SGGGGGGGRGSYGSGG-------GSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSG
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSG
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KB6 GRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
610 620 630 640
>>NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II cytos (639 aa)
initn: 2142 init1: 2142 opt: 2571 Z-score: 1096.7 bits: 213.1 E(85289): 2.4e-54
Smith-Waterman score: 2586; 66.8% identity (84.7% similar) in 647 aa overlap (1-626:1-623)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGG-----FSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGS
:: :.: .: :.::: :::::: . . .::.::: . .: :::::.
NP_000 MSCQISCKSRGRGGGGGGFRGFSSGSAVVSGGSRRSTSSFSC--------LSRHGGGGGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FGAGGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGG--GGFGGGG-FGGG-GFGG
:: ::::::::::.:::.:::::::: ::: : : .::.:: ::::::. :::: ::.:
NP_000 FG-GGGFGSRSLVGLGGTKSISISVA-GGGGGFGAAGGFGGRGGGFGGGSSFGGGSGFSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GGIGGGGFGGFGSGGGGFGG-GGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEID
::.::::::: : :: ::: :: :: : ::.:: ::::.::..::::::::::..:
NP_000 GGFGGGGFGG-GRFGG-FGGPGGVGGLGGPGGFGPGGYPGGIHEVSVNQSLLQPLNVKVD
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PEIQKVKSREREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPY
::::.::..::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::....:: ::::
NP_000 PEIQNVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQMNVGTRPINLEPI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 FESFINNLRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKD
:...:..:.: .: : .... .:::.::::.::::..:::::::::: :::.:::.:::
NP_000 FQGYIDSLKRYLDGLTAERTSQNSELNNMQDLVEDYKKKYEDEINKRTAAENDFVTLKKD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 VDGAYMTKVDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSI
::.::: ::.::.:.: :.:::.:: .::.::.::.. ....:::::::::.:.::::::
NP_000 VDNAYMIKVELQSKVDLLNQEIEFLKVLYDAEISQIHQSVTDTNVILSMDNSRNLDLDSI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 IAEVKAQYEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRS
:::::::::.:::.:: :::.::.:::::::.:.::::::... ::::::::::::::..
NP_000 IAEVKAQYEEIAQRSKEEAEALYHSKYEELQVTVGRHGDSLKEIKIEISELNRVIQRLQG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 EIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMN
:: .:::: .:.:..:.:::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::::
NP_000 EIAHVKKQCKNVQDAIADAEQRGEHALKDARNKLNDLEEALQQAKEDLARLLRDYQELMN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB6 TKLALDLEIATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTS--------HTTISGGGSRGGG-
.:::::.:::::: :::::: ::::. . ::.:::..: .....:.:.::..
NP_000 VKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGDLSSNVTVSVTSSTISSNVASKAAFGGSGGRGSSS
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 GGGYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGGRGSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYR
::::.::.::::::: . :: ::.::: :: :::: ::::::.::. :::: :: .
NP_000 GGGYSSGSSSYGSGGRQSGSRGGSGGG-GSI-SGGG-YGSGGGSGGR--YGSG---GGSK
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KB6 GGS-GGGGGGSSGGR-GSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
::: .::: ::.::. .::::: ::: .: : .::: :::::::
NP_000 GGSISGGGYGSGGGKHSSGGGSRGGSSSGGGYGSGG----GGSSSVKGSSGEAFGSSVTF
590 600 610 620 630
NP_000 SFR
>>NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskeletal (638 aa)
initn: 2274 init1: 1991 opt: 2258 Z-score: 966.9 bits: 189.1 E(85289): 4.1e-47
Smith-Waterman score: 2327; 61.3% identity (80.1% similar) in 653 aa overlap (1-633:1-631)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGAGG
:.:: ..: . ::: : ..... . : : . ::::.:: ..:: .:. :
NP_056 MNRQVCKKSFSGRSQGFS-GRSAVVSGSSRM--SCVARSGGAGG--GACGFRSGA----G
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 GFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGG---GFGG---GGFGGG-G
.:::::: :::..:::::::: :..:..::::: .. ::.:: :::: :::::: :
NP_056 SFGSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGGSYGGGFGGGRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 IGGG--GFGGFGSGGGGFGGGG-FGG-GGYGG--GYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNV
.:.: : :::: :.::::: : ::: :..:: :.:: ::::::: .::::::::::
NP_056 VGSGFGGAGGFG-GAGGFGGPGVFGGPGSFGGPGGFGPGGFPGGIQEVIVNQSLLQPLNV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 EIDPEIQKVKSREREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNL
::::.: .::..::::::.:::.:::::::::::::::.::.:::::::: :.. .:
NP_056 EIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWELLQQQTTGSGPSSL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 EPYFESFINNLRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTI
:: :::.:. : ...:.: .... :..:::.:::.:::...:::::::::: :::::: .
NP_056 EPCFESYISFLCKQLDSLLGERGNLEGELKSMQDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVGL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KKDVDGAYMTKVDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDL
:::::.:.:.::.::::.:.: .:..:: .::. ::::::.. :.:.:.::::::: :::
NP_056 KKDVDAAFMNKVELQAKVDSLTDEVSFLRTLYEMELSQMQSHASDTSVVLSMDNNRCLDL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 DSIIAEVKAQYEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQR
::::::.::::.:::.::.:::.:::.: ::: :::::::..::.: :: ::::.:::
NP_056 GSIIAEVRAQYEEIAQRSKSEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIMELNRMIQR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LRSEIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQE
::.::.::::: .::: .:..:::::: :::::. ::.::. :::.::.:::::::::::
NP_056 LRAEIENVKKQNANLQTAIAEAEQRGEMALKDANAKLQDLQTALQKAKDDLARLLRDYQE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 LMNTKLALDLEIATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISG--GGSRG--GGGG
:::.:::::.:::::: :::::: :::::: : .:: .. :. :: :.::: :: .
NP_056 LMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGECQSAVCISVVSNVTSTSGSSGSSRGVFGGVS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 GYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGGRGSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGG
: :::: . ::...: .:: : .:: :: : :: : :: :: :. ::: :.:: :
NP_056 GSGSGGYKGGSSSSS-SSGYGVSGGSGS-GYGGVSSGSTGGRGSSGSYQSSSS------G
540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KB6 SGGGGGGSSGGRGSGGGSSGGSI---GGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
: ::.:: . :: :::.::: :: : .::: :::.:..: .:: :
NP_056 SRLGGAGSISVSHSGMGSSSGSIQTSGGSGYKSGG----GGSTSIRFSQTTSSSQHSSTK
590 600 610 620 630
>>NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II cytos (628 aa)
initn: 1596 init1: 1596 opt: 2252 Z-score: 964.5 bits: 188.6 E(85289): 5.6e-47
Smith-Waterman score: 2363; 63.0% identity (79.6% similar) in 652 aa overlap (1-619:1-623)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGG--GFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
:::: :. :: :: ::: : ..... . : : . .:::.:: :. : ::
NP_476 MSRQASKTSG---GGSQGFS-GRSAVVSGSSRM--SCVAHSGGAGG-----GAYGFRSGA
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB6 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGG---------YGGG---GFGGG---G
:: :::::: ::::.:::::::: ::.:..::::: :::: :.::: :
NP_476 GG-FGSRSLYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGG
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KB6 FGGG-GFGGGGIGGGGFGGFGS--GGGGFGG-GGFGG-GGYGG--------GYGPVCPPG
:::: :.::: :.::::: :. :.::::: ::::: ::.:: :.:: ::
NP_476 FGGGRGMGGGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPG
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 GIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKSREREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQT
:::::::::::::::::::::.: .::..::::::.:::.:::::::::::::::.::.:
NP_476 GIQEVTINQSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLET
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KB6 KWELLQQVDTST--RTHNLEPYFESFINNLRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRN
::.:::: ::. :.:::: ::. :: :: .:.. ....:::::::::.:.:::...
NP_476 KWNLLQQQGTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKK
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 KYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTKVDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQT
:::::::::: :::::::.:::::.:::.::.::::.: : .::::: .::.:::::::.
NP_476 KYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQS
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 QISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQYEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHG
.::.:.:.::::::::::::::::::.::::::::.::::::.:::.: ::: ::::::
NP_476 HISDTSVVLSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHG
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 DSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLE
:..::.: :: ::::.:::::.::..:::: .::: .:..:::.:: :::::. ::..:.
NP_476 DDLRNTKSEIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQ
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 DALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTS
::::::.::::::::::::::.:::::.:::::: :::::: :::::: ::.:: .:
NP_476 AALQQAKDDLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSS
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 HTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGGRGSYGSGGGSYGSGGGGGGH
:: ..: :: ::::: :: . : ::: ...:::.:.: .: :::::
NP_476 STT---SASAGGYGGGYG-GGMGGGLGGG-FSAGGGSGSG----------FGRGGGGGIG
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 GSYGSGSSSGGYRGGSGGGG-GGSSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKF
:..:.::: :. :::: :. .:. : ..:: ::... :: . : . .::
NP_476 GGFGGGSS--GFSGGSGFGSISGARYGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
580 590 600 610 620
630
pF1KB6 VSTTYSGVTR
>>NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskeletal (578 aa)
initn: 1955 init1: 1955 opt: 2188 Z-score: 938.3 bits: 183.7 E(85289): 1.6e-45
Smith-Waterman score: 2280; 62.7% identity (83.3% similar) in 593 aa overlap (1-584:1-560)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSS-------CGGGG
::.::::.:. ::: : .: ..::. ::::. .: :::::
NP_778 MSHQFSSQSA------FSSMS------RRVYSTSSSAGSGGGSPAVGSVCYARGRCGGGG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GSFGAGG-GFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGG
.: : ::::::: :::::.::::.. : ::: : : :::: :: ::: :
NP_778 --YGIHGRGFGSRSLYNLGGSRSISINLM--GRSTSGFCQGGGVGGFG----GGRGFGVG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GIGGGGFGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYG-GGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDP
. :.::::: :::::.::: ...: ::.:: ::::::::::::::::.::..:.::
NP_778 STGAGGFGG-----GGFGGAGFGTSNFGLGGFGPYCPPGGIQEVTINQSLLEPLHLEVDP
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EIQKVKSREREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYF
:::..:..::::: :::.::::::::::::::::::::::::::::.::: :.:::: .
NP_778 EIQRIKTQEREQIMVLNNKFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVNTSTGTNNLEPLL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 ESFINNLRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDV
:..:..:::.:: :...: : ..:...:::.::::..::::::::::..::.::..::::
NP_778 ENYIGDLRRQVDLLSAEQMRQNAEVRSMQDVVEDYKSKYEDEINKRTGSENDFVVLKKDV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGAYMTKVDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSII
:.::..::::....:.: :..:: :. .::::.::.::.:::::::::::::::::::
NP_778 DAAYVSKVDLESRVDTLTGEVNFLKYLFLTELSQVQTHISDTNVILSMDNNRSLDLDSII
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 AEVKAQYEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSE
:..::: :::.:: :::.:::.::.:::::::::::...:::.::.::::..:::..:
NP_778 DAVRTQYELIAQRSKDEAEALYQTKYQELQITAGRHGDDLKNSKMEIAELNRTVQRLQAE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 IDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNT
:.:::::: ..:. :::::.:::.::.:: .::.:::.::::.::.::::::::: ....
NP_778 ISNVKKQIEQMQSLISDAEERGEQALQDAWQKLQDLEEALQQSKEELARLLRDYQAMLGV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 KLALDLEIATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSS
::.::.:::::: :::::::::::: .::.::..:.....::. ::::.::::: .
NP_778 KLSLDVEIATYRQLLEGEESRMSGELQSHVSISVQNSQVSVNGGA---GGGGSYGSGGYG
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 YGSGGGSYGSGGGGGGGRGSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGS
::::: ::.: . :: :. : .::.:::: :::: ::::... :: ::.:
NP_778 GGSGGG-YGGGRSYRGG-GARGRSGGGYGSGCGGGG-GSYGGSGRSG--RGSSRVQIIQT
520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KB6 SGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
NP_778 STNTSHRRILE
570
>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17 (590 aa)
initn: 1998 init1: 1998 opt: 2157 Z-score: 925.4 bits: 181.3 E(85289): 8.4e-45
Smith-Waterman score: 2312; 62.3% identity (80.8% similar) in 636 aa overlap (1-633:1-583)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGG--FSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
:::: :: : .::::. ::..:: . .: . .: .: .::::: :. . .: . :.
NP_000 MSRQ-SSVS-FRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAG-ACGV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGG-GFGGGGFGGGGFGGGGIGGG
:: .::::: :::::: ::::.. ::. . ::.: ::: :::::. :.::: :: .::
NP_000 GG-YGSRSLYNLGGSKRISISTS-GGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGA--GSGFGFGGGAGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GFGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVK
::: .: ::.::::: ::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:.
NP_000 GFG-LG-GGAGFGGG-FGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SREREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINN
..::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..:::
NP_000 TEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMT
:::..:.. ....::::::.::::.:::..:::::::::::.:::::: .:::::.:::.
NP_000 LRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KVDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQ
::.:.::.: :..::.:. ...::::::::..:.:.:.:::::::.:::::::::::::
NP_000 KVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 YEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKK
::.::..:..:::: ::.:::::: :::::::..::.: ::::.::.:::::.:::::::
NP_000 YEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 QISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDL
: .:::..:.::::::: :::::.::: .::.:::.::.:.:::::.::::::::::::.
NP_000 QCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 EIATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGG
:::::: :::::: :.::: . :..:: :: ..:.:
NP_000 EIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTS--SVSSG----------------------
470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSGGRGS
::::.: ::: : :. ::. :.: .::. ::: :.:: :: : ::: : : ::
NP_000 -YGSGSGYGGGLG--GGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSS-----GGVGLGGGLSVG--GS
510 520 530 540 550
600 610 620 630
pF1KB6 GGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
: ..:.: : : .::: :.:::::::::: :
NP_000 GFSASSGRGLGVGFGSGG----GSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
560 570 580 590
>>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 1946 init1: 1946 opt: 2092 Z-score: 898.6 bits: 176.3 E(85289): 2.6e-43
Smith-Waterman score: 2200; 64.0% identity (82.4% similar) in 581 aa overlap (2-577:3-557)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
: . . :: : :::..:: . . .: :: :. :: :.:: ..:::.:
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
:::::: .::::: ::: ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
NP_005 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
::: :::. .::::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
NP_005 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
.::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..::::
NP_005 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
::..:.. ....::::::.::::.::: .::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
NP_005 RRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
:.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
NP_005 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
:.:::.:.::::: ::.::::::::::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
NP_005 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
.::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
NP_005 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYG-SGGSSYGSGGG
::::: :::::: :..:: . .:..:: : :. :: :. .: :.: : .:::::
NP_005 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQS-TVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSY-----
470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SYGSGGGGGGGRGSYGSG---GGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSGG
::::: : ::: .: .:: ::. .: :::.. .: . :::
NP_005 SYGSGLGVGGGFSS-SSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KB6 RGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
>>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 1945 init1: 1945 opt: 2091 Z-score: 898.2 bits: 176.2 E(85289): 2.7e-43
Smith-Waterman score: 2199; 63.7% identity (82.6% similar) in 581 aa overlap (2-577:3-557)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
: . . :: : :::..:: . . .: :: :. :: :.:: ..:::.:
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
:::::: .::::: ::: ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
NP_005 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
::: :::. .::::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
NP_005 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
.::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..::::
NP_005 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
::..:.. ....::::::..:::.:::..::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
NP_005 RRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
:.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
NP_005 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
:.:::.:.::::: ::.::::::.:::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
NP_005 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
.::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
NP_005 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYG-SGGSSYGSGGG
::::: :::::: :..:: . .:..:: : :. :: :. .: :.: : .:::::
NP_005 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQS-TVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSY-----
470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SYGSGGGGGGGRGSYGSG---GGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSGG
::::: : ::: .: .:: ::. .: :::.. .: . :::
NP_005 SYGSGLGVGGGFSS-SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KB6 RGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
>>NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 1939 init1: 1939 opt: 2085 Z-score: 895.7 bits: 175.8 E(85289): 3.8e-43
Smith-Waterman score: 2193; 63.9% identity (82.3% similar) in 581 aa overlap (2-577:3-557)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
: . . :: : :::..:: . . .: :: :. :: :.:: ..:::.:
NP_775 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
:::::: .::::: ::: ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
NP_775 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
::: :::. .::::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
NP_775 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
.::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..::::
NP_775 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
::..:.. ....::::::.::::.::: .::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
NP_775 RRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
:.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
NP_775 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
:.:::.:.::::: ::.::::::.:::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
NP_775 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
..:: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
NP_775 CASLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYG-SGGSSYGSGGG
::::: :::::: :..:: . .:.::: : : :: :. .: :.: : .:::::
NP_775 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNVSVVQS-TISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSY-----
470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SYGSGGGGGGGRGSYGSG---GGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSGG
::::: : ::: .: .:: ::. .: :::.. .: . :::
NP_775 SYGSGLGIGGGFSS-SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KB6 RGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
>>NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II cytos (520 aa)
initn: 1940 init1: 1771 opt: 1913 Z-score: 824.7 bits: 162.5 E(85289): 3.4e-39
Smith-Waterman score: 2003; 60.9% identity (81.2% similar) in 558 aa overlap (1-558:2-507)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGAG
..:: :.: : ::: ::: :.. .: . ::. :::.: : ::
NP_002 MIARQQCVRGGPR---GFSCGSA-IVGGGKRGAFSSVSMSGGAG-RCSS-----------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGGF
:::::::: :: :.::::.::: :. .:. :: :.:::: :::::: :::. :
NP_002 GGFGSRSLYNLRGNKSISMSVA-GSRQGACFG---GAGGFGTGGFGGG-FGGS------F
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKSR
. :.:: :: :::: ::::::::::::: ::.::::::::::...
NP_002 S--GKGGPGF---------------PVCPAGGIQEVTINQSLLTPLHVEIDPEIQKVRTE
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNLR
:::::: :::.::::::::.::::::.::.:::.:::: :.: ..:::: ::.... ::
NP_002 EREQIKLLNNKFASFIDKVQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTTTSSKNLEPLFETYLSVLR
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTKV
...: : .:..::.::::.::: :::...:::.:::::: :::.::..:::::.::..::
NP_002 KQLDTLGNDKGRLQSELKTMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAENDFVVLKKDVDAAYLNKV
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQYE
.:.::.:.:..::.:: .::.::::::::..:.:.:.:::::::.::::::::::.::::
NP_002 ELEAKVDSLNDEINFLKVLYDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVRAQYE
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 DIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQI
.:::.::::::.:::.: ..:::.. .:::...:.: ::.::::.:::::.::.:.:::
NP_002 EIAQRSKAEAEALYQTKVQQLQISVDQHGDNLKNTKSEIAELNRMIQRLRAEIENIKKQC
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 SNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEI
..:: :..:::::::::::::..: .:: :::::::.:::.::.:::::..:::::.::
NP_002 QTLQVSVADAEQRGENALKDAHSKRVELEAALQQAKEELARMLREYQELMSVKLALDIEI
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 ATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGGSY
:::: :::::: :::::: ::.:: .::. : :: .:: ::: :..: ..: .
NP_002 ATYRKLLEGEEYRMSGECQSAVSISV------VSGSTSTGGISGGLGSG-SGFGLSSG-F
440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 GSGGGGGGGRGSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSGGRGSGG
:::.:.: : :. ::..:
NP_002 GSGSGSGFGFGGSVSGSSSSKIISTTTLNKRR
490 500 510 520
637 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 20:35:05 2016 done: Sun Nov 6 20:35:07 2016
Total Scan time: 12.720 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]