FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0466, 988 aa
1>>>pF1KB0466 988 - 988 aa - 988 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8661+/-0.000471; mu= -15.4731+/- 0.029
mean_var=548.7422+/-113.996, 0's: 0 Z-trim(123.3): 49 B-trim: 1490 in 1/61
Lambda= 0.054751
statistics sampled from 42777 (42850) to 42777 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.502), width: 16
Scan time: 11.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689618 (OMIM: 604279) junction-mediating and -r ( 988) 6486 527.7 1.2e-148
XP_005248487 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-me ( 947) 4501 370.9 1.8e-101
XP_011541457 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-me ( 956) 4304 355.3 8.6e-97
NP_001073904 (OMIM: 612393) WASP homolog-associate ( 809) 1176 108.2 1.8e-22
XP_005272478 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 596) 1055 98.5 1.1e-19
XP_016877412 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 507) 993 93.6 2.9e-18
XP_005272479 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 579) 907 86.8 3.5e-16
XP_005272480 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 579) 907 86.8 3.5e-16
XP_011519534 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 536) 727 72.6 6.3e-12
>>NP_689618 (OMIM: 604279) junction-mediating and -regul (988 aa)
initn: 6486 init1: 6486 opt: 6486 Z-score: 2790.0 bits: 527.7 E(85289): 1.2e-148
Smith-Waterman score: 6486; 99.9% identity (100.0% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-988)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 LYQLEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LYQMEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KB0 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
970 980
>>XP_005248487 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-mediat (947 aa)
initn: 4750 init1: 4486 opt: 4501 Z-score: 1942.8 bits: 370.9 E(85289): 1.8e-101
Smith-Waterman score: 6122; 95.7% identity (95.9% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-947)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 LYQLEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LYQMEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
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pF1KB0 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
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pF1KB0 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQ--------------------------------
670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ---------VEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
740 750 760 770 780 790
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
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pF1KB0 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
860 870 880 890 900 910
970 980
pF1KB0 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
920 930 940
>>XP_011541457 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-mediat (956 aa)
initn: 4542 init1: 4278 opt: 4304 Z-score: 1858.7 bits: 355.3 E(85289): 8.6e-97
Smith-Waterman score: 6201; 96.7% identity (96.8% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-956)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 LYQLEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LYQMEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQL----
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ----------------------------RYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
870 880 890 900 910 920
970 980
pF1KB0 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
930 940 950
>>NP_001073904 (OMIM: 612393) WASP homolog-associated pr (809 aa)
initn: 1805 init1: 1080 opt: 1176 Z-score: 524.4 bits: 108.2 E(85289): 1.8e-22
Smith-Waterman score: 1579; 36.7% identity (64.2% similar) in 790 aa overlap (214-987:63-808)
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 SASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRAVHQ
: : . :. . :::::.: ::..:.
NP_001 AWNGAEGKFAVTCHDRTAQQRRLREGARLGPEPEPKPEAAVSPSSWAGLLSAAGLRGAHR
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290
pF1KB0 QLCSVNSQLEPCLPVFPEEPS-----------GMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVY
:: .. :: :.: .: : . :.:..:. : .. :: ::. :
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:: . : :: . ..:: . :: :.:... . .: :...... : ..
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..:: :...:: :::::. :. ..: ..:::::::: :::.: : . .: :...: :::
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::. .:.:: .: :.:. ::.::::.::.::. :.:: .. .:. : :.::.:.::.
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. :...:... .:::..:::. ::.. ::..:. : .: ..:: . : ::
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..:.::.:...::..:. :..::::.::.:::.::.. :::.. :. ..
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: :: .::: :. . : . :. :. : : ... .. :
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.. ...: . .:. . . : . . : : :: :::::::::::::::: . ..
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..:. : .: ..:: . : ::..:.::.:...::..:. :..::::.::.:::
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.::.. :::.. :. ..: : .::: :. . : .
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:. :. : : ... .. : .. ...: . .:. . . : . . :
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: :: :::::::::::::::: . ..:. . ...: : : . . : . .
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: .. ..:. . ::::::::..: :.::: .. : : . ...
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pF1KB0 LPCTDWEN
.:.
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pF1KB0 EILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQKL
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initn: 1621 init1: 896 opt: 907 Z-score: 411.5 bits: 86.8 E(85289): 3.5e-16
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pF1KB0 ADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKLQY
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pF1KB0 AVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEVQF
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XP_005 MLARETLQLMRAKELCLNHKRAEIQGKMEDLPEQEKNTNVVDELEIQFYEIQLELYEVKF
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XP_005 RRQCQQLESKRGRICAKRASLRSRKDQCKENHRFRLQQAEESIRYSRQHHSIQMKRDKIK
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.::: :. . : . :. :. : : ... .. : .. ...:
XP_005 PNLPSDLSQQMCLPASHAVSVIHPSSRKTRG---VPLSEAG----NVKSPKCQNCHGNIP
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XP_005 GF------RAPVKDDQPRPLVCESPA--------ERPRDSLESFSCPGSMDEVLASLRHG
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