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# NO CUT ENZYMES ( 161 enzymes) #
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AatII AccI AccII AccIII AclI
AcsI AcyI AflII AflIII AgeI
AhdI Alw44I AocI Aor51HI ApaI
ApaLI ApoI AscI AseI AsnI
Asp700I AspEI AspI AviII AvrII
BalI BamHI BbeI BbrPI BbsI
BcgI BciVI BclI BfrI BglI
BglII BlnI BpuAI BsaAI BsaBI
BsaHI BsaI BsaWI BseAI BseRI
BsgI BsiWI BsmAI BsmBI Bsp1407I
BspDI BspEI BspHI BspLU11I BsrBI
BsrDI BsrFI BsrGI BsrI BssHII
BssSI Bst1107I BstAPI BstBI BstEII
BstPI BstUI BstYI BstZ17I Bsu36I
CfoI Cfr10I ClaI CpoI DraI
DraIII DrdI Eam1105I Eco47III Eco81I
EcoNI EcoO65I EcoRI EcoRV EcoT22I
FauI FbaI FseI FspI HaeII
HgaI HhaI Hin1I HinP1I HincII
HindII HindIII HpaI KasI KspI
MaeII MamI MflI MluI MluNI
MroI MscI MvnI NaeI NarI
NdeI NgoMIV NotI NruI NsiI
NspI NspV PacI PaeR7I PflFI
PflMI PinAI PmaCI PmeI PmlI
PshAI PshBI Psp1406I PvuI RcaI
RsrII SacII SalI SapI SbfI
ScaI SexAI SfiI SfoI SfuI
SgrAI SmaI SnaBI SpeI SphI
Sse8387I SspBI SspI StuI SwaI
TaqI Tth111I TthHB8I Van91I XbaI
XcmI XhoI XhoII XmaCI XmaI
XmnI
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# ONE CUT ENZYMES ( 39 enzymes) #
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Acc65I 26 GGTACC G^GTACC
AlwI 750 GATCC GGATC(4/5)
AlwNI 715 CAGGACCTG CAG[ACGT][ACGT][ACGT]^CTG
Asp718I 26 GGTACC G^GTACC
BanI 26 GGTACC G^G[CT][GA]CC
BbvCI 271 GCTGAGG CCTCAGC(-5/-2)
BfaI 793 CTAG C^TAG
BlpI 492 GCTGAGC GC^T[ACGT]AGC
Bpu1102I 492 GCTGAGC GC^T[ACGT]AGC
BsiEI 704 CGGCCG CG[GA][CT]^CG
BsmI 548 GCATTC GAATGC(1/-1)
BspMI 719 ACCTGC ACCTGC(4/8)
BstXI 375 CCATGGCTGTGG CCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT]TGG
CelII 492 GCTGAGC GC^T[ACGT]AGC
DpnII 750 GATC ^GATC
EaeI 704 CGGCCG [CT]^GGCC[GA]
EagI 704 CGGCCG C^GGCCG
EclXI 704 CGGCCG C^GGCCG
Eco52I 704 CGGCCG C^GGCCG
KpnI 26 GGTACC GGTAC^C
MaeI 793 CTAG C^TAG
MaeIII 480 GTCAC ^GT[ACGT]AC
MboI 750 GATC ^GATC
MfeI 764 CAATTG C^AATTG
MseI 113 TTAA T^TAA
MspA1I 31 CAGCTG C[AC]G^C[GT]G
MunI 764 CAATTG C^AATTG
NdeII 750 GATC ^GATC
NheI 792 GCTAGC G^CTAGC
PleI 232 GAGTC GAGTC(4/5)
PstI 541 CTGCAG CTGCA^G
PvuII 31 CAGCTG CAG^CTG
Sau3AI 750 GATC ^GATC
SfcI 541 CTGCAG C^T[GA][CT]AG
SmlI 724 CTCAAG C^T[CT][GA]AG
TfiI 158 GATTC G^A[AT]TC
Tru9I 113 TTAA T^TAA
Tsp45I 480 GTCAC ^GT[GC]AC
TspRI 314 CACTG CA[GC]TG[ACGT][ACGT]^
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# TWO CUT ENZYMES ( 18 enzymes) #
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AciI 366 CCGC CCGC(-3/-1)
509 GCGG
AspHI 172 GAGCTC G[AT]GC[AT]^C
265 GAGCTC
AvaI 167 CTCGGG C^[CT]CG[GA]G
532 CCCGAG
BanII 172 GAGCTC G[GA]GC[CT]^C
265 GAGCTC
BmyI 172 GAGCTC G[AGT]GC[ACT]^C
265 GAGCTC
BpmI 229 CTGGAG CTGGAG(16/14)
579 CTGGAG
BsiHKAI 172 GAGCTC G[AT]GC[AT]^C
265 GAGCTC
BsmFI 55 GGGAC GGGAC(10/14)
398 GGGAC
BsoBI 167 CTCGGG C^[CT]CG[GA]G
532 CCCGAG
Bsp1286I 172 GAGCTC G[AGT]GC[ACT]^C
265 GAGCTC
DsaI 375 CCATGG C^C[GA][CT]GG
787 CCATGG
EarI 340 CTCTTC CTCTTC(1/4)
142 GAAGAG
HinfI 158 GATTC G^A[ACGT]TC
232 GAGTC
HphI 258 GGTGA GGTGA(8/7)
571 GGTGA
Ksp632I 340 CTCTTC CTCTTC(1/4)
142 GAAGAG
NcoI 375 CCATGG C^CATGG
787 CCATGG
SacI 172 GAGCTC GAGCT^C
265 GAGCTC
Tsp509I 111 AATT ^AATT
765 AATT
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 40 enzymes) #
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AfaI AluI AvaII BbvI BcnI
BsaJI BsiYI BslI BssKI BstF5I
BstNI Cac8I Cfr13I DdeI DraII
EcoO109I EcoRII EcoT14I Fnu4HI FokI
HaeIII HapII HpaII ItaI MboII
MnlI MslI MspI MvaI MwoI
NciI NlaIII NlaIV PpuMI RsaI
Sau96I ScrFI SfaNI StyI TseI