FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6147, 596 aa
  1>>>pF1KB6147 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3439+/-0.00103; mu= -2.6724+/- 0.061
 mean_var=331.2856+/-71.879, 0's: 0 Z-trim(113.1): 49  B-trim: 297 in 3/52
 Lambda= 0.070465
 statistics sampled from 13700 (13739) to 13700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.422), width:  16
 Scan time:  3.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8          ( 596) 3894 409.9 4.6e-114
CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10         ( 669)  673 82.5 1.9e-15


>>CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8               (596 aa)
 initn: 3894 init1: 3894 opt: 3894  Z-score: 2161.3  bits: 409.9 E(32554): 4.6e-114
Smith-Waterman score: 3894; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590      
pF1KB6 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI
              550       560       570       580       590      

>>CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10              (669 aa)
 initn: 1122 init1: 541 opt: 673  Z-score: 391.0  bits: 82.5 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 1080; 39.3% identity (62.1% similar) in 657 aa overlap (3-596:28-669)

                                        10        20        30     
pF1KB6                          MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHL-KKL
                                  ::::::::     . : ..    :. .     .
CCDS75 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISG-----RPCPGGPAPPRHHGPPGPTF
               10        20        30             40        50     

           40         50         60        70        80        90  
pF1KB6 NRYSDGLLRFGF-SQDS-GHGKSSSKMGKSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGG
        : .::::: :. .:.    .    :     .: ::. . ....   :.  . .. .  .
CCDS75 FRQQDGLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRA
          60        70        80        90       100       110     

            100       110       120       130                      
pF1KB6 QAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKGAVRPTAFKPVLPR------------------S
       . .    :  ::::.: :..:: . ::  .::::::::::.                  :
CCDS75 HNAHLRGP--PPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLS
         120         130       140       150       160       170   

               140       150        160        170       180       
pF1KB6 GAI-----LHSSPESASHQLHPAPP-DKPKEQELKPGLC-SGALSDSGRNSMSSLPTHST
       :.      : ..: :.: .   .   :::       . : ::.::::::::.:::::.::
CCDS75 GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYST
           180       190       200       210       220       230   

       190       200               210       220       230         
pF1KB6 SSSYQLDPLVTPVG---PTSRFG-----GSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGG---
       ...   .: ..  :   :.   :     : :...  :   .::.  : .  . : ::   
CCDS75 GGA---EPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVA
              240       250       260       270       280       290

         240        250             260        270       280       
pF1KB6 -SKLGHSNKADK-GPSC-VRSPIS-----TDECSIQE-LEQKLLEREGALQKLQRSFEEK
        . :: ...:.  . ::  :::       .::  ..  :: :: .::. ::.:. :..:.
CCDS75 GGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDEN
              300       310       320       330       340       350

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB6 ELASSLAYEERPRRCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQ
       : .   ::::: :. . : :. .    .   :: :..:::::.:.:::.:::::::::..
CCDS75 EATMCQAYEERQRHWQREREALRE---DCAAQA-QRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQD
              360       370          380        390       400      

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB6 ELESLMKEQDLLETKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNA
       .. .:..:.. :: .  . :::.  .:: ::::.:::::::::::::::::::::.:.  
CCDS75 DFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQ
        410       420       430       440       450       460      

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB6 KASEILGLKAQLKDTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREK
       :.::...:.. :...:. :.  : :.. :. : :.. ::::.: .::::...::: ::::
CCDS75 KGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREK
        470       480       490       500       510       520      

       470       480       490        500                  510     
pF1KB6 VNLLEQELQELRAQAALARDMGPPTFPE-DVPALQR-----------ELERLRAEL-REE
       .. :. :   ::   .      :  . : :   .::           ..::::.:: ::.
CCDS75 AGQLDAEAAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRER
        530       540       550       560       570       580      

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB6 RQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVIQYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAG
       :.:..: .: :. :::.:. :::.::.::::::..:. ::.::..::. ::::.    : 
CCDS75 RRGEEQRDS-FEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEAR
        590        600       610       620       630       640     

          580         590      
pF1KB6 EPLEVDL-EGAD-IPYEDIIATEI
       :  .. : : :  :  :.: ::::
CCDS75 ELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
         650       660         




596 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 16:12:40 2016 done: Sun Nov  6 16:12:40 2016
 Total Scan time:  3.190 Total Display time: -0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]