Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5989
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5989, 573 aa
1>>>pF1KB5989 573 - 573 aa - 573 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4667+/-0.000787; mu= 11.4972+/- 0.047
mean_var=193.5023+/-39.696, 0's: 0 Z-trim(115.9): 52 B-trim: 229 in 1/52
Lambda= 0.092200
statistics sampled from 16459 (16512) to 16459 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.81), E-opt: 0.2 (0.507), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8858.1 AMHR2 gene_id:269|Hs108|chr12 ( 573) 4073 554.1 1.7e-157
CCDS55829.1 AMHR2 gene_id:269|Hs108|chr12 ( 478) 2999 411.1 1.5e-114
CCDS53798.1 AMHR2 gene_id:269|Hs108|chr12 ( 478) 2660 366.0 5.8e-101
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CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 ( 512) 470 74.8 3e-13
CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 513) 442 71.0 3.9e-12
CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 453) 410 66.7 6.9e-11
CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 505) 410 66.8 7.4e-11
CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 405) 406 66.1 9.2e-11
>>CCDS8858.1 AMHR2 gene_id:269|Hs108|chr12 (573 aa)
initn: 4073 init1: 4073 opt: 4073 Z-score: 2940.9 bits: 554.1 E(32554): 1.7e-157
Smith-Waterman score: 4073; 100.0% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (1-573:1-573)
10 20 30 40 50 60
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CCDS88 CFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LTQPPAWTPTQPQGPAAIMEAGTQRYMAPELLDKTLDLQDWGMALRRADIYSLALLLWEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LSRCPDLRPDSSPPPFQLAYEAELGNTPTSDELWALAVQERRRPYIPSTWRCFATDPDGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RELLEDCWDADPEARLTAECVQQRLAALAHPQESHPFPESCPRGCPPLCPEDCTSIPAPT
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550 560 570
pF1KB5 ILPCRPQRSACHFSVQQGPCSRNPQPACTLSPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ILPCRPQRSACHFSVQQGPCSRNPQPACTLSPV
550 560 570
>>CCDS55829.1 AMHR2 gene_id:269|Hs108|chr12 (478 aa)
initn: 2996 init1: 2996 opt: 2999 Z-score: 2169.8 bits: 411.1 E(32554): 1.5e-114
Smith-Waterman score: 2999; 99.1% identity (99.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLGSLGLWALLPTAVEAPPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRCLYSRC
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CCDS55 MLGSLGLWALLPTAVEAPPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRCLYSRC
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CCDS55 CFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SHLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMALVLLGLFLLLLLLLGSIILALLQRKNYRVRGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PVPEPRPDSGRDWSVELQELPELCFSQVIREGGHAVVWAGQLQGKLVAIKAFPPRSVAQF
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QAERALYELPGLQHDHIVRFITASRGGPGRLLSGPLLVLELHPKGSLCHYLTQYTSDWGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LTQPPAWTPTQPQGPAAIMEAGTQRYMAPELLDKTLDLQDWGMALRRADIYSLALLLWEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::: :
CCDS55 LSRCPDLRPAVHHPSNWPMRQNWAIPLPLMSYGPWQCRRGGVPTSHPPGAALPQTLMG
430 440 450 460 470
>>CCDS53798.1 AMHR2 gene_id:269|Hs108|chr12 (478 aa)
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Smith-Waterman score: 3210; 83.4% identity (83.4% similar) in 573 aa overlap (1-573:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLGSLGLWALLPTAVEAPPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRCLYSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 CFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SHLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMALVLLGLFLLLLLLLGSIILALLQRKNYRVRGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PVPEPRPDSGRDWSVELQELPELCFSQVIREGGHAVVWAGQLQGKLVAIKAFPPRSVAQF
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pF1KB5 QAERALYELPGLQHDHIVRFITASRGGPGRLLSGPLLVLELHPKGSLCHYLTQYTSDWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QAERALYELPGLQHDHIVRFITASRGGPGRLLSGPLLVLELHPKGSLCHYLTQYTSDWGS
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pF1KB5 SLRMALSLAQGLAFLHEERWQNGQYKPGIAHRDLSSQNVLIREDGSCAIGDLGLALVLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLRMALSLAQGLAFLHEERWQNGQYKPGIAHRDLSSQNVLIREDGSCAIGDLGLALVLPG
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pF1KB5 LTQPPAWTPTQPQGPAAIMEAGTQRYMAPELLDKTLDLQDWGMALRRADIYSLALLLWEI
::::::::::::::::::::
CCDS53 LTQPPAWTPTQPQGPAAIME----------------------------------------
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pF1KB5 LSRCPDLRPDSSPPPFQLAYEAELGNTPTSDELWALAVQERRRPYIPSTWRCFATDPDGL
:::::
CCDS53 -------------------------------------------------------DPDGL
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pF1KB5 RELLEDCWDADPEARLTAECVQQRLAALAHPQESHPFPESCPRGCPPLCPEDCTSIPAPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RELLEDCWDADPEARLTAECVQQRLAALAHPQESHPFPESCPRGCPPLCPEDCTSIPAPT
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550 560 570
pF1KB5 ILPCRPQRSACHFSVQQGPCSRNPQPACTLSPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILPCRPQRSACHFSVQQGPCSRNPQPACTLSPV
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>>CCDS33361.1 BMPR2 gene_id:659|Hs108|chr2 (1038 aa)
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Smith-Waterman score: 1019; 35.1% identity (66.3% similar) in 510 aa overlap (8-508:16-504)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGSLGLWALL--PTAVEAPPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELP
:..: ::. . ..: :.: . : . :: . ..
CCDS33 MTSSLQRPWRVPWLPWTILLVSTAAASQNQERLCAF-KDP----YQQDLGIGESRISHEN
10 20 30 40 50
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pF1KB5 RAIRCLYSRCCFGIWNLTQDRAQVEMQGCRD--SDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFT
.: : . :.:.:. .. .. ::: . .: :. .: . ..:
CCDS33 GTILCSKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRF
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pF1KB5 CSCGTDFCNANYS-HLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMALVLLGLFLLLLLLLGSIIL
: :.::.::.:.. ..::: . :: : . :.: .::. .... .:.. :
CCDS33 CCCSTDLCNVNFTENFPPPDT--TPLSPPHSFNRDETIIIALASVSVLAVLIVALCFGYR
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170 180 190 200 210 220
pF1KB5 ALLQRKNYRVRGEPVPEPRPDSGRDWSVELQELPELCFSQVIREGGHAVVWAGQLQGKLV
: .. ... . : .. . :..:..: : ..: .: ...:. :.:. . :
CCDS33 MLTGDRKQGLHSMNMMEA---AASEPSLDLDNLKLL---ELIGRGRYGAVYKGSLDERPV
180 190 200 210 220
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pF1KB5 AIKAFPPRSVAQFQAERALYELPGLQHDHIVRFITASR--GGPGRLLSGPLLVLELHPKG
:.:.: . .: :. .:..: ..::.:.:::.... . ::. :::.: .:.:
CCDS33 AVKVFSFANRQNFINEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEY--LLVMEYYPNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 SLCHYLTQYTSDWGSSLRMALSLAQGLAFLHEERWQNGQYKPGIAHRDLSSQNVLIREDG
:::.::. .:::: :: :.: :...:::.:: : .. .:::.:.::::.:.:::...::
CCDS33 SLCKYLSLHTSDWVSSCRLAHSVTRGLAYLHTELPRGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 SCAIGDLGLALVLPG--LTQPPAWTPTQPQGPAAIMEAGTQRYMAPELLDKTLDLQDWGM
.:.:.:.::.. : : :..: . ::: :.:: ::::::.:. ...:.:
CCDS33 TCVISDFGLSMRLTGNRLVRPGE------EDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNLRDCES
350 360 370 380 390
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pF1KB5 ALRRADIYSLALLLWEILSRCPDLRPDSSPPPFQLAYEAELGNTPTSDELWALAVQERRR
::...:.:.:.:. :::. :: :: : : : .:.:...:.:: :: ... .:. .:..:
CCDS33 ALKQVDMYALGLIYWEIFMRCTDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQR
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PYIPSTWRCFATDPDGLRELLEDCWDADPEARLTAECVQQRLAALAHPQESHPFPESCPR
: .: .:. . .:.: .::::: : ::::::.:...:.: :
CCDS33 PKFPEAWKENSLAVRSLKETIEDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVN
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 GCPPLCPEDCTSIPAPTILPCRPQRSACHFSVQQGPCSRNPQPACTLSPV
CCDS33 PMSTAMQNERNLSHNRRVPKIGPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTI
520 530 540 550 560 570
>>CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 (512 aa)
initn: 613 init1: 151 opt: 470 Z-score: 351.4 bits: 74.8 E(32554): 3e-13
Smith-Waterman score: 774; 31.1% identity (58.7% similar) in 511 aa overlap (7-506:11-479)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGSLGLW-ALLPTAVEAPPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRC
:: .: . .. . : :....: :. : : . :
CCDS26 MTAPWVALALLWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKR----
10 20 30 40 50
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pF1KB5 LYSRCCFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDF
:. :.. : .. .. .:: :. .: . . . . .:. .. : : .:
CCDS26 LH---CYASWRNSSGTIELVKKGCW-LDDFNCYDRQECVATEENPQ----VYFCCCEGNF
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CNANYSHLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMALVLLGLFLLLLLLLGSI-ILALLQRKN
:: ..::: :.: . . : .:: .:: .. :: .:.. ...::
CCDS26 CNERFTHLPEAGGPEVT-YEPPPTAP--------TLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWM
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YRVRGEPVP--EPRPDSGRDWSVELQELPELCFSQVIREGGHAVVWAGQLQGKLVAIKAF
:: : : . . : : : : : . .. .: . :: .::.. .::.: :
CCDS26 YRHRKPPYGHVDIHEDPGPPPPSPLVGLKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDFVAVKIF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 PPRSVAQFQAERALYELPGLQHDHIVRFITASRGGPGRLLSGPLLVLELHPKGSLCHYLT
: .. ..:.:: .. ::..:.....::.: . : . : :. .: :::: ::
CCDS26 PLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSN-LEVELWLITAFHDKGSLTDYLK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 QYTSDWGSSLRMALSLAQGLAFLHEER-WQNGQ-YKPGIAHRDLSSQNVLIREDGSCAIG
:. ..: ....::..:::. : :. .::.:::::..:.:::.. : . ...
CCDS26 GNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB5 DLGLALVL-PGLTQPPAWTPTQPQGPAAIMEAGTQRYMAPELLDKTLDLQ-DWGMALRRA
:.:::. . :: .::. : : .::.::::::.:. ....: : :. :
CCDS26 DFGLAVRFEPG--KPPGDTHGQ---------VGTRRYMAPEVLEGAINFQRD---AFLRI
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 DIYSLALLLWEILSRCPDLRPDSSPPPFQLAYEAELGNTPTSDELWALAVQERRRPYIPS
:.:...:.:::..::: :. ..: .: :.:. :. .:: ..:... :: : .
CCDS26 DMYAMGLVLWELVSRCK--AADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKD
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 TWRCFATDPDGLREL---LEDCWDADPEARLTAECVQQRLAALAHPQESHPFPESCPRGC
: : :: .: .:.::: : ::::.: ::..:..
CCDS26 HW---LKHP-GLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVT
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KB5 PPLCPEDCTSIPAPTILPCRPQRSACHFSVQQGPCSRNPQPACTLSPV
CCDS26 SVTNVDLPPKESSI
500 510
>>CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 (513 aa)
initn: 473 init1: 178 opt: 442 Z-score: 331.3 bits: 71.0 E(32554): 3.9e-12
Smith-Waterman score: 755; 29.7% identity (58.0% similar) in 505 aa overlap (14-508:20-482)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGSLGLWALLPTAVEAPPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIR
:. . . . :.::.: . :. : : . :
CCDS33 MGAAAKLAFAVFLISCSSGAILGRSETQECLFFNANWEKDRTNQTGVEPCYGDKDKR---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 CLYSRCCFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHC-DPSPRAHPSPGSTLFTCSCGT
: ::. :. . .. ::: .: ..: : . .. . . .. : :
CCDS33 ----RHCFATWKNISGSIEIVKQGCWLDD------INCYDRTDCVEKKDSPEVYFCCCEG
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
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..:: ..:..: : ..: :: . : .:: .. :.:. : .:
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:. ..... :: : : : : : : . .: .: . :: .:: .. :
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:.: :: .. ..: : .: :::..:..:..:: : . : . . :. .: ::::
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. . :. : : : .:.::: : ::::.: :: .:.. .
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CCDS88 EDVKI
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CCDS63 FIGAEKRGTSVDVDL-WLITAFHEKGSLSDFLKANVVSWNELCHIAETMARGLAYLHEDI
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