FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5742, 741 aa 1>>>pF1KB5742 741 - 741 aa - 741 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9699+/-0.00065; mu= 2.3147+/- 0.039 mean_var=345.5543+/-75.935, 0's: 0 Z-trim(113.3): 393 B-trim: 1136 in 2/49 Lambda= 0.068995 statistics sampled from 22125 (22595) to 22125 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16 Scan time: 8.610 The best scores are: opt bits E(85289) NP_066956 (OMIM: 180435,601518) 2-5A-dependent rib ( 741) 4947 508.1 5.2e-143 XP_011542148 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1301) 345 50.3 5.8e-05 XP_006716326 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1316) 345 50.3 5.8e-05 XP_011542147 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1316) 345 50.3 5.8e-05 NP_003738 (OMIM: 603303) tankyrase-1 [Homo sapiens (1327) 345 50.3 5.9e-05 XP_011538517 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 ( 695) 329 48.4 0.00012 XP_016872188 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1059) 329 48.6 0.00015 NP_079511 (OMIM: 607128) tankyrase-2 [Homo sapiens (1166) 329 48.7 0.00016 XP_011538515 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1187) 329 48.7 0.00016 XP_016872189 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 ( 977) 306 46.3 0.00071 XP_016872186 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1062) 306 46.3 0.00075 XP_016872187 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1062) 306 46.3 0.00075 XP_016872185 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1169) 306 46.4 0.0008 XP_005270242 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1190) 306 46.4 0.00081 XP_011542149 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1223) 304 46.2 0.00094 NP_001188894 (OMIM: 605760) ankyrin repeat and SOC ( 445) 267 42.0 0.0065 NP_665862 (OMIM: 605760) ankyrin repeat and SOCS b ( 445) 267 42.0 0.0065 NP_057199 (OMIM: 605760) ankyrin repeat and SOCS b ( 518) 267 42.1 0.0071 XP_011541040 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 702) 269 42.4 0.0075 NP_848605 (OMIM: 608774) ankyrin repeat and protei ( 765) 269 42.5 0.0079 XP_011541039 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 766) 269 42.5 0.0079 XP_016872964 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 775) 269 42.5 0.008 XP_011541038 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 776) 269 42.5 0.008 >>NP_066956 (OMIM: 180435,601518) 2-5A-dependent ribonuc (741 aa) initn: 4947 init1: 4947 opt: 4947 Z-score: 2688.5 bits: 508.1 E(85289): 5.2e-143 Smith-Waterman score: 4947; 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XP_006 AEYLLEHGADVNAQDKGGLIPLHNAASYGHVD-IAALLIKYNTCVNATDKWAFTPLHEAA 860 870 880 890 900 910 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ELKLKKIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSS . .. :: .:: XP_006 QKGRTQLCALLLAHGADPTMKNQEGQTPLDLATADDIRALLIDAMPPEALPTCFKPQATV 920 930 940 950 960 970 >-- initn: 458 init1: 200 opt: 344 Z-score: 209.5 bits: 50.2 E(85289): 6.2e-05 Smith-Waterman score: 344; 32.4% identity (59.8% similar) in 281 aa overlap (29-297:186-459) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEG :..: .: ::. :..:... :::: .. : XP_006 AAGVSSTAPLGPGAAGPGTGVPAVSGALRELLEACRNGDVSRVKRLVDA-ANVNAKDMAG 160 170 180 190 200 210 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GWT-PLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGAD . ::: :. ..:.:.:: ::. ::. : .: :. : : .....:.: .::: XP_006 RKSSPLHFAAGFGRKDVVEHLLQMGANVHARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVSLLLCQGAD 220 230 240 250 260 270 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATA------ : : ...: . :::. ::. . : ..::. :.: .. : .: : XP_006 PNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIVLLQHGADPNIRNTDGKSALDLADPSAKAVLTGEY 280 290 300 310 320 330 180 190 200 210 220 pF1KB5 ----LMDAAEKGHVEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAITHLLL :..::..:. : : :: .... .: : ::.. .: :.. . :. :..::: XP_006 KKDELLEAARSGNEEKLMALLTPLNVNCHASD--GRKSTPLH--LAAGYNRVR-IVQLLL 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 DHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLK .:::::... . : .:: : : : .:: .. .: : : : :. . XP_006 QHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYE-VTELLLKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRV 390 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 KIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAA .. :: ..:: XP_006 EVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTYEFKGHSLLQAAREADLAKVKKT 450 460 470 480 490 500 >>XP_011542147 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 iso (1316 aa) initn: 538 init1: 208 opt: 345 Z-score: 210.0 bits: 50.3 E(85289): 5.8e-05 Smith-Waterman score: 387; 33.6% identity (61.2% similar) in 286 aa overlap (26-297:651-927) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQE .. :..: . :.. :.:: .. ::: .. XP_011 SLQGFTAAQMGNEAVQQILSESTPIRTSDVDYRLLEASKAGDLETVKQLC-SSQNVNCRD 630 640 650 660 670 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 EEGGW-TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSK :: :::: :. ..: ..:: ::.:::: . :.: .:. : : .. .:.. . XP_011 LEGRHSTPLHFAAGYNRVSVVEYLLHHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVAELLVRH 680 690 700 710 720 730 120 130 140 150 160 pF1KB5 GADVNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGAN-----------VNLRRKTKEDQER ::.:: :.. :: . :::. :: . :.: :.::. ..: .. : . XP_011 GASVNVADLWKFTPLHEAAAKGKYEICKLLLKHGADPTKKNRDGNTPLDLVKEGDTDIQD 740 750 760 770 780 790 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 LRKGGATALMDAAEKGHV-EVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAI : .: : ::.:::.:: . .: :. : ..: :..:::. .: :.. ...: . XP_011 LLRGDA-ALLDAAKKGCLARVQKLCTPE---NINCRDTQGRNSTPLH--LAAGYNNLE-V 800 810 820 830 840 850 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 THLLLDHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAV .. ::.::::::.. . : :: :. :. . :: . . .: ::. . : : :. XP_011 AEYLLEHGADVNAQDKGGLIPLHNAASYGHVD-IAALLIKYNTCVNATDKWAFTPLHEAA 860 870 880 890 900 910 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ELKLKKIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSS . .. :: .:: XP_011 QKGRTQLCALLLAHGADPTMKNQEGQTPLDLATADDIRALLIDAMPPEALPTCFKPQATV 920 930 940 950 960 970 >-- initn: 458 init1: 200 opt: 344 Z-score: 209.5 bits: 50.2 E(85289): 6.2e-05 Smith-Waterman score: 344; 32.4% identity (59.8% similar) in 281 aa overlap (29-297:186-459) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEG :..: .: ::. :..:... :::: .. : XP_011 AAGVSSTAPLGPGAAGPGTGVPAVSGALRELLEACRNGDVSRVKRLVDA-ANVNAKDMAG 160 170 180 190 200 210 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GWT-PLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGAD . ::: :. ..:.:.:: ::. ::. : .: :. : : .....:.: .::: XP_011 RKSSPLHFAAGFGRKDVVEHLLQMGANVHARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVSLLLCQGAD 220 230 240 250 260 270 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATA------ : : ...: . :::. ::. . : ..::. :.: .. : .: : XP_011 PNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIVLLQHGADPNIRNTDGKSALDLADPSAKAVLTGEY 280 290 300 310 320 330 180 190 200 210 220 pF1KB5 ----LMDAAEKGHVEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAITHLLL :..::..:. : : :: .... .: : ::.. .: :.. . :. :..::: XP_011 KKDELLEAARSGNEEKLMALLTPLNVNCHASD--GRKSTPLH--LAAGYNRVR-IVQLLL 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 DHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLK .:::::... . : .:: : : : .:: .. .: : : : :. . XP_011 QHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYE-VTELLLKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRV 390 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 KIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAA .. :: ..:: XP_011 EVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTYEFKGHSLLQAAREADLAKVKKT 450 460 470 480 490 500 >>NP_003738 (OMIM: 603303) tankyrase-1 [Homo sapiens] (1327 aa) initn: 538 init1: 208 opt: 345 Z-score: 210.0 bits: 50.3 E(85289): 5.9e-05 Smith-Waterman score: 387; 33.6% identity (61.2% similar) in 286 aa overlap (26-297:651-927) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQE .. :..: . :.. :.:: .. ::: .. NP_003 SLQGFTAAQMGNEAVQQILSESTPIRTSDVDYRLLEASKAGDLETVKQLC-SSQNVNCRD 630 640 650 660 670 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 EEGGW-TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSK :: :::: :. ..: ..:: ::.:::: . :.: .:. : : .. .:.. . 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NP_003 AEYLLEHGADVNAQDKGGLIPLHNAASYGHVD-IAALLIKYNTCVNATDKWAFTPLHEAA 860 870 880 890 900 910 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ELKLKKIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSS . .. :: .:: NP_003 QKGRTQLCALLLAHGADPTMKNQEGQTPLDLATADDIRALLIDAMPPEALPTCFKPQATV 920 930 940 950 960 970 >-- initn: 458 init1: 200 opt: 344 Z-score: 209.5 bits: 50.2 E(85289): 6.3e-05 Smith-Waterman score: 344; 32.4% identity (59.8% similar) in 281 aa overlap (29-297:186-459) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEG :..: .: ::. :..:... :::: .. : NP_003 AAGVSSTAPLGPGAAGPGTGVPAVSGALRELLEACRNGDVSRVKRLVDA-ANVNAKDMAG 160 170 180 190 200 210 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GWT-PLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGAD . ::: :. ..:.:.:: ::. ::. : .: :. : : .....:.: .::: NP_003 RKSSPLHFAAGFGRKDVVEHLLQMGANVHARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVSLLLCQGAD 220 230 240 250 260 270 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATA------ : : ...: . :::. ::. . : ..::. :.: .. : .: : NP_003 PNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIVLLQHGADPNIRNTDGKSALDLADPSAKAVLTGEY 280 290 300 310 320 330 180 190 200 210 220 pF1KB5 ----LMDAAEKGHVEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAITHLLL :..::..:. : : :: .... .: : ::.. .: :.. . :. :..::: NP_003 KKDELLEAARSGNEEKLMALLTPLNVNCHASD--GRKSTPLH--LAAGYNRVR-IVQLLL 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 DHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLK .:::::... . : .:: : : : .:: .. .: : : : :. . NP_003 QHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYE-VTELLLKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRV 390 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 KIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAA .. :: ..:: NP_003 EVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTYEFKGHSLLQAAREADLAKVKKT 450 460 470 480 490 500 >>XP_011538517 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 iso (695 aa) initn: 438 init1: 202 opt: 329 Z-score: 204.5 bits: 48.4 E(85289): 0.00012 Smith-Waterman score: 367; 33.1% identity (60.3% similar) in 287 aa overlap (24-297:20-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEGGW : .. :..:.. ::. :..: .:: .. :: XP_011 MGNENVQQLLQEGISLGNSEADRQLLEAAKAGDVETVKKLCTV-QSVNCRDIEGRQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB5 -TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGADVN :::: :. ..: ..:: ::.:::: . :.: .:. : : .. .:....:: :: XP_011 STPLHFAAGYNRVSVVEYLLQHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVAELLVKHGAVVN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 ECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGAN-----------VNLRRKTKEDQERLRKGG :.. :: . :::. :: . :.: ..::. ..: . : . : .: XP_011 VADLWKFTPLHEAAAKGKYEICKLLLQHGADPTKKNRDGNTPLDLVKDGDTDIQDLLRGD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 ATALMDAAEKGHVEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAITHLLLD : ::.:::.:: . .: : . .:: :..::.. .: :.. ...: ... ::. 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