Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6149
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6149, 596 aa
1>>>pF1KB6149 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6625+/-0.00136; mu= 1.7763+/- 0.078
mean_var=243.1124+/-60.677, 0's: 0 Z-trim(107.7): 159 B-trim: 716 in 2/50
Lambda= 0.082257
statistics sampled from 9548 (9729) to 9548 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8975.1 IRAK3 gene_id:11213|Hs108|chr12 ( 596) 4055 495.4 8.3e-140
CCDS44937.1 IRAK3 gene_id:11213|Hs108|chr12 ( 535) 3335 410.0 4e-114
CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 682) 586 83.8 7.7e-16
CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 712) 586 83.8 7.9e-16
CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 633) 574 82.4 2e-15
CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3 ( 625) 451 67.8 4.8e-11
>>CCDS8975.1 IRAK3 gene_id:11213|Hs108|chr12 (596 aa)
initn: 4055 init1: 4055 opt: 4055 Z-score: 2623.5 bits: 495.4 E(32554): 8.3e-140
Smith-Waterman score: 4055; 99.8% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHIEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YVDQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNYGAVLSPSEKSYQEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YVDQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNYGAVLSPSEKSYQEGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FPNILFKETANVTVDNVLIPEHNEKGVLLKSSISFQNIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVY
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FPNILFKETANVTVDNVLIPEHNEKGILLKSSISFQNIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RVEIQNLTYAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RVEIQNLTYAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YPYMRNGTLFDRLQCVGDTAPLPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YPYMRNGTLFDRLQCVGDTAPLPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LDDQFQPKLTDFAMAHFRSHLEHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LDDQFQPKLTDFAMAHFRSHLEHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GIVIMEVLTGCRVVLDDPKHIQLRDLLRELMEKRGLDSCLSFLDKKVPPCPRNFSAKLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GIVIMEVLTGCRVVLDDPKHIQLRDLLRELMEKRGLDSCLSFLDKKVPPCPRNFSAKLFC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAEDPPTSLKSFRCPSPLFLENVPSIPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAEDPPTSLKSFRCPSPLFLENVPSIPVE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DDESQNNNLLPSDEGLRIDRMTQKTPFECSQSEVMFLSLDKKPESKRNEEACNMPSSSCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DDESQNNNLLPSDEGLRIDRMTQKTPFECSQSEVMFLSLDKKPESKRNEEACNMPSSSCE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB6 ESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSEAPGHSCRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSEAPGHSCRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
550 560 570 580 590
>>CCDS44937.1 IRAK3 gene_id:11213|Hs108|chr12 (535 aa)
initn: 3335 init1: 3335 opt: 3335 Z-score: 2162.3 bits: 410.0 E(32554): 4e-114
Smith-Waterman score: 3514; 89.6% identity (89.8% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGL----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YVDQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNYGAVLSPSEKSYQEGG
:::::::::::::::
CCDS44 ---------------------------------------------GAVLSPSEKSYQEGG
50
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FPNILFKETANVTVDNVLIPEHNEKGVLLKSSISFQNIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVY
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FPNILFKETANVTVDNVLIPEHNEKGILLKSSISFQNIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVY
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RVEIQNLTYAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RVEIQNLTYAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLI
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YPYMRNGTLFDRLQCVGDTAPLPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YPYMRNGTLFDRLQCVGDTAPLPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANIL
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LDDQFQPKLTDFAMAHFRSHLEHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDDQFQPKLTDFAMAHFRSHLEHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSF
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GIVIMEVLTGCRVVLDDPKHIQLRDLLRELMEKRGLDSCLSFLDKKVPPCPRNFSAKLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GIVIMEVLTGCRVVLDDPKHIQLRDLLRELMEKRGLDSCLSFLDKKVPPCPRNFSAKLFC
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAEDPPTSLKSFRCPSPLFLENVPSIPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAEDPPTSLKSFRCPSPLFLENVPSIPVE
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DDESQNNNLLPSDEGLRIDRMTQKTPFECSQSEVMFLSLDKKPESKRNEEACNMPSSSCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DDESQNNNLLPSDEGLRIDRMTQKTPFECSQSEVMFLSLDKKPESKRNEEACNMPSSSCE
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590
pF1KB6 ESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSEAPGHSCRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSEAPGHSCRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (682 aa)
initn: 646 init1: 321 opt: 586 Z-score: 397.9 bits: 83.8 E(32554): 7.7e-16
Smith-Waterman score: 668; 28.8% identity (53.8% similar) in 626 aa overlap (16-549:18-632)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHI
.:...:: .. .. :.:. . : : .: . . ..:
CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPA-DWCQFAALIVRDQTELRLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB6 EKYVDQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNY-------------
:. .:. : .:: : ..: ..::...: .. :: .:: .
CCDS35 ER---SGQR-TASVLWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHPPAPLPSPGTTA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB6 ---GAVLSPSE-------------KSYQEGGFPNILFK---ETANVTVDNVLIPEHN---
... .:.: ... .::. . : . : : :
CCDS35 PRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVPSPASLWPPPPSPA
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180
pF1KB6 --------EKGV-LLKSSISFQ------NIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVYRVEIQNLT
:..: ::... : .: .::.:: ... :::: . :::. ..: .
CCDS35 PSSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGGFGCVYRAVMRNTV
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLIYPYMRNGT
:::: .:.. .. . ::.:.: : :.::::...:.: ... .::.: .. ::.
CCDS35 YAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNGFYCLVYGFLPNGS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LFDRLQCVGDTAP-LPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANILLDDQFQP
: :::.: .. : : : :. ::.: ..::..::. .: :.: :.:.:.:.:::... :
CCDS35 LEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSP-SLIHGDIKSSNVLLDERLTP
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KLTDFAMAHFRSHL---EHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSFGIVI
:: ::..:.: :: . :.. : :.:::::. :.:.. ::..:::.:.
CCDS35 KLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLAVDTDTFSFGVVV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KB6 MEVLTGCRVVLDDPKHIQ-LRDLLRELMEKRG--LDSCLS--------------------
.:.:.: :.: . . :.::..: :. : : : :
CCDS35 LETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAADAWAAPIAMQIY
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KB6 --FLDKKVPPCPRNFSAKLFCLAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAEDPPTS
:: . ::: ... : :: : ::: :: : . :. :. . . . :
CCDS35 KKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMTQE-NSYVSSTGRAHSGAAPWQP
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500
pF1KB6 LKSFRCPSPLFLENV---PSIPVEDDESQNNNLLPSDEGLRIDRMTQKTPFE--------
: . : :.. :. :::.::: : . .:: ..: . :..
CCDS35 LAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDES----LGGLSAALRSWHLTPSCPLDPAPLREAG
540 550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 CSQSEVM-FLSLDKKPESKRNE-EACNMPSSSCEESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSE
: :... : . : :. . :. . ::. : :. :.
CCDS35 CPQGDTAGESSWGSGPGSRPTAVEGLALGSSASSSSEPPQIIINPARQKMVQKLALYEDG
590 600 610 620 630 640
570 580 590
pF1KB6 APGHSCRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
CCDS35 ALDSLQLLSSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
650 660 670 680
>>CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (712 aa)
initn: 669 init1: 321 opt: 586 Z-score: 397.6 bits: 83.8 E(32554): 7.9e-16
Smith-Waterman score: 673; 28.2% identity (54.1% similar) in 614 aa overlap (16-546:18-622)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHI
.:...:: .. .. :.:. . : : .: . . ..:
CCDS14 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPA-DWCQFAALIVRDQTELRLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB6 EKYVDQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNY-------------
:. .:. : .:: : ..: ..::...: .. :: .:: .
CCDS14 ER---SGQR-TASVLWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHPPAPLPSPGTTA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB6 ---GAVLSPSE-------------KSYQEGGFPNILFK---ETANVTVDNVLIPEHN---
... .:.: ... .::. . : . : : :
CCDS14 PRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVPSPASLWPPPPSPA
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180
pF1KB6 --------EKGV-LLKSSISFQ------NIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVYRVEIQNLT
:..: ::... : .: .::.:: ... :::: . :::. ..: .
CCDS14 PSSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGGFGCVYRAVMRNTV
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLIYPYMRNGT
:::: .:.. .. . ::.:.: : :.::::...:.: ... .::.: .. ::.
CCDS14 YAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNGFYCLVYGFLPNGS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LFDRLQCVGDTAP-LPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANILLDDQFQP
: :::.: .. : : : :. ::.: ..::..::. .: :.: :.:.:.:.:::... :
CCDS14 LEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSP-SLIHGDIKSSNVLLDERLTP
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KLTDFAMAHFRSHL---EHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSFGIVI
:: ::..:.: :: . :.. : :.:::::. :.:.. ::..:::.:.
CCDS14 KLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLAVDTDTFSFGVVV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KB6 MEVLTGCRVVLDDPKHIQ-LRDLLRELMEKRGL-----DSCLS-----------------
.:.:.: :.: . . :.::..: :. :. .: :.
CCDS14 LETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAADAWAAPIAMQIY
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KB6 --FLDKKVPPCPRNFSAKLFCLAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAEDPPTS
:: . ::: ... : :: : ::: :: : .: . ::. :: . :
CCDS14 KKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMTQVYERLEKLQAVV---AGVPGH
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 LKSFRC--PSPLFLENVPSIPVEDDESQNNNLL--PSDEGLRIDRMTQKTPFECSQSEVM
.. : ::: : : . . . : :: . . .. :. : . .:.
CCDS14 SEAASCIPPSPQENSYVSSTGRAHSGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDES
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 FLSLDKKPESKRNEEACNMPSSSCEESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSEAPGHSCRSR
. .:. .: . .: . . .:. :.
CCDS14 LGGLSAALRSWHLTPSCPLDPAPLREAGCPQGDTAGESSWGSGPGSRPTAVEGLALGSSA
600 610 620 630 640 650
580 590
pF1KB6 PVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
CCDS14 SSSSEPPQIIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLLSSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQ
660 670 680 690 700 710
>>CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (633 aa)
initn: 573 init1: 321 opt: 574 Z-score: 390.6 bits: 82.4 E(32554): 2e-15
Smith-Waterman score: 602; 28.0% identity (53.7% similar) in 603 aa overlap (16-549:18-583)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHI
.:...:: .. .. :.:. . : : .: . . ..:
CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPA-DWCQFAALIVRDQTELRLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB6 EKYVDQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNY-------------
:. .:. : .:: : ..: ..::...: .. :: .:: .
CCDS35 ER---SGQR-TASVLWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHPPAPLPSPGTTA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB6 ---GAVLSPSE-------------KSYQEGGFPNILFK---ETANVTVDNVLIPEHN---
... .:.: ... .::. . : . : : :
CCDS35 PRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVPSPASLWPPPPSPA
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180
pF1KB6 --------EKGV-LLKSSISFQ------NIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVYRVEIQNLT
:..: ::... : .: .::.:: ... :::: . :::. ..: .
CCDS35 PSSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGGFGCVYRAVMRNTV
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YAVKLFKQEKKMQCKKHWKRFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLIYPYMRNGT
:::: .:.. .. . ::.:.: : :.::::...:.: ... .::.: .. ::.
CCDS35 YAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNGFYCLVYGFLPNGS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LFDRLQCVGDTAP-LPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANILLDDQFQP
: :::.: .. : : : :. ::.: ..::..::. .: :.: :.:.:.:.:::... :
CCDS35 LEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSP-SLIHGDIKSSNVLLDERLTP
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KLTDFAMAHFRSHL---EHQSCTINMTSSSSKHLWYMPEEYIRQGKLSIKTDVYSFGIVI
:: ::..:.: :: . :.. : :.:::::. :.:.. ::..:::.:.
CCDS35 KLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLAVDTDTFSFGVVV
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