Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4905
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4905, 352 aa
1>>>pF1KB4905 352 - 352 aa - 352 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9548+/-0.000843; mu= 13.1178+/- 0.050
mean_var=106.0979+/-28.708, 0's: 0 Z-trim(108.6): 280 B-trim: 1299 in 2/48
Lambda= 0.124515
statistics sampled from 9846 (10294) to 9846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 790 152.7 4.4e-37
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CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 480 97.0 2.5e-20
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 462 93.8 2.4e-19
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 447 91.1 1.7e-18
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CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 437 89.3 6e-18
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 435 88.9 6.9e-18
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CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 420 86.3 4.8e-17
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CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 417 85.7 6.8e-17
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 415 85.3 8.4e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 412 84.8 1.2e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 406 83.7 2.6e-16
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 404 83.4 3.7e-16
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 403 83.2 3.8e-16
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 402 83.0 4.5e-16
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 401 82.8 4.8e-16
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CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 399 82.5 6.3e-16
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 398 82.3 7.5e-16
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 394 81.6 1.2e-15
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 393 81.4 1.3e-15
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 393 81.4 1.3e-15
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 391 81.0 1.7e-15
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 391 81.0 1.7e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 390 80.9 1.9e-15
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 389 80.7 2.2e-15
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 388 80.5 2.4e-15
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 388 80.5 2.4e-15
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 388 80.5 2.4e-15
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 388 80.5 2.6e-15
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 384 79.8 4.2e-15
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 383 79.6 4.5e-15
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 383 79.6 4.7e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 381 79.3 6.1e-15
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 381 79.3 6.2e-15
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CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 380 79.1 6.7e-15
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 379 78.9 7.4e-15
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 379 78.9 7.5e-15
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 378 78.7 9.2e-15
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 374 78.0 1.4e-14
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 373 77.8 1.5e-14
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 371 77.4 1.9e-14
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 369 77.1 2.7e-14
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 368 76.9 2.9e-14
>>CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 (352 aa)
initn: 2241 init1: 2241 opt: 2241 Z-score: 2188.0 bits: 413.4 E(32554): 1.5e-115
Smith-Waterman score: 2241; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 ALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWKTNMSLCFPRYPSEGHRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 RPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWKTNMSLCFPRYPSEGHRAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 NLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB4 VAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 VAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN
310 320 330 340 350
>>CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 (358 aa)
initn: 716 init1: 379 opt: 790 Z-score: 779.2 bits: 152.7 E(32554): 4.4e-37
Smith-Waterman score: 796; 45.7% identity (71.1% similar) in 322 aa overlap (21-336:25-331)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSIL--KRMQKRSVTA
:..::.. : :::::.:::::. . . : ..:
CCDS96 MSVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALL--GLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAA
10 20 30 40 50
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pF1KB4 LMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSMYASVLLITAMSLD
.::.::::: :::: .:.:. ::.. .: .: :::. .:::..:::::::: .::.
CCDS96 TLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQAGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 RSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWKTNM-SLCFPRYP
: :::.:::.. .::. :.:::.: ..:. ..:::.:. .:: . :. . .:: .:
CCDS96 RCLAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHL--WRDRVCQLC---HP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 SEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF---RRSRRTGRLVVLIILTF
: : : :: .:..:.:.::: ... :: ::.. :. :.. :.:::: :.:.:
CCDS96 SPVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGG
. .: :::.::: .: ::: ..:. .: . :: ::::.:::::::::. ..:
CCDS96 GLLWAPYHAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARAGTTALAFFSSSVNPVLYVFTAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 GLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAALEPGPSESLTASSPLKLNE
:: :: :...:.::.: :: ::: :.. : : :. :
CCDS96 DLLPRAGPRFLTRLFEGSG-EA----RGG--GRS-REGTMELRTTPQLKVVGQGRGNGDP
300 310 320 330 340
pF1KB4 LN
CCDS96 GGGMEKDGPEWDL
350
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
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Smith-Waterman score: 500; 32.1% identity (60.9% similar) in 340 aa overlap (2-331:26-350)
10 20 30
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGN
: : . :: :.. ..:. .: .. :.:: ::
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGAR--AVLVPVLYLLVCAAGLGGN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 SFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYV
..:.. .:. . ..:: ...::::.::. .: ::. : . : :: . ::: .
CCDS10 TLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGPVLCRLVMTL
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100 110 120 130 140 150
pF1KB4 CGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYR
::....::. .:.::.:: :::..:. : . : .:. . :. ::::. .. :.:..
CCDS10 DGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSLCMSLPLLVFA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB4 TVVPWKT-NMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDI-------GRRL
: : : : .:. : : .:. :: ::. :.:.. : : : :.
CCDS10 DVQEGGTCNAS--WPE-PVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKVRAAGVRV
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 QARRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARN
: : :.. :.:....:.::. :::. .::... . :: . :. ::
CCDS10 GCVRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYF--------
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 VLIALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGS-EASSTR-RGGSLGQTAR
.. :.. .: .:::::. . .. .: : : .:.:. .:..:. : . : .
CCDS10 FVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQS--FQKVLCLRKGSGAKDADATEPRPDRIRQQQE
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330 340 350
pF1KB4 SGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN
. : :
CCDS10 ATPPAHRAAANGLMQTSKL
350 360
>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa)
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Smith-Waterman score: 480; 30.9% identity (62.5% similar) in 333 aa overlap (1-324:22-338)
10 20 30
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFV
.:: . . .: : ..::.....:.. ::. ::..:
CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVP--DILALVIFAVVFLVGVLGNALV
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 VWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAP-FFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCG
:: . ::...:. ::::.::. :. : .: .. . : :: :.: . .
CCDS33 VW-VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLIL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 VSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTV
..::::.::....: :: : : .:. :..: ..: . : : :..::. : . ::.:
CCDS33 LNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 ----VPWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHL-IFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF
: :. :: : . .: . : . : ::: :.:... :. : : .::
CCDS33 REEYFPPKV---LCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 RRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIAL
:: .: ..:: .. .: :::::.:... . . .. :. :.:. .. ...
CCDS33 TRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMS---FLEPSSPTFLLLKKLD---SLCVSF
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 AFLSSSVNPVLYACAGGGL---LRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPA
:... .::..:. :: :. ::.. . .::... .: : .:.. :. ..
CCDS33 AYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKS----LPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMA
290 300 310 320 330 340
340 350
pF1KB4 ALEPGPSESLTASSPLKLNELN
CCDS33 QKTQAV
350
>>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa)
initn: 253 init1: 180 opt: 462 Z-score: 460.9 bits: 93.8 E(32554): 2.4e-19
Smith-Waterman score: 466; 31.0% identity (64.5% similar) in 290 aa overlap (10-286:25-304)
10 20 30 40
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSILK
: .:. .......... .:.:. :::.:. ..:
CCDS12 MELAVGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVFGLIFALGVLGNSLVI-TVLA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 RMQK---RSVTALMVLNLALADLAVLL-TAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSM
: . ::.: :..:::..:::: :: :: : :: .: :.. :: :::
CCDS12 RSKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSM
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 YASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVV-P
.:.. ..:::.:: .:... :..::.. : .. ::.::. .:.:: .. . :
CCDS12 LVSIFTLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGVGCIWALSIAMASPVAYHQGLFHP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB4 WKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQAR---RFRRS-
.:...:. ..:. :. ... : :.:::.: . :. . .:. . ..:
CCDS12 RASNQTFCWEQWPDPRHKKAYVVCTFVFGYLLPLLLICFCYAKVLNHLHKKLKNMSKKSE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 ---RRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNL-AEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIA
..:.. :......:. :::.:...: :: : .. :.. : : .
CCDS12 ASKKKTAQTVLVVVVVFGISWLPHHIIHLWAEFG-VFPLTPASF--------LFRITAHC
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 LAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAAL
::. .:::::..::
CCDS12 LAYSNSSVNPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV
300 310 320 330 340
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 510 init1: 319 opt: 447 Z-score: 445.3 bits: 91.1 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 522; 34.5% identity (62.1% similar) in 293 aa overlap (6-285:32-313)
10 20 30
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPG
::.: :. ..: .. :. .::: :
CCDS13 DMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLLG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 NSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHY
::.:.. .:.. . ::: ...::::::: .: ::. : . : :: :::
CCDS13 NSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRLVMA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 VCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAY
: :.....:.. .:.::.:: :::..: : . :: .:: : :..:: : ... ::...
CCDS13 VDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVVVF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB4 RTVVPWKTNMSLCFPRYP--SEGHRAFHLIFEAVTGFLLP-------FLAVVASYSDIGR
. :: .:: : ..: . . :: .:. :. ::. : .: .:.. . ::
CCDS13 -SGVP--RGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGR
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 RLQA----RRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKR
:. : :: : ::. :.:: .. :. :.:..:.:.... : . : .::
CCDS13 RVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLY---
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLG
...:: . .: .::.::
CCDS13 -----FLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEE
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 347 init1: 220 opt: 437 Z-score: 436.3 bits: 89.3 E(32554): 5.5e-18
Smith-Waterman score: 437; 29.5% identity (61.9% similar) in 336 aa overlap (4-332:39-368)
10 20 30
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGL
:: : .....: . : :. . .::
CCDS14 QVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGL
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40 50 60 70 80 90
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::. :. .:.: : : ..:.::.:: ..:: :.. : : :: . :..
CCDS14 LGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWA-VDAAVQWVFGSGLCKVA
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pF1KB4 HYVCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLA--GIWVLSFLLATP
. ....::..::.. .:.:: : ... ..: : :: .:. ..: : .:.: :
CCDS14 GALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVH--ATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALP
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160 170 180 190 200 210
pF1KB4 VLAYRTVV-PWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQA
. . .. . : . : .:. :. :.. ... :.:::::.:... :. : : .
CCDS14 DFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALR-VLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 RRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVL
: .: :. ::::.....:: : :::.: :.. :.. : . : . :...:..:
CCDS14 SRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRES-RVDVAKSVT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KB4 IALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKL----LEGTGSEASSTRRGGSLGQTAR
.:... .::.::: .: . : .. .: .: . ::.:: .: ..:..
CCDS14 SGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKF-RERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSE
310 320 330 340 350 360
330 340 350
pF1KB4 SGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN
.. ..:
CCDS14 ASYSGL
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
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Smith-Waterman score: 437; 29.5% identity (61.9% similar) in 336 aa overlap (4-332:86-415)
10 20 30
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGL
:: : .....: . : :. . .::
CCDS48 QVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGL
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pF1KB4 PGNSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLC
::. :. .:.: : : ..:.::.:: ..:: :.. : : :: . :..
CCDS48 LGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWA-VDAAVQWVFGSGLCKVA
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 HYVCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLA--GIWVLSFLLATP
. ....::..::.. .:.:: : ... ..: : :: .:. ..: : .:.: :
CCDS48 GALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVH--ATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALP
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160 170 180 190 200 210
pF1KB4 VLAYRTVV-PWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQA
. . .. . : . : .:. :. :.. ... :.:::::.:... :. : : .
CCDS48 DFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALR-VLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLV
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 RRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVL
: .: :. ::::.....:: : :::.: :.. :.. : . : . :...:..:
CCDS48 SRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRES-RVDVAKSVT
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320
pF1KB4 IALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKL----LEGTGSEASSTRRGGSLGQTAR
.:... .::.::: .: . : .. .: .: . ::.:: .: ..:..
CCDS48 SGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKF-RERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSE
360 370 380 390 400
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pF1KB4 SGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN
.. ..:
CCDS48 ASYSGL
410
>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa)
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10 20 30 40
pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVW
::: . ....: .:...:.:::..:.:
CCDS23 LEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGV--VHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIW
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pF1KB4 SILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGT-WSFGLAGCRLCHYVCGVS
. :..::.: ::::.::. :: :... ..:.. : ::. :. .. ..
CCDS23 -FTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLN
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pF1KB4 MYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVP
:.:::...:..:::. . . .: .:.. :: . :. ::.:. :.. :.: .: .:
CCDS23 MFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVE
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.. : .::. . :. :.. . . :.:.:.:.. : . ... : .
CCDS23 FN-NHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSIL
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pF1KB4 RSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALA
: : .......:.. : :::. .. : . . . .: :: . ::
CCDS23 ISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTG------LA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 FLSSSVNPVLYACAGGGL---LRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAA
::.: .::.::. . . .::. ::..:. : :.: . :.... :.
CCDS23 FLNSCLNPILYVLISKKFQARFRSS----VAEILKYTLWEVSCS---GTVSEQLRNSETK
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pF1KB4 LEPGPSESLTASSPLKLNELN
CCDS23 NLCLLETAQ
350
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 357 init1: 157 opt: 420 Z-score: 420.0 bits: 86.2 E(32554): 4.5e-17
Smith-Waterman score: 420; 29.5% identity (63.1% similar) in 295 aa overlap (10-294:19-311)
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pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVE-FISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSILKRMQKR
:. : . .: .. : :. ..::. :::.:: : :. .
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
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pF1KB4 SVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLA-QGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSMYASVLLIT
.:.....:::::::: ::: :.. . : . : :: :.. . ..::::.:.:
CCDS31 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT
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pF1KB4 AMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWK-TNMSLC
.:.:: ::...:. :. :: .:. . ::.:. : . :.. .:.: . ::...:
CCDS31 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC
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pF1KB4 FPRYPSEGHR-AFHL-IFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQ-ARRFRRSRRTG----R
.: :.. . : . . . :::.::: ...::. : . :. : ...... . .
CCDS31 AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFK
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pF1KB4 LVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVN
... :.: : :.:... .. .. : : .. .. : . : .:.... .:
CCDS31 IIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQL-GIIRDCR-IADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
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:..:. : . :
CCDS31 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEV
300 310 320 330 340 350
352 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:07:10 2016 done: Sun Nov 6 22:07:11 2016
Total Scan time: 3.020 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]