Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0002, 548 aa
1>>>pF1KA0002 548 - 548 aa - 548 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7268+/-0.00103; mu= 15.4965+/- 0.062
mean_var=59.3678+/-11.748, 0's: 0 Z-trim(102.7): 40 B-trim: 57 in 2/47
Lambda= 0.166456
statistics sampled from 7021 (7057) to 7021 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 3536 858.0 0
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 3402 825.8 0
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 3037 738.2 5.3e-213
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 911 227.6 3e-59
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 835 209.4 9.1e-54
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 828 207.7 2.8e-53
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 819 205.5 1.2e-52
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 815 204.6 2.5e-52
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 761 191.6 2.1e-48
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 738 186.1 9.4e-47
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 682 172.6 1e-42
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 648 164.4 2.7e-40
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 640 162.5 1.1e-39
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 639 162.3 1.2e-39
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 628 159.6 7.9e-39
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 609 155.1 1.7e-37
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 609 155.1 1.8e-37
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 522 134.2 3.8e-31
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 517 133.0 7.6e-31
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 516 132.8 1e-30
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 509 131.1 2.5e-30
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 499 128.7 1.8e-29
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 428 111.6 1.5e-24
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 410 107.3 4.4e-23
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 397 104.2 3.8e-22
>>CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (548 aa)
initn: 3536 init1: 3536 opt: 3536 Z-score: 4584.1 bits: 858.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3536; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEVFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEVFLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEIELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEIELA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEGNKNVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEGNKNVGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKK
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DWDDDQND
::::::::
CCDS33 DWDDDQND
>>CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (529 aa)
initn: 3402 init1: 3402 opt: 3402 Z-score: 4410.5 bits: 825.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3402; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (21-548:2-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEVFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEVFLA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEIELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEIELA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEGNKNVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEGNKNVGL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKK
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 DWDDDQND
::::::::
CCDS68 DWDDDQND
>>CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (475 aa)
initn: 3037 init1: 3037 opt: 3037 Z-score: 3937.6 bits: 738.2 E(32554): 5.3e-213
Smith-Waterman score: 3037; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (78-548:5-475)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 GPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MDQMVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVF
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 AGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 AGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTS
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 IMSKQYGNEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IMSKQYGNEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKET
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 EGDVTSVKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EGDVTSVKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTG
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 ANVVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ANVVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHC
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 DSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 YAVHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 YAVHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMA
400 410 420 430 440 450
530 540
pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
:::::::::::::::::::::
CCDS68 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
460 470
>>CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 (557 aa)
initn: 846 init1: 318 opt: 911 Z-score: 1177.2 bits: 227.6 E(32554): 3e-59
Smith-Waterman score: 928; 31.9% identity (64.8% similar) in 546 aa overlap (2-545:8-536)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNK
::..:. .: .:. . : . .. : . ::.. : :::.: .:
CCDS13 MDSTVPSALELPQR--LALNPRESPRSPEEEEPHLLSSLAAVQTLASVIRPCYGPHGRQK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 MVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLEL
.... . :. :..::: ::..:::: .. :.. : .. :::: ::.... ::::
CCDS13 FLVTMKGETVCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLLTEALLEQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 AEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDID-EVSSLLRTSIMSKQY
::.::. :: .. :.: : .. ::.:. : :.: . . :.. : .: .
CCDS13 AEQLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHTLSPMD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GNEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTS
:.::.:.:: .: .: :. . . :: . :. . .: .: :.... . :....
CCDS13 ----HLTKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQMAT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 V-KDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVV
: . :..:...::: .. .:. ... .: .:::: ..:.. :: .: .: ::.:
CCDS13 VLSGARVALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGINVAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYL
. :.: . .: :.::.:.... : .. : ... . :::: :: .. :.:. ::
CCDS13 VLGEVDEETLTLADKYGIVVIQARSWMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPP--QRPGKCQRVYR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGG
.:.:: .:::. : :.::::.: . . . :.:: :.... : .: ::.::.
CCDS13 QELGDGLAVVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQDPRLIPGA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 GATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQ
::::. :::.... : : :. :: :.. .:..::::.:. ...:.... .:::
CCDS13 GATEMALAKMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMAEMSGVHQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGG
:: .:. :. . .. . :. :: . : ... ...... .. ::.:..::
CCDS13 GGNLLMGVGTEG----IINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIVVAK----
480 490 500 510 520
540
pF1KA0 PKPPSGKKDWDDDQND
: :. .. :. :
CCDS13 -KSPTHQEIWNPDSKKTKKHPPPVETKKILGLNN
530 540 550
>>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa)
initn: 745 init1: 339 opt: 835 Z-score: 1078.7 bits: 209.4 E(32554): 9.1e-54
Smith-Waterman score: 835; 31.8% identity (66.8% similar) in 509 aa overlap (24-524:30-533)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNK
::: :. .:.: : .:.: ::. ::::..:
CCDS38 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLE-ALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 MVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLEL
:.... . ::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.::::::
CCDS38 MMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 AEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYG
::.:: :. .. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .
CCDS38 AEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 N-EVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKE-TEGD
. . .:.. ..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .. .
CCDS38 SCHRQMAEIAVNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KA0 VTS-VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGAN
. . :.:::::. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::
CCDS38 MPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGAN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDS
... : : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..:
CCDS38 LAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 VYLSEVGDTQ--VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR
: : :. ..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:
CCDS38 VQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL
.: ::::.:: : ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ......
CCDS38 VVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEV
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470 480 490 500 510 520
pF1KA0 YAVH-QEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIM
: . .: : .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.:
CCDS38 RARQVKEMNPALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRK
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530 540
pF1KA0 AKPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
CCDS38 PGESEE
540
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.:. .:.: : .:.: ::. ::::..::....
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. ::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.:::::: ::.::
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:. .. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .. . .
CCDS82 RGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQM
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:.. ..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .:.
CCDS82 AEIAVNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVE
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:::::. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::...
CCDS82 DAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQW
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: : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: :
CCDS82 GFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISF
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: :. ..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:.: :::
CCDS82 GTTKDKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGG
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pF1KA0 ATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVH-Q
:.:: : ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... : . .
CCDS82 AAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVK
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: : .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.:
CCDS82 EMNPALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
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540
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::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.:::::: ::.:: :.
CCDS77 VTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIH
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.. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .. . .:..
CCDS77 PIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIA
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..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .:.::::
CCDS77 VNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
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:. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::... :
CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
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: : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: : : :.
CCDS77 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTK
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pF1KA0 --VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEI
..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:.: ::::.::
CCDS77 DKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEI
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: ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... : . .: :
CCDS77 SCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNP
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CCDS77 ALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
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540
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CCDS33 KGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLL
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. :. . . :... : .:. ::: .. .: : . . . ::. :: ::..
CCDS33 QKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDM--SRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSS-
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.:. . ..: .... . .:: .:.. : ::. :.. ...:.:. .: ... .:
CCDS33 -LLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
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:. :::.. . ... :. . .... .. . :. . :: : :: ::..
CCDS33 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
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.. .:.:::. ::..::... . :.. .:::.:. . .. . . .: .
CCDS33 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
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. .. :. ... . : :::.:::. .... ::.. :.. ... :.. .
CCDS33 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
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:. :::: ::::: ..: :..: :.:.: .. ::.:.:.:: .::::.:.. ....:
CCDS33 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
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CCDS33 RNRHAQGEKTAGINVRK--GGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNT
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pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
.
CCDS33 R
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CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESG-RKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPM
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CCDS11 GGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLE
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CCDS11 QQMHPTVVISAY----RKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSS
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CCDS11 LACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMR
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.:. .:.. . .. :.. . : :.. . . ::. .. . : . .::
CCDS11 RYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVV
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.: ..:.: :: . :: .: : : :. .. :: . : : :.: .: .
CCDS11 ITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSR--PEELREDDVGTGAG
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. ....:: . .: . .: ::.:::.. ......:: ..:.... . . : .:
CCDS11 LLEIKKIGD-EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQL
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::::::.:. .:. .: ... :.::. . :.:.:.:::.: .: :... .....:
CCDS11 VPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLR
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CCDS11 AKHTQENCETWG--VNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV--
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pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
::.: :::.
CCDS11 ---------SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
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CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLV-SNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGR
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CCDS46 GKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVE
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:: . .:... ..: : .:: .. . . : . : .. : ....:.:
CCDS46 EGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQ--
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CCDS46 -KAFFAKMVVDA-VMMLDDLLQLKMIGIK--KVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEM
180 190 200 210 220
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pF1KA0 DVTSVKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGAN
. . .. :::. . .. . .. . ..:.:. . . .: :.. ... : .::.
CCDS46 QPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAK
230 240 250 260 270 280
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::.. ..:.: .: ... . . ::.: . :.. .. . .:.:.
CCDS46 VVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQV
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CCDS46 FEETQIGGERYNFFTGCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVV
350 360 370 380 390 400
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:::: :.::.: . .:..: :: .: : .:.:.: ::: : .:.: :.....:: :
CCDS46 AGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRA
410 420 430 440 450 460
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: .:. :.::. : . : .:: . . . . :. :..:: .. ::. :
CCDS46 RHAQGGTWYGVDINNE--DIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPR
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CCDS46 STVDAPTAAGRGRGRGRPH
530 540
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