FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0007, 2272 aa
1>>>pF1KB0007 2272 - 2272 aa - 2272 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9760+/-0.00166; mu= -0.0008+/- 0.096
mean_var=412.6894+/-86.283, 0's: 0 Z-trim(104.9): 177 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.063134
statistics sampled from 8055 (8163) to 8055 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 5.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47368.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2272) 14766 1362.3 0
CCDS4501.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2871) 8270 770.8 0
CCDS47936.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4515) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43771.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4525) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43770.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4533) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43775.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43773.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43774.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4551) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43769.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4574) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS43772.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4684) 2334 230.3 1.6e-58
CCDS4959.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (2649) 1356 141.0 7.1e-32
CCDS47443.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5171) 1307 136.8 2.5e-30
CCDS75474.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5537) 1307 136.8 2.6e-30
CCDS435.1 MACF1 gene_id:23499|Hs108|chr1 (5430) 1120 119.8 3.5e-25
CCDS75800.1 EPPK1 gene_id:83481|Hs108|chr8 (5088) 1087 116.8 2.7e-24
CCDS10526.1 PPL gene_id:5493|Hs108|chr16 (1756) 802 90.3 8.3e-17
>>CCDS47368.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2272 aa)
initn: 14766 init1: 14766 opt: 14766 Z-score: 7287.6 bits: 1362.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14766; 100.0% identity (100.0% similar) in 2272 aa overlap (1-2272:1-2272)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSCNGGSHPRINTLGRMIRAESGPDLRYEVTSGGGGTSRMYYSRRGVITDQNSDGYCQTG
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CCDS47 MSCNGGSHPRINTLGRMIRAESGPDLRYEVTSGGGGTSRMYYSRRGVITDQNSDGYCQTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 TMSRHQNQNTIQELLQNCSDCLMRAELIVQPELKYGDGIQLTRSRELDECFAQANDQMEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TMSRHQNQNTIQELLQNCSDCLMRAELIVQPELKYGDGIQLTRSRELDECFAQANDQMEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LDSLIREMRQMGQPCDAYQKRLLQLQEQMRALYKAISVPRVRRASSKGGGGYTCQSGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LDSLIREMRQMGQPCDAYQKRLLQLQEQMRALYKAISVPRVRRASSKGGGGYTCQSGSGW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 DEFTKHVTSECLGWMRQQRAEMDMVAWGVDLASVEQHINSHRGIHNSIGDYRWQLDKIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DEFTKHVTSECLGWMRQQRAEMDMVAWGVDLASVEQHINSHRGIHNSIGDYRWQLDKIKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 DLREKSAIYQLEEEYENLLKASFERMDHLRQLQNIIQATSREIMWINDCEEEELLYDWSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLREKSAIYQLEEEYENLLKASFERMDHLRQLQNIIQATSREIMWINDCEEEELLYDWSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 KNTNIAQKQEAFSIRMSQLEVKEKELNKLKQESDQLVLNQHPASDKIEAYMDTLQTQWSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KNTNIAQKQEAFSIRMSQLEVKEKELNKLKQESDQLVLNQHPASDKIEAYMDTLQTQWSW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 ILQITKCIDVHLKENAAYFQFFEEAQSTEAYLKGLQDSIRKKYPCDKNMPLQHLLEQIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILQITKCIDVHLKENAAYFQFFEEAQSTEAYLKGLQDSIRKKYPCDKNMPLQHLLEQIKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 LEKEREKILEYKRQVQNLVNKSKKIVQLKPRNPDYRSNKPIILRALCDYKQDQKIVHKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEKEREKILEYKRQVQNLVNKSKKIVQLKPRNPDYRSNKPIILRALCDYKQDQKIVHKGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 ECILKDNNERSKWYVTGPGGVDMLVPSVGLIIPPPNPLAVDLSCKIEQYYEAILALWNQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ECILKDNNERSKWYVTGPGGVDMLVPSVGLIIPPPNPLAVDLSCKIEQYYEAILALWNQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 YINMKSLVSWHYCMIDIEKIRAMTIAKLKTMRQEDYMKTIADLELHYQEFIRNSQGSEMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YINMKSLVSWHYCMIDIEKIRAMTIAKLKTMRQEDYMKTIADLELHYQEFIRNSQGSEMF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 GDDDKRKIQSQFTDAQKHYQTLVIQLPGYPQHQTVTTTEITHHGTCQDVNHNKVIETNRE
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CCDS47 GDDDKRKIQSQFTDAQKHYQTLVIQLPGYPQHQTVTTTEITHHGTCQDVNHNKVIETNRE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 NDKQETWMLMELQKIRRQIEHCEGRMTLKNLPLADQGSSHHITVKINELKSVQNDSQAIA
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CCDS47 NDKQETWMLMELQKIRRQIEHCEGRMTLKNLPLADQGSSHHITVKINELKSVQNDSQAIA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 EVLNQLKDMLANFRGSEKYCYLQNEVFGLFQKLENINGVTDGYLNSLCTVRALLQAILQT
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CCDS47 EVLNQLKDMLANFRGSEKYCYLQNEVFGLFQKLENINGVTDGYLNSLCTVRALLQAILQT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 EDMLKVYEARLTEEETVCLDLDKVEAYRCGLKKIKNDLNLKKSLLATMKTELQKAQQIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EDMLKVYEARLTEEETVCLDLDKVEAYRCGLKKIKNDLNLKKSLLATMKTELQKAQQIHS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 QTSQQYPLYDLDLGKFGEKVTQLTDRWQRIDKQIDFRLWDLEKQIKQLRNYRDNYQAFCK
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CCDS47 QTSQQYPLYDLDLGKFGEKVTQLTDRWQRIDKQIDFRLWDLEKQIKQLRNYRDNYQAFCK
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910 920 930 940 950 960
pF1KB0 WLYDAKRRQDSLESMKFGDSNTVMRFLNEQKNLHSEISGKRDKSEEVQKIAELCANSIKD
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CCDS47 WLYDAKRRQDSLESMKFGDSNTVMRFLNEQKNLHSEISGKRDKSEEVQKIAELCANSIKD
910 920 930 940 950 960
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pF1KB0 YELQLASYTSGLETLLNIPIKRTMIQSPSGVILQEAADVHARYIELLTRSGDYYRFLSEM
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CCDS47 YELQLASYTSGLETLLNIPIKRTMIQSPSGVILQEAADVHARYIELLTRSGDYYRFLSEM
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KB0 LKSLEDLKLKNTKIEVLEEELRLARDANSENCNKNKFLDQNLQKYQAECSQFKAKLASLE
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CCDS47 LKSLEDLKLKNTKIEVLEEELRLARDANSENCNKNKFLDQNLQKYQAECSQFKAKLASLE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB0 ELKRQAELDGKSAKQNLDKCYGQIKELNEKITRLTYEIEDEKRRRKSVEDRFDQQKNDYD
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CCDS47 ELKRQAELDGKSAKQNLDKCYGQIKELNEKITRLTYEIEDEKRRRKSVEDRFDQQKNDYD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 QLQKARQCEKENLGWQKLESEKAIKEKEYEIERLRVLLQEEGTRKREYENELAKASNRIQ
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CCDS47 QLQKARQCEKENLGWQKLESEKAIKEKEYEIERLRVLLQEEGTRKREYENELAKASNRIQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB0 ESKNQCTQVVQERESLLVKIKVLEQDKARLQRLEDELNRAKSTLEAETRVKQRLECEKQQ
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CCDS47 ESKNQCTQVVQERESLLVKIKVLEQDKARLQRLEDELNRAKSTLEAETRVKQRLECEKQQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB0 IQNDLNQWKTQYSRKEEAIRKIESEREKSEREKNSLRSEIERLQAEIKRIEERCRRKLED
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CCDS47 IQNDLNQWKTQYSRKEEAIRKIESEREKSEREKNSLRSEIERLQAEIKRIEERCRRKLED
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB0 STRETQSQLETERSRYQREIDKLRQRPYGSHRETQTECEWTVDTSKLVFDGLRKKVTAMQ
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CCDS47 STRETQSQLETERSRYQREIDKLRQRPYGSHRETQTECEWTVDTSKLVFDGLRKKVTAMQ
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB0 LYECQLIDKTTLDKLLKGKKSVEEVASEIQPFLRGAGSIAGASASPKEKYSLVEAKRKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LYECQLIDKTTLDKLLKGKKSVEEVASEIQPFLRGAGSIAGASASPKEKYSLVEAKRKKL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 ISPESTVMLLEAQAATGGIIDPHRNEKLTVDSAIARDLIDFDDRQQIYAAEKAITGFDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISPESTVMLLEAQAATGGIIDPHRNEKLTVDSAIARDLIDFDDRQQIYAAEKAITGFDDP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB0 FSGKTVSVSEAIKKNLIDRETGMRLLEAQIASGGVVDPVNSVFLPKDVALARGLIDRDLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FSGKTVSVSEAIKKNLIDRETGMRLLEAQIASGGVVDPVNSVFLPKDVALARGLIDRDLY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KB0 RSLNDPRDSQKNFVDPVTKKKVSYVQLKERCRIEPHTGLLLLSVQKRSMSFQGIRQPVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSLNDPRDSQKNFVDPVTKKKVSYVQLKERCRIEPHTGLLLLSVQKRSMSFQGIRQPVTV
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KB0 TELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAMK
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CCDS47 TELVDSGILRPSTVNELESGQISYDEVGERIKDFLQGSSCIAGIYNETTKQKLGIYEAMK
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pF1KB0 IGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLRLPVEEAYKRGLVGIEFKEKLLSAERAVTGY
1690 1700 1710 1720 1730 1740
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pF1KB0 NDPETGNIISLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NDPETGNIISLFQAMNKELIEKGHGIRLLEAQIATGGIIDPKESHRLPVDIAYKRGYFNE
1750 1760 1770 1780 1790 1800
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pF1KB0 ELSEILSDPSDDTKGFFDPNTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTSQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELSEILSDPSDDTKGFFDPNTEENLTYLQLKERCIKDEETGLCLLPLKEKKKQVQTSQKN
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB0 TLRKRRVVIVDPETNKEMSVQEAYKKGLIDYETFKELCEQECEWEEITITGSDGSTRVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLRKRRVVIVDPETNKEMSVQEAYKKGLIDYETFKELCEQECEWEEITITGSDGSTRVVL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB0 VDRKTGSQYDIQDAIDKGLVDRKFFDQYRSGSLSLTQFADMISLKNGVGTSSSMGSGVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VDRKTGSQYDIQDAIDKGLVDRKFFDQYRSGSLSLTQFADMISLKNGVGTSSSMGSGVSD
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB0 DVFSSSRHESVSKISTISSVRNLTIRSSSFSDTLEESSPIAAIFDTENLEKISITEGIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DVFSSSRHESVSKISTISSVRNLTIRSSSFSDTLEESSPIAAIFDTENLEKISITEGIER
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB0 GIVDSITGQRLLEAQACTGGIIHPTTGQKLSLQDAVSQGVIDQDMATRLKPAQKAFIGFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GIVDSITGQRLLEAQACTGGIIHPTTGQKLSLQDAVSQGVIDQDMATRLKPAQKAFIGFE
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB0 GVKGKKKMSAAEAVKEKWLPYEAGQRFLEFQYLTGGLVDPEVHGRISTEEAIRKGFIDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GVKGKKKMSAAEAVKEKWLPYEAGQRFLEFQYLTGGLVDPEVHGRISTEEAIRKGFIDGR
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB0 AAQRLQDTSSYAKILTCPKTKLKISYKDAINRSMVEDITGLRLLEAASVSSKGLPSPYNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AAQRLQDTSSYAKILTCPKTKLKISYKDAINRSMVEDITGLRLLEAASVSSKGLPSPYNM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270
pF1KB0 SSAPGSRSGSRSGSRSGSRSGSRSGSRRGSFDATGNSSYSYSYSFSSSSIGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSAPGSRSGSRSGSRSGSRSGSRSGSRRGSFDATGNSSYSYSYSFSSSSIGH
2230 2240 2250 2260 2270
>>CCDS4501.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2871 aa)
initn: 8591 init1: 7928 opt: 8270 Z-score: 4088.7 bits: 770.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9943; 74.0% identity (74.0% similar) in 2304 aa overlap (1-1705:1-2304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSCNGGSHPRINTLGRMIRAESGPDLRYEVTSGGGGTSRMYYSRRGVITDQNSDGYCQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSCNGGSHPRINTLGRMIRAESGPDLRYEVTSGGGGTSRMYYSRRGVITDQNSDGYCQTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 TMSRHQNQNTIQELLQNCSDCLMRAELIVQPELKYGDGIQLTRSRELDECFAQANDQMEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TMSRHQNQNTIQELLQNCSDCLMRAELIVQPELKYGDGIQLTRSRELDECFAQANDQMEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LDSLIREMRQMGQPCDAYQKRLLQLQEQMRALYKAISVPRVRRASSKGGGGYTCQSGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDSLIREMRQMGQPCDAYQKRLLQLQEQMRALYKAISVPRVRRASSKGGGGYTCQSGSGW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 DEFTKHVTSECLGWMRQQRAEMDMVAWGVDLASVEQHINSHRGIHNSIGDYRWQLDKIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DEFTKHVTSECLGWMRQQRAEMDMVAWGVDLASVEQHINSHRGIHNSIGDYRWQLDKIKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 DLREKSAIYQLEEEYENLLKASFERMDHLRQLQNIIQATSREIMWINDCEEEELLYDWSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLREKSAIYQLEEEYENLLKASFERMDHLRQLQNIIQATSREIMWINDCEEEELLYDWSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 KNTNIAQKQEAFSIRMSQLEVKEKELNKLKQESDQLVLNQHPASDKIEAYMDTLQTQWSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KNTNIAQKQEAFSIRMSQLEVKEKELNKLKQESDQLVLNQHPASDKIEAYMDTLQTQWSW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 ILQITKCIDVHLKENAAYFQFFEEAQSTEAYLKGLQDSIRKKYPCDKNMPLQHLLEQIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILQITKCIDVHLKENAAYFQFFEEAQSTEAYLKGLQDSIRKKYPCDKNMPLQHLLEQIKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 LEKEREKILEYKRQVQNLVNKSKKIVQLKPRNPDYRSNKPIILRALCDYKQDQKIVHKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEKEREKILEYKRQVQNLVNKSKKIVQLKPRNPDYRSNKPIILRALCDYKQDQKIVHKGD
430 440 450 460 470 480
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pF1KB0 ECILKDNNERSKWYVTGPGGVDMLVPSVGLIIPPPNPLAVDLSCKIEQYYEAILALWNQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ECILKDNNERSKWYVTGPGGVDMLVPSVGLIIPPPNPLAVDLSCKIEQYYEAILALWNQL
490 500 510 520 530 540
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pF1KB0 YINMKSLVSWHYCMIDIEKIRAMTIAKLKTMRQEDYMKTIADLELHYQEFIRNSQGSEMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YINMKSLVSWHYCMIDIEKIRAMTIAKLKTMRQEDYMKTIADLELHYQEFIRNSQGSEMF
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:: ..:: ..:.:::: :. . :. . .... .::.:.::. ::.. .:.:. .:.::.
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.::::: :::.:::::..:. :: :::::::::::..::: .. ...::..: ::::.::
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: :.:.::. .::::.:.::.:.::::.: . : : : :..: ::: . :
CCDS47 IAKNLIDRSALDQYRAGTLSITEFADMLSGNAG-GFRSR-----SSSVGSSSSYP----I
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: : .: .:.:: ::..:.:.:.:::.:::.::::...:..::.:::::::::
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:::::::: :.::... . :::..:..:. :. :.. ::::: ::: . : :::::.:.
CCDS47 QACTGGIIDPSTGERFPVTDAVNKGLVDKIMVDRINLAQKAFCGFEDPRTKTKMSAAQAL
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:. :: ::::::::: :::::::..:.. ::. .::...: .:.:.::.:.:...:.:
CCDS47 KKGWLYYEAGQRFLEVQYLTGGLIEPDTPGRVPLDEALQRGTVDARTAQKLRDVGAYSKY
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:::::::::::::::..:::::. :::::::::. :.:: :::..:. ::: .::
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