FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB1426, 681 aa
1>>>pF1KSDB1426 681 - 681 aa - 681 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8655+/-0.00118; mu= -14.6051+/- 0.070
mean_var=439.2127+/-91.923, 0's: 0 Z-trim(114.7): 617 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.061198
statistics sampled from 14579 (15270) to 14579 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.469), width: 16
Scan time: 4.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 4595 420.3 4.5e-117
CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 636) 3917 360.4 4.4e-99
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 1565 152.8 1.4e-36
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 1537 150.2 5.9e-36
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 1542 150.8 6.5e-36
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 1010 103.7 7.2e-22
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 1007 103.5 8.6e-22
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 1007 103.5 8.8e-22
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 1007 103.5 8.9e-22
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 1006 103.4 8.9e-22
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 1007 103.5 9.1e-22
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 978 100.9 5.1e-21
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 687 75.4 4e-13
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 687 75.4 4.1e-13
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 682 74.9 5.1e-13
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 682 74.9 5.2e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 671 73.8 6.7e-13
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 677 74.5 7e-13
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 677 74.5 7.1e-13
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 670 73.7 7.2e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 670 73.7 7.5e-13
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 667 73.4 7.8e-13
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 667 73.4 8e-13
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 656 72.4 1.5e-12
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 642 71.2 3.5e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 639 71.2 8.2e-12
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 634 70.8 1.3e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 634 70.8 1.3e-11
>>CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 (681 aa)
initn: 4595 init1: 4595 opt: 4595 Z-score: 2215.4 bits: 420.3 E(32554): 4.5e-117
Smith-Waterman score: 4595; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
:::::::::::::::::::::
CCDS10 TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
670 680
>>CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 (636 aa)
initn: 3917 init1: 3917 opt: 3917 Z-score: 1892.3 bits: 360.4 E(32554): 4.4e-99
Smith-Waterman score: 4181; 93.4% identity (93.4% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-636)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILDTLRRPKPVVDPSRIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 HWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASPPTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSATGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PGGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTWHAQIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEV------------------
550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ---------------------------SPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQ
590 600 610
670 680
pF1KSD TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
:::::::::::::::::::::
CCDS61 TGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
620 630
>>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (591 aa)
initn: 1750 init1: 1487 opt: 1565 Z-score: 770.4 bits: 152.8 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1860; 50.3% identity (67.2% similar) in 680 aa overlap (1-675:1-589)
10 20 30 40 50
pF1KSD MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNILD-TLRRPKPVVDPSRI
:: :.::: :::::.::.:::::.:: .: ::.::: :::.... . :::::.:::. :
CCDS12 MF-GKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRRAQSLGLLGD
: .: ::.:::: :: .. ::......:: ::.:: :: ::.. . . .
CCDS12 TSIQPGAPKTIVRGSKGAKDGALTLLLDEFENMSVTRSNSLRRDSPPPPARARQENGMPE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EHWATDPDMYLQSPQSERTDPHGLYLSCNGGTPAGHKQMPWPEPQSPRVLPNGLAAKAQS
: .: .. . : :. .::. .. : .:.: : .: :
CCDS12 EPATTARGGPGKAGSRGRFAGHS---EAGGGSGDRRRAGPEKRPKSSR---EG------S
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LGPAEFQGASQRCLQLGACLQSSPPGASP-PTGTNRHGMKAAKHGSEEARPQSCLVGSAT
:: : .. ..: : :.: ..: :.: : : : .:: . . :
CCDS12 GGPQE-SSRDKRPL-------SGPDVGTPQPAGLAS-GAKLA-----AGRPFNTYPRADT
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GRP--GGEGSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPG-PPPQSKPNSSFRPPQ
.: :..: : .:: . : : :::. .:: :::
CCDS12 DHPSRGAQGEPHD---------------------VAPNGPSAGGLAIPQSSSSSS-RPP-
220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTFSPLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQLPGRSSPAGSPRTW
..:.. :: : :...: .. .: .::: .:: : : ::.
CCDS12 --------TRARGAPS--P-GVLGPHASEPQLAPPACTPAAPA---VPG---PPG-PRS-
260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD HAQISTSNLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGE
:: .. :.::::.:::..::: :::: ::...::::
CCDS12 -----------PQ-----------REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGE
300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GSTGIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGE
:::::::.: . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.
CCDS12 GSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGD
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ELWVLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLT
::::.::::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. :::::::::::::::::::
CCDS12 ELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLT
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LDGRVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMV
::::::::::::::.::.::.::::::::::::::.::: :. :::::::::::::::
CCDS12 HDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMV
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KSD DGEPPYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDH
:::::::.. :..::: .::. ::.::: ::::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :
CCDS12 DGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKH
510 520 530 540 550 560
660 670 680
pF1KSD PFLLQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
::: ..: : .:::.. :
CCDS12 PFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
570 580 590
>>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1750 init1: 1487 opt: 1537 Z-score: 758.9 bits: 150.2 E(32554): 5.9e-36
Smith-Waterman score: 1550; 60.8% identity (76.9% similar) in 403 aa overlap (275-675:46-436)
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVA
:. .: : . .:..: . : ::
CCDS33 NFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVA
20 30 40 50 60 70
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KAQSLPSDQPVGTFS-PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQL-PGRSSPAGSPRTWHAQISTS
:. .: .. : ..:..: : : ::. : : : : : .: . ..
CCDS33 -----PNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPA--CTPAAP
80 90 100 110 120
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVC
. : : . .. :.::::.:::..::: :::: ::...:::::::::::
CCDS33 AVPGPPGPRSPQ-----REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVC
130 140 150 160 170 180
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLME
.: . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::::.::
CCDS33 IATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVME
190 200 210 220 230 240
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKL
::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. ::::::::::::::::::: ::::::
CCDS33 FLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKL
250 260 270 280 290 300
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
::::::::.::.::.::::::::::::::.::: :. ::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
310 320 330 340 350 360
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTG
.. :..::: .::. ::.::: ::::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :::: ..:
CCDS33 NEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAG
370 380 390 400 410 420
670 680
pF1KSD LPECLVPLIQLYRKQTSTC
: .:::.. :
CCDS33 PPASIVPLMRQNRTR
430
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10 20 30 40 50
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CCDS13 MFGKKKKKIEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCI
10 20 30 40 50
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: .:: ::::.:::. . :.:::.:....:: ::.:: .:: . .
CCDS13 TPIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGH
60 70 80 90 100 110
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:. :.. ..... : : :.. ::. : . ... :: .:
CCDS13 AEENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPY--YRGSHAAKQNGHVMKMKH
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170 180 190 200
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: .: : . .: .. .::. :.:.. . :: . : .: .:
CCDS13 GEAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPS
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
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.. .: ..... .. . . ::.: .... ::.: :. :
CCDS13 RTAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQT--------SPQPTMRQRS---
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260 270 280 290 300 310
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:: : ..: ::.. .:. :. ..: . :.. :. ..
CCDS13 ---RSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDY---DRAQMVL
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320 330 340 350 360
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:: :. ::: .: : .. .: . ... :.: .. : ....:. :.
CCDS13 SPPLSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASY
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410
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: . :. . .. . :.::::.:::..::. :::: : ...:::::::
CCDS13 LSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGST
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420 430 440 450 460 470
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::::.: :::.:.::::: ::::::::::::::::::::::.: :::.::.:::::.:::
CCDS13 GIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELW
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480 490 500 510 520 530
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CCDS13 VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDG
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540 550 560 570 580 590
pF1KSD RVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGE
:.::::::::::.::.::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::.:::
CCDS13 RIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGE
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600 610 620 630 640 650
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CCDS13 PPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFL
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660 670 680
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CCDS13 KLAGPPSCIVPLMRQYRHH
710
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CCDS82 MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKK
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.. . : :: . .. . : : : :: . ... .. :.. .. : .
CCDS82 KDRFYRSIL--PGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQ
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.:.. . :: :: ... .... ..: .:. .. : .:: ..... :
CCDS82 TSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKSAEDYNSSNALNVKAVSETP
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.: : :. .:: :.. . : .. :: :: :: . .. ...
CCDS82 AVPPVSEDEDDDDDDATPPPVIAPRPEHTKSVYTRSVIEPLPVTPTRDVATSPISPTENN
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CCDS82 TTPPDALTRNTEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAM
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CCDS82 DVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLA
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CCDS82 GGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDF
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pF1KSD GFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFSDS
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CCDS82 GFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNEN
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CCDS82 PLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFL-KIAKPL
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD ECLVPLIQLYRKQTSTC
:.::: .. :
CCDS82 SSLTPLIAAAKEATKNNH
530 540
>>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (544 aa)
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. ..: ...: : .:. . :. .:.. .: : . .:
CCDS14 D---------ENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP---PSAENA--
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CCDS14 NSSTLYRNTDRQRKKSKM--------TDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASG
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CCDS14 TVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWV
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CCDS14 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGS
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CCDS14 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
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CCDS14 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
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pF1KSD QTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
. :.:::
CCDS14 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
530 540
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CCDS48 D---------ENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP---PSAENA--
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:::.::::::::. . ::...:::::::::::..:. :. .:::::::::.::::.:::
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CCDS48 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
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CCDS48 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
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CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
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. ..: ...: : .:. . :. .:.. .: : . .:
CCDS48 D---------ENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP---PSAENA--
210 220 230 240
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CCDS48 NSSTLYRNTDRQRKKSKM--------TDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASG
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CCDS48 TVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWV
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD LMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGR
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CCDS48 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGS
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD VKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
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CCDS48 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
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pF1KSD PYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLL
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CCDS48 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
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pF1KSD QTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC
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CCDS48 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
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CCDS33 ITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPS------GTPALNAKGTEA
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CCDS33 PAVVTEEEDDDE--ETAP----------PVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSHVD
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CCDS33 GAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALG
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CCDS33 QEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLT
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CCDS33 DVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQ
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CCDS33 ITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRAL
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:
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