Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0426, 845 aa
1>>>pF1KB0426 845 - 845 aa - 845 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8619+/-0.00127; mu= 9.4267+/- 0.075
mean_var=298.5565+/-63.152, 0's: 0 Z-trim(108.5): 157 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.074227
statistics sampled from 10123 (10267) to 10123 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 845) 5790 635.3 1.3e-181
CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 823) 4385 484.8 2.6e-136
CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 813) 4309 476.7 7.2e-134
CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 847) 3428 382.4 1.9e-105
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 839) 2808 316.0 1.8e-85
CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 878) 2510 284.1 7.4e-76
CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 287) 924 113.6 5.2e-25
>>CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (845 aa)
initn: 5790 init1: 5790 opt: 5790 Z-score: 3373.8 bits: 635.3 E(32554): 1.3e-181
Smith-Waterman score: 5790; 100.0% identity (100.0% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-845)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 YSEYC
:::::
CCDS12 YSEYC
>>CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (823 aa)
initn: 4422 init1: 4384 opt: 4385 Z-score: 2560.8 bits: 484.8 E(32554): 2.6e-136
Smith-Waterman score: 5569; 97.4% identity (97.4% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEG---------------------
610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 -PPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
760 770 780 790 800 810
pF1KB0 YSEYC
:::::
CCDS59 YSEYC
820
>>CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (813 aa)
initn: 5551 init1: 4278 opt: 4309 Z-score: 2516.9 bits: 476.7 E(32554): 7.2e-134
Smith-Waterman score: 5491; 96.2% identity (96.2% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-813)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
:::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS59 EPVSMP--------------------------------HFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
750 760 770 780 790 800
pF1KB0 YSEYC
:::::
CCDS59 YSEYC
810
>>CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 (847 aa)
initn: 3080 init1: 1630 opt: 3428 Z-score: 2006.8 bits: 382.4 E(32554): 1.9e-105
Smith-Waterman score: 3428; 58.7% identity (82.4% similar) in 849 aa overlap (1-840:1-846)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
:: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.:::::::::::::: :.:::.:.
CCDS78 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
:::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: :::
CCDS78 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
: :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::.
CCDS78 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
.: . :: : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::
CCDS78 AEE-AHQPKCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
: .:...: ....:..... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: ..
CCDS78 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA
..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.::
CCDS78 TKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......:
CCDS78 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA
..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. ::
CCDS78 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
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CCDS78 FPSTYVEEDE
840
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CCDS69 TNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
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CCDS48 YFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRER
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CCDS48 PAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLD
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CCDS48 TTLKYPYKSRERSASRASSRSPASCASYNFSFLSPQGLSFASQGPSAPFWSVFTPRVIGT
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CCDS48 AVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
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CCDS44 MPIFTFLSEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVI
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CCDS44 RNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPC
50 60 70 80 90 100
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CCDS44 VPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIK
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CCDS44 ILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRA
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CCDS44 GNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPS
230 240 250 260 270 280
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pF1KB0 NYVEEDYSEYC
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CCDS44 TYVEEDE
845 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 13:29:10 2016 done: Sun Nov 6 13:29:11 2016
Total Scan time: 4.380 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]