Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6122
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6122, 584 aa
1>>>pF1KB6122 584 - 584 aa - 584 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7915+/-0.00173; mu= -3.8320+/- 0.105
mean_var=463.4052+/-94.069, 0's: 0 Z-trim(109.6): 161 B-trim: 92 in 1/53
Lambda= 0.059579
statistics sampled from 10844 (10986) to 10844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 3.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 3876 348.4 1.5e-95
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 2029 189.6 9.7e-48
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1743 165.0 2.2e-40
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1644 156.4 7.4e-38
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1644 156.4 7.5e-38
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1621 154.4 2.9e-37
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1621 154.4 3e-37
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1589 151.7 1.9e-36
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1588 151.5 1.9e-36
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1544 147.8 2.8e-35
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1535 147.0 4.7e-35
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1521 145.8 1.1e-34
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1488 143.0 7.9e-34
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1416 136.7 5.3e-32
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1387 134.3 3.3e-31
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1202 118.4 2e-26
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1186 117.0 5.2e-26
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 1123 111.8 2.8e-24
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1115 110.9 3.5e-24
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1089 108.6 1.5e-23
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1089 108.6 1.6e-23
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1075 107.4 3.6e-23
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1071 107.1 4.7e-23
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1065 106.6 6.7e-23
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1067 107.0 7.7e-23
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1038 104.3 3.4e-22
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 1039 104.5 4e-22
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 980 99.5 1.4e-20
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 965 98.0 2.6e-20
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 960 97.6 3.6e-20
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 957 97.3 4.2e-20
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 949 96.6 7e-20
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 941 96.0 1.2e-19
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 917 94.0 5.6e-19
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 871 90.1 8.5e-18
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 771 81.5 3.2e-15
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 770 81.4 3.4e-15
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 769 81.3 3.6e-15
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 754 80.0 8.5e-15
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 745 79.2 1.5e-14
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 695 74.6 1.9e-13
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 676 73.3 9.7e-13
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 667 72.8 2.2e-12
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 658 71.7 2.5e-12
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 659 71.8 2.5e-12
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 658 71.7 2.6e-12
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 641 70.3 7.3e-12
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 639 70.0 7.5e-12
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 635 69.7 9.5e-12
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 617 68.1 2.8e-11
>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 (584 aa)
initn: 3876 init1: 3876 opt: 3876 Z-score: 1828.9 bits: 348.4 E(32554): 1.5e-95
Smith-Waterman score: 3876; 99.7% identity (99.8% similar) in 584 aa overlap (1-584:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
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CCDS11 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS11 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 GSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
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550 560 570 580
pF1KB6 GYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY
550 560 570 580
>>CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 (623 aa)
initn: 3222 init1: 1268 opt: 2029 Z-score: 970.5 bits: 189.6 E(32554): 9.7e-48
Smith-Waterman score: 2075; 57.1% identity (79.5% similar) in 624 aa overlap (1-584:1-613)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSL--RISSSKGSLGGG-FSSG-GFSGGS
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CCDS32 MSCRQFSSSYLSRS---GGGGGGGLGSGGSIRSSYSRFSSSGGGGGGGRFSSSSGYGGGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FSR--GSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS--FGGSYGGSFGG-GSFGGGS
:: : .::: :: : :: .: :::...:. :..:..: :::. ::.... :.::::
CCDS32 -SRVCGRGGGGSFGYSYGGGSG-GGFSASSLGGGFGGGSRGFGGASGGGYSSSGGFGGG-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 FGGGSFGGGGFGGG---GFGG--GFGGGFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVR
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CCDS32 FGGGS--GGGFGGGYGSGFGGFGGFGGGAGGGDGGILTANEKSTMQELNSRLASYLDKVQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 ALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQID
::::.: .::.::..::.:.: . . ..:: ::.::::::.::..::. : . ::.::
CCDS32 ALEEANNDLENKIQDWYDKKGPA--AIQKNYSPYYNTIDDLKDQIVDLTVGNNKTLLDID
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 NARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKK
:.:.. ::::.:.: : :::.:.:::::::.:::.::. :.::::: :.: ::: :::
CCDS32 NTRMTLDDFRIKFEMEQNLRQGVDADINGLRQVLDNLTMEKSDLEMQYETLQEELMALKK
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 NHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSK
::.:::..: . ..::::::.:.::: :::. ::.::..:::: .:::: : .. .
CCDS32 NHKEEMSQLTGQNSGDVNVEINVAPGKDLTKTLNDMRQEYEQLIAKNRKDIENQYETQIT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 ELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLS
.. :.... ....: .:.:.::..:: :::::::::. : .:: :: .:..::: ::.
CCDS32 QIEHEVSSSGQEVQSSAKEVTQLRHGVQELEIELQSQLSKKAALEKSLEDTKNRYCGQLQ
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pF1KB6 QIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEG-----EGSSG
.:: ::: :: :. ..: : :::: ::. ::.::.:::.::.::..:::: :.:..
CCDS32 MIQEQISNLEAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEKEIETYHNLLEGGQEDFESSGA
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470 480 490 500
pF1KB6 G----GGRGG--GSFG-GGYGG--GSSGGGSSGGGYGGGHG--GSSGGGYGGGSSGGGSS
: ::::: ::.: :. :: :: :::.:::::::: : :.:::.:::::..::.:
CCDS32 GKIGLGGRGGSGGSYGRGSRGGSGGSYGGGGSGGGYGGGSGSRGGSGGSYGGGSGSGGGS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 GGGYGGGS-------SSGGHGGSSSGGYGGGS-SGGG-GGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGG
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CCDS32 GGGYGGGSGGGHSGGSGGGHSGGSGGNYGGGSGSGGGSGGGYGGGS-GSRGGSGGSHGGG
540 550 560 570 580
570 580
pF1KB6 SSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY
:. ::....: :. :.:..: :
CCDS32 SGFGGESGGSYGGGEEASGSGGGYGGGSGKSSHS
590 600 610 620
>>CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 (525 aa)
initn: 1234 init1: 1234 opt: 1743 Z-score: 838.5 bits: 165.0 E(32554): 2.2e-40
Smith-Waterman score: 1743; 60.2% identity (81.9% similar) in 502 aa overlap (6-494:2-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
: :.. ::::.::.... .::.. :: .:. .:::. :. :: ::. : .
CCDS11 MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSS----GSRCGLGGS-SAQGFRGGASSCS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SSGG--GCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS-FGGSYGGSFGGGS-FGGGS-FGGG
::: : :::: :: : . ::: : :. ::.. ::: :.:::: : :: :: : :.
CCDS11 LSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGG-FGGASGSGTGFGG--GSSFGGVSGFGRGSGFCGS
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 S-FGGGGFGG-GGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYE
: :..:. :: ..:::.::: : ::::.::.:: ::::::::::.::::::::::.: .
CCDS11 SRFSSGATGGFYSYGGGMGGGVG-DGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LEGKIKEWYEKHG--NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAA
::.::::::.:.: .. : :::::::. :.::.:::. :..::.:.:.::::::::
CCDS11 LENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEM
::::::::::. :::::::::::::.:::.::.:..::::::::.:::::::.:::::::
CCDS11 DDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKNHEEEM
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEI
:.... : :.:.::::::::.:::.:::.::.:::.::::::..:: ::..: : ..:
CCDS11 KNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 DNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQI
... .: :.:::::.:..::::::::::::.:.:::..::.::. : .:::.::.::
CCDS11 STDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSEIQTQI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB6 SALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGG----GGRGGG
:::::.. :: .::.:::.::.:::::: ::: ::.::: ::.:::.... :::..:
CCDS11 SALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFGGRNSG
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 SFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSS
: . : :: . ::. : :. .:
CCDS11 SVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSISEVKVK
470 480 490 500 510 520
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 1233 init1: 1233 opt: 1644 Z-score: 793.1 bits: 156.4 E(32554): 7.4e-38
Smith-Waterman score: 1651; 65.0% identity (83.6% similar) in 426 aa overlap (37-456:12-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G
:: ::: : : ::..::: :: :: :
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR-GSYGSSSFGGSYGGSFGGGS--FGGGSFGGGSFGGG
:.: . :. ::: :.. .: : .: :. ..::.:::.:...: ::.: :::: .:::
CCDS11 GSCRAPST--YGG--GLSVSSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSG-FGGG-YGGG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
:.:.::::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..
CCDS11 L--GAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRD
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
::... . .: .::: :.:::.::.:.::. :.::::.::::::::::::::: :::.
CCDS11 WYQRQ---RPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYET
150 160 170 180 190 200
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pF1KB6 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
:. ::.::::::::::::::::::..:::::::::: ::::::::::::::. ::. :
CCDS11 ELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGG
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pF1KB6 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
::::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: :: :..::. :. .: : ..:
CCDS11 DVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQS
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pF1KB6 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
::::.::::..: :::::::::..: ::: :: ::.::::.::.::: .:...:::: :
CCDS11 GKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQ
330 340 350 360 370 380
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pF1KB6 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
.: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: :::::
CCDS11 LRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSR
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CCDS11 QIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
450 460 470
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:: ::: : : ::..::: :: :: :
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10 20 30
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:.: . :. :: ::.. .: .: :. ..::.:::.:...: :..:::: :: : :
CCDS11 GSCRAPST--YG--GGLSVSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAG
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pF1KB6 -GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWY
:::.:.::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..::
CCDS11 FGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWY
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... : : .::: :.:::.::.:.:. : .::. .:::::::::::::: :::.:.
CCDS11 QRQRPS---EIKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHEL
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::::.::::.::::::::::::...:::::::.: ::::::.::::::: ::. . :::
CCDS11 ALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDV
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pF1KB6 NVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYK
::::.:::::::...::.::.::::.::.::.:::.:: :..::. :. .: : ..: .
CCDS11 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSR
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::.::::: .:.:::::::::..: ::: :: ::.::::.::::::. :...:::: :.:
CCDS11 SEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR
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pF1KB6 AETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGG-SFGGGYGGGSSGGG
: : :. ::: :::.: :::.:: ::: ::::: . .. ...: :... ::...
CCDS11 CEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSS
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::
CCDS11 SSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
460 470
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::. :.::: .::.: ::: :::.: .:
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGS-TRGGSLLAGGGGFGGGSLSG
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:: .....: : . ::. ::.:::.. .::::. :: ::::::: ::::::
CCDS11 GGGSRSISASSAR--FVSSGSGGGYGGGMRVCGFGGGA---GSVFGGGFGGG-VGGGFGG
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:::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::.: .:: ::..::.:. .
CCDS11 GFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTS---
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:. :::.:.:::..:...:. : ::. ..:.::::::::::::::::::.::::.::::
CCDS11 PECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEAD
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:::::::::::::...:::::::.:.:::::::::::::::.. . .:.:::::.::::
CCDS11 INGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPG
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pF1KB6 VDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRN
::::..: .:: ::: .::.::.:.:::: :..::. :. .: :.:.. :.:::.:::.
CCDS11 VDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRT
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pF1KB6 VQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTE
.: :::::::::..: .:: :::::: :: .::.:::. :..:: ::...: : : :: :
CCDS11 MQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQE
330 340 350 360 370 380
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pF1KB6 YQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGH
:..::::: :::.:: ::::::::. .. .: . .:: ::.::
CCDS11 YKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGG-GGSSSNFHINVEESVDGQ
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CCDS11 VVSSHKREI
450
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.:: . . ..... ..:..:..:. :
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFG
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.: :: :...: .:. .:::::: :: ....:..:: ..::::::: :
CCDS11 ASCGGGFSAASM-FGSSSGFGGGS--GSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGL--------GM
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pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
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CCDS11 GFGGSPGGGSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIRE
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::: .:. . .. :::::: :.::.:.:.. . ::..:::::::::::.:::.:::
CCDS11 WYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYE
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CCDS11 NELALRQGVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGP
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pF1KB6 GDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQIS
:.:.:::.::::::::.:::.::.::: .:::::::::::: ::: :: ::..: ::..
CCDS11 GEVSVEMDAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQ
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pF1KB6 SYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQ
: :::.:.::: : ::::::::::.:.::: ::::.:: ::.::::.: :: :: ::
CCDS11 SSKSEVTDLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLL
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 QIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSG
:.::..: ::...:.::..: ::: ::.::: ::.::... :
CCDS11 QVRADAERQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTD
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pF1KB6 GGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGG
CCDS11 SSKDPTKTRKIKTVVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM
460 470 480 490
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CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGG-GRGVS
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. . : :::.::::: : :::::. .:.:::.:::..::: .:::
CCDS11 TCSTRFVSGGSAGGYGG-GVSCGFGGGA------GSGFGGGYGGGLGGG------YGGGL
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pF1KB6 FGGGGFGGGGFGGGFGGGFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELE
::::::: :.::: ::. :::::.::::.:::::::::::::.:::::::.: .::
CCDS11 --GGGFGGG-FAGGFVD-FGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLE
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pF1KB6 GKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFR
::..:. :. : . :::: :::::..:...::. : .: ..:.::::::::::::
CCDS11 VKIRDWHLKQ--SPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFR
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pF1KB6 LKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLR
::::::.::::::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::.:::::::::..
CCDS11 LKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFS
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pF1KB6 NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNI
: .:.:::::.:.::.:::..: .:: ::: .::.::.::: ::. :: ::. :...:
CCDS11 NQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNT
260 270 280 290 300 310
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pF1KB6 EQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALE
.:.. :.:::::::..:.:::::::::..: .:: ..:::: :: .::.:::. ::..:
CCDS11 AMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIE
320 330 340 350 360 370
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pF1KB6 EQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGG
::...:.: :::: ::..::::: :::.:: ::::::::. .. :
CCDS11 AQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRST
380 390 400 410 420 430
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pF1KB6 GSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSS
CCDS11 SVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
440 450
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pF1KB6 VRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG-S
:::..::..: ::::..:. . :. .:: :
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGG-GRGVS
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. . : :::.::::: : :::::. .:.:::.:::..::: .:::
CCDS11 TCSTRFVSGGSAGGYGG-GVSCGFGGGA------GSGFGGGYGGGLGGG------YGGGL
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::::::: :.::: ::. :::::.::::.:::::::::::::.:::::::.: .::
CCDS11 --GGGFGGG-FAGGFVD-FGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLE
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pF1KB6 GKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFR
::..:. :. : . :::: :::::..:...::. : .: ..:.::::::::::::
CCDS11 VKIRDWHLKQ--SPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFR
140 150 160 170 180 190
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pF1KB6 LKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLR
::::::.::::::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::.:::::::::..
CCDS11 LKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFS
200 210 220 230 240 250
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pF1KB6 NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNI
: .:.:::::.:.::.:::..: .:: ::: .::.::.::: ::. :: ::. :...:
CCDS11 NQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNT
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pF1KB6 EQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALE
.:.. :.:::::::..:.:::::::::..: .:: ..:::: :: .::.:::. ::..:
CCDS11 AMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIE
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pF1KB6 EQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGG
::...:.: :::: ::..::::: :::.:: ::::::::.
CCDS11 AQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKRQPP
380 390 400 410 420
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>>CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 (464 aa)
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:: :: :. .: :.. ..::.
CCDS11 MSLQFSNGSRHV-CL---RSGAGSVRPLNGGA--
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 GSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGG-DGGLLSGN
: :::. ::: .:: . ..::: :: ::. .::..:.. ::.: .:::::::
CCDS11 GFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGL---GSVPGGSHAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGN
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