Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5347, 435 aa
1>>>pF1KB5347 435 - 435 aa - 435 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5446+/-0.00102; mu= 15.5393+/- 0.061
mean_var=59.5763+/-11.724, 0's: 0 Z-trim(103.0): 35 B-trim: 0 in 0/46
Lambda= 0.166164
statistics sampled from 7196 (7227) to 7196 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 435) 2880 699.1 2.1e-201
CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 423) 1600 392.3 4.9e-109
CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 423) 1351 332.6 4.5e-91
CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 425) 1327 326.8 2.5e-89
CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 433) 1078 267.2 2.3e-71
CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 435) 1072 265.7 6.3e-71
CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 460) 1014 251.8 1e-66
CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 ( 453) 409 106.8 4.6e-23
CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 ( 418) 273 74.2 2.8e-13
CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 ( 418) 262 71.5 1.7e-12
>>CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 (435 aa)
initn: 2880 init1: 2880 opt: 2880 Z-score: 3729.2 bits: 699.1 E(32554): 2.1e-201
Smith-Waterman score: 2880; 100.0% identity (100.0% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
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CCDS46 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPW
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB5 VRYITQNGDYQLRTQ
:::::::::::::::
CCDS46 VRYITQNGDYQLRTQ
430
>>CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 (423 aa)
initn: 2770 init1: 1600 opt: 1600 Z-score: 2071.1 bits: 392.3 E(32554): 4.9e-109
Smith-Waterman score: 2750; 97.2% identity (97.2% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKS
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LL------------VSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKS
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSH
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPW
350 360 370 380 390 400
430
pF1KB5 VRYITQNGDYQLRTQ
:::::::::::::::
CCDS12 VRYITQNGDYQLRTQ
410 420
>>CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 (423 aa)
initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1748.5 bits: 332.6 E(32554): 4.5e-91
Smith-Waterman score: 2269; 77.6% identity (92.6% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
::::::..::.::: :: :::.::: ::..:::::.:...:::: :.:.:.:: :.:.::
CCDS45 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
::.:::::::..::: .:::.:::::...:: :::::::::::::::::.::::::::::
CCDS45 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
:.:::::::::::::::...::::: : : :::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS45 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKS
:: :.:::.:: :::::.::..:::::::::::::::.:::. :::.:.
CCDS45 LL------------VNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGRSKN
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSH
:::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:.::::::::::::: ::
CCDS45 KSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSH
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSF
::.: :.:::.:::..:.::.::: .:::.:::::.:::.:::.:.::: . ..::::::
CCDS45 SRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPW
:::::::::::::::::: :. ::.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS45 PGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPW
350 360 370 380 390 400
430
pF1KB5 VRYITQNGDYQLRTQ
::::::.:::::::
CCDS45 VRYITQSGDYQLRTS
410 420
>>CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 (425 aa)
initn: 2070 init1: 1131 opt: 1327 Z-score: 1717.4 bits: 326.8 E(32554): 2.5e-89
Smith-Waterman score: 2245; 77.1% identity (92.0% similar) in 436 aa overlap (1-434:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
::::::..::.::: :: :::.::: ::..:::::.:...:::: :.:.:.:: :.:.::
CCDS77 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
::.:::::::..::: .:::.:::::...:: :::::::::::::::::.::::::::::
CCDS77 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN
:.:::::::::::::::...::::: : : :::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS77 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB5 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRG--
:: :.:::.:: :::::.::..:::::::::::::::.:::. :: .
CCDS77 LL------------VNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGS
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKH
:.:::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:.:::::::::::::
CCDS77 KNKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIK
::::.: :.:::.:::..:.::.::: .:::.:::::.:::.:::.:.::: . ..::::
CCDS77 SHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQAL
:::::::::::::::::::: :. ::.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::
CCDS77 SFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQAL
350 360 370 380 390 400
420 430
pF1KB5 PWVRYITQNGDYQLRTQ
::::::::.:::::::
CCDS77 PWVRYITQSGDYQLRTS
410 420
>>CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (433 aa)
initn: 1063 init1: 365 opt: 1078 Z-score: 1394.6 bits: 267.2 E(32554): 2.3e-71
Smith-Waterman score: 1078; 39.1% identity (71.3% similar) in 442 aa overlap (6-433:5-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
... . ::.::: : :: :. . :. : ... ... . ::. . . :. .
CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
:..:..:.:..:.:. ...:: ::::. .:.. :: .. ::.:..:::.:::::::..::
CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPAT--VTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIES
::::.... :. .:::.: : .: . : ::. ..:: ::::::.::.::::.::
CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLES
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRG
:::: .: .:.:: ... : . :. .:::::: ..:.:::..... :.:
CCDS43 VNLL------------MSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ------KS--KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIW
:: .:. ..: ::::::::.:...:.::::::::::::: :: . . .
CCDS43 TADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPEN
. .... .....: . ::.:: :...:..::.: .... . :..:. .
CCDS43 VIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKII
. :::.:: . : :: . :.. : .. . : ..::::..::.: :. ::..:::::..
CCDS43 NAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVF
350 360 370 380 390 400
420 430
pF1KB5 EK----SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ
: : .... ::::: ..: :. :
CCDS43 EPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC
410 420 430
>>CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (435 aa)
initn: 953 init1: 545 opt: 1072 Z-score: 1386.8 bits: 265.7 E(32554): 6.3e-71
Smith-Waterman score: 1072; 38.5% identity (70.9% similar) in 444 aa overlap (6-433:5-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
... . ::.::: : :: :. . :. : ... ... . ::. . . :. .
CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
:..:..:.:..:.:. ...:: ::::. .:.. :: .. ::.:..:::.:::::::..::
CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEG----HKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVI
::::.... :. .:::.: :. . . . ::. ..:: ::::::.::.::::.
CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTG
:::::: .: .:.:: ... : . :. .:::::: ..:.:::..... :
CCDS43 ESVNLL------------MSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB5 RG------KS--KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPL
.: :: .:. ..: ::::::::.:...:.::::::::::::: :: . .
CCDS43 KGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 IWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVP
. . .... .....: . ::.:: :...:..::.: .... . :..:.
CCDS43 FRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKA
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLK
.. :::.:: . : :: . :.. : .. . : ..::::..::.: :. ::..:::::
CCDS43 SENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLK
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KB5 IIEK----SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ
..: : .... ::::: ..: :. :
CCDS43 VFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC
410 420 430
>>CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (460 aa)
initn: 936 init1: 545 opt: 1014 Z-score: 1311.3 bits: 251.8 E(32554): 1e-66
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10 20 30 40
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: :. :: .:. .. ... . ::.
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50 60 70 80 90 100
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110 120 130 140 150 160
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CCDS82 IYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIK
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170 180 190 200 210 220
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::.::.::::.:::::: .: .:.:: ... : . :. .:::::: ..:
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230 240 250 260 270
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.:::..... :.: :: .:. ..: ::::::::.:...:.:::::::::::::
CCDS82 MNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELM
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280 290 300 310 320 330
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:: . . . . .... .....: . ::.:: :...:..::.: .... .
CCDS82 RYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQV
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340 350 360 370 380 390
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:..:. .. :::.:: . : :: . :.. : .. . : ..::::..::.: :
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400 410 420 430
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. ::..:::::..: : .... ::::: ..: :. :
CCDS82 APSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC
420 430 440 450 460
>>CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 (453 aa)
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10 20 30 40 50
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: ..:. :: :: ...::: .: : :. : : ::. . : : .:.
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160 170 180 190 200 210
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CCDS56 SEMRIGLTEEFCVGKSELRGYGPGIRVDEVSFHSSVNLDEFESHRILRLQPPQGELTVMR
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280 290 300 310 320 330
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. . . : .. . :.. ::.. .. .:. . ..: .:
CCDS56 SQELSSPEQKAELAEGALRWDLPRVQGGSQLSGLFQMDVPGPPGPPSHGLSTSASPLGLG
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CCDS56 PASLSFELPRHTCSGLQVRFLRLAFRPCGNANPHKWVRHLSHSDAYVIRI
410 420 430 440 450
>>CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 (418 aa)
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10 20 30 40 50 60
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...... .: ... ..... :..: ..:. . . . :... .. :
CCDS73 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI
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CCDS73 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN
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pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN
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CCDS73 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSS-NVGDTLPTGQLSN-IPWRRAGVKYTNN
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CCDS73 EAYFDVVEEIDAI------------IDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNP
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:.: ::.:: :.:..:.:..:..:::::::.:.:.:::.... :
CCDS73 RLLD-------------DVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAI
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.... : :. : .:.. : :... . . .: .:.: : : .: : :
CCDS73 PVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTP----TQG
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CCDS73 SYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQS-GAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGL
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CCDS73 KVNRLDMYGEK-YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT
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CCDS61 MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSV
10 20 30 40 50
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CCDS61 YRHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDN
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pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN
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CCDS61 GFPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTITG-STNVGDQLPTGQLS-VVPWRRTGVKYTNN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EVFLDVIESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDK
:...:::: .. . .. .:... .:: : : : :.:::.: :.. .
CCDS61 EAYFDVIEEIDAI------------IDKSGSTITAEIQGVIDACVKLTGMPDLTLSFMNP
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CCDS61 RLLD-------------DVSFHPCVRFKRWESERILSFIPPDGNFRLLSYHVSAQNLVAI
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CCDS61 PVYVKHNISFRDSSSLGRFEITVGPKQTMGK--TIEGVTVTSQMPKGVLNMSLTPSQGTH
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CCDS61 TFDPVTKMLSWDVGKINPQKLPSLKGTMSLQAGASKPDEN-PTINLQFKIQQLAISGLKV
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CCDS61 NRLDMYGEK-YKPFKGIKYMTKAGKFQVRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]