FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0120, 1529 aa
1>>>pF1KB0120 1529 - 1529 aa - 1529 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6270+/-0.00199; mu= 19.5586+/- 0.119
mean_var=324.1708+/-63.460, 0's: 0 Z-trim(105.1): 306 B-trim: 49 in 1/49
Lambda= 0.071234
statistics sampled from 7915 (8237) to 7915 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 5.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 10738 1120.5 0
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 10657 1112.2 0
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 10639 1110.3 0
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 7465 784.1 0
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 7433 780.9 0
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 6289 663.3 1.6e-189
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 940 113.4 4.4e-24
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 868 106.4 9.5e-22
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 767 96.1 1.4e-18
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 740 92.4 5.3e-18
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 741 93.5 8.9e-18
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 731 92.5 1.8e-17
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 712 89.7 4.3e-17
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 699 88.2 9.6e-17
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 634 81.4 9.1e-15
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 634 81.4 9.2e-15
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 634 82.8 2.2e-14
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9 (1285) 620 80.6 3.6e-14
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 566 75.0 1.6e-12
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 566 75.0 1.7e-12
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 587) 561 73.9 1.7e-12
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 618) 561 73.9 1.7e-12
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 556 74.0 3.6e-12
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 533 72.5 3.2e-11
CCDS75461.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6 ( 377) 507 68.0 6.3e-11
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6 ( 383) 502 67.5 9.1e-11
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4 (4981) 518 71.1 9.8e-11
>>CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529 aa)
initn: 10738 init1: 10738 opt: 10738 Z-score: 5986.8 bits: 1120.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10738; 100.0% identity (100.0% similar) in 1529 aa overlap (1-1529:1-1529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 KEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 QKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKC
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 VHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 GYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520
pF1KB0 KYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1510 1520
>>CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521 aa)
initn: 7459 init1: 7459 opt: 10657 Z-score: 5941.9 bits: 1112.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10657; 99.5% identity (99.5% similar) in 1529 aa overlap (1-1529:1-1521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIPRNTERL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIAKGTFSPLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCS-
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 KEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 -------GTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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CCDS75 DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNHLQLFPE
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CCDS75 GNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYC
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CCDS75 ECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLR
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CCDS75 SKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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CCDS64 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
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CCDS64 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
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::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .:
CCDS64 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
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:::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.::.:
CCDS64 EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS
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::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::.
CCDS64 LVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTIS
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pF1KB0 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK
:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
CCDS64 KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK
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pF1KB0 SKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIP
::::::: :.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:
CCDS64 SKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLP
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pF1KB0 QYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSN
.:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:
CCDS64 EYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGN
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.::.:. ..:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: :
CCDS64 QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTT
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: ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS64 LVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTC
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pF1KB0 DDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKE
: ::...::. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.:
CCDS64 D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE
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:: .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.:
CCDS64 LSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTL
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:::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: :
CCDS64 HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM
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pF1KB0 ADKLLLTTPSKKFTCQ-------GPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTC
::.::::::...: :. ::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:
CCDS64 ADRLLLTTPTHRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCAC
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pF1KB0 PYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDN
::..::.:: :::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: ::::::
CCDS64 PYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDN
960 970 980 990 1000 1010
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:::::.:::::::::.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..::: :::.:.:.
CCDS64 DCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KB0 PGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPC
::: :. :. : ::: .::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .::::
CCDS64 PGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPC
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KB0 DNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNIT
:...::::::::: .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.
CCDS64 DQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANIS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KB0 LQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVEL
::.:::.:.::::::::.: .:.:::.:.:: ::. : : ...:::::.:::.:: :::
CCDS64 LQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVEL
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..:.:.:.: :: :.:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::. . .::
CCDS64 VTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFH
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CCDS43 D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE
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CCDS43 HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM
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CCDS43 ADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGK
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CCDS43 DCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNAT
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CCDS43 CVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKL
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CCDS43 CETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQN
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CCDS43 GAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDK
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pF1KB0 DSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSL
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CCDS43 DNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTL
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CCDS12 ESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACV---SNPC-----
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CCDS12 FTGTYCEVDID----------ECQS-----SPCVNGGV-CKDRV---------NGFS---
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CCDS12 CQPG-FTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDG-ENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHE
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CCDS12 PCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPP
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