Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5686
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5686, 480 aa
1>>>pF1KB5686 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6952+/-0.000844; mu= 16.6841+/- 0.051
mean_var=84.3434+/-16.478, 0's: 0 Z-trim(108.6): 57 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.139652
statistics sampled from 10290 (10347) to 10290 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 480) 3231 660.8 8.9e-190
CCDS45400.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 453) 3026 619.5 2.3e-177
CCDS66930.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 300) 1771 366.5 2.2e-101
CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 428 96.0 8e-20
CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 428 96.1 8.6e-20
CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 416 93.6 3.7e-19
CCDS10726.1 DNAJA2 gene_id:10294|Hs108|chr16 ( 412) 416 93.6 4.2e-19
CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 378 85.9 7.3e-17
CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 345 79.3 7.3e-15
CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 338 77.8 1.5e-14
CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 338 77.8 1.9e-14
CCDS3277.1 DNAJB11 gene_id:51726|Hs108|chr3 ( 358) 329 76.1 7.1e-14
CCDS45316.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 397) 327 75.7 1e-13
CCDS10299.2 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 426) 327 75.7 1.1e-13
CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9 ( 397) 324 75.1 1.6e-13
CCDS5752.1 DNAJB9 gene_id:4189|Hs108|chr7 ( 223) 304 70.9 1.6e-12
CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 301 70.3 2.9e-12
CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 301 70.4 3.3e-12
CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 296 69.4 6.4e-12
CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 287 67.5 1.8e-11
CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 282 66.5 4.6e-11
CCDS30606.1 DNAJC16 gene_id:23341|Hs108|chr1 ( 782) 285 67.4 6.2e-11
CCDS7316.2 DNAJB12 gene_id:54788|Hs108|chr10 ( 409) 281 66.4 6.5e-11
>>CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 (480 aa)
initn: 3231 init1: 3231 opt: 3231 Z-score: 3520.6 bits: 660.8 E(32554): 8.9e-190
Smith-Waterman score: 3231; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAARCSTRWLLVVVGTPRLPAISGRGARPPREGVVGAWLSRKLSVPAFASSLTSCGPRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAARCSTRWLLVVVGTPRLPAISGRGARPPREGVVGAWLSRKLSVPAFASSLTSCGPRAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGSQHSYWKGGPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGSQHSYWKGGPTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQAKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQAKQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS
430 440 450 460 470 480
>>CCDS45400.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 (453 aa)
initn: 3026 init1: 3026 opt: 3026 Z-score: 3297.8 bits: 619.5 E(32554): 2.3e-177
Smith-Waterman score: 3026; 100.0% identity (100.0% similar) in 447 aa overlap (1-447:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAARCSTRWLLVVVGTPRLPAISGRGARPPREGVVGAWLSRKLSVPAFASSLTSCGPRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAARCSTRWLLVVVGTPRLPAISGRGARPPREGVVGAWLSRKLSVPAFASSLTSCGPRAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGSQHSYWKGGPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGSQHSYWKGGPTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQAKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQAKQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGKRSTGN
430 440 450
>>CCDS66930.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 (300 aa)
initn: 1771 init1: 1771 opt: 1771 Z-score: 1933.8 bits: 366.5 E(32554): 2.2e-101
Smith-Waterman score: 1771; 99.6% identity (100.0% similar) in 262 aa overlap (186-447:33-294)
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AYGSAGFDPGASGSQHSYWKGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMEL
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EPQAERPRLCVFPDLLRPPSAADIETWCQPYRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMEL
10 20 30 40 50 60
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 TFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTC
70 80 90 100 110 120
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 RRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQK
130 140 150 160 170 180
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 SPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPR
190 200 210 220 230 240
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 INSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQQSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 INSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQQSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGKRSTGN
250 260 270 280 290 300
460 470 480
pF1KB5 GSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS
>>CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (420 aa)
initn: 353 init1: 162 opt: 428 Z-score: 469.3 bits: 96.0 E(32554): 8e-20
Smith-Waterman score: 445; 30.9% identity (54.3% similar) in 392 aa overlap (61-424:42-413)
40 50 60 70 80
pF1KB5 REGVVGAWLSRKLSVPAFASSLTSCGPRALLTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSA-PL
. :.: ..: . : :. . .::: :.
CCDS47 PAAPPLQARGAFRSFPHSWGEDFLASLMFKIQLEP-LKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPV
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 A--KEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYHPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSD
: .:::.:::.: .:.. :::::: ..: ::::: ::. :.:.:::...::::.::::
CCDS47 AVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKE-PNAEEKFKEIAEAYDVLSD
80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 EVKRKQYDAYGSAGFDPG------ASGSQHSYWKGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDF
:: :: :: :. : .::: : ..: ::. : ..:: .:. : :
CCDS47 PKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHG----DPHATFASFFG--GSNPFDIF
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250
pF1KB5 --QTVFDQPQEYF----MELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQH---
.. .: : :.. .. :. .: : .. : . : :::
CCDS47 FASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPV
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300
pF1KB5 CHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSII-----ISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIP
: : : . . :. : :: . : . : :. :: :. .. .:
CCDS47 VHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKILHIVIKRGW---KEGTKITFP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQG
. :. .:. .: .... . :::::... . .::. .:: : :.
CCDS47 KEG---DATPDNIPA---DIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLKEALCGCTVNIPT
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LYETI-----NVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQQS
. . : .: ::: ...: : .:.. . :: ...:.: : ::: . ..
CCDS47 IDGRVIPLPCNDVIKPGTV--KRLRGEGLPFPKVPTQ-RGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS
..
CCDS47 ILKQHLPCS
420
>>CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (462 aa)
initn: 376 init1: 162 opt: 428 Z-score: 468.8 bits: 96.1 E(32554): 8.6e-20
Smith-Waterman score: 445; 30.9% identity (54.3% similar) in 392 aa overlap (61-424:84-455)
40 50 60 70 80
pF1KB5 REGVVGAWLSRKLSVPAFASSLTSCGPRALLTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSA-PL
. :.: ..: . : :. . .::: :.
CCDS47 TAAPPLQARGAFRSFPHSWGEDFLASLMFKIQLEP-LKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPV
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 A--KEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYHPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSD
: .:::.:::.: .:.. :::::: ..: ::::: ::. :.:.:::...::::.::::
CCDS47 AVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKE-PNAEEKFKEIAEAYDVLSD
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 EVKRKQYDAYGSAGFDPG------ASGSQHSYWKGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDF
:: :: :: :. : .::: : ..: ::. : ..:: .:. : :
CCDS47 PKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHG----DPHATFASFFG--GSNPFDIF
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KB5 --QTVFDQPQEYF----MELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQH---
.. .: : :.. .. :. .: : .. : . : :::
CCDS47 FASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPV
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300
pF1KB5 CHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSII-----ISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIP
: : : . . :. : :: . : . : :. :: :. .. .:
CCDS47 VHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKILHIVIKRGW---KEGTKITFP
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQG
. :. .:. .: .... . :::::... . .::. .:: : :.
CCDS47 KEG---DATPDNIPA---DIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLKEALCGCTVNIPT
350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LYETI-----NVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQQS
. . : .: ::: ...: : .:.. . :: ...:.: : ::: . ..
CCDS47 IDGRVIPLPCNDVIKPGTV--KRLRGEGLPFPKVPTQ-RGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQ
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS
..
CCDS47 ILKQHLPCS
460
>>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa)
initn: 353 init1: 162 opt: 416 Z-score: 457.4 bits: 93.6 E(32554): 3.7e-19
Smith-Waterman score: 433; 31.3% identity (54.2% similar) in 358 aa overlap (92-424:3-341)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYH
.:::.:::.: .:.. :::::: ..: :::
CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYH
10 20 30
130 140 150 160 170
pF1KB5 PDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPG------ASGSQHSYWK
:: ::. :.:.:::...::::.:::: :: :: :: :. : .::: : ..
CCDS35 PDKNKE-PNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFH
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220
pF1KB5 GGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDF--QTVFDQPQEYF----MELTFNQAAKGVNKEFT
: ::. : ..:: .:. : : .. .: : :.. .. :. .:
CCDS35 G----DPHATFASFFG--GSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFG
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQH---CHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSII-
: .. : . : ::: : : : . . :. : :: . : .
CCDS35 FNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVR
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 ----ISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRR
: :. :: :. .. .: : :. .:. .: .... . :::
CCDS35 TEDKILHIVIKRGW---KEGTKITFP-KEG--DATPDNIPA---DIVFVLKDKPHAHFRR
210 220 230 240 250
350 360 370 380 390
pF1KB5 DGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQGLYETI-----NVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRI
::... . .::. .:: : :. . . : .: ::: ...: : .:..
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400 410 420 430 440 450
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. :: ...:.: : ::: . ....
CCDS35 PTQ-RGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQILKQHLPCS
320 330 340
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.. :.. : :.:.:.. :. ::.: : : :.. . . .: . :.:.: :.:.:
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.: : :.: :. : . . : :.. :: . . : : .: . ..
CCDS10 EVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQ
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CCDS10 EKEHEVFQRDGNDLHMTYKIGLVEALCGFQFTFKHLDGRQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVR
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:.:.:. : . :: ::.. .. :. :. ..:. : : .. : .. :
CCDS10 GEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPE-VPNIIGETEEVE
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: . .::. :: . :::: .:
CCDS10 L-----QEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEESSSHHGPGVQCAHQ
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CCDS12 VNFGRS--R---SAQEPARKKQDPPVTHDLRVS-LEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSI
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CCDS12 RNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFP---KEGDQTSNNIPADIVFV-LKDKPHNIFKRDGSD
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CCDS12 VIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTIPVVFKDVIRPGMRRKVPGEGLPLPKTPEKRGD
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CCDS12 LIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI
320 330 340
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CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFH
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CCDS68 PDKNKS-PQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFH
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CCDS68 GDPHATFAAFFG--GSNPFEIFFGRRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAFG----FSMNGYPRD
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. : . . : : . .: : .: :. . .: .. : : .
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CCDS68 REALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRR----RIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEF
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CCDS68 EVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS
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CCDS47 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHP
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CCDS47 FRNPDDVFREFFGGRDPFSF-DF---FEDPFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]