Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5744
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5744, 746 aa
1>>>pF1KB5744 746 - 746 aa - 746 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1443+/-0.000481; mu= 16.2342+/- 0.030
mean_var=112.9952+/-21.900, 0's: 0 Z-trim(110.6): 131 B-trim: 420 in 1/56
Lambda= 0.120655
statistics sampled from 18852 (19008) to 18852 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 10.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha pr ( 746) 5111 901.8 0
XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 774) 4972 877.7 0
XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 705) 4773 843.0 0
NP_001295100 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta ( 700) 1786 323.0 2.5e-87
NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta iso ( 701) 1786 323.0 2.5e-87
XP_011524315 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 628) 918 171.9 7.1e-42
XP_011524316 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 577) 607 117.7 1.3e-25
NP_001002036 (OMIM: 608860) astacin-like metalloen ( 431) 423 85.6 4.6e-16
XP_011509508 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 432) 423 85.6 4.7e-16
XP_011509507 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 436) 423 85.6 4.7e-16
XP_011542919 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 622) 375 77.4 2e-13
XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 375 77.4 2.2e-13
NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 375 77.5 2.2e-13
XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 375 77.5 2.4e-13
NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 375 77.6 2.8e-13
NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 369 76.5 5.9e-13
NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like pr ( 392) 362 75.0 6.8e-13
XP_016864059 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 964) 362 75.3 1.3e-12
NP_036596 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like prote (1013) 362 75.3 1.4e-12
XP_011509510 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 252) 345 71.8 3.8e-12
XP_011509509 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 418) 346 72.2 4.9e-12
XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 837) 334 70.4 3.5e-11
NP_705691 (OMIM: 609626) MAM domain-containing gly ( 955) 239 53.9 3.7e-06
XP_016866223 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 961) 239 53.9 3.7e-06
XP_006715119 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 973) 239 53.9 3.7e-06
NP_694999 (OMIM: 612879) MAM domain-containing pro ( 686) 208 48.4 0.00012
>>NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha precur (746 aa)
initn: 5111 init1: 5111 opt: 5111 Z-score: 4816.3 bits: 901.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5111; 99.7% identity (99.9% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLYPNSGESSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::::
NP_005 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLYPNSRESSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
730 740
>>XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A subuni (774 aa)
initn: 4972 init1: 4972 opt: 4972 Z-score: 4685.3 bits: 877.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5045; 96.1% identity (96.3% similar) in 774 aa overlap (1-746:1-774)
10 20 30
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVP----------------------------IKYLPEENV
::::::::::::::::::::::: :::::::::
XP_011 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPVSRVLLFGYLEILILVYIIHFLYIYFFQIKYLPEENV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 HDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 GAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYIIFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYIIFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 IEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 HYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 KANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLES
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 RILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVVWVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVVWVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAH
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pF1KB5 VVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGD
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460 470 480 490 500 510
pF1KB5 KLQSPRFYNSEGYGFGLTLYPNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILD
::::::::::::::::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLQSPRFYNSEGYGFGVTLYPNSRESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILD
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pF1KB5 QEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAINDTVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAINDTVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFIS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 HQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGK
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640 650 660 670 680 690
pF1KB5 AMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMA
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700 710 720 730 740
pF1KB5 SCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLGMVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLGMVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
730 740 750 760 770
>>XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A subuni (705 aa)
initn: 4773 init1: 4773 opt: 4773 Z-score: 4498.7 bits: 843.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4773; 99.7% identity (99.9% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG
190 200 210 220 230 240
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pF1KB5 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV
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310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV
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pF1KB5 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY
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pF1KB5 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLYPNSGESSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::::
XP_011 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLYPNSRESSG
430 440 450 460 470 480
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pF1KB5 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRASIWLRLSQS
670 680 690 700
730 740
pF1KB5 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
>>NP_001295100 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta isof (700 aa)
initn: 1630 init1: 599 opt: 1786 Z-score: 1688.7 bits: 323.0 E(85289): 2.5e-87
Smith-Waterman score: 1847; 40.4% identity (66.0% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-681)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI
: : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.:::
NP_001 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES
:... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::.
NP_001 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV
.:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.::::::
NP_001 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN
: ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:.
NP_001 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ
..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ...
NP_001 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP
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