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# NO CUT ENZYMES (  214 enzymes) #
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AatII       Acc65I      AccI        AccII       AccIII      
AciI        AclI        AcyI        AflII       AflIII      
AgeI        AhdI        Alw44I      AlwI        AlwNI       
AocI        Aor51HI     ApaI        ApaLI       AscI        
Asp700I     Asp718I     AspEI       AspHI       AspI        
AvaI        AviII       AvrII       BalI        BamHI       
BanI        BanII       BbeI        BbrPI       BbsI        
BbvCI       BbvI        BcgI        BciVI       BclI        
BcnI        BfaI        BfrI        BglI        BglII       
BlnI        BlpI        BmyI        BpmI        Bpu1102I    
BpuAI       BsaAI       BsaBI       BsaHI       BsaI        
BsaWI       BseAI       BseRI       BsgI        BsiEI       
BsiHKAI     BsiWI       BsmBI       BsmFI       BsmI        
BsoBI       Bsp1286I    Bsp1407I    BspDI       BspEI       
BspHI       BspLU11I    BspMI       BsrBI       BsrDI       
BsrFI       BsrGI       BssHII      BssSI       Bst1107I    
BstAPI      BstBI       BstEII      BstPI       BstUI       
BstXI       BstYI       BstZ17I     Bsu36I      Cac8I       
CelII       CfoI        Cfr10I      ClaI        CpoI        
DpnII       DraI        DraII       DraIII      DrdI        
DsaI        EaeI        EagI        Eam1105I    EarI        
EclXI       Eco47III    Eco52I      Eco81I      EcoO109I    
EcoO65I     EcoRI       EcoRV       EcoT14I     FauI        
FbaI        Fnu4HI      FseI        FspI        HaeII       
HaeIII      HapII       HgaI        HhaI        Hin1I       
HinP1I      HincII      HindII      HpaI        HpaII       
HphI        ItaI        KasI        KpnI        Ksp632I     
KspI        MaeI        MaeII       MamI        MboI        
MfeI        MflI        MluI        MluNI       MroI        
MscI        MslI        MspA1I      MspI        MunI        
MvnI        MwoI        NaeI        NarI        NciI        
NcoI        NdeI        NdeII       NgoMIV      NheI        
NlaIV       NotI        NruI        NspI        NspV        
PacI        PaeR7I      PflFI       PflMI       PinAI       
PmaCI       PmeI        PmlI        PpuMI       PshAI       
Psp1406I    PstI        PvuI        PvuII       RcaI        
RsrII       SacI        SacII       SalI        SapI        
Sau3AI      SbfI        ScaI        SexAI       SfiI        
SfoI        SfuI        SgrAI       SmaI        SmlI        
SnaBI       SpeI        SphI        Sse8387I    SspBI       
StuI        StyI        SwaI        TseI        TspRI       
Tth111I     Van91I      XbaI        XcmI        XhoI        
XhoII       XmaCI       XmaI        XmnI        


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# ONE CUT ENZYMES (   26 enzymes) #
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AcsI          103  GAATTT               [GA]^AATT[CT]
AfaI           86  GTAC                 GT^AC
AluI          191  AGCT                 AG^CT
ApoI          103  GAATTT               [GA]^AATT[CT]
AseI          241  ATTAAT               AT^TAAT
AsnI          241  ATTAAT               AT^TAAT
AvaII         347  GGTCC                G^G[AT]CC
BsiYI          25  CCTAATCCAGG          CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BslI           25  CCTAATCCAGG          CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BsmAI         145  GAGAC                GTCTC(1/5)
BstF5I        343  GGATG                GGATG(2/0)
Cfr13I        347  GGTCC                G^G[ACGT]CC
EcoNI          25  CCTAATCCAGG          CCT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT][ACGT]AGG
EcoT22I       320  ATGCAT               ATGCA^T
FokI          343  GGATG                GGATG(9/13)
HindIII       190  AAGCTT               A^AGCTT
MnlI           95  GAGG                 CCTC(7/6)
NsiI          320  ATGCAT               ATGCA^T
PleI           35  GACTC                GAGTC(4/5)
PshBI         241  ATTAAT               AT^TAAT
RsaI           86  GTAC                 GT^AC
Sau96I        347  GGTCC                G^G[ACGT]CC
SfcI          298  CTACAG               C^T[GA][CT]AG
SspI          202  AATATT               AAT^ATT
TaqI           93  TCGA                 T^CGA
TthHB8I        93  TCGA                 T^CGA


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# TWO CUT ENZYMES (   13 enzymes) #
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BsaJI         220  CCCAGG               C^C[ACGT][ACGT]GG
              221  CCAGGG              
BsrI          267  ACTGG                ACTGG(1/-1)
              169  CCAGT               
BssKI          31  CCAGG                ^CC[ACGT]GG
              221  CCAGG               
BstNI          31  CCAGG                CC^[AT]GG
              221  CCAGG               
DdeI          143  CTGAG                C^T[ACGT]AG
              188  CTAAG               
EcoRII         31  CCAGG                ^CC[AT]GG
              221  CCAGG               
MboII         250  GAAGA                GAAGA(8/7)
              271  GAAGA               
MseI          154  TTAA                 T^TAA
              242  TTAA                
MvaI           31  CCAGG                CC^[AT]GG
              221  CCAGG               
ScrFI          31  CCAGG                CC^[ACGT]GG
              221  CCAGG               
TfiI          233  GATTC                G^A[AT]TC
              382  GAATC               
Tru9I         154  TTAA                 T^TAA
              242  TTAA                
Tsp45I        226  GTCAC                ^GT[GC]AC
              303  GTCAC               


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# 3 OR MORE CUT ENZYMES (    5 enzymes) #
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HinfI       MaeIII      NlaIII      SfaNI       Tsp509I