Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0234
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0234, 1203 aa
1>>>pF1KSDB0234 1203 - 1203 aa - 1203 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9173+/-0.00121; mu= 15.3367+/- 0.073
mean_var=113.3781+/-22.317, 0's: 0 Z-trim(105.6): 193 B-trim: 87 in 2/49
Lambda= 0.120451
statistics sampled from 8290 (8487) to 8290 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 4.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9443.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1203) 7902 1385.2 0
CCDS81770.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1195) 7589 1330.8 0
CCDS9444.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1237) 6551 1150.4 0
CCDS81769.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1032) 6543 1149.0 0
CCDS76066.1 PCDH11Y gene_id:83259|Hs108|chrY (1340) 4356 769.0 0
CCDS55461.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX (1310) 4294 758.3 2.8e-218
CCDS55458.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX (1065) 3964 700.9 4.4e-201
CCDS55460.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX (1329) 3964 700.9 5.3e-201
CCDS14462.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX (1337) 3964 700.9 5.3e-201
CCDS55459.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX (1339) 3964 700.9 5.3e-201
CCDS14461.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX (1347) 3964 700.9 5.3e-201
CCDS14776.1 PCDH11Y gene_id:83259|Hs108|chrY (1037) 3942 697.0 6.1e-200
CCDS14777.1 PCDH11Y gene_id:83259|Hs108|chrY (1048) 3942 697.0 6.1e-200
CCDS9442.2 PCDH20 gene_id:64881|Hs108|chr13 ( 951) 2086 374.5 6.9e-103
CCDS33971.1 PCDH7 gene_id:5099|Hs108|chr4 (1069) 1446 263.3 2.3e-69
CCDS75116.1 PCDH7 gene_id:5099|Hs108|chr4 (1072) 1446 263.3 2.3e-69
CCDS75193.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1134) 1228 225.4 6.1e-58
CCDS34064.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1135) 1228 225.4 6.1e-58
CCDS43375.1 PCDH1 gene_id:5097|Hs108|chr5 (1060) 1226 225.1 7.4e-58
CCDS4267.1 PCDH1 gene_id:5097|Hs108|chr5 (1237) 1226 225.1 8.4e-58
CCDS75350.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5 ( 878) 1123 207.1 1.5e-52
CCDS4263.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5 ( 944) 1123 207.1 1.6e-52
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 1110 204.8 6.8e-52
CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100) 1098 202.8 3.8e-51
CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101) 1098 202.8 3.8e-51
CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148) 1098 202.8 3.9e-51
CCDS75348.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5 ( 863) 1084 200.3 1.7e-50
CCDS4261.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5 ( 934) 1084 200.4 1.8e-50
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 1083 200.2 1.9e-50
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 1083 200.2 2e-50
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 1078 199.3 3.3e-50
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 1078 199.3 3.7e-50
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 1077 199.1 3.7e-50
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 1077 199.1 4.1e-50
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 1063 196.7 2e-49
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 1063 196.7 2.2e-49
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 1039 192.5 4e-48
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 1038 192.3 4.1e-48
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 1038 192.4 4.5e-48
CCDS47281.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5 ( 950) 1036 192.0 5.8e-48
CCDS4242.1 PCDHAC2 gene_id:56134|Hs108|chr5 (1007) 1032 191.3 9.9e-48
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 1030 190.9 1.1e-47
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 1030 191.0 1.2e-47
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 1024 189.9 2.3e-47
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 1024 189.9 2.5e-47
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 1019 189.0 4e-47
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 1019 189.1 4.5e-47
CCDS54930.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 750) 1014 188.1 6.8e-47
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 1014 188.2 7.4e-47
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 1014 188.2 8.2e-47
>>CCDS9443.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1203 aa)
initn: 7902 init1: 7902 opt: 7902 Z-score: 7421.2 bits: 1385.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7902; 100.0% identity (100.0% similar) in 1203 aa overlap (1-1203:1-1203)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFIF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 VTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVSG
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD NNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAGN
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD ASYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVRCRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ASYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVRCRH
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pF1KSD ASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDDAVHEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDDAVHEPI
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD NGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKK
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD HHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQSQRRVTFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQSQRRVTFH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LPDGSQESCSDSGLGDHEPVGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LPDGSQESCSDSGLGDHEPVGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSD
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pF1KSD GPLGPRGLAEATEMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GPLGPRGLAEATEMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NGHTLTRAWKEDSNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NGHTLTRAWKEDSNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD HQL
:::
CCDS94 HQL
>>CCDS81770.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1195 aa)
initn: 7598 init1: 6543 opt: 7589 Z-score: 7127.3 bits: 1330.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7589; 97.0% identity (98.1% similar) in 1204 aa overlap (1-1203:1-1195)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFIF
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pF1KSD TVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVSG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAGN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ASYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVRCRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVRCRH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDDAVHEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKK
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ... .
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..: :. :..:. .: . :: .:::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGPLGPRGLAEATEMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKL
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CCDS81 VNGHTLTRAWKEDSNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPK
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CCDS81 EHQL
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CCDS94 ASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDDAVHEPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKK
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pF1KSD HHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQ--------
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CCDS94 NEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKEHQL
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CCDS81 LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
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CCDS81 NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFIF
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CCDS81 ASYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVRCRH
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pF1KSD ASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDDAVHEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDDAVHEPI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKK
910 920 930 940 950 960
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pF1KSD HHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQSQRRVTFH
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CCDS81 HHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQVNEHFYWS
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pF1KSD LPDGSQESCSDSGLGDHEPVGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSD
CCDS81 ISTAYKCPVNQY
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pF1KSD ELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSASLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRI
:.:::: :::. ::::.: : . :. .. ..:: :.::.::... .:::::::. ::
CCDS76 EIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTT-TMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTGARI
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pF1KSD DREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPNDFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIP
:::::::: :. ::.:.::.:::...:::.::.....: :::::.::. :::::::
CCDS76 DREKLCAGIPRDEH--CFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISIP
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD ENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYELLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDR
::. :::.. .:.:.:::.:.::::.:::...:..::::..:::::.: ::::::..:::
CCDS76 ENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELDR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQVTVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVI
:.:::::::.:::::: ::.::::::::.:.:.:::.::::: ..:: :::::::::::
CCDS76 EEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSVT
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280 290 300 310 320 330
pF1KSD QLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATKRLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLA
:::::::::: ::.:.. :. :. ..::: :: ::::::... :::::: ::. :::
CCDS76 QLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVLA
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDLRYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKD
:::. :::: : .:::::::: :.::.:::..:.: :: :::. :.:::::::::.:::
CCDS76 SDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDKD
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYLLETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQT
.: ::.: :: ..:.::.:. :..::.:::... ::::.:::...:..:.:.::: :::.
CCDS76 ADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQS
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSENNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNA
:.. .:..::::: :.:.: . .:. ::: :. : .:::: ::: ::.: : :::.:
CCDS76 AMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPDA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD S-FFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFIFTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPK
:.:::.::.::. . .:::......::. :.:::.::: :...:.:...:.:::::
CCDS76 PPEFSLDRRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSPV
550 560 570 580 590 600
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pF1KSD FTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDADAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNV
::::...:.: ::::...:::.::::: : :.:.:::::::..::.:..: .:::. :.
CCDS76 FTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPNI
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD SFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAKVTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSA
:::::.: :::: ::: :::. :::.:::::::.:::::.:: : :: : :..:: :.
CCDS76 SFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPYNYSYELVLPST
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
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760 770 780 790 800
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.:. .::: : :: ..:.: :.::... ::. : .:.:...:.:. : :.: :.: .
CCDS76 LVKANDLGQPDSLFSVVIVNLFVNESVTNATLINELVRKSIEAPVTPNTEIADVSSP--T
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1050 1060 1070 1080 1090
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CCDS55 ELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELDREEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQ
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CCDS55 VSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSVTQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIA
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::::.. ::::.:::...:..:.:.::: :::.:.. .:..::::: :.:.: . .:.
CCDS55 LLETAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQSAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIP
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CCDS55 SDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLSQASTQHHSPRVTQTIALCHSPPVTQTIALC
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