Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5784
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5784, 770 aa
1>>>pF1KB5784 770 - 770 aa - 770 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4110+/-0.000413; mu= -18.0710+/- 0.026
mean_var=429.5974+/-90.933, 0's: 0 Z-trim(122.5): 50 B-trim: 1375 in 1/60
Lambda= 0.061879
statistics sampled from 40629 (40710) to 40629 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16
Scan time: 11.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001334 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 isofor ( 770) 5195 478.5 4.6e-134
NP_001231800 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 iso ( 749) 3703 345.3 5.6e-94
NP_066566 (OMIM: 603448) disabled homolog 1 [Homo ( 555) 746 81.3 1.3e-14
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XP_016859792 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 366) 304 41.7 0.0068
XP_016859794 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 366) 304 41.7 0.0068
XP_011509631 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 376) 304 41.7 0.0069
XP_006712646 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 304 41.7 0.007
XP_006712647 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 304 41.7 0.007
XP_006712643 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 304 41.7 0.007
XP_006712645 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 304 41.7 0.007
XP_006712648 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 304 41.7 0.007
XP_006712644 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 304 41.7 0.007
>>NP_001334 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 isoform 1 (770 aa)
initn: 5195 init1: 5195 opt: 5195 Z-score: 2527.9 bits: 478.5 E(85289): 4.6e-134
Smith-Waterman score: 5195; 100.0% identity (100.0% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKEKKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKEKKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKSGVDQMDLFGDMSTPPDLNSPTESKDILLVDLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKSGVDQMDLFGDMSTPPDLNSPTESKDILLVDLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPNPDPFRDDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPNPDPFRDDPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TQPDQSTPSSFDSLKSPDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQPDQSTPSSFDSLKSPDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQEAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSPPKGLSIQNGVKQDLESSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSPPKGLSIQNGVKQDLESSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QSSPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPVSEPSGQASPTGQPTALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSSPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPVSEPSGQASPTGQPTALQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PNPLDLFKTSAPAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQPSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNPLDLFKTSAPAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQPSGF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SQPVIFGTSPAVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGNPFQSNIFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPVIFGTSPAVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGNPFQSNIFP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 APAVSTQPPSMHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDVKEMFKDFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APAVSTQPPSMHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDVKEMFKDFQL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RQPPAVPARKGEQTSSGTLSAFASYFNSKVGIPQENADHDDFDANQLLNKINEPPKPAPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQPPAVPARKGEQTSSGTLSAFASYFNSKVGIPQENADHDDFDANQLLNKINEPPKPAPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB5 QVSLPVTKSTDNAFENPFFKDSFGSSQASVASSQPVSSEMYRDPFGNPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVSLPVTKSTDNAFENPFFKDSFGSSQASVASSQPVSSEMYRDPFGNPFA
730 740 750 760 770
>>NP_001231800 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 isoform (749 aa)
initn: 3697 init1: 3697 opt: 3703 Z-score: 1808.2 bits: 345.3 E(85289): 5.6e-94
Smith-Waterman score: 4994; 97.3% identity (97.3% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-749)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKEKKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKEKKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKSGVDQMDLFGDMSTPPDLNSPTESKDILLVDLN
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_001 KIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKS---------------------ESKDILLVDLN
190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPNPDPFRDDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPNPDPFRDDPF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TQPDQSTPSSFDSLKSPDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQPDQSTPSSFDSLKSPDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQEAQ
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSPPKGLSIQNGVKQDLESSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSPPKGLSIQNGVKQDLESSV
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QSSPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPVSEPSGQASPTGQPTALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSSPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPVSEPSGQASPTGQPTALQ
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PNPLDLFKTSAPAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQPSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNPLDLFKTSAPAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQPSGF
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SQPVIFGTSPAVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGNPFQSNIFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPVIFGTSPAVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGNPFQSNIFP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 APAVSTQPPSMHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDVKEMFKDFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APAVSTQPPSMHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDVKEMFKDFQL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RQPPAVPARKGEQTSSGTLSAFASYFNSKVGIPQENADHDDFDANQLLNKINEPPKPAPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQPPAVPARKGEQTSSGTLSAFASYFNSKVGIPQENADHDDFDANQLLNKINEPPKPAPR
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770
pF1KB5 QVSLPVTKSTDNAFENPFFKDSFGSSQASVASSQPVSSEMYRDPFGNPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVSLPVTKSTDNAFENPFFKDSFGSSQASVASSQPVSSEMYRDPFGNPFA
700 710 720 730 740
>>NP_066566 (OMIM: 603448) disabled homolog 1 [Homo sapi (555 aa)
initn: 1062 init1: 701 opt: 746 Z-score: 383.5 bits: 81.3 E(85289): 1.3e-14
Smith-Waterman score: 839; 32.9% identity (51.7% similar) in 773 aa overlap (13-768:4-540)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKE-KKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDD
. . :.: :. .::. .::: .... :. ::::.::.:::::::::.
NP_066 MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQDRSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VPDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVN
: :::::. :::::::::..:..::.:.:::.:...::..::::.:::::...:.: :.
NP_066 VSAARGDKLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEK
.::.::.:.::.:::::::: ::.:.: ::::.: :::...::.::::.::..:..:: .
NP_066 EISYIAKDITDHRAFGYVCGKEGNHRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KKIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKSGVDQMDLFGDMSTPPDLNSPTESKDILLVDL
:: .. : : .. .: : : :.
NP_066 KKAQK---------------DKQCEQ---AVYQTILEEDV--------------------
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NSEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPNPDPFRDDP
:.: . : :. .:.:: :
NP_066 ------------EDPVYQYIV-------------------FEAG--------HEPIRD-P
200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FTQPD-QSTPSSFDSLKSPDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQE
:. . ..:.: :::: : :
NP_066 ETEENIYQVPTS--------QKKE---------------GVYDV----------------
220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AQAGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSPPKGLSIQNGVKQDLES
: ..::. ..:.. : :. :.: : . :::
NP_066 ----P------KSQPV----SAVTQLEL--FGDMSTP-PDITSPP---------------
240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 SVQSSPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPVSEPSGQASPTGQPTA
. ..: : :.:: ..: :. ..:.:. : : :
NP_066 -TPATPGD--AFIPSSSQTLPA--------------SADVFS---SVPFG----------
270 280 290
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LQPNPLDLFKTSAPAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQPS
.: .: : :..:.: ::. :. :.: . .::.::
NP_066 -----------TAAVPSG-YVAMGAV---LPSF--WG-------QQPLVQQQMVMGAQPP
300 310 320
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GFSQPVIFGTSPAVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGNPFQSNI
.: :. :..: . :.::. : : : : :.: : . : :. : :. .
NP_066 -VAQ-VMPGAQPIA--WGQPGLFPA-TQQPWPTVAG---QFPPAAFM-------PTQT-V
330 340 350 360 370
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 FPAPAVSTQPPSMHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDV-KEMFKD
.: ::. : : .:: : : .::. : .: :: . . :: :::
NP_066 MPLPAAMFQGP-------LTPLATVP--G-----TSDS-TRSSPQTDKPRQKMGKETFKD
380 390 400 410
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 FQLRQPPAVPARKGEQTS-SGTLSAFASYFNSKVGIPQENADHDDFDANQL-LNKI----
::. ::: ::.:: .: : . : ::.:::: :::. :.. : :::: .:: :. .
NP_066 FQMAQPPPVPSRKPDQPSLTCTSEAFSSYFN-KVGVAQDTDDCDDFDISQLNLTPVTSTT
420 430 440 450 460 470
720 730 740 750 760
pF1KB5 ---NEPPKPAPRQVSLPVTKSTDNAFE---NPFFKDSFGSSQASVASSQPVSSEMYR--D
: :: ::::: : : .:...: . . .:...: : . : . : .:. :
NP_066 PSTNSPPTPAPRQSS-PSKSSASHASDPTTDDIFEEGFESPSKSEEQEAPDGSQASSNSD
480 490 500 510 520 530
770
pF1KB5 PFGNPFA
:::.:
NP_066 PFGEPSGEPSGDNISPQAGS
540 550
>>XP_016859793 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (366 aa)
initn: 287 init1: 213 opt: 304 Z-score: 173.0 bits: 41.7 E(85289): 0.0068
Smith-Waterman score: 304; 27.1% identity (57.8% similar) in 332 aa overlap (21-334:3-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKEKKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDV
.: :.: : : .: : : .: . :.::..: .:
XP_016 MNRAFSRK-KDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNK
. .: .. .:.. ::: .:.::. .. ..::. :.::.. :: ..:. ...
XP_016 EQPKGTEVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB5 ISFIARDVTDNRAFGYVCGGE--GQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEE
::: : : ::.: : ..: ..: ... . . :: ... . . :.. : .: :
XP_016 ISFCADDKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAY--RKFLES
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KKKIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKSGVDQMD---LFGDMSTPPDLNSPTESKDIL
: :. : . . .. .. :. .. .::. :.... . ..:.:: :.. .. .. .
XP_016 GGKDVETRKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LVDLNSEI-DTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPN---
. .: . .: .: .: :. :.: :. :: : :.. .: .: ..: :.
XP_016 FQRCSSSFWRSNGDS---SPCLN--ISSISV---TPINS--PDSRLSLGL-LIPPPSKCG
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB5 -PDPFRDDPFTQPDQS--TPSS-----FDSLK-SPDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDY
: : .. . .: . ::.: :: . :: : .:: : ::
XP_016 FPKPVSESSIPRPHAGSMTPKSPSTDIFDMIPFSP-----ISHQSSMPTRNGTQPPPVPS
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FGQQFDQISNRTGKQEAQAGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSP
XP_016 RSTEIKRDLFGAEPFDPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQRQRWRGSKWD
320 330 340 350 360
>>XP_016859792 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (366 aa)
initn: 287 init1: 213 opt: 304 Z-score: 173.0 bits: 41.7 E(85289): 0.0068
Smith-Waterman score: 304; 27.1% identity (57.8% similar) in 332 aa overlap (21-334:3-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKEKKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDV
.: :.: : : .: : : .: . :.::..: .:
XP_016 MNRAFSRK-KDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNK
. .: .. .:.. ::: .:.::. .. ..::. :.::.. :: ..:. ...
XP_016 EQPKGTEVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHR
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