Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5773
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5773, 822 aa
1>>>pF1KB5773 822 - 822 aa - 822 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6734+/-0.00117; mu= 5.3363+/- 0.069
mean_var=283.9797+/-61.684, 0's: 0 Z-trim(110.2): 676 B-trim: 488 in 1/52
Lambda= 0.076108
statistics sampled from 10648 (11425) to 10648 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 4.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 5469 615.2 1.4e-175
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 4622 522.2 1.3e-147
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 2875 330.4 7.1e-90
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 2721 313.5 9.3e-85
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 2124 247.9 4.5e-65
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 1732 204.6 3.1e-52
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 832 106.2 3.2e-22
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 832 106.2 3.2e-22
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 823 104.8 3.6e-22
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 814 103.9 7.6e-22
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 814 104.2 1.2e-21
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 814 104.2 1.2e-21
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 814 104.2 1.2e-21
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 814 104.2 1.2e-21
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 814 104.3 1.3e-21
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 814 104.3 1.3e-21
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 814 104.3 1.3e-21
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 789 101.1 4.5e-21
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 786 100.9 7.4e-21
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 775 99.7 1.6e-20
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 770 99.1 2.4e-20
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 770 99.2 2.5e-20
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 770 99.2 2.6e-20
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 758 97.7 4.8e-20
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 754 97.3 7.2e-20
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 749 96.7 9.3e-20
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 749 96.7 1e-19
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 466) 744 96.1 1.4e-19
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 507) 744 96.2 1.5e-19
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 508) 744 96.2 1.5e-19
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 744 96.2 1.6e-19
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 738 95.6 2.5e-19
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 743 96.4 2.5e-19
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 737 95.4 2.6e-19
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 736 95.3 2.9e-19
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 735 95.2 3.1e-19
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 730 95.0 7.1e-19
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 730 95.0 7.1e-19
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 722 93.8 8e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 722 93.8 8e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 722 93.8 8.2e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 722 93.8 8.2e-19
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 719 93.8 1.6e-18
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 712 92.7 1.7e-18
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 717 93.5 1.8e-18
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 717 93.5 1.8e-18
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 716 93.4 2e-18
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 714 93.2 2.3e-18
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 705 91.9 2.9e-18
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 705 91.9 2.9e-18
>>CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 (822 aa)
initn: 5469 init1: 5469 opt: 5469 Z-score: 3265.8 bits: 615.2 E(32554): 1.4e-175
Smith-Waterman score: 5469; 100.0% identity (100.0% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-822)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LVRESQGKQEYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVRESQGKQEYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB5 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
790 800 810 820
>>CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 (764 aa)
initn: 4622 init1: 4622 opt: 4622 Z-score: 2763.6 bits: 522.2 E(32554): 1.3e-147
Smith-Waterman score: 4972; 92.9% identity (92.9% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-764)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
:::::::::::
CCDS45 RAISPDSPISQ-------------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ---------THSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
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310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
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pF1KB5 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDF
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490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LVRESQGKQEYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVRESQGKQEYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
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550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
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pF1KB5 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820
pF1KB5 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
730 740 750 760
>>CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 (752 aa)
initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 1727.0 bits: 330.4 E(32554): 7.1e-90
Smith-Waterman score: 4835; 91.5% identity (91.5% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-752)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDF
::::::::::::::::::::
CCDS45 TPTLEILKSHISGIFRPKFS----------------------------------------
430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LVRESQGKQEYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ------------------------------NLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
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550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
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670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
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pF1KB5 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
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:::.:.: ..: .. ..:. :::::: ..:.:: :.:::.:::. :... : . ..
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.. : .:.:: . .::: :::... :::::::::: .:...:...::..:.:
CCDS40 VQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGVH
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::.. :. :. . ..:::: .:: : .. .::.::.:: .: :. .:::..: .. ::
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pF1KB5 FAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQD
::.:::....::::....... :: :: ::: ..::: :: :..:: .:.::: .
CCDS40 HMLHNQYVLALKGAQLHQNQYYDITLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 EVVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLN
:.: .:.:. .. .:.: .::..:. . .. . :: :::::.: :. .:.. :
CCDS40 EIVNVHKEIQMSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQEIEFDTSLLEENENLQANEIMWN
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pF1KB5 ELTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPR-ERVQLLGKRQ
.::.::.: : ....:: . .:.. ..: : .:...... :. . . . : ::...:
CCDS40 NLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSETCEKKSDIVLLLSQKQ
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pF1KB5 VLQEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREG
.:.: :..: :..::..::.:::. :... :::::. ..: .:..: :...
CCDS40 ALEELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERKE--
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 GRTPTLEILKSHISGIFR-PKFSLPPPL--QLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLV
: .: .. :.::.: :: .: ..: .::: :: :::::::: :. :::
CCDS40 -RLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLK
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pF1KB5 HSGDFLVRESQGKQ-EYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQ
..::::::::.:: :::::: :: :::::: .::.::.:: :: .:: :::: .:.
CCDS40 KQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTK
480 490 500 510 520 530
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pF1KB5 QPLTKKSGVVLHRAVPKDK-WVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCR
: .:::::::: .:::: :.:.:::..::: .:.::::::..: :. :.: ::::.:.
CCDS40 QVITKKSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLK-DKTSVAVKTCK
540 550 560 570 580 590
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pF1KB5 ETLPPDLKAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGA
: :: .:: ::::::.:::::.:::::.:::::::.::.::.::::.::::::::: .
CCDS40 EDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLRRKKD
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pF1KB5 RLRVKTLLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVY
.:..: :... :::::: ::::: ::::::::::::: :.::::::::::::.: :::
CCDS40 ELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVY
660 670 680 690 700 710
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pF1KB5 AASGGLRQVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFV
..:: :.:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::. :::...:::.:: :
CCDS40 SSSG-LKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQV
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pF1KB5 EKGGRLPCPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
:.: :. :. ::. . ..: .:: :.: .::.:: . .:: :...
CCDS40 ERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT
780 790 800 810 820
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
:::::::::::
CCDS45 RAISPDSPISQ-------------------------------------------------
70
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pF1KB5 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ---------THSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEASKDKDRDKAKDKYVRSLWKLF
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pF1KB5 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDE
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLNE
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVL
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREGGR
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 TPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDF
::::::::::::::::::::
CCDS45 TPTLEILKSHISGIFRPKFS----------------------------------------
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pF1KB5 LVRESQGKQEYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ------------------------------NLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKK
390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGVVLHRAVPKDKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDL
420 430 440 450 460 470
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTL
480 490 500 510 520 530
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLR
540 550 560 570 580 590
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLP
600 610 620 630 640 650
790 800 810 820
pF1KB5 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
660 670 680 690
>>CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 (453 aa)
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pF1KB5 LCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSS--SEQEREGGRTPTLEILK
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CCDS78 MEQKMKCPHCKDQLESGFGSQSCKTCALMFSSEPSTSEVHRDQERKE-RLSKFESIR
10 20 30 40 50
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pF1KB5 SHISGIFR-PKFSLPPPL--QLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLVHSGDFLVRES
:.::.: :: .: ..: .::: :: :::::::: :. ::: ..::::::::
CCDS78 HSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDFLVRES
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 QGKQ-EYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQQPLTKKSGVV
.:: :::::: :: :::::: .::.::.:: :: .:: :::: .:.: .:::::::
CCDS78 HGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITKKSGVV
120 130 140 150 160 170
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LHRAVPKDK-WVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCRETLPPDLKAK
: .:::: :.:.:::..::: .:.::::::..: :. :.: ::::.:.: :: .:: :
CCDS78 LLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLK-DKTSVAVKTCKEDLPQELKIK
180 190 200 210 220 230
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 FLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGARLRVKTLLQM
:::::.:::::.:::::.:::::::.::.::.::::.::::::::: . .:..: :...
CCDS78 FLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLRRKKDELKLKQLVKF
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 VGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVYAASGGLRQVP
:::::: ::::: ::::::::::::: :.::::::::::::.: :::..:: :.:.:
CCDS78 SLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVYSSSG-LKQIP
300 310 320 330 340 350
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 VKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLPCPE
.:::::::::::::::::::::::::::::::::. :::...:::.:: ::.: :. :.
CCDS78 IKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQ
360 370 380 390 400 410
790 800 810 820
pF1KB5 LCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQSIRKRHR
::. . ..: .:: :.: .::.:: . .:: :...
CCDS78 HCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT
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pF1KB5 QEREGGRTPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAEL
: . : :.. :... :::: . : ..::
CCDS35 ITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNS-LEKHSWYHGPVSR-NAAEY
90 100 110 120 130
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pF1KB5 LVHSG---DFLVRESQGKQ-EYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDN--LYRLEGEGFPSIPLLI
:. :: .::::::... . .:. ..: :. :.. .. :: : .. :.
CCDS35 LLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELV
140 150 160 170 180 190
530 540 550 560 570
pF1KB5 DH-------LLST-QQPLTKKSGVVLHRAVPK-DKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSG
: :..: . : :.. ... . :. ::: ... :... ...: :..:::. :
CCDS35 HHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEG
200 210 220 230 240 250
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 RLRADNTLVAVKSCRE-TLPPDLKAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVME
. . ::::. .: :. . .::.:: ..:. .:::.:.:.::::.. :.::. :
CCDS35 VWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVE---EFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITE
260 270 280 290 300 310
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 LVQGGDFLTFLRTEGARLRVKT--LLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKN
.. :..: .:: : : .:.. :: :. . ...:::::.: :::::::::::: :..
CCDS35 FMTYGNLLDYLR-ECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENH
320 330 340 350 360 370
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 VLKISDFGMSREEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFS
..:..:::.:: . .:.: .: . :.::::::.: :...: .::::.::.:::: .
CCDS35 LVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAK-FPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIAT
380 390 400 410 420 430
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 LGASPYPNLSNQQTREFVEKGGRLPCPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSTIYQELQ
: ::::... .:. :..:: :. :: ::. :..::. :: ..:..::::. :.: ..
CCDS35 YGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFE
440 450 460 470 480 490
820
pF1KB5 SIRKRHR
..
CCDS35 TMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVSTLLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSK
500 510 520 530 540 550
>>CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149 aa)
initn: 835 init1: 484 opt: 832 Z-score: 512.4 bits: 106.2 E(32554): 3.2e-22
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420 430 440 450 460 470
pF1KB5 QEREGGRTPTLEILKSHISGIFRPKFSLPPPLQLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAEL
: . : :.. :... :::: . : ..::
CCDS35 ITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNS-LEKHSWYHGPVSR-NAAEY
110 120 130 140 150
480 490 500 510 520
pF1KB5 LVHSG---DFLVRESQGKQ-EYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDN--LYRLEGEGFPSIPLLI
:. :: .::::::... . .:. ..: :. :.. .. :: : .. :.
CCDS35 LLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELV
160 170 180 190 200 210
530 540 550 560 570
pF1KB5 DH-------LLST-QQPLTKKSGVVLHRAVPK-DKWVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSG
: :..: . : :.. ... . :. ::: ... :... ...: :..:::. :
CCDS35 HHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEG
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 RLRADNTLVAVKSCRE-TLPPDLKAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVME
. . ::::. .: :. . .::.:: ..:. .:::.:.:.::::.. :.::. :
CCDS35 VWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVE---EFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITE
280 290 300 310 320 330
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 LVQGGDFLTFLRTEGARLRVKT--LLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKN
.. :..: .:: : : .:.. :: :. . ...:::::.: :::::::::::: :..
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:
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CCDS44 HHHSTVADGLVTTLHYPAPKCNKPTVYGVSPIHDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYVG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]