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# NO CUT ENZYMES ( 166 enzymes) #
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AatII Acc65I AccII AccIII AclI
AcyI AfaI AflIII AhdI Alw44I
AlwI Aor51HI ApaI ApaLI AscI
AseI AsnI Asp700I Asp718I AspEI
AspHI AspI AvaI AviII AvrII
BalI BamHI BanI BbeI BbrPI
BbvCI BcgI BciVI BcnI BglI
BglII BlnI BsaAI BsaBI BsaHI
BsaI BseAI BsgI BsiEI BsiHKAI
BsiWI BsmAI BsmBI BsoBI Bsp1407I
BspDI BspEI BspHI BspLU11I BspMI
BsrBI BsrDI BsrGI BssHII BssSI
Bst1107I BstBI BstEII BstPI BstUI
BstYI BstZ17I CfoI ClaI CpoI
DraI DraIII DrdI DsaI EaeI
EagI Eam1105I EarI EclXI Eco47III
Eco52I EcoO65I EcoRV EcoT22I FauI
FseI FspI HaeII HgaI HhaI
Hin1I HinP1I HindIII HpaI KasI
KpnI Ksp632I KspI MaeIII MamI
MfeI MflI MluI MluNI MroI
MscI MslI MunI MvnI NaeI
NarI NciI NcoI NdeI NgoMIV
NheI NotI NruI NsiI NspV
PacI PaeR7I PflFI PflMI PleI
PmaCI PmeI PmlI PpuMI PshAI
PshBI Psp1406I PstI PvuI PvuII
RcaI RsaI RsrII SacI SacII
SapI SbfI ScaI SexAI SfiI
SfoI SfuI SgrAI SmaI SnaBI
SpeI SphI Sse8387I SspBI SspI
SwaI Tsp45I TspRI Tth111I Van91I
XcmI XhoI XhoII XmaCI XmaI
XmnI
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# ONE CUT ENZYMES ( 56 enzymes) #
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AccI 498 GTCGAC GT^[AC][GT]AC
AciI 75 GCGG CCGC(-3/-1)
AflII 369 CTTAAG C^TTAAG
AgeI 486 ACCGGT A^CCGGT
AlwNI 298 CAGGGCCTG CAG[ACGT][ACGT][ACGT]^CTG
AocI 444 CCTGAGG CC^T[ACGT]AGG
BanII 217 GAGCCC G[GA]GC[CT]^C
BbvI 510 GCTGC GCAGC(8/12)
BclI 191 TGATCA T^GATCA
BfaI 31 CTAG C^TAG
BfrI 369 CTTAAG C^TTAAG
BlpI 70 GCTCAGC GC^T[ACGT]AGC
BmyI 217 GAGCCC G[AGT]GC[ACT]^C
Bpu1102I 70 GCTCAGC GC^T[ACGT]AGC
BsaWI 486 ACCGGT [AT]^CCGG[AT]
BseRI 46 GAGGAG GAGGAG(10/8)
BsmFI 3 GGGAC GGGAC(10/14)
Bsp1286I 217 GAGCCC G[AGT]GC[ACT]^C
BsrFI 486 ACCGGT [GA]^CCGG[CT]
BstAPI 297 GCAGGGCCTGC GCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT]TGC
BstXI 43 CCAGAGGAGTGG CCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT]TGG
Bsu36I 444 CCTGAGG CC^T[ACGT]AGG
CelII 70 GCTCAGC GC^T[ACGT]AGC
Cfr10I 486 ACCGGT [GA]^CCGG[CT]
DraII 299 AGGGCCT [GA]G^G[ACGT]CC[CT]
Eco81I 444 CCTGAGG CC^T[ACGT]AGG
EcoNI 126 CCTTGGTGAGG CCT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT][ACGT]AGG
EcoO109I 299 AGGGCCT [GA]G^G[ACGT]CC[CT]
EcoRI 34 GAATTC G^AATTC
EcoT14I 126 CCTTGG C^C[AT][AT]GG
FbaI 191 TGATCA T^GATCA
Fnu4HI 510 GCTGC GC^[ACGT]GC
HapII 487 CCGG C^CGG
HincII 498 GTCGAC GT[CT]^[GA]AC
HindII 498 GTCGAC GT[CT]^[GA]AC
HinfI 432 GATTC G^A[ACGT]TC
HpaII 487 CCGG C^CGG
HphI 130 GGTGA GGTGA(8/7)
ItaI 510 GCTGC GC^[ACGT]GC
MaeI 31 CTAG C^TAG
MaeII 227 ACGT A^CGT
MseI 370 TTAA T^TAA
MspA1I 73 CAGCGG C[AC]G^C[GT]G
MspI 487 CCGG C^CGG
NlaIV 63 GGACCC GG[ACGT]^[ACGT]CC
NspI 468 GCATGT [GA]CATG^[CT]
PinAI 486 ACCGGT A^CCGGT
SalI 498 GTCGAC G^TCGAC
SfaNI 327 GATGC GCATC(5/9)
SfcI 108 CTACAG C^T[GA][CT]AG
StuI 448 AGGCCT AGG^CCT
StyI 126 CCTTGG C^C[AT][AT]GG
TfiI 432 GATTC G^A[AT]TC
Tru9I 370 TTAA T^TAA
TseI 510 GCTGC G^C[AT]GC
XbaI 30 TCTAGA T^CTAGA
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# TWO CUT ENZYMES ( 26 enzymes) #
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AcsI 34 GAATTC [GA]^AATT[CT]
386 AAATTC
ApoI 34 GAATTC [GA]^AATT[CT]
386 AAATTC
AvaII 63 GGACC G^G[AT]CC
489 GGTCC
BpmI 41 CTCCAG CTGGAG(16/14)
202 CTGGAG
BsaJI 126 CCTTGG C^C[ACGT][ACGT]GG
220 CCCTGG
BsiYI 126 CCTTGGTGAGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
292 CCAGAGCAGGG
BslI 126 CCTTGGTGAGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
292 CCAGAGCAGGG
BsmI 55 GAATGC GAATGC(1/-1)
13 GCATTC
BsrI 380 ACTGG ACTGG(1/-1)
492 CCAGT
BssKI 60 CCTGG ^CC[ACGT]GG
221 CCTGG
BstF5I 21 GGATG GGATG(2/0)
90 GGATG
BstNI 60 CCTGG CC^[AT]GG
221 CCTGG
Cac8I 302 GCCTGC GC[ACGT]^[ACGT]GC
405 GCTTGC
DpnII 120 GATC ^GATC
192 GATC
EcoRII 60 CCTGG ^CC[AT]GG
221 CCTGG
FokI 21 GGATG GGATG(9/13)
90 GGATG
HaeIII 301 GGCC GG^CC
449 GGCC
MboI 120 GATC ^GATC
192 GATC
MvaI 60 CCTGG CC^[AT]GG
221 CCTGG
MwoI 297 GCAGGGCCTGC GC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GC
468 GCATGTAAAGC
NdeII 120 GATC ^GATC
192 GATC
Sau3AI 120 GATC ^GATC
192 GATC
ScrFI 60 CCTGG CC^[ACGT]GG
221 CCTGG
SmlI 355 CTTGAG C^T[CT][GA]AG
369 CTTAAG
TaqI 499 TCGA T^CGA
506 TCGA
TthHB8I 499 TCGA T^CGA
506 TCGA
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 10 enzymes) #
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AluI BbsI BpuAI Cfr13I DdeI
MboII MnlI NlaIII Sau96I Tsp509I