Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB3800
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB3800, 1323 aa
1>>>pF1KSDB3800 1323 - 1323 aa - 1323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4998+/-0.00106; mu= 13.1524+/- 0.064
mean_var=120.9998+/-24.577, 0's: 0 Z-trim(107.6): 61 B-trim: 37 in 1/51
Lambda= 0.116596
statistics sampled from 9640 (9697) to 9640 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 5.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS563.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1425) 8942 1516.2 0
CCDS564.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1366) 4466 763.3 0
CCDS4050.1 ZFYVE16 gene_id:9765|Hs108|chr5 (1539) 1954 340.8 1.8e-92
>>CCDS563.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1425 aa)
initn: 8942 init1: 8942 opt: 8942 Z-score: 8127.1 bits: 1516.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8942; 99.9% identity (99.9% similar) in 1323 aa overlap (1-1323:103-1425)
10 20 30
pF1KSD MWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRSCLALAPDSPDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS56 NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDND
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
680 690 700 710 720 730
640 650 660 670 680 690
pF1KSD CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
740 750 760 770 780 790
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
800 810 820 830 840 850
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
860 870 880 890 900 910
820 830 840 850 860 870
pF1KSD VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
920 930 940 950 960 970
880 890 900 910 920 930
pF1KSD VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
980 990 1000 1010 1020 1030
940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1300 1310 1320
pF1KSD DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
1400 1410 1420
>>CCDS564.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1366 aa)
initn: 8520 init1: 4462 opt: 4466 Z-score: 4058.3 bits: 763.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8406; 95.5% identity (95.5% similar) in 1323 aa overlap (1-1323:103-1366)
10 20 30
pF1KSD MWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNYSWDDQCSAVEVG
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKKCGNLACLPDEKNVLVVAVMHNCDKRTLQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQT
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSPSQLKDDGSI
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGCPAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSH
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MSEGILMKKEPAEESTTEESLRSGLPLLLKPDMPNGSGRNNDCERCSDCLVPNEVRADEN
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EGYEHEETLGTTEFLNMTEHFSESQDMTNWKLTKLNEMNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCDSYGMQDPGVSFVP
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KTLPSKEDSVTEEKEIEESKSECYSNIYEQRGNEATEGSGLLLNSTGDLMKKNYLHNFCS
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QVPSVLGQSSPKVVASLPSISVPFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTK
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRSCLALAPDSPDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS56 NKNDILGKAKLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDSPDND
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LRAGQFGISARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASC
680 690 700 710 720 730
640 650 660 670 680 690
pF1KSD CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMNAQAWENMMSASSQSPNPNNPAEYCSTIPPLQQA
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CSLKCKLLYMDRKEARVCVICHSVLMN---------------------------------
740 750
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QASGALSSPPPTVMVPVGVLKHPGAEVAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 --------------------------VAQPREQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS
760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SAGTLAVSHDPVKPVTTSPLPAETDICLFSGSITQVGSPVGSAMNLIPEDGLPPILISTG
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860 870
pF1KSD VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VKGDYAVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTTKGMHA
860 870 880 890 900 910
880 890 900 910 920 930
pF1KSD VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGSKEHGG
920 930 940 950 960 970
940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPCPLFSV
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMN
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDD
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADH
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDL
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1300 1310 1320
pF1KSD DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DSALVPVIHGGACQLSEGPVVMELIFYILENIV
1340 1350 1360
>>CCDS4050.1 ZFYVE16 gene_id:9765|Hs108|chr5 (1539 aa)
initn: 1909 init1: 1064 opt: 1954 Z-score: 1773.8 bits: 340.8 E(32554): 1.8e-92
Smith-Waterman score: 2560; 37.5% identity (64.1% similar) in 1374 aa overlap (90-1322:216-1538)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LQNDLQDCNNYNSQSLMDAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTE--KDMNSEKQMDPLNRP
.:....: .:. . : .:. ... .:
CCDS40 REQQNDISSELQNREIGGIKELGIKVDTTLSDSYNYSGTENLKDKKIFNQLESIVDFNMS
190 200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KTEGRSVNHLCPTSSDSLASVCSP-SQLKDDGSIGRDPSMSAITSLTVDSVISSQGTDGC
.. :. ... ..:.: .: . ::: : . .. ....::. .. .: .
CCDS40 SALTRQSSKMFH-AKDKLQHKSQPCGLLKDVGLVKEEVDVAVITAAE---CLKEEGKTSA
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220
pF1KSD PAVKKQENYIPDEDLTGKISSPRTDLGSPNSFSHMSEGILMKKEPAEESTTEE-------
. . .: ::: . :. : . . .:: . . ..:. :.: . .
CCDS40 LTCSLPKN----EDLCLNDSNSRDENFKLPDFSFQEDKTVIKQSAQEDSKSLDLKDNDVI
310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KSD -SLRSGLPLLLKPDMPNG-SGRNNDCERCSDCLVPNEVRADENEGYEHEETLGTT-----
. :.: . : :.:.. : . :.. :. ...:.: .::.... .
CCDS40 QDSSSALHVSSK-DVPSSLSCLPASGSMCGS-LIESKARGDFLPQHEHKDNIQDAVTIHE
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330
pF1KSD EFLNMT----EHFSESQDMTNWK-----LTKLNE-MNDSQVNEEKEKFLQISQPEDTNGD
:. : . : :.:.. . . : : .: : :.: ... .. . . :. .:
CCDS40 EIQNSVVLGGEPFKENDLLKQEKCKSILLQSLIEGMEDRKIDPDQT----VIRAESLDGG
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSNGCD-SYGMQDPGVSFVPK
. .. : .. ::. :: . :: .: :.: ..: . .: : .: : :.. :
CCDS40 DTSSTVVESQEGLS--GTHVPESSDC-CEGFINTFSSNDM-DGQDLDYFNIDEGAKSGPL
480 490 500 510 520
400 410 420 430 440
pF1KSD TLPSKEDS-VTEE-------KEIEESKSECYS--NIYEQRGNEATEGSGLLLNS-TGDLM
.. :. .::. : .::. .. : : ...: . . ... .:. .: .
CCDS40 ISDAELDAFLTEQYLQTTNIKSFEENVNDSKSQMNQIDMKGLDDGNINNIYFNAEAGAIG
530 540 550 560 570 580
450 460 470
pF1KSD KKNYLHNFCSQVPS--------VLGQSSP-KVVASLPS--------ISVP------FGGA
... .. .: : . ::..: : .::. .:: :::
CCDS40 ESHGINIICEIVDKQNTIENGLSLGEKSTIPVQQGLPTSKSEITNQLSVSDINSQSVGGA
590 600 610 620 630 640
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CCDS40 RPKQLFSLPSRT-RSSKDLNKPDVPDTIESEPSTADTVVPITCAIDSTADPQVSFN-SNY
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CCDS40 IDIESNSEGGSSF---------VTANEDSVPENTCKEG----------LVLGQKQPTWVP
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CCDS40 DSEAPNCMNCQVKFTFTKRRHHCRACGKVFCGVCCNRKCKLQYLE-KEARVCVVCYETIS
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CCDS40 KAQAFERMMSPTGSNLKSNHSDE-CTTVQPPQENQTS---SIPSPATL-PVSALKQPGVE
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CCDS40 GLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLS-SGSKRCSEDFSPLSPDVPMTVNTVDHSHST
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CCDS40 TVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGNEGLPTSGSFTLDDDVFAETEEPS
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CCDS40 SPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLPNDEDSLPPLLVASGEKGSVPVVE
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CCDS40 EHPSHEQIILLLEGESFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDKYWYFSTNGLHGLGQAEIII
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CCDS40 LLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFTESFLSSKDHGGFLFITPTF
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CCDS40 QKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAEYKAYPAPLTSIRGRKPLFG
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pF1KSD ETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEMMKAMNKSNEHVLA
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CCDS40 EIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPRKKYSDVMKVLNSSNEHVIS
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pF1KSD GGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSGALKSSSGYLAKSS
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CCDS40 IGASFSTEADSHLVCIQND-GIYETQANSATGHPRKVTGASFVVFNGALKTSSGFLAKSS
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pF1KSD IVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQWVDDDKNVSKGVV
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CCDS40 IVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVDAEEKGNKGVI
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pF1KSD SPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLSDPADHSRLTEHVA
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CCDS40 SSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSILST---SYQFAKEIA
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pF1KSD KAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQYMNDLDSALVPVI
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CCDS40 MACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLPQHYLNDLDSALIPVI
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CCDS40 HGGTSN-SSLPLEIELVFFIIEHLF
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1323 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]