Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1354
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1354, 617 aa
1>>>pF1KA1354 617 - 617 aa - 617 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4008+/-0.000958; mu= 18.6174+/- 0.058
mean_var=69.9766+/-14.222, 0's: 0 Z-trim(103.9): 174 B-trim: 2 in 1/53
Lambda= 0.153320
statistics sampled from 7461 (7647) to 7461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 4192 936.9 0
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 3911 874.8 0
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 3911 874.8 0
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 3911 874.8 0
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 3911 874.8 0
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 1611 366.0 8.2e-101
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 1483 337.7 2.7e-92
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 1324 302.5 1.1e-81
CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 ( 628) 1180 270.7 4.1e-72
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 1172 268.9 1.4e-71
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1051 242.2 1.8e-63
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1051 242.2 1.9e-63
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1049 241.7 2e-63
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 968 223.8 5.9e-58
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 963 222.7 1.1e-57
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 963 222.7 1.1e-57
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 933 216.1 1.3e-55
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 933 216.1 1.3e-55
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 926 214.5 3.9e-55
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 909 210.7 4.3e-54
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 909 210.7 4.4e-54
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 909 210.7 4.4e-54
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 898 208.3 2.4e-53
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 894 207.4 4.3e-53
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 891 206.7 6.7e-53
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 887 205.8 1.2e-52
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 882 204.8 2.9e-52
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 878 203.9 5.7e-52
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 868 201.7 2.4e-51
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 830 193.2 7.5e-49
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 830 193.2 7.9e-49
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 796 185.7 1.5e-46
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 792 184.8 2.6e-46
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 771 180.2 5.9e-45
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 734 172.0 2e-42
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 732 171.6 2.6e-42
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 718 168.5 2.3e-41
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 696 163.6 6.7e-40
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 690 162.3 1.5e-39
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 677 159.4 1.3e-38
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 641 151.4 3e-36
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 624 147.7 4.1e-35
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 607 143.9 5.7e-34
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 597 141.7 2.4e-33
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 597 141.7 2.6e-33
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 578 137.5 5e-32
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 572 136.2 1.3e-31
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 514 123.3 8.6e-28
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 509 122.3 1.9e-27
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 461 111.6 3e-24
>>CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 (617 aa)
initn: 4192 init1: 4192 opt: 4192 Z-score: 5008.8 bits: 936.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4192; 100.0% identity (100.0% similar) in 617 aa overlap (1-617:1-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEEN
550 560 570 580 590 600
610
pF1KA1 PGSPSRESPLSAPSDHS
:::::::::::::::::
CCDS65 PGSPSRESPLSAPSDHS
610
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 3911 init1: 3911 opt: 3911 Z-score: 4672.9 bits: 874.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3911; 92.8% identity (98.2% similar) in 613 aa overlap (1-613:1-613)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDGD
::.:::..:::.:.::: ::: ::.::::::::::::::::::.:::::::::.::: :
CCDS55 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMD
. :::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS55 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKN
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::.:.:::
CCDS55 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::.::::::::
CCDS55 FPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHL
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS55 RFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDT
::::::::::::::::::::::.:.::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::: ::::::
CCDS55 KGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMT
:: :::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::
CCDS55 PRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGV
::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS55 TVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEEN
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS55 AVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEET
550 560 570 580 590 600
610
pF1KA1 PGSPSRESPLSAPSDHS
:::::::::::
CCDS55 TPSPSRESPLSAP
610
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 3911 init1: 3911 opt: 3911 Z-score: 4672.7 bits: 874.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3911; 92.8% identity (98.2% similar) in 613 aa overlap (1-613:27-639)
10 20 30
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSS
::.:::..:::.:.::: ::: ::.::::::::
CCDS55 MDHLHRGELVAAILRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK
::::::::::.:::::::::.::: :. :::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNC
::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 LHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 VEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELE
:::::::::::: :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS
::::.:::::::.::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 NYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMD
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.::.::::::
CCDS55 NYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 APRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 SALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGI
:::::.:::::::.::::: :::::::: :::.:::::::::::::::::::.:::::::
CCDS55 SALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGI
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 THDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLS
::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::
CCDS55 THDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 CEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEW
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 CEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEW
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610
pF1KA1 HKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
:::::::::::::::::::::::::. :::::::::::
CCDS55 HKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
610 620 630
>>CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (655 aa)
initn: 3911 init1: 3911 opt: 3911 Z-score: 4672.5 bits: 874.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3911; 92.8% identity (98.2% similar) in 613 aa overlap (1-613:43-655)
10 20 30
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSN
::.:::..:::.:.::: ::: ::.::::
CCDS14 WKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSN
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 THSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
::::::::::::::.:::::::::.::: :. :::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 THSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 MCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVS
::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 MCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVT
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 LDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
:::::::::::::::: :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 TELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
::::::::.:::::::.::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS14 TELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.::.::
CCDS14 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSL
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYI
:::::::::.:::::::.::::: :::::::: :::.:::::::::::::::::::.:::
CCDS14 FFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYI
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460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYD
::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS14 SGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYD
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520 530 540 550 560 570
pF1KA1 DVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPE
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 DVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPD
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580 590 600 610
pF1KA1 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
:::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::
CCDS14 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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10 20 30
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSN
::.:::..:::.:.::: ::: ::.::::
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40 50 60 70 80 90
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::::::::::::::.:::::::::.::: :. :::::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 THSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 MCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVS
::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS55 MCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVT
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 LDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
:::::::::::::::: :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 TELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
::::::::.:::::::.::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS55 TELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.::.::
CCDS55 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSL
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340 350 360 370 380 390
pF1KA1 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYI
:::::::::.:::::::.::::: :::::::: :::.:::::::::::::::::::.:::
CCDS55 FFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYI
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460 470 480 490 500 510
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::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS55 SGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYD
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520 530 540 550 560 570
pF1KA1 DVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPE
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS55 DVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPD
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580 590 600 610
pF1KA1 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
:::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::
CCDS55 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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Smith-Waterman score: 1611; 42.4% identity (72.7% similar) in 582 aa overlap (20-596:32-609)
10 20 30 40
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRF-FTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGL
: :. . :.. .::. .:::. :: .:
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50 60 70 80 90 100
pF1KA1 LCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIID
: ::.:. . : ::.:....:. ::::.:::::::.: . :.:.::. ::..:::
CCDS12 LLDVVLTIN--REAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHIID
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110 120 130 140 150 160
pF1KA1 FIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIE
: :.:...:..: .::.: :: :::.:::...:. :: ...:...:...:..:.:..:
CCDS12 FAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLAS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 VDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDP
. . :. : ...: . .::.::.:::.: :.:: :. :.:..::.:: :::. .
CCDS12 LRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDPA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQS
: :.... .:::::: ..:.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : :::
CCDS12 RRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQS
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 DRTAIRSDSTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVI
:::.::: :::.::. .. : :: .. . :...: :. :.. . .::.
CCDS12 PRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVAVL
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 GNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVG
::.::.::: .:. :::. .:.::. :.:... ...:.: :.:..: : .::.:
CCDS12 DNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYATG
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 GRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNE-LM
::. :: ::.:: : :: :::.:. .... .::::.. :: .::::: .. ... :
CCDS12 GRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKALH
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470 480 490 500 510 520
pF1KA1 CFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQ
:.:: .:.: ::::. : :: : .: ..:..:: . .: ::. ::: : ::
CCDS12 CYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPETDQ
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pF1KA1 WTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESL
:: .. : :::..: ..: :::.::::.: .. ::: :. . :::.. . .:::.
CCDS12 WTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPESF
540 550 560 570 580 590
590 600 610
pF1KA1 GGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
.:: ::. ...:
CCDS12 AGI-ACAPVLLPRAGTRR
600 610
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Smith-Waterman score: 1483; 38.4% identity (71.5% similar) in 594 aa overlap (17-599:12-601)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAG-TTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDG
.: : . ... . :::.::: ... :..::.:::.:: .:
CCDS10 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLV-ADE
10 20 30 40 50
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pF1KA1 DEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNM
... :.:: ..: ::::..::: ::.: ..: :.. .::: ..::.: ..: :.
CCDS10 QRV-PAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILK
:.. .::.: .::: :.::: .: . :: :: . . ..:. :.: ..: ....:::.
CCDS10 GNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMK
.: .: : .::. . ...: :::. ... : .:..:: .:: . : .: ....
CCDS10 HFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NIRFPLMTPQDLINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
::.:::. .::.. :. . ... . .: ... :: :. :::::. :::.:..
CCDS10 NIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 STHLVTLGGVLRQQ-LVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQ
. .:. .:: . .. : .: . . : ....: . .:. : : .: .::.:.:....::.
CCDS10 QERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELAT
. :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... : :.:::. : :..
CCDS10 FSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHD----TFQNELMCFDPDTD
:: :.:. . ::::: . . ::::::.: ..::::: :: ....:.:.: ::
CCDS10 VETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLCYDHRTD
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 KWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAA
: .. ::::.:: : ::..::..: :::. : . :::. : ::: .::: .:
CCDS10 VWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAP
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 MLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRAC
.:...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: : :.: . :::....: ::
CCDS10 LLHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSAC
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KA1 TLTVFP-PEENPGSPSRESPLSAPSDHS
. .. : ::.
CCDS10 VCALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
600 610
>>CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 (634 aa)
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Smith-Waterman score: 1324; 35.6% identity (68.5% similar) in 593 aa overlap (27-614:50-628)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVP
.:. ... .:.:....: :..::: ::
CCDS34 IIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLLEGLSKMRQENFLCD--LVI
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLS
: . : ::...::: :.:: .. :. ... . :. .. .:: .: . ::.::.
CCDS34 GTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVDLNDISPLGLATVIAYAYTGKLT
80 90 100 110 120 130
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pF1KA1 LNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNF
:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: .:..::. : ::.::.: .. ...:
CCDS34 LSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAETYSLKNAKAAAQKF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 ILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKL
: :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:. :. : .::.... :. ::: :
CCDS34 IRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKWLEFDQKRVKYAADL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 MKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
..:::: .. :::.::::.: : : : ::..: ::...:: : ..:: :: ::.
CCDS34 LSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGG
260 270 280 290 300 310
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pF1KA1 STHLVTLGGVLRQQLV---VSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVG
:::.:: : :. .:... .: . . : .:. : : ... .::. .::::.:
CCDS34 CRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCVAVMDGFLYVAG
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 GQSNYDTKG--KTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAG
:... :... : ::.. :.:::.: :...::.:.::: : ::...: .::.:::.: :
CCDS34 GEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGLVYAAGGRNAEG
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 ELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTD
::..::: : :.:. . . . ::..: : . ..:: .... . .:: .:
CCDS34 SLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYSRSVCAYDPASD
440 450 460 470 480 490
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pF1KA1 KWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAM
.:.. ..: :: :: :..:..::.::... .. :::. : :::. ::. : .
CCDS34 SWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSPATGQWSYAAPL
500 510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 LRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRACT
: : .::...... :.:::.. ... . . .: ..:: .:: . .:::. :. ::
CCDS34 QVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDELPEATVGVSCCT
560 570 580 590 600 610
600 610
pF1KA1 LTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
:.. :.. .::: :. :
CCDS34 LSM------PNNVTRESRASSVSSVPVSI
620 630
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CCDS13 HI-EAHRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSELELSLS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]