Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5778
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5778, 766 aa
1>>>pF1KB5778 766 - 766 aa - 766 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7782+/-0.00056; mu= 22.9753+/- 0.035
mean_var=70.8858+/-14.633, 0's: 0 Z-trim(106.6): 82 B-trim: 232 in 1/47
Lambda= 0.152333
statistics sampled from 14634 (14716) to 14634 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 9.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001926 (OMIM: 102720) dipeptidyl peptidase 4 [H ( 766) 5214 1156.4 0
XP_005246428 (OMIM: 102720) PREDICTED: dipeptidyl ( 765) 5191 1151.3 0
NP_004451 (OMIM: 600403) prolyl endopeptidase FAP ( 760) 2829 632.2 2.4e-180
XP_011509098 (OMIM: 600403) PREDICTED: prolyl endo ( 750) 2794 624.5 4.9e-178
NP_001278736 (OMIM: 600403) prolyl endopeptidase F ( 735) 2624 587.2 8.4e-167
NP_001308835 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 789) 1679 379.5 2.9e-104
NP_001004360 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 789) 1679 379.5 2.9e-104
NP_001171508 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 792) 1679 379.5 2.9e-104
NP_065919 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pepti ( 796) 1679 379.5 3e-104
NP_001171505 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 800) 1679 379.5 3e-104
NP_001308834 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 813) 1679 379.5 3e-104
XP_016860055 (OMIM: 608209) PREDICTED: inactive di ( 755) 1650 373.1 2.4e-102
NP_001308837 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 766) 1650 373.1 2.4e-102
NP_001171507 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 746) 1649 372.9 2.7e-102
NP_001308840 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 746) 1649 372.9 2.7e-102
NP_001308839 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 746) 1649 372.9 2.7e-102
NP_001308838 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 757) 1591 360.2 1.9e-98
NP_001034439 (OMIM: 126141,612956,616311) dipeptid ( 801) 1535 347.9 1e-94
NP_001927 (OMIM: 126141,612956,616311) dipeptidyl ( 803) 1535 347.9 1e-94
XP_016867299 (OMIM: 126141,612956,616311) PREDICTE ( 804) 1535 347.9 1e-94
XP_016867298 (OMIM: 126141,612956,616311) PREDICTE ( 804) 1535 347.9 1e-94
XP_016867300 (OMIM: 126141,612956,616311) PREDICTE ( 804) 1535 347.9 1e-94
XP_016867297 (OMIM: 126141,612956,616311) PREDICTE ( 804) 1535 347.9 1e-94
NP_570629 (OMIM: 126141,612956,616311) dipeptidyl ( 865) 1535 347.9 1.1e-94
XP_011509099 (OMIM: 600403) PREDICTED: prolyl endo ( 491) 1515 343.3 1.5e-93
NP_001308841 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 681) 1516 343.6 1.6e-93
XP_016859074 (OMIM: 600403) PREDICTED: prolyl endo ( 475) 1452 329.4 2.1e-89
XP_016867301 (OMIM: 126141,612956,616311) PREDICTE ( 657) 1355 308.2 7e-83
NP_001277181 (OMIM: 126141,612956,616311) dipeptid ( 758) 1295 295.1 7.2e-79
NP_001308843 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 542) 1182 270.1 1.7e-71
NP_001308842 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 542) 1182 270.1 1.7e-71
NP_001308836 (OMIM: 608209) inactive dipeptidyl pe ( 783) 969 223.5 2.7e-57
XP_016860054 (OMIM: 608209) PREDICTED: inactive di ( 776) 968 223.2 3.2e-57
XP_005254562 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 479) 561 133.6 1.9e-30
XP_016877872 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 514) 561 133.6 2e-30
XP_016877871 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 514) 561 133.6 2e-30
XP_016877866 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 781) 561 133.8 2.7e-30
XP_011520035 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 824) 561 133.8 2.8e-30
XP_016877864 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 839) 561 133.8 2.8e-30
XP_011520033 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 840) 561 133.8 2.8e-30
XP_011520032 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 855) 561 133.8 2.9e-30
NP_001307805 (OMIM: 606819) dipeptidyl peptidase 8 ( 882) 561 133.9 2.9e-30
NP_569118 (OMIM: 606819) dipeptidyl peptidase 8 is ( 882) 561 133.9 2.9e-30
NP_932064 (OMIM: 606819) dipeptidyl peptidase 8 is ( 898) 561 133.9 3e-30
XP_016877862 (OMIM: 606819) PREDICTED: dipeptidyl ( 898) 561 133.9 3e-30
NP_001307804 (OMIM: 606819) dipeptidyl peptidase 8 ( 898) 561 133.9 3e-30
XP_011526712 (OMIM: 608258) PREDICTED: dipeptidyl ( 863) 523 125.5 9.4e-28
XP_005259730 (OMIM: 608258) PREDICTED: dipeptidyl ( 892) 523 125.5 9.6e-28
XP_011526710 (OMIM: 608258) PREDICTED: dipeptidyl ( 892) 523 125.5 9.6e-28
NP_631898 (OMIM: 608258) dipeptidyl peptidase 9 [H ( 892) 523 125.5 9.6e-28
>>NP_001926 (OMIM: 102720) dipeptidyl peptidase 4 [Homo (766 aa)
initn: 5214 init1: 5214 opt: 5214 Z-score: 6191.6 bits: 1156.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5214; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKTPWKVLLGLLGAAALVTIITVPVVLLNKGTDDATADSRKTYTLTDYLKNTYRLKLYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKTPWKVLLGLLGAAALVTIITVPVVLLNKGTDDATADSRKTYTLTDYLKNTYRLKLYSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RWISDHEYLYKQENNILVFNAEYGNSSVFLENSTFDEFGHSINDYSISPDGQFILLEYNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RWISDHEYLYKQENNILVFNAEYGNSSVFLENSTFDEFGHSINDYSISPDGQFILLEYNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSYRITWTGKEDIIYNGITDWVYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSVTNATSIQITAPASMLIGDHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSVTNATSIQITAPASMLIGDHYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDVTWATQERISLQWLRRIQNYSVMDICDYDESSGRWNCLVARQHIEMSTTGWVGRFRPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPHFTLDGNSFYKIISNEEGYRHICYFQIDKKDCTFITKGTWEVIGIEALTSDYLYYISN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYKGMPGGRNLYKIQLSDYTKVTCLSCELNPERCQYYSVSFSKEAKYYQLRCSGPGLPLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLHSSVNDKGLRVLEDNSALDKMLQNVQMPSKKLDFIILNETKFWYQMILPPHFDKSKKY
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pF1KB5 PLLLDVYAGPCSQKADTVFRLNWATYLASTENIIVASFDGRGSGYQGDKIMHAINRRLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLLDVYAGPCSQKADTVFRLNWATYLASTENIIVASFDGRGSGYQGDKIMHAINRRLGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FEVEDQIEAARQFSKMGFVDNKRIAIWGWSYGGYVTSMVLGSGSGVFKCGIAVAPVSRWE
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670 680 690 700 710 720
pF1KB5 YYDSVYTERYMGLPTPEDNLDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YYDSVYTERYMGLPTPEDNLDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQIS
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730 740 750 760
pF1KB5 KALVDVGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFIKQCFSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KALVDVGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFIKQCFSLP
730 740 750 760
>>XP_005246428 (OMIM: 102720) PREDICTED: dipeptidyl pept (765 aa)
initn: 5022 init1: 5022 opt: 5191 Z-score: 6164.3 bits: 1151.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5191; 99.7% identity (99.9% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKTPWKVLLGLLGAAALVTIITVPVVLLNKGTDDATADSRKTYTLTDYLKNTYRLKLYSL
::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RWISDHEYLYKQENNILVFNAEYGNSSVFLENSTFDEFGHSINDYSISPDGQFILLEYNY
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pF1KB5 VKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPNL
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pF1KB5 PSYRITWTGKEDIIYNGITDWVYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSYRITWTGKEDIIYNGITDWVYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYSF
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pF1KB5 YSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSVTNATSIQITAPASMLIGDHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSVTNATSIQITAPASMLIGDHYL
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pF1KB5 CDVTWATQERISLQWLRRIQNYSVMDICDYDESSGRWNCLVARQHIEMSTTGWVGRFRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CDVTWATQERISLQWLRRIQNYSVMDICDYDESSGRWNCLVARQHIEMSTTGWVGRFRPS
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pF1KB5 EPHFTLDGNSFYKIISNEEGYRHICYFQIDKKDCTFITKGTWEVIGIEALTSDYLYYISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPHFTLDGNSFYKIISNEEGYRHICYFQIDKKDCTFITKGTWEVIGIEALTSDYLYYISN
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pF1KB5 EYKGMPGGRNLYKIQLSDYTKVTCLSCELNPERCQYYSVSFSKEAKYYQLRCSGPGLPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EYKGMPGGRNLYKIQLSDYTKVTCLSCELNPERCQYYSVSFSKEAKYYQLRCSGPGLPLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLHSSVNDKGLRVLEDNSALDKMLQNVQMPSKKLDFIILNETKFWYQMILPPHFDKSKKY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 FEVEDQIEAARQFSKMGFVDNKRIAIWGWSYGGYVTSMVLGSGSGVFKCGIAVAPVSRWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FEVEDQIEAARQFSKMGFVDNKRIAIWGWSYGGYVTSMVLGSGSGVFKCGIAVAPVSRWE
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 YYDSVYTERYMGLPTPEDNLDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YYDSVYTERYMGLPTPEDNLDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQIS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760
pF1KB5 KALVDVGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFIKQCFSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KALVDVGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFIKQCFSLP
720 730 740 750 760
>>NP_004451 (OMIM: 600403) prolyl endopeptidase FAP isof (760 aa)
initn: 2522 init1: 1387 opt: 2829 Z-score: 3358.9 bits: 632.2 E(85289): 2.4e-180
Smith-Waterman score: 2829; 51.6% identity (80.4% similar) in 767 aa overlap (1-765:1-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKTPWKVLLGLLGAAALVTIITVPVVLLNKGTDDATADSRKTYTLTDYLKNTYRLKLYSL
::: :...:. .:.:. .. .:: . . .. .. .. :: : :..:. : .
NP_004 MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMC-IVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 RWISDHEYLYKQ-ENNILVFNAEYGNSSVFLENSTFDEFGHSINDYSISPDGQFILLEYN
::: .:::... .:::...: : :.: ..: : :. . : .:..::: ::. :: .
NP_004 NWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNAS--NYGLSPDRQFVYLESD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 YVKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPN
: : ::.::::.: ::::.. ... ...: :.. ::::: :::::..:.::.: .:.
NP_004 YSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LPSYRITWTGKEDIIYNGITDWVYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYS
: ..::..:.:. :.::: :::::::.... :::::::: :::::.::::..:.: ::
NP_004 DPPFQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FYSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSVTNATSIQITAPASMLIGDHY
.:.:: :::.:. .::::::: ::.:..:...: . : .. .:: . .:.:
NP_004 YYGDE--QYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQ---EVPVPAMIASSDYY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LCDVTWATQERISLQWLRRIQNYSVMDICDYDESSGRWNCLVARQHIEMSTTGWVGRFRP
. .::.:.::. ::::.:.:: ::..:::. :. :.: ...::: : :::.: :
NP_004 FSWLTWVTDERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SEPHFTLDGNSFYKIISNEEGYRHICYFQIDKKDCTFITKGTWEVIGIEALTSDYLYYIS
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NP_001 SIFGKGYGGYIASMILKSDEKLFKCGSVVAPITDLKLYASAFSERYLGMPSKEEST--YQ
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NP_001 WWSPDGERLAFLMINDSLVPTMVIPRFTGA--LYPKGKQYPYPKAGQVNPTIKLYVVN--
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start: Sun Nov 6 18:13:49 2016 done: Sun Nov 6 18:13:51 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]