Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5918
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5918, 532 aa
1>>>pF1KB5918 532 - 532 aa - 532 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0801+/-0.00034; mu= 15.4991+/- 0.021
mean_var=95.1397+/-19.187, 0's: 0 Z-trim(116.9): 92 B-trim: 25 in 1/54
Lambda= 0.131490
statistics sampled from 28297 (28401) to 28297 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 11.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000192 (OMIM: 147840,611162) intercellular adhe ( 532) 3549 683.6 4e-196
NP_002153 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mo ( 547) 1577 309.5 1.7e-83
NP_001307535 (OMIM: 146631) intercellular adhesion ( 470) 1464 288.0 4.2e-77
XP_011526531 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellul ( 924) 1458 287.1 1.6e-76
NP_003250 (OMIM: 601852) intercellular adhesion mo ( 924) 1458 287.1 1.6e-76
NP_001307534 (OMIM: 146631) intercellular adhesion ( 451) 722 147.3 9.5e-35
NP_001307537 (OMIM: 146631) intercellular adhesion ( 286) 660 135.4 2.3e-31
XP_016882674 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellul ( 586) 488 103.0 2.7e-21
NP_001093259 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14
NP_001093257 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14
NP_000864 (OMIM: 146630) intercellular adhesion mo ( 275) 366 79.6 1.4e-14
NP_001093256 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14
NP_001093258 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14
NP_001535 (OMIM: 111250,614088) intercellular adhe ( 271) 209 49.8 1.3e-05
NP_542413 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pr ( 647) 181 44.7 0.001
NP_001155179 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-lik ( 600) 173 43.2 0.0027
XP_011541335 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 766) 173 43.3 0.0033
NP_001288026 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-lik ( 766) 173 43.3 0.0033
XP_011541334 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 772) 173 43.3 0.0033
XP_011541333 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 778) 173 43.3 0.0033
NP_115920 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-like p ( 778) 173 43.3 0.0033
XP_016873909 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 778) 173 43.3 0.0033
XP_011541332 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 784) 173 43.3 0.0033
XP_016873908 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 791) 173 43.3 0.0034
XP_011541329 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 803) 173 43.3 0.0034
XP_011541330 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 803) 173 43.3 0.0034
XP_016873907 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 803) 173 43.3 0.0034
XP_011541328 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 809) 173 43.3 0.0034
>>NP_000192 (OMIM: 147840,611162) intercellular adhesion (532 aa)
initn: 3549 init1: 3549 opt: 3549 Z-score: 3642.1 bits: 683.6 E(85289): 4e-196
Smith-Waterman score: 3549; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQTSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQPKLLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQTSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQPKLLGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWTPERVELAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWTPERVELAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAEVTTTVLVRRDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAEVTTTVLVRRDHH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLEVDTQGTVVCSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLEVDTQGTVVCSLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRLTCAVILGNQSQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRLTCAVILGNQSQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQLLLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQLLLKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQTPMCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQTPMCQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AWGNPLPELKCLKDGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLSPRYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AWGNPLPELKCLKDGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLSPRYE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 IVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP
490 500 510 520 530
>>NP_002153 (OMIM: 146631) intercellular adhesion molecu (547 aa)
initn: 1403 init1: 1403 opt: 1577 Z-score: 1620.2 bits: 309.5 E(85289): 1.7e-83
Smith-Waterman score: 1577; 47.3% identity (74.3% similar) in 529 aa overlap (1-523:4-530)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQ--TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQP
:.:: : :.. : :: . . : :.. .: :::..:.:::.: .
NP_002 MATMVPSVLWPRACWTLLVCCLLTPGVQGQEFLLRVEPQNPVLSAGGSLFVNCSTDCPSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWTPER
. ...:: : .:::. : . ...:::: .:. .: : .: :... .::: :::
NP_002 EKIALETSL-SKELVASGMGWAAFNLSNVTGNSRILCSVYCNGSQITGSSNITVYRLPER
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAEVTTTVLV
::::::: :::::.:.::::::: :.::..::::::: :.::.:.::: ::::::.:::.
NP_002 VELAPLPPWQPVGQNFTLRCQVEDGSPRTSLTVVLLRWEEELSRQPAVEEPAEVTATVLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLEVDTQGTV
:: ::: ::::::::..:::: :: ::::: ::.:::::.:::.::.:: :::.:. :
NP_002 SRDDHGAPFSCRTELDMQPQGLGLFVNTSAPRQLRTFVLPVTPPRLVAPRFLEVETSWPV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRLTCAVILG
:.::::::.:::::.:::::: :: :: .:...: :.... :..::.....: : ::
NP_002 DCTLDGLFPASEAQVYLALGDQMLNATVMNHGDTLTATATATARADQEGAREIVCNVTLG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 NQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQ
.. .:. ...:..:: .: : :..: . ::. :::.: : :..:::.:::: : ::
NP_002 GERREARENLTVFSFLGPIVNLSEPTAHEGSTVTVSCMAGARVQVTLDGVPAAAPGQPAQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQ
: :.:: :.:::: ::::::: :...:.:.. .:::::::..:. :: . : .....
NP_002 LQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLKWKDKTRH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNV
. .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. : :....
NP_002 VLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYTLVVVMDI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLST---YLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATP
. ..: . ::. . .:.. . :.. .... .:.... . :.
NP_002 EAGSSHFVPV-FVAVLLTLGVVTIVLALMYVFREHQRSGSYHVREESTYLPLTSMQPTEA
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 P
NP_002 MGEEPSRAE
540
>>NP_001307535 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mol (470 aa)
initn: 1386 init1: 1386 opt: 1464 Z-score: 1505.3 bits: 288.0 E(85289): 4.2e-77
Smith-Waterman score: 1464; 49.3% identity (76.8% similar) in 452 aa overlap (79-523:6-453)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 STSCDQPKLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLT
..:::: .:. .: : .: :... .:
NP_001 MGWAAFNLSNVTGNSRILCSVYCNGSQITGSSNIT
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VYWTPERVELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAE
:: :::::::::: :::::.:.::::::: :.::..::::::: :.::.:.::: ::::
NP_001 VYRLPERVELAPLPPWQPVGQNFTLRCQVEDGSPRTSLTVVLLRWEEELSRQPAVEEPAE
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 VTTTVLVRRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLE
::.:::. :: ::: ::::::::..:::: :: ::::: ::.:::::.:::.::.:: ::
NP_001 VTATVLASRDDHGAPFSCRTELDMQPQGLGLFVNTSAPRQLRTFVLPVTPPRLVAPRFLE
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRL
:.:. : :.::::::.:::::.:::::: :: :: .:...: :.... :..::....
NP_001 VETSWPVDCTLDGLFPASEAQVYLALGDQMLNATVMNHGDTLTATATATARADQEGAREI
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TCAVILGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQ
.: : ::.. .:. ...:..:: .: : :..: . ::. :::.: : :..:::.::::
NP_001 VCNVTLGGERREARENLTVFSFLGPIVNLSEPTAHEGSTVTVSCMAGARVQVTLDGVPAA
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PLGPRAQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWT
: ::: :.:: :.:::: ::::::: :...:.:.. .:::::::..:. :: .
NP_001 APGQPAQLQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLK
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 WPENSQQTPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVT
: ...... .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. :
NP_001 WKDKTRHVLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYT
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 RKVTVNV------LSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGT
:.... . : . :..:. ....... :.. .... .:.... .
NP_001 LVVVMDIEAGSSHFVPVFVAVLLTLGVVTIVLALM----YVFREHQRSGSYHVREESTYL
400 410 420 430 440 450
530
pF1KB5 PMKPNTQATPP
:.
NP_001 PLTSMQPTEAMGEEPSRAE
460 470
>>XP_011526531 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellular a (924 aa)
initn: 1562 init1: 1018 opt: 1458 Z-score: 1494.9 bits: 287.1 E(85289): 1.6e-76
Smith-Waterman score: 1467; 49.0% identity (73.0% similar) in 488 aa overlap (1-474:1-487)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAPSSP--RPALPALLVLLG-ALFPGPGNAQ----TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCD
: :: : :: .: . :: .:: . .: ....: ... ::::. ..:::.:
XP_011 MPGPSPGLRRALLGLWAALGLGLFGLSAVSQEPFWADLQPRVAFVERGGSLWLNCSTNCP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QPKLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQE-DSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWT
.:. :.:: : ... : . .: ...: ..::.:. : :. .. ..
XP_011 RPERGGLETSL-RRNGTQRGLRWLARQLVDIREPETQPVCFFRCARRTLQARGLIRTFQR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB5 PERVELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEP-----A
:.:::: ::: :::::.:.:: :.: :..:::.::..:::: .:: :. .::: :
XP_011 PDRVELMPLPPWQPVGENFTLSCRVPGAGPRASLTLTLLRGAQELIRRSFAGEPPRARGA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EVTTTVLVRRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVL
.:.:::.::. ::::::::.::::::.:: ::::.::: .:.:: : :.:..::.:
XP_011 VLTATVLARREDHGANFSCRAELDLRPHGLGLFENSSAPRELRTFSLSPDAPRLAAPRLL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 EVDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQR
:: .. : :.::::::.:::.:.:::::: :.: :: .:.: : :.....::.::...
XP_011 EVGSERPVSCTLDGLFPASEARVYLALGDQNLSPDVTLEGDAFVATATATASAEQEGARQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LTCAVILGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPA
:.: : ::....:: ..::::::::: . :..: :::: ::: : : .: :::.::::
XP_011 LVCNVTLGGENRETRENVTIYSFPAPLLTLSEPSVSEGQMVTVTCAAGAQALVTLEGVPA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 QPLGPRAQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNW
: ::: :.:: .:. ::: :.:::.: :. . ::.. ::::::.::::. ::: .:
XP_011 AVPGQPAQLQLNATENDDRRSFFCDATLDVDGETLIKNRSAELRVLYAPRLDDSDCPRSW
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 TWPENSQQTPMCQAWGNPLPELKCLK-DGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEV
::::. .:: :.: ::: : ..: . :: : .: ::: : ::: :.: . :::.
XP_011 TWPEGPEQTLRCEARGNPEPSVHCARSDGGAVLALGLLGPVTRALSGTYRCKAANDQGEA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 TRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPN
.. ::..:
XP_011 VKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAVIEGL
480 490 500 510 520 530
>--
initn: 235 init1: 166 opt: 265 Z-score: 271.8 bits: 60.8 E(85289): 2.1e-08
Smith-Waterman score: 265; 33.9% identity (58.2% similar) in 165 aa overlap (324-477:506-665)
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPR
::::....: :: . : . ::
XP_011 QGEAVKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAV
480 490 500 510 520 530
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENS
. ::... : : .. : :: . :. :: . . : ::::..: .::.:::: :.:
XP_011 IEGLLRVAREHAG-TYRCEAT-NPRGSAA-KNVA--VTVEYGPRFEEPSCPSNWTWVEGS
540 550 560 570 580 590
420 430 440 450 460
pF1KB5 QQTPMCQAWGNPLPELKCLKDG------TFPL----PIGESVTVTRDLE-GTYLCRARST
. :.. :.: : .::. .: .:: : .. . : : : :.: : .
XP_011 GRLFSCEVDGKPQPSVKCVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPRAPRIPRVLAPGIYVCNATNR
600 610 620 630 640 650
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 QGEVTRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTP
.: :.. :.:.. ::
XP_011 HGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGRPSPGVRCSREGIPWP
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>--
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370 380 390 400 410 420
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:..:: ::.. :: :... . . : : :
XP_011 RVLAPGIYVCNATNRHGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGR
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: : ..: ..: .: : :. :.:. ::: : : ...: .: :::.: .:. :.
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..:.
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10 20 30 40 50
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: :: : :: .: . :: .:: . .: ....: ... ::::. ..:::.:
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.:. :.:: : ... : . .: ...: ..::.:. : :. .. ..
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:.:::: ::: :::::.:.:: :.: :..:::.::..:::: .:: :. .::: :
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.:.:::.::. ::::::::.::::::.:: ::::.::: .:.:: : :.:..::.:
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:: .. : :.::::::.:::.:.:::::: :.: :: .:.: : :.....::.::...
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:.: : ::....:: ..::::::::: . :..: :::: ::: : : .: :::.::::
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: ::: :.:: .:. ::: :.:::.: :. . ::.. ::::::.::::. ::: .:
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::::. .:: :.: ::: : ..: . :: : .: ::: : ::: :.: . :::.
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pF1KB5 TRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPN
.. ::..:
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>--
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Smith-Waterman score: 265; 33.9% identity (58.2% similar) in 165 aa overlap (324-477:506-665)
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pF1KB5 LGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPR
::::....: :: . : . ::
NP_003 QGEAVKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAV
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pF1KB5 AQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENS
. ::... : : .. : :: . :. :: . . : ::::..: .::.:::: :.:
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pF1KB5 QQTPMCQAWGNPLPELKCLKDG------TFPL----PIGESVTVTRDLE-GTYLCRARST
. :.. :.: : .::. .: .:: : .. . : : : :.: : .
NP_003 GRLFSCEVDGKPQPSVKCVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPRAPRIPRVLAPGIYVCNATNR
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pF1KB5 QGEVTRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTP
.: :.. :.:.. ::
NP_003 HGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGRPSPGVRCSREGIPWP
660 670 680 690 700 710
>--
initn: 133 init1: 65 opt: 199 Z-score: 204.1 bits: 48.3 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 199; 35.8% identity (65.3% similar) in 95 aa overlap (396-489:666-754)
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQTPM-CQAWGN
:..:: ::.. :: :... . . : : :
NP_003 RVLAPGIYVCNATNRHGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGR
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pF1KB5 PLPELKCLKDGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLSPRYEIVII
: : ..: ..: .: : :. :.:. ::: : : ...: .: :::.: .:. :.
NP_003 PSPGVRCSREG-IPWP--EQQRVSREDAGTYHCVATNAHGTDSRTVTVGV---EYRPVVA
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..:.
NP_003 ELAASPPGGVRPGGNFTLTCRAEAWPPAQISWRAPPGALNIGLSSNNSTLSVAGAMGSHG
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>>NP_001307534 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mol (451 aa)
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pF1KB5 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQ--TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQP
:.:: : :.. : :: . . : :.. .: :::..:.:::.: .
NP_001 MATMVPSVLWPRACWTLLVCCLLTPGVQGQEFLLRVEPQNPVLSAGGSLFVNCSTDCPSS
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. ...:: : .:::. : . ...:::: .:. .: : .: :... .::: :::
NP_001 EKIALETSL-SKELVASGMGWAAFNLSNVTGNSRILCSVYCNGSQITGSSNITVYRLPER
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pF1KB5 VELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAEVTTTVLV
::::::: :::::.:.::::::: :.::..::::::: :.::.:.::: ::::::.:::.
NP_001 VELAPLPPWQPVGQNFTLRCQVEDGSPRTSLTVVLLRWEEELSRQPAVEEPAEVTATVLA
120 130 140 150 160 170
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:: ::: ::::::::..:::: :: ::::: ::.::
NP_001 SRDDHGAPFSCRTELDMQPQGLGLFVNTSAPRQLRTF-----------------------
180 190 200 210
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pF1KB5 VCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRLTCAVILG
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KB5 NQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQ
.: .: : :..: . ::. :::.: : :..:::.:::: : ::
NP_001 -------------GFLGPIVNLSEPTAHEGSTVTVSCMAGARVQVTLDGVPAAAPGQPAQ
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: :.:: :.:::: ::::::: :...:.:.. .:::::::..:. :: . : .....
NP_001 LQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLKWKDKTRH
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pF1KB5 TPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNV
. .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. : :....
NP_001 VLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYTLVVVMDI
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pF1KB5 LSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLST---YLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATP
. ..: . ::. . .:.. . :.. .... .:.... . :.
NP_001 EAGSSHFVPV-FVAVLLTLGVVTIVLALMYVFREHQRSGSYHVREESTYLPLTSMQPTEA
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 P
NP_001 MGEEPSRAE
450
>>NP_001307537 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mol (286 aa)
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pF1KB5 VDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRL
:: :: .:...: :.... :..::....
NP_001 MLNATVMNHGDTLTATATATARADQEGAREI
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pF1KB5 TCAVILGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQ
.: : ::.. .:. ...:..:: .: : :..: . ::. :::.: : :..:::.::::
NP_001 VCNVTLGGERREARENLTVFSFLGPIVNLSEPTAHEGSTVTVSCMAGARVQVTLDGVPAA
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 PLGPRAQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWT
: ::: :.:: :.:::: ::::::: :...:.:.. .:::::::..:. :: .
NP_001 APGQPAQLQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLK
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pF1KB5 WPENSQQTPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVT
: ...... .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. :
NP_001 WKDKTRHVLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYT
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pF1KB5 RKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLST---YLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMK
:.... . ..: . ::. . .:.. . :.. .... .:.... . :.
NP_001 LVVVMDIEAGSSHFVPV-FVAVLLTLGVVTIVLALMYVFREHQRSGSYHVREESTYLPLT
220 230 240 250 260 270
530
pF1KB5 PNTQATPP
NP_001 SMQPTEAMGEEPSRAE
280
>>XP_016882674 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellular a (586 aa)
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pF1KB5 SQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQLL
::: : : .: :::.:::: : :::
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:.:: .:. ::: :.:::.: :. . ::.. ::::::.::::. ::: .:::::. .::
XP_016 LNATENDDRRSFFCDATLDVDGETLIKNRSAELRVLYAPRLDDSDCPRSWTWPEGPEQTL
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 MCQAWGNPLPELKCLK-DGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLS
:.: ::: : ..: . :: : .: ::: : ::: :.: . :::... ::..:
XP_016 RCEARGNPEPSVHCARSDGGAVLALGLLGPVTRALSGTYRCKAANDQGEAVKDVTLTVEY
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pF1KB5 PRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP
XP_016 APALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAVIEGLLRVAREHAGT
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>--
initn: 235 init1: 166 opt: 265 Z-score: 274.6 bits: 60.6 E(85289): 1.5e-08
Smith-Waterman score: 265; 33.9% identity (58.2% similar) in 165 aa overlap (324-477:168-327)
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPR
::::....: :: . : . ::
XP_016 QGEAVKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAV
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pF1KB5 AQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENS
. ::... : : .. : :: . :. :: . . : ::::..: .::.:::: :.:
XP_016 IEGLLRVAREHAG-TYRCEAT-NPRGSAA-KNVA--VTVEYGPRFEEPSCPSNWTWVEGS
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. :.. :.: : .::. .: .:: : .. . : : : :.: : .
XP_016 GRLFSCEVDGKPQPSVKCVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPRAPRIPRVLAPGIYVCNATNR
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 QGEVTRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTP
.: :.. :.:.. ::
XP_016 HGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGRPSPGVRCSREGIPWP
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>--
initn: 133 init1: 65 opt: 199 Z-score: 207.0 bits: 48.1 E(85289): 8.6e-05
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:..:: ::.. :: :... . . : : :
XP_016 RVLAPGIYVCNATNRHGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGR
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PLPELKCLKDGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLSPRYEIVII
: : ..: ..: .: : :. :.:. ::: : : ...: .: :::.: .:. :.
XP_016 PSPGVRCSREG-IPWP--EQQRVSREDAGTYHCVATNAHGTDSRTVTVGV---EYRPVVA
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530
pF1KB5 TVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP
..:.
XP_016 ELAASPPGGVRPGGNFTLTCRAEAWPPAQISWRAPPGALNIGLSSNNSTLSVAGAMGSHG
420 430 440 450 460 470
>>NP_001093259 (OMIM: 146630) intercellular adhesion mol (275 aa)
initn: 326 init1: 170 opt: 366 Z-score: 382.9 bits: 79.6 E(85289): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 366; 35.0% identity (62.7% similar) in 220 aa overlap (13-222:9-225)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQ----TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQPK
: : : .:. ::. . . : :.:. . ::. :.:::.:.::.
NP_001 MSSFGYRTLTVALFTLICCPGSDEKVFEVHVRPKKLAVEPKGSLEVNCSTTCNQPE
10 20 30 40 50
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pF1KB5 LLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWTPERV
. :.:: : : :: . : : .::...:. .:. .: : . .. ..:: :..:
NP_001 VGGLETSLDKI-LLDEQAQWKHYLVSNISHDTVLQCHFTCSGKQESMNSNVSVYQPPRQV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 ELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREP---AVGEPAEVTTT-
:. :. :::..:..:.: : .::. :.::.. :. : :. : :.:.:
NP_001 ILTLQPTLVAVGKSFTIECRVPTVEPLDSLTLFLFRGNETLHYETFGKAAPAPQEATATF
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 --VLVRRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLEVD
. :.: : :::: . ::: .: ..:.. ::: .:. . :.. :.:
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